RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551597.6

PSMA3-AS1-201, PSMA3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PSMA3-AS1, Length 507 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA3-AS1-201ENST00000551597 CRY2Q49AN0 593 aa14.68□□□□□ -0.06
PSMA3-AS1-201ENST00000551597 SLC10A5Q5PT55 438 aa14.68□□□□□ -0.06
PSMA3-AS1-201ENST00000551597 C2CD5Q86YS7 1000 aa14.68□□□□□ -0.06
PSMA3-AS1-201ENST00000551597 MEIS3Q99687 375 aa14.68□□□□□ -0.06
PSMA3-AS1-201ENST00000551597 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa14.68□□□□□ -0.06
PSMA3-AS1-201ENST00000551597 WWC3Q9ULE0 1092 aa14.68□□□□□ -0.06
PSMA3-AS1-201ENST00000551597 CDHR2Q9BYE9 1310 aa14.67□□□□□ -0.06
PSMA3-AS1-201ENST00000551597 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa14.67□□□□□ -0.06
PSMA3-AS1-201ENST00000551597 H7C1W4 665 aa14.67□□□□□ -0.06
PSMA3-AS1-201ENST00000551597 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
PSMA3-AS1-201ENST00000551597 ALDH1L1O75891 902 aa14.67□□□□□ -0.06
PSMA3-AS1-201ENST00000551597 PDE6BP35913 854 aa14.67□□□□□ -0.06
PSMA3-AS1-201ENST00000551597 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa14.67□□□□□ -0.06
PSMA3-AS1-201ENST00000551597 GRM8O00222 908 aa14.66□□□□□ -0.06
PSMA3-AS1-201ENST00000551597 GNAI3P08754 354 aa14.66□□□□□ -0.06
PSMA3-AS1-201ENST00000551597 SRGNP10124 158 aa14.66□□□□□ -0.06
PSMA3-AS1-201ENST00000551597 USP44Q9H0E7 712 aa14.66□□□□□ -0.06
PSMA3-AS1-201ENST00000551597 C1orf115Q9H7X2 142 aa14.66□□□□□ -0.06
PSMA3-AS1-201ENST00000551597 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa14.65□□□□□ -0.06
PSMA3-AS1-201ENST00000551597 H0YIN7 160 aa14.65□□□□□ -0.06
PSMA3-AS1-201ENST00000551597 SIRT2Q8IXJ6 389 aa14.65□□□□□ -0.06
PSMA3-AS1-201ENST00000551597 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
PSMA3-AS1-201ENST00000551597 UTYO14607 1347 aa14.65□□□□□ -0.06
PSMA3-AS1-201ENST00000551597 LTBP1Q14766 1721 aa14.64□□□□□ -0.07
PSMA3-AS1-201ENST00000551597 SBF1O95248 1867 aa14.64□□□□□ -0.07
PSMA3-AS1-201ENST00000551597 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
PSMA3-AS1-201ENST00000551597 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP14.64□□□□□ -0.07
PSMA3-AS1-201ENST00000551597 SLC51AQ86UW1 340 aa14.64□□□□□ -0.07
PSMA3-AS1-201ENST00000551597 SMC5Q8IY18 1101 aa14.64□□□□□ -0.07
PSMA3-AS1-201ENST00000551597 ANKRD44Q8N8A2 993 aa14.64□□□□□ -0.07
PSMA3-AS1-201ENST00000551597 NLRP3Q96P20 1036 aa14.64□□□□□ -0.07
PSMA3-AS1-201ENST00000551597 PDE8AO60658 829 aa14.63□□□□□ -0.07
PSMA3-AS1-201ENST00000551597 GNAI2P04899 355 aa14.63□□□□□ -0.07
PSMA3-AS1-201ENST00000551597 NPR1P16066 1061 aa14.63□□□□□ -0.07
PSMA3-AS1-201ENST00000551597 STYK1Q6J9G0 422 aa14.63□□□□□ -0.07
PSMA3-AS1-201ENST00000551597 CEP85Q6P2H3 762 aa14.63□□□□□ -0.07
PSMA3-AS1-201ENST00000551597 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP14.63□□□□□ -0.077e-7■■■■■ 27
PSMA3-AS1-201ENST00000551597 MASTLQ96GX5 879 aa14.63□□□□□ -0.07
PSMA3-AS1-201ENST00000551597 KAZALD1Q96I82 304 aa14.63□□□□□ -0.07
PSMA3-AS1-201ENST00000551597 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa14.63□□□□□ -0.07
PSMA3-AS1-201ENST00000551597 CHD4Q14839 1912 aa14.62□□□□□ -0.07
PSMA3-AS1-201ENST00000551597 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
PSMA3-AS1-201ENST00000551597 CTSWP56202 376 aa14.62□□□□□ -0.07
PSMA3-AS1-201ENST00000551597 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
PSMA3-AS1-201ENST00000551597 EPHA10Q5JZY3 1008 aa14.62□□□□□ -0.07
PSMA3-AS1-201ENST00000551597 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
PSMA3-AS1-201ENST00000551597 SUCLG2Q96I99 432 aa14.62□□□□□ -0.07
PSMA3-AS1-201ENST00000551597 PLA2G12BQ9BX93 195 aa14.62□□□□□ -0.07
PSMA3-AS1-201ENST00000551597 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
PSMA3-AS1-201ENST00000551597 PIM2Q9P1W9 311 aa14.62□□□□□ -0.07
PSMA3-AS1-201ENST00000551597 UTRNP46939 3433 aa14.62□□□□□ -0.07
PSMA3-AS1-201ENST00000551597 SNED1Q8TER0 1413 aa14.61□□□□□ -0.07
PSMA3-AS1-201ENST00000551597 FOXO4P98177 505 aa14.61□□□□□ -0.07
PSMA3-AS1-201ENST00000551597 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
PSMA3-AS1-201ENST00000551597 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
PSMA3-AS1-201ENST00000551597 BCS1LQ9Y276 419 aa14.61□□□□□ -0.07
PSMA3-AS1-201ENST00000551597 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
PSMA3-AS1-201ENST00000551597 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
PSMA3-AS1-201ENST00000551597 TTLL11Q8NHH1 800 aa14.6□□□□□ -0.07
PSMA3-AS1-201ENST00000551597 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
PSMA3-AS1-201ENST00000551597 TIAM2Q8IVF5 1701 aa14.6□□□□□ -0.07
PSMA3-AS1-201ENST00000551597 DUOX1Q9NRD9 1551 aa14.6□□□□□ -0.07
PSMA3-AS1-201ENST00000551597 RTL9Q8NET4 1388 aa14.6□□□□□ -0.07
PSMA3-AS1-201ENST00000551597 ATP8B2P98198 1209 aa14.59□□□□□ -0.07
PSMA3-AS1-201ENST00000551597 FAM161AQ3B820 660 aa14.59□□□□□ -0.07
PSMA3-AS1-201ENST00000551597 TTLL6Q8N841 843 aa14.59□□□□□ -0.07
PSMA3-AS1-201ENST00000551597 CNKSR1Q969H4 720 aa14.59□□□□□ -0.07
PSMA3-AS1-201ENST00000551597 GCC1Q96CN9 775 aa14.59□□□□□ -0.07
PSMA3-AS1-201ENST00000551597 CRAMP1Q96RY5 1269 aa14.59□□□□□ -0.07
PSMA3-AS1-201ENST00000551597 GREM2Q9H772 168 aa14.59□□□□□ -0.07
PSMA3-AS1-201ENST00000551597 DCTPP1Q9H773 170 aa14.59□□□□□ -0.07
PSMA3-AS1-201ENST00000551597 SEC31BQ9NQW1 1179 aa14.59□□□□□ -0.07
PSMA3-AS1-201ENST00000551597 CSF1RP07333 972 aa14.58□□□□□ -0.08
PSMA3-AS1-201ENST00000551597 OLFM4Q6UX06 510 aa14.58□□□□□ -0.08
PSMA3-AS1-201ENST00000551597 C7orf43Q8WVR3 580 aa14.58□□□□□ -0.08
PSMA3-AS1-201ENST00000551597 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
PSMA3-AS1-201ENST00000551597 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
PSMA3-AS1-201ENST00000551597 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
PSMA3-AS1-201ENST00000551597 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
PSMA3-AS1-201ENST00000551597 HDAC5Q9UQL6 1122 aa14.58□□□□□ -0.08
PSMA3-AS1-201ENST00000551597 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
PSMA3-AS1-201ENST00000551597 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
PSMA3-AS1-201ENST00000551597 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
PSMA3-AS1-201ENST00000551597 GRAPQ13588 217 aa14.57□□□□□ -0.08
PSMA3-AS1-201ENST00000551597 GPR162Q16538 588 aa14.57□□□□□ -0.08
PSMA3-AS1-201ENST00000551597 CCDC152Q4G0S7 254 aa14.57□□□□□ -0.08
PSMA3-AS1-201ENST00000551597 SKAP1Q86WV1 359 aa14.57□□□□□ -0.08
PSMA3-AS1-201ENST00000551597 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
PSMA3-AS1-201ENST00000551597 C21orf2O43822 256 aa14.56□□□□□ -0.08
PSMA3-AS1-201ENST00000551597 HMMRO75330 724 aa14.56□□□□□ -0.08
PSMA3-AS1-201ENST00000551597 ALDH1B1P30837 517 aa14.56□□□□□ -0.08
PSMA3-AS1-201ENST00000551597 NUCB1Q02818 461 aa14.56□□□□□ -0.08
PSMA3-AS1-201ENST00000551597 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
PSMA3-AS1-201ENST00000551597 LMBR1LQ6UX01 489 aa14.56□□□□□ -0.08
PSMA3-AS1-201ENST00000551597 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
PSMA3-AS1-201ENST00000551597 MTX1Q13505 466 aa14.55□□□□□ -0.08
PSMA3-AS1-201ENST00000551597 SSH3Q8TE77 659 aa14.55□□□□□ -0.08
PSMA3-AS1-201ENST00000551597 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa14.54□□□□□ -0.08
PSMA3-AS1-201ENST00000551597 ITGA6P23229 1130 aa14.54□□□□□ -0.08
PSMA3-AS1-201ENST00000551597 RASSF7Q02833 373 aa14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.5 ms