RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546248.5

TRDN-205, Transcript of triadin, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRDN, Length 1,179 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDN-205ENST00000546248 USP17L18D6R9N7 530 aa8.47□□□□□ -1.05
TRDN-205ENST00000546248 USP17L22D6RA61 530 aa8.47□□□□□ -1.05
TRDN-205ENST00000546248 USP17L17D6RBQ6 530 aa8.47□□□□□ -1.05
TRDN-205ENST00000546248 USP17L19D6RCP7 530 aa8.47□□□□□ -1.05
TRDN-205ENST00000546248 USP17L20D6RJB6 530 aa8.47□□□□□ -1.05
TRDN-205ENST00000546248 TGFBR3LH3BV60 316 aa8.47□□□□□ -1.05
TRDN-205ENST00000546248 USP17L24Q0WX57 530 aa8.47□□□□□ -1.05
TRDN-205ENST00000546248 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
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TRDN-205ENST00000546248 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
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TRDN-205ENST00000546248 MBTPS1Q14703 1052 aa8.43□□□□□ -1.06
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TRDN-205ENST00000546248 CEP162Q5TB80 1403 aa8.42□□□□□ -1.06
TRDN-205ENST00000546248 FANCD2Q9BXW9 1451 aa8.42□□□□□ -1.06
TRDN-205ENST00000546248 CEP164Q9UPV0 1460 aa8.42□□□□□ -1.06
TRDN-205ENST00000546248 NESP48681 1621 aa8.42□□□□□ -1.06
TRDN-205ENST00000546248 ZBTB42B2RXF5 422 aa8.41□□□□□ -1.06
TRDN-205ENST00000546248 WEE1P30291 646 aa8.41□□□□□ -1.06
TRDN-205ENST00000546248 DGKZQ13574 1117 aa8.41□□□□□ -1.06
TRDN-205ENST00000546248 KRT25Q7Z3Z0 450 aa8.41□□□□□ -1.06
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TRDN-205ENST00000546248 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
TRDN-205ENST00000546248 IFT43Q96FT9 208 aa8.4□□□□□ -1.06
TRDN-205ENST00000546248 LPIN3Q9BQK8 851 aa8.4□□□□□ -1.06
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TRDN-205ENST00000546248 EPB42P16452 691 aa8.39□□□□□ -1.07
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TRDN-205ENST00000546248 PRSS36Q5K4E3 855 aa8.39□□□□□ -1.07
TRDN-205ENST00000546248 TXNRD3Q86VQ6 643 aa8.39□□□□□ -1.07
TRDN-205ENST00000546248 FOXO3O43524 673 aa8.38□□□□□ -1.07
TRDN-205ENST00000546248 MICAL2O94851 1124 aa8.38□□□□□ -1.07
TRDN-205ENST00000546248 MAP3K6O95382 1288 aa8.38□□□□□ -1.07
TRDN-205ENST00000546248 ARSDP51689 593 aa8.38□□□□□ -1.07
TRDN-205ENST00000546248 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
TRDN-205ENST00000546248 PERM1Q5SV97 790 aa8.38□□□□□ -1.07
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TRDN-205ENST00000546248 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa8.38□□□□□ -1.07
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TRDN-205ENST00000546248 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
TRDN-205ENST00000546248 C11orf91Q3C1V1 193 aa8.36□□□□□ -1.07
TRDN-205ENST00000546248 TRPM4Q8TD43 1214 aa8.36□□□□□ -1.07
TRDN-205ENST00000546248 FRRS1LQ9P0K9 344 aa8.36□□□□□ -1.07
TRDN-205ENST00000546248 FGD5Q6ZNL6 1462 aa8.36□□□□□ -1.07
TRDN-205ENST00000546248 CUX2O14529 1486 aa8.35□□□□□ -1.07
TRDN-205ENST00000546248 SCO2A0A1W2PP80 73 aa8.35□□□□□ -1.07
TRDN-205ENST00000546248 H2AFB1P0C5Y9 115 aa8.35□□□□□ -1.07
TRDN-205ENST00000546248 H2AFB2P0C5Z0 115 aa8.35□□□□□ -1.07
TRDN-205ENST00000546248 RARAP10276 462 aa8.35□□□□□ -1.07
TRDN-205ENST00000546248 PCSK7Q16549 785 aa8.35□□□□□ -1.07
TRDN-205ENST00000546248 CDCA8Q53HL2 280 aa8.35□□□□□ -1.07
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