RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531188.5

RPS3-217, Transcript of ribosomal protein S3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RPS3, Length 2,097 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3-217ENST00000531188 ECHDC1Q9NTX5 307 aa14.87□□□□□ -0.03
RPS3-217ENST00000531188 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
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RPS3-217ENST00000531188 CSF1RP07333 972 aa14.86□□□□□ -0.03
RPS3-217ENST00000531188 LRRC24Q50LG9 513 aa14.86□□□□□ -0.03
RPS3-217ENST00000531188 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
RPS3-217ENST00000531188 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
RPS3-217ENST00000531188 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
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RPS3-217ENST00000531188 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa14.85□□□□□ -0.03
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RPS3-217ENST00000531188 CCDC57Q2TAC2 916 aa14.85□□□□□ -0.03
RPS3-217ENST00000531188 AMIGO3Q86WK7 504 aa14.85□□□□□ -0.03
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RPS3-217ENST00000531188 ERC2O15083 957 aa14.84□□□□□ -0.03
RPS3-217ENST00000531188 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
RPS3-217ENST00000531188 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
RPS3-217ENST00000531188 GPATCH3Q96I76 525 aa14.84□□□□□ -0.03
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RPS3-217ENST00000531188 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
RPS3-217ENST00000531188 GREM2Q9H772 168 aa14.84□□□□□ -0.03
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RPS3-217ENST00000531188 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.03
RPS3-217ENST00000531188 KRT27Q7Z3Y8 459 aa14.83□□□□□ -0.03
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RPS3-217ENST00000531188 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa14.83□□□□□ -0.03
RPS3-217ENST00000531188 SPEF2Q9C093 1822 aa14.83□□□□□ -0.04
RPS3-217ENST00000531188 LAMB2P55268 1798 aa14.83□□□□□ -0.04
RPS3-217ENST00000531188 PDE8AO60658 829 aa14.83□□□□□ -0.04
RPS3-217ENST00000531188 RPS6KA4O75676 772 aa14.83□□□□□ -0.04
RPS3-217ENST00000531188 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
RPS3-217ENST00000531188 IL15P40933 162 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
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RPS3-217ENST00000531188 C4AP0C0L4 1744 aa14.82□□□□□ -0.04
RPS3-217ENST00000531188 GNPATO15228 680 aa14.82□□□□□ -0.04
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RPS3-217ENST00000531188 CNTROBQ8N137 903 aa14.82□□□□□ -0.04
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RPS3-217ENST00000531188 BOLA2Q9H3K6 86 aa14.82□□□□□ -0.04
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RPS3-217ENST00000531188 TAF1P21675 1872 aa14.82□□□□□ -0.04
RPS3-217ENST00000531188 CIAO1O76071 339 aa14.81□□□□□ -0.04
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RPS3-217ENST00000531188 TIMM10P62072 90 aa14.81□□□□□ -0.04
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RPS3-217ENST00000531188 USPL1Q5W0Q7 1092 aa14.8□□□□□ -0.04
RPS3-217ENST00000531188 FAM196AQ6ZSG2 479 aa14.8□□□□□ -0.04
RPS3-217ENST00000531188 NEUROD6Q96NK8 337 aa14.8□□□□□ -0.04
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RPS3-217ENST00000531188 ZNF652Q9Y2D9 606 aa14.8□□□□□ -0.04
RPS3-217ENST00000531188 REC8O95072 547 aa14.8□□□□□ -0.04
RPS3-217ENST00000531188 CLEC4GQ6UXB4 293 aa14.8□□□□□ -0.04
RPS3-217ENST00000531188 BICDL1Q6ZP65 573 aa14.8□□□□□ -0.04
RPS3-217ENST00000531188 UBR3Q6ZT12 1888 aa14.8□□□□□ -0.04
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RPS3-217ENST00000531188 TBC1D9BQ66K14 1250 aa14.79□□□□□ -0.04
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RPS3-217ENST00000531188 ZNF609O15014 1411 aa14.79□□□□□ -0.04
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RPS3-217ENST00000531188 ATP5JP18859 108 aa14.78□□□□□ -0.04
RPS3-217ENST00000531188 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa14.78□□□□□ -0.04
RPS3-217ENST00000531188 EVI5LQ96CN4 794 aa14.78□□□□□ -0.04
RPS3-217ENST00000531188 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa14.78□□□□□ -0.04
RPS3-217ENST00000531188 RIC1Q4ADV7 1423 aa14.77□□□□□ -0.04
RPS3-217ENST00000531188 PHF14O94880 888 aa14.77□□□□□ -0.04
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RPS3-217ENST00000531188 ANO2Q9NQ90 1003 aa14.77□□□□□ -0.04
RPS3-217ENST00000531188 FBXO3Q9UK99 471 aa14.77□□□□□ -0.04
RPS3-217ENST00000531188 COL4A1P02462 1669 aa14.77□□□□□ -0.04
RPS3-217ENST00000531188 COL24A1Q17RW2 1714 aa14.77□□□□□ -0.05
RPS3-217ENST00000531188 ERFEQ4G0M1 354 aa14.77□□□□□ -0.05
RPS3-217ENST00000531188 AK7Q96M32 723 aa14.77□□□□□ -0.05
RPS3-217ENST00000531188 SEC31BQ9NQW1 1179 aa14.77□□□□□ -0.05
RPS3-217ENST00000531188 SGSM2O43147 1006 aa14.76□□□□□ -0.05
RPS3-217ENST00000531188 ZPR1O75312 459 aa14.76□□□□□ -0.05
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