RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497146.5

PTGER3-211, Transcript of prostaglandin E receptor 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTGER3, Length 1,971 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER3-211ENST00000497146 DBNDD2Q9BQY9 259 aa26.04■■□□□ 1.76
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PTGER3-211ENST00000497146 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa26.04■■□□□ 1.76
PTGER3-211ENST00000497146 RAB3GAP1Q15042 981 aa26.03■■□□□ 1.76
PTGER3-211ENST00000497146 TAF7LQ5H9L4 462 aa26.03■■□□□ 1.76
PTGER3-211ENST00000497146 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP26.03■■□□□ 1.76
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PTGER3-211ENST00000497146 ZNF34Q8IZ26 560 aa26■■□□□ 1.75
PTGER3-211ENST00000497146 AK7Q96M32 723 aa26■■□□□ 1.75
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PTGER3-211ENST00000497146 NECTIN1Q15223 517 aa25.94■■□□□ 1.74
PTGER3-211ENST00000497146 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP25.94■■□□□ 1.74
PTGER3-211ENST00000497146 CAMTA2O94983 1202 aa25.93■■□□□ 1.74
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PTGER3-211ENST00000497146 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
PTGER3-211ENST00000497146 GBP4Q96PP9 640 aa25.93■■□□□ 1.74
PTGER3-211ENST00000497146 GREM2Q9H772 168 aa25.93■■□□□ 1.74
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PTGER3-211ENST00000497146 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa25.93■■□□□ 1.74
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PTGER3-211ENST00000497146 KCNJ4P48050 445 aa25.92■■□□□ 1.74
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PTGER3-211ENST00000497146 CLEC4GQ6UXB4 293 aa25.9■■□□□ 1.74
PTGER3-211ENST00000497146 CLEC17AQ6ZS10 378 aa25.9■■□□□ 1.74
PTGER3-211ENST00000497146 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP25.9■■□□□ 1.74
PTGER3-211ENST00000497146 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP25.89■■□□□ 1.74
PTGER3-211ENST00000497146 METTL24Q5JXM2 366 aa25.89■■□□□ 1.74
PTGER3-211ENST00000497146 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP25.89■■□□□ 1.74
PTGER3-211ENST00000497146 TM6SF1Q9BZW5 370 aa25.89■■□□□ 1.74
PTGER3-211ENST00000497146 CNNM1Q9NRU3 951 aa25.89■■□□□ 1.74
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