RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496526.5

TTLL3-232, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, humanhuman

TSL 2

Gene TTLL3, Length 5,282 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL3-232ENST00000496526 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa12.69□□□□□ -0.38
TTLL3-232ENST00000496526 VAT1LQ9HCJ6 419 aa12.69□□□□□ -0.38
TTLL3-232ENST00000496526 BTG4Q9NY30 223 aa12.69□□□□□ -0.38
TTLL3-232ENST00000496526 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP12.69□□□□□ -0.38
TTLL3-232ENST00000496526 RNMTO43148 476 aaKnown RBP12.69□□□□□ -0.38
TTLL3-232ENST00000496526 SSR1P43307 286 aaKnown RBP12.69□□□□□ -0.38
TTLL3-232ENST00000496526 KLHL10Q6JEL2 608 aa12.69□□□□□ -0.38
TTLL3-232ENST00000496526 C8orf58Q8NAV2 365 aa12.69□□□□□ -0.38
TTLL3-232ENST00000496526 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP12.69□□□□□ -0.38
TTLL3-232ENST00000496526 CAMK4Q16566 473 aa12.69□□□□□ -0.38
TTLL3-232ENST00000496526 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP12.69□□□□□ -0.38
TTLL3-232ENST00000496526 TTC41PQ6P2S7 1318 aa12.69□□□□□ -0.38
TTLL3-232ENST00000496526 B4DLN1 442 aa12.68□□□□□ -0.38
TTLL3-232ENST00000496526 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP12.68□□□□□ -0.38
TTLL3-232ENST00000496526 SLC26A6Q9BXS9 759 aa12.68□□□□□ -0.38
TTLL3-232ENST00000496526 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP12.68□□□□□ -0.38
TTLL3-232ENST00000496526 A0A1W2PP64 1363 aa12.68□□□□□ -0.38
TTLL3-232ENST00000496526 ZSCAN12O43309 604 aa12.68□□□□□ -0.38
TTLL3-232ENST00000496526 GJB2P29033 226 aa12.68□□□□□ -0.38
TTLL3-232ENST00000496526 PIK3C2GO75747 1445 aa12.68□□□□□ -0.38
TTLL3-232ENST00000496526 ZBTB43O43298 467 aa12.68□□□□□ -0.38
TTLL3-232ENST00000496526 PARP10Q53GL7 1025 aa12.68□□□□□ -0.38
TTLL3-232ENST00000496526 TRAPPC3LQ5T215 181 aa12.68□□□□□ -0.38
TTLL3-232ENST00000496526 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP12.68□□□□□ -0.38
TTLL3-232ENST00000496526 FSIP1Q8NA03 581 aa12.68□□□□□ -0.38
TTLL3-232ENST00000496526 ARHGEF10O15013 1369 aa12.68□□□□□ -0.38
TTLL3-232ENST00000496526 MAP3K19Q56UN5 1328 aa12.68□□□□□ -0.38
TTLL3-232ENST00000496526 STX6O43752 255 aa12.68□□□□□ -0.38
TTLL3-232ENST00000496526 FAM114A1Q8IWE2 563 aa12.68□□□□□ -0.38
TTLL3-232ENST00000496526 ZRANB1Q9UGI0 708 aa12.68□□□□□ -0.38
TTLL3-232ENST00000496526 SYCE3A1L190 88 aa12.68□□□□□ -0.38
TTLL3-232ENST00000496526 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP12.68□□□□□ -0.38
TTLL3-232ENST00000496526 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa12.68□□□□□ -0.38
TTLL3-232ENST00000496526 PDE1AP54750 535 aa12.67□□□□□ -0.38
TTLL3-232ENST00000496526 ANAPC15P60006 121 aa12.67□□□□□ -0.38
TTLL3-232ENST00000496526 SBNO1A3KN83 1393 aa12.67□□□□□ -0.38
TTLL3-232ENST00000496526 CALM1P0DP23 149 aa12.67□□□□□ -0.38
TTLL3-232ENST00000496526 CALM2P0DP24 149 aa12.67□□□□□ -0.38
TTLL3-232ENST00000496526 CALM3P0DP25 149 aa12.67□□□□□ -0.38
TTLL3-232ENST00000496526 RBM25P49756 843 aaKnown RBP12.67□□□□□ -0.38
TTLL3-232ENST00000496526 SAMM50Q9Y512 469 aa12.67□□□□□ -0.38
TTLL3-232ENST00000496526 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa12.67□□□□□ -0.38
TTLL3-232ENST00000496526 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa12.67□□□□□ -0.38
TTLL3-232ENST00000496526 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP12.67□□□□□ -0.38
TTLL3-232ENST00000496526 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP12.67□□□□□ -0.38
TTLL3-232ENST00000496526 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP12.66□□□□□ -0.38
TTLL3-232ENST00000496526 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP12.66□□□□□ -0.38
TTLL3-232ENST00000496526 STK32BQ9NY57 414 aa12.66□□□□□ -0.38
TTLL3-232ENST00000496526 HOXB7P09629 217 aa12.66□□□□□ -0.38
TTLL3-232ENST00000496526 TOP1P11387 765 aaKnown RBP12.66□□□□□ -0.38
TTLL3-232ENST00000496526 SKIDA1Q1XH10 827 aa12.66□□□□□ -0.38
TTLL3-232ENST00000496526 TMEM87AQ8NBN3 555 aa12.66□□□□□ -0.38
TTLL3-232ENST00000496526 CCDC191Q8NCU4 936 aa12.66□□□□□ -0.38
TTLL3-232ENST00000496526 TESK2Q96S53 571 aa12.66□□□□□ -0.38
TTLL3-232ENST00000496526 PAG1Q9NWQ8 432 aa12.66□□□□□ -0.38
TTLL3-232ENST00000496526 ATP7AQ04656 1500 aa12.66□□□□□ -0.38
TTLL3-232ENST00000496526 CAVIN2O95810 425 aa12.66□□□□□ -0.38
TTLL3-232ENST00000496526 RTN1Q16799 776 aa12.66□□□□□ -0.38
TTLL3-232ENST00000496526 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa12.66□□□□□ -0.38
TTLL3-232ENST00000496526 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP12.66□□□□□ -0.38
TTLL3-232ENST00000496526 IDEP14735 1019 aa12.66□□□□□ -0.38
TTLL3-232ENST00000496526 TBCAO75347 108 aaKnown RBP12.65□□□□□ -0.38
TTLL3-232ENST00000496526 YEATS4O95619 227 aa12.65□□□□□ -0.38
TTLL3-232ENST00000496526 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP12.65□□□□□ -0.38
TTLL3-232ENST00000496526 BRF1Q92994 677 aa12.65□□□□□ -0.38
TTLL3-232ENST00000496526 F8W031 263 aaPredicted RBP12.65□□□□□ -0.38
TTLL3-232ENST00000496526 GNPATO15228 680 aa12.65□□□□□ -0.38
TTLL3-232ENST00000496526 SDSP20132 328 aa12.65□□□□□ -0.38
TTLL3-232ENST00000496526 CCDC102BQ68D86 513 aa12.65□□□□□ -0.38
TTLL3-232ENST00000496526 RMND1Q9NWS8 449 aa12.65□□□□□ -0.38
TTLL3-232ENST00000496526 NEO1Q92859 1461 aa12.65□□□□□ -0.38
TTLL3-232ENST00000496526 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP12.65□□□□□ -0.39
TTLL3-232ENST00000496526 USO1O60763 962 aaKnown RBP12.64□□□□□ -0.39
TTLL3-232ENST00000496526 CCDC40Q4G0X9 1142 aa12.64□□□□□ -0.39
TTLL3-232ENST00000496526 USP37Q86T82 979 aa12.64□□□□□ -0.39
TTLL3-232ENST00000496526 CLEC11AQ9Y240 323 aa12.64□□□□□ -0.39
TTLL3-232ENST00000496526 RTL9Q8NET4 1388 aa12.64□□□□□ -0.39
TTLL3-232ENST00000496526 H0YHG0 523 aa12.64□□□□□ -0.39
TTLL3-232ENST00000496526 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP12.64□□□□□ -0.39
TTLL3-232ENST00000496526 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP12.64□□□□□ -0.39
TTLL3-232ENST00000496526 TNNI2P48788 182 aa12.64□□□□□ -0.39
TTLL3-232ENST00000496526 CNBD1Q8NA66 436 aa12.64□□□□□ -0.39
TTLL3-232ENST00000496526 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP12.64□□□□□ -0.39
TTLL3-232ENST00000496526 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP12.64□□□□□ -0.39
TTLL3-232ENST00000496526 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP12.64□□□□□ -0.39
TTLL3-232ENST00000496526 VAMP4O75379 141 aa12.64□□□□□ -0.39
TTLL3-232ENST00000496526 STX1AQ16623 288 aa12.64□□□□□ -0.39
TTLL3-232ENST00000496526 TSHZ3Q63HK5 1081 aa12.64□□□□□ -0.39
TTLL3-232ENST00000496526 SYCP3Q8IZU3 236 aa12.64□□□□□ -0.39
TTLL3-232ENST00000496526 MAST1Q9Y2H9 1570 aa12.64□□□□□ -0.39
TTLL3-232ENST00000496526 KIF5CO60282 957 aa12.63□□□□□ -0.39
TTLL3-232ENST00000496526 LDHBP07195 334 aaKnown RBP12.63□□□□□ -0.39
TTLL3-232ENST00000496526 EZRP15311 586 aaKnown RBP12.63□□□□□ -0.39
TTLL3-232ENST00000496526 PICALMQ13492 652 aa12.63□□□□□ -0.39
TTLL3-232ENST00000496526 LEKR1Q6ZMV7 388 aa12.63□□□□□ -0.39
TTLL3-232ENST00000496526 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa12.63□□□□□ -0.39
TTLL3-232ENST00000496526 GBP3Q9H0R5 595 aa12.63□□□□□ -0.39
TTLL3-232ENST00000496526 TBC1D2Q9BYX2 928 aa12.63□□□□□ -0.39
TTLL3-232ENST00000496526 NEMFO60524 1076 aa12.63□□□□□ -0.39
TTLL3-232ENST00000496526 PLBD2Q8NHP8 589 aa12.63□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 69.3 ms