RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484841.5

ACTB-212, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 5

Gene ACTB, Length 1,032 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-212ENST00000484841 TMEM88BA6NKF7 163 aa26.03■■□□□ 1.76
ACTB-212ENST00000484841 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP26.03■■□□□ 1.76
ACTB-212ENST00000484841 SLC51AQ86UW1 340 aa26.03■■□□□ 1.76
ACTB-212ENST00000484841 CNTROBQ8N137 903 aa26.03■■□□□ 1.76
ACTB-212ENST00000484841 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP26.03■■□□□ 1.76
ACTB-212ENST00000484841 ZNRF3Q9ULT6 936 aa26.03■■□□□ 1.76
ACTB-212ENST00000484841 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP26.02■■□□□ 1.76
ACTB-212ENST00000484841 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa26.02■■□□□ 1.76
ACTB-212ENST00000484841 DDX58O95786 925 aaKnown RBP26.01■■□□□ 1.75
ACTB-212ENST00000484841 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP26.01■■□□□ 1.75
ACTB-212ENST00000484841 CCDC30Q5VVM6 783 aa26.01■■□□□ 1.75
ACTB-212ENST00000484841 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP26■■□□□ 1.75
ACTB-212ENST00000484841 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP26■■□□□ 1.75
ACTB-212ENST00000484841 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP26■■□□□ 1.75
ACTB-212ENST00000484841 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP26■■□□□ 1.75
ACTB-212ENST00000484841 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP26■■□□□ 1.75
ACTB-212ENST00000484841 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP26■■□□□ 1.75
ACTB-212ENST00000484841 SCNN1DP51172 638 aa25.99■■□□□ 1.75
ACTB-212ENST00000484841 KIAA2012Q0VF49 1180 aa25.99■■□□□ 1.75
ACTB-212ENST00000484841 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP25.99■■□□□ 1.75
ACTB-212ENST00000484841 MYD88Q99836 296 aa25.99■■□□□ 1.75
ACTB-212ENST00000484841 EPS15P42566 896 aa25.98■■□□□ 1.75
ACTB-212ENST00000484841 TNIP1Q15025 636 aa25.98■■□□□ 1.75
ACTB-212ENST00000484841 CIAPIN1Q6FI81 312 aa25.98■■□□□ 1.75
ACTB-212ENST00000484841 C8orf58Q8NAV2 365 aa25.98■■□□□ 1.75
ACTB-212ENST00000484841 BCL2L13Q9BXK5 485 aa25.98■■□□□ 1.75
ACTB-212ENST00000484841 CXCL9Q07325 125 aa25.97■■□□□ 1.75
ACTB-212ENST00000484841 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP25.97■■□□□ 1.75
ACTB-212ENST00000484841 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP25.97■■□□□ 1.75
ACTB-212ENST00000484841 CNTNAP1P78357 1384 aa25.96■■□□□ 1.75
ACTB-212ENST00000484841 STK31Q9BXU1 1019 aa25.96■■□□□ 1.75
ACTB-212ENST00000484841 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
ACTB-212ENST00000484841 LTBP1Q14766 1721 aa25.96■■□□□ 1.75
ACTB-212ENST00000484841 ANP32CO43423 234 aa25.95■■□□□ 1.74
ACTB-212ENST00000484841 WASHC4Q2M389 1173 aa25.95■■□□□ 1.74
ACTB-212ENST00000484841 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP25.95■■□□□ 1.74
ACTB-212ENST00000484841 GPRC5DQ9NZD1 345 aa25.95■■□□□ 1.74
ACTB-212ENST00000484841 LRRC37AA6NMS7 1700 aa25.94■■□□□ 1.74
ACTB-212ENST00000484841 C6orf229H3BNL8 230 aa25.94■■□□□ 1.74
ACTB-212ENST00000484841 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP25.94■■□□□ 1.74
ACTB-212ENST00000484841 CCDC191Q8NCU4 936 aa25.94■■□□□ 1.74
ACTB-212ENST00000484841 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP25.94■■□□□ 1.74
ACTB-212ENST00000484841 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP25.94■■□□□ 1.74
ACTB-212ENST00000484841 RAD17O75943 681 aa25.93■■□□□ 1.74
ACTB-212ENST00000484841 EYA3Q99504 573 aa25.93■■□□□ 1.74
ACTB-212ENST00000484841 MRS2Q9HD23 443 aa25.93■■□□□ 1.74
ACTB-212ENST00000484841 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP25.92■■□□□ 1.74
ACTB-212ENST00000484841 RPS8P62241 208 aaKnown RBP25.92■■□□□ 1.74
ACTB-212ENST00000484841 CCDC27Q2M243 656 aa25.92■■□□□ 1.74
ACTB-212ENST00000484841 DEFB115Q30KQ5 88 aa25.92■■□□□ 1.74
ACTB-212ENST00000484841 CCDC184Q52MB2 194 aa25.92■■□□□ 1.74
ACTB-212ENST00000484841 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP25.92■■□□□ 1.74
ACTB-212ENST00000484841 CCDC152Q4G0S7 254 aa25.91■■□□□ 1.74
ACTB-212ENST00000484841 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP25.91■■□□□ 1.74
ACTB-212ENST00000484841 CDHR2Q9BYE9 1310 aa25.9■■□□□ 1.74
ACTB-212ENST00000484841 G3V3G9 751 aa25.9■■□□□ 1.74
ACTB-212ENST00000484841 RIMBP2O15034 1052 aa25.9■■□□□ 1.74
ACTB-212ENST00000484841 PDE8AO60658 829 aa25.9■■□□□ 1.74
ACTB-212ENST00000484841 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP25.9■■□□□ 1.74
ACTB-212ENST00000484841 NEXNQ0ZGT2 675 aa25.9■■□□□ 1.74
ACTB-212ENST00000484841 DCAF8Q5TAQ9 597 aa25.9■■□□□ 1.74
ACTB-212ENST00000484841 TSPYL6Q8N831 410 aa25.9■■□□□ 1.74
ACTB-212ENST00000484841 AIDAQ96BJ3 306 aa25.9■■□□□ 1.74
ACTB-212ENST00000484841 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa25.9■■□□□ 1.74
ACTB-212ENST00000484841 TRPM7Q96QT4 1865 aa25.89■■□□□ 1.74
ACTB-212ENST00000484841 VEGFBP49765 207 aa25.89■■□□□ 1.74
ACTB-212ENST00000484841 WWC1Q8IX03 1113 aa25.89■■□□□ 1.74
ACTB-212ENST00000484841 TNS4Q8IZW8 715 aa25.89■■□□□ 1.74
ACTB-212ENST00000484841 H7C1D1 291 aa25.88■■□□□ 1.73
ACTB-212ENST00000484841 GPSM2P81274 684 aa25.88■■□□□ 1.73
ACTB-212ENST00000484841 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP25.88■■□□□ 1.73
ACTB-212ENST00000484841 KSR2Q6VAB6 950 aa25.88■■□□□ 1.73
ACTB-212ENST00000484841 DUOX1Q9NRD9 1551 aa25.87■■□□□ 1.73
ACTB-212ENST00000484841 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP25.87■■□□□ 1.73
ACTB-212ENST00000484841 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP25.87■■□□□ 1.73
ACTB-212ENST00000484841 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP25.87■■□□□ 1.73
ACTB-212ENST00000484841 DBNDD1Q9H9R9 158 aa25.87■■□□□ 1.73
ACTB-212ENST00000484841 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa25.87■■□□□ 1.73
ACTB-212ENST00000484841 RASSF10A6NK89 507 aa25.86■■□□□ 1.73
ACTB-212ENST00000484841 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP25.86■■□□□ 1.73
ACTB-212ENST00000484841 PI4KAP2A4QPH2 592 aa25.85■■□□□ 1.73
ACTB-212ENST00000484841 YDJCA8MPS7 323 aa25.85■■□□□ 1.73
ACTB-212ENST00000484841 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa25.85■■□□□ 1.73
ACTB-212ENST00000484841 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP25.85■■□□□ 1.73
ACTB-212ENST00000484841 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP25.85■■□□□ 1.73
ACTB-212ENST00000484841 SEC31BQ9NQW1 1179 aa25.85■■□□□ 1.73
ACTB-212ENST00000484841 POLLQ9UGP5 575 aa25.85■■□□□ 1.73
ACTB-212ENST00000484841 IL16Q14005 1332 aa25.85■■□□□ 1.73
ACTB-212ENST00000484841 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa25.84■■□□□ 1.73
ACTB-212ENST00000484841 TBC1D16Q8TBP0 767 aa25.84■■□□□ 1.73
ACTB-212ENST00000484841 ECE2O60344 883 aa25.83■■□□□ 1.73
ACTB-212ENST00000484841 UFL1O94874 794 aa25.83■■□□□ 1.73
ACTB-212ENST00000484841 SLC4A2P04920 1241 aa25.83■■□□□ 1.73
ACTB-212ENST00000484841 ECE1P42892 770 aa25.83■■□□□ 1.73
ACTB-212ENST00000484841 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP25.83■■□□□ 1.73
ACTB-212ENST00000484841 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP25.83■■□□□ 1.73
ACTB-212ENST00000484841 TRAF5O00463 557 aa25.82■■□□□ 1.72
ACTB-212ENST00000484841 DOK7Q18PE1 504 aa25.82■■□□□ 1.72
ACTB-212ENST00000484841 MICALL2Q8IY33 904 aa25.82■■□□□ 1.72
ACTB-212ENST00000484841 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 616.4 ms