RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473406.5

RABGGTB-209, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 721 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-209ENST00000473406 RAB11FIP3O75154 756 aa8.63□□□□□ -1.03
RABGGTB-209ENST00000473406 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
RABGGTB-209ENST00000473406 GSTT1P30711 240 aa8.63□□□□□ -1.03
RABGGTB-209ENST00000473406 NASPP49321 788 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
RABGGTB-209ENST00000473406 GALNT12Q8IXK2 581 aa8.63□□□□□ -1.03
RABGGTB-209ENST00000473406 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF280CQ8ND82 737 aa8.63□□□□□ -1.03
RABGGTB-209ENST00000473406 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa8.63□□□□□ -1.03
RABGGTB-209ENST00000473406 C7orf43Q8WVR3 580 aa8.63□□□□□ -1.03
RABGGTB-209ENST00000473406 HSH2DQ96JZ2 352 aa8.63□□□□□ -1.03
RABGGTB-209ENST00000473406 RSRP1Q9BUV0 290 aa8.63□□□□□ -1.03
RABGGTB-209ENST00000473406 SUV39H2Q9H5I1 410 aa8.63□□□□□ -1.03
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF408Q9H9D4 720 aa8.63□□□□□ -1.03
RABGGTB-209ENST00000473406 TMEM63CQ9P1W3 806 aa8.63□□□□□ -1.03
RABGGTB-209ENST00000473406 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
RABGGTB-209ENST00000473406 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
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RABGGTB-209ENST00000473406 PWP1Q13610 501 aa8.62□□□□□ -1.03
RABGGTB-209ENST00000473406 C4orf17Q53FE4 359 aa8.62□□□□□ -1.03
RABGGTB-209ENST00000473406 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
RABGGTB-209ENST00000473406 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
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RABGGTB-209ENST00000473406 POLR3GLQ9BT43 218 aa8.62□□□□□ -1.03
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RABGGTB-209ENST00000473406 INPP5BP32019 993 aa8.61□□□□□ -1.03
RABGGTB-209ENST00000473406 GRM2Q14416 872 aa8.61□□□□□ -1.03
RABGGTB-209ENST00000473406 SLC27A3Q5K4L6 730 aa8.61□□□□□ -1.03
RABGGTB-209ENST00000473406 LIAT1Q6ZQX7 453 aa8.61□□□□□ -1.03
RABGGTB-209ENST00000473406 RELL1Q8IUW5 271 aa8.61□□□□□ -1.03
RABGGTB-209ENST00000473406 ITPKCQ96DU7 683 aa8.61□□□□□ -1.03
RABGGTB-209ENST00000473406 KLRG1Q96E93 195 aa8.61□□□□□ -1.03
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
RABGGTB-209ENST00000473406 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
RABGGTB-209ENST00000473406 SIRPGQ9P1W8 387 aa8.61□□□□□ -1.03
RABGGTB-209ENST00000473406 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa8.61□□□□□ -1.03
RABGGTB-209ENST00000473406 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa8.61□□□□□ -1.03
RABGGTB-209ENST00000473406 KCNMB2Q9Y691 235 aa8.61□□□□□ -1.03
RABGGTB-209ENST00000473406 WASF2Q9Y6W5 498 aa8.61□□□□□ -1.03
RABGGTB-209ENST00000473406 ENPP3O14638 875 aa8.6□□□□□ -1.03
RABGGTB-209ENST00000473406 EREGO14944 169 aa8.6□□□□□ -1.03
RABGGTB-209ENST00000473406 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
RABGGTB-209ENST00000473406 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
RABGGTB-209ENST00000473406 ALDH1A1P00352 501 aa8.6□□□□□ -1.03
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RABGGTB-209ENST00000473406 GRIP2Q9C0E4 1043 aa8.6□□□□□ -1.03
RABGGTB-209ENST00000473406 CHRDQ9H2X0 955 aa8.6□□□□□ -1.03
RABGGTB-209ENST00000473406 STRIP2Q9ULQ0 834 aa8.6□□□□□ -1.03
RABGGTB-209ENST00000473406 EFR3BQ9Y2G0 817 aa8.6□□□□□ -1.03
RABGGTB-209ENST00000473406 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
RABGGTB-209ENST00000473406 BICDL1Q6ZP65 573 aa8.59□□□□□ -1.03
RABGGTB-209ENST00000473406 ANKS3Q6ZW76 656 aa8.59□□□□□ -1.03
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RABGGTB-209ENST00000473406 F6X3S4 739 aa8.58□□□□□ -1.04
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RABGGTB-209ENST00000473406 ETFBP38117 255 aa8.58□□□□□ -1.04
RABGGTB-209ENST00000473406 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
RABGGTB-209ENST00000473406 ANAPC15P60006 121 aa8.58□□□□□ -1.04
RABGGTB-209ENST00000473406 C1orf127Q8N9H9 656 aa8.58□□□□□ -1.04
RABGGTB-209ENST00000473406 C3orf58Q8NDZ4 430 aa8.58□□□□□ -1.04
RABGGTB-209ENST00000473406 GINM1Q9NU53 330 aa8.58□□□□□ -1.04
RABGGTB-209ENST00000473406 PPP4R2Q9NY27 417 aa8.58□□□□□ -1.04
RABGGTB-209ENST00000473406 TRAK1Q9UPV9 953 aa8.58□□□□□ -1.04
RABGGTB-209ENST00000473406 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
RABGGTB-209ENST00000473406 MRVI1Q9Y6F6 885 aa8.58□□□□□ -1.04
RABGGTB-209ENST00000473406 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
RABGGTB-209ENST00000473406 TMEM74Q96NL1 305 aa8.57□□□□□ -1.04
RABGGTB-209ENST00000473406 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
RABGGTB-209ENST00000473406 ZFAND3Q9H8U3 227 aa8.57□□□□□ -1.04
RABGGTB-209ENST00000473406 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
RABGGTB-209ENST00000473406 CNTN3Q9P232 1028 aa8.57□□□□□ -1.04
RABGGTB-209ENST00000473406 EPB42P16452 691 aa8.56□□□□□ -1.04
RABGGTB-209ENST00000473406 SOX9P48436 509 aa8.56□□□□□ -1.04
RABGGTB-209ENST00000473406 RAB33AQ14088 237 aa8.56□□□□□ -1.04
RABGGTB-209ENST00000473406 KIAA0319Q5VV43 1072 aa8.56□□□□□ -1.04
RABGGTB-209ENST00000473406 GLIS3Q8NEA6 775 aa8.56□□□□□ -1.04
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
RABGGTB-209ENST00000473406 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
RABGGTB-209ENST00000473406 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
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RABGGTB-209ENST00000473406 EHD4Q9H223 541 aa8.56□□□□□ -1.04
RABGGTB-209ENST00000473406 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
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RABGGTB-209ENST00000473406 XYLBO75191 536 aa8.55□□□□□ -1.04
RABGGTB-209ENST00000473406 RLBP1P12271 317 aa8.55□□□□□ -1.04
RABGGTB-209ENST00000473406 PHKA2P46019 1235 aa8.55□□□□□ -1.04
RABGGTB-209ENST00000473406 VEGFBP49765 207 aa8.55□□□□□ -1.04
RABGGTB-209ENST00000473406 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
RABGGTB-209ENST00000473406 WDR4P57081 412 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
RABGGTB-209ENST00000473406 MAP3K10Q02779 954 aa8.55□□□□□ -1.04
RABGGTB-209ENST00000473406 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
RABGGTB-209ENST00000473406 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa8.55□□□□□ -1.04
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