RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470201.5

RABGGTB-207, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 848 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-207ENST00000470201 DRC1Q96MC2 740 aa7.31□□□□□ -1.24
RABGGTB-207ENST00000470201 C12orf49Q9H741 205 aa7.31□□□□□ -1.24
RABGGTB-207ENST00000470201 NLRP2Q9NX02 1062 aa7.31□□□□□ -1.24
RABGGTB-207ENST00000470201 FIGNL2A6NMB9 653 aa7.3□□□□□ -1.24
RABGGTB-207ENST00000470201 F11P03951 625 aa7.3□□□□□ -1.24
RABGGTB-207ENST00000470201 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
RABGGTB-207ENST00000470201 TREML4Q6UXN2 200 aa7.3□□□□□ -1.24
RABGGTB-207ENST00000470201 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa7.3□□□□□ -1.24
RABGGTB-207ENST00000470201 TGIF2Q9GZN2 237 aa7.3□□□□□ -1.24
RABGGTB-207ENST00000470201 RUBCNLQ9H714 662 aa7.3□□□□□ -1.24
RABGGTB-207ENST00000470201 GPAMQ9HCL2 828 aa7.3□□□□□ -1.24
RABGGTB-207ENST00000470201 NPHS2Q9NP85 383 aa7.3□□□□□ -1.24
RABGGTB-207ENST00000470201 BRD7Q9NPI1 651 aa7.3□□□□□ -1.24
RABGGTB-207ENST00000470201 IRS1P35568 1242 aa7.29□□□□□ -1.24
RABGGTB-207ENST00000470201 LBRQ14739 615 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
RABGGTB-207ENST00000470201 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP7.29□□□□□ -1.24
RABGGTB-207ENST00000470201 PI16Q6UXB8 463 aa7.29□□□□□ -1.24
RABGGTB-207ENST00000470201 NLRP13Q86W25 1043 aa7.29□□□□□ -1.24
RABGGTB-207ENST00000470201 ZFP42Q96MM3 310 aa7.29□□□□□ -1.24
RABGGTB-207ENST00000470201 CHRDQ9H2X0 955 aa7.29□□□□□ -1.24
RABGGTB-207ENST00000470201 SENP2Q9HC62 589 aa7.29□□□□□ -1.24
RABGGTB-207ENST00000470201 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
RABGGTB-207ENST00000470201 DNMT3LQ9UJW3 386 aa7.29□□□□□ -1.24
RABGGTB-207ENST00000470201 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
RABGGTB-207ENST00000470201 KCNQ4P56696 695 aa7.28□□□□□ -1.24
RABGGTB-207ENST00000470201 EFHC2Q5JST6 749 aa7.28□□□□□ -1.24
RABGGTB-207ENST00000470201 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
RABGGTB-207ENST00000470201 GALNT12Q8IXK2 581 aa7.28□□□□□ -1.24
RABGGTB-207ENST00000470201 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
RABGGTB-207ENST00000470201 PMEPA1Q969W9 287 aa7.28□□□□□ -1.24
RABGGTB-207ENST00000470201 TRIM47Q96LD4 638 aa7.28□□□□□ -1.24
RABGGTB-207ENST00000470201 OSBPL7Q9BZF2 842 aa7.28□□□□□ -1.24
RABGGTB-207ENST00000470201 CCSER2Q9H7U1 834 aa7.28□□□□□ -1.24
RABGGTB-207ENST00000470201 FAM8A1Q9UBU6 413 aa7.28□□□□□ -1.24
RABGGTB-207ENST00000470201 FAM157BP0CG42 384 aa7.27□□□□□ -1.25
RABGGTB-207ENST00000470201 VEGFBP49765 207 aa7.27□□□□□ -1.25
RABGGTB-207ENST00000470201 FIGNL1Q6PIW4 674 aa7.27□□□□□ -1.25
RABGGTB-207ENST00000470201 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
RABGGTB-207ENST00000470201 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa7.27□□□□□ -1.25
RABGGTB-207ENST00000470201 EREGO14944 169 aa7.26□□□□□ -1.25
RABGGTB-207ENST00000470201 WFS1O76024 890 aa7.26□□□□□ -1.25
RABGGTB-207ENST00000470201 C1orf127Q8N9H9 656 aa7.26□□□□□ -1.25
RABGGTB-207ENST00000470201 KIFC2Q96AC6 838 aa7.26□□□□□ -1.25
RABGGTB-207ENST00000470201 TINF2Q9BSI4 451 aa7.26□□□□□ -1.25
RABGGTB-207ENST00000470201 CNTN3Q9P232 1028 aa7.26□□□□□ -1.25
RABGGTB-207ENST00000470201 KCNH4Q9UQ05 1017 aa7.26□□□□□ -1.25
RABGGTB-207ENST00000470201 USP31Q70CQ4 1352 aa7.25□□□□□ -1.25
RABGGTB-207ENST00000470201 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa7.25□□□□□ -1.25
RABGGTB-207ENST00000470201 EFSO43281 561 aa7.25□□□□□ -1.25
RABGGTB-207ENST00000470201 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
RABGGTB-207ENST00000470201 USP17L7P0C7H9 530 aa7.25□□□□□ -1.25
RABGGTB-207ENST00000470201 CES1P23141 567 aa7.25□□□□□ -1.25
RABGGTB-207ENST00000470201 ST13P50502 369 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
RABGGTB-207ENST00000470201 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
RABGGTB-207ENST00000470201 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
RABGGTB-207ENST00000470201 HS2ST1Q7LGA3 356 aa7.25□□□□□ -1.25
RABGGTB-207ENST00000470201 UBXN4Q92575 508 aa7.25□□□□□ -1.25
RABGGTB-207ENST00000470201 BCO2Q9BYV7 579 aa7.25□□□□□ -1.25
RABGGTB-207ENST00000470201 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
RABGGTB-207ENST00000470201 SUV39H2Q9H5I1 410 aa7.25□□□□□ -1.25
RABGGTB-207ENST00000470201 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
RABGGTB-207ENST00000470201 MAN1A2O60476 641 aa7.24□□□□□ -1.25
RABGGTB-207ENST00000470201 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
RABGGTB-207ENST00000470201 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
RABGGTB-207ENST00000470201 LAMC2Q13753 1193 aa7.24□□□□□ -1.25
RABGGTB-207ENST00000470201 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
RABGGTB-207ENST00000470201 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
RABGGTB-207ENST00000470201 EDN3P14138 238 aa7.23□□□□□ -1.25
RABGGTB-207ENST00000470201 CCINQ13939 588 aa7.23□□□□□ -1.25
RABGGTB-207ENST00000470201 GRM2Q14416 872 aa7.23□□□□□ -1.25
RABGGTB-207ENST00000470201 MEI1Q5TIA1 1274 aa7.23□□□□□ -1.25
RABGGTB-207ENST00000470201 NXPE4Q6UWF7 544 aa7.23□□□□□ -1.25
RABGGTB-207ENST00000470201 SLC43A3Q8NBI5 491 aa7.23□□□□□ -1.25
RABGGTB-207ENST00000470201 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
RABGGTB-207ENST00000470201 TRAK1Q9UPV9 953 aa7.23□□□□□ -1.25
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RABGGTB-207ENST00000470201 PHF20L1A8MW92 1017 aa7.22□□□□□ -1.25
RABGGTB-207ENST00000470201 THBS1P07996 1170 aa7.22□□□□□ -1.25
RABGGTB-207ENST00000470201 GSTT1P30711 240 aa7.22□□□□□ -1.25
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RABGGTB-207ENST00000470201 KIAA0319Q5VV43 1072 aa7.22□□□□□ -1.25
RABGGTB-207ENST00000470201 USP48Q86UV5 1035 aa7.22□□□□□ -1.25
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RABGGTB-207ENST00000470201 OR13H1Q8NG92 308 aa7.22□□□□□ -1.25
RABGGTB-207ENST00000470201 GSX2Q9BZM3 304 aa7.22□□□□□ -1.25
RABGGTB-207ENST00000470201 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
RABGGTB-207ENST00000470201 ACBD3Q9H3P7 528 aa7.22□□□□□ -1.25
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RABGGTB-207ENST00000470201 H7C1W4 665 aa7.21□□□□□ -1.26
RABGGTB-207ENST00000470201 TERTO14746 1132 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
RABGGTB-207ENST00000470201 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
RABGGTB-207ENST00000470201 SASH3O75995 380 aa7.21□□□□□ -1.26
RABGGTB-207ENST00000470201 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
RABGGTB-207ENST00000470201 RARAP10276 462 aa7.21□□□□□ -1.26
RABGGTB-207ENST00000470201 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
RABGGTB-207ENST00000470201 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
RABGGTB-207ENST00000470201 ZNF394Q53GI3 561 aa7.21□□□□□ -1.26
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