RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453216.1

TRAM2-AS1-201, Transcript of TRAM2 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene TRAM2-AS1, Length 664 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TMC4Q7Z404 712 aa33.88■■■■□ 3.01
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SCNN1DP51172 638 aa33.87■■■■□ 3.01
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CCDC184Q52MB2 194 aa33.87■■■■□ 3.01
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 C8orf58Q8NAV2 365 aa33.87■■■■□ 3.01
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP33.87■■■■□ 3.01
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP33.87■■■■□ 3.01
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNRF3Q9ULT6 936 aa33.86■■■■□ 3.01
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TAF1P21675 1872 aa33.86■■■■□ 3.01
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LTBP1Q14766 1721 aa33.85■■■■□ 3.01
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP33.85■■■■□ 3.01
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP33.85■■■■□ 3.01
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CNTROBQ8N137 903 aa33.85■■■■□ 3.01
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP33.84■■■■□ 3.01
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 EPS15P42566 896 aa33.84■■■■□ 3.01
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CHMP4AQ9BY43 222 aa33.84■■■■□ 3.01
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TMEM88BA6NKF7 163 aa33.83■■■■□ 3.01
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KIAA2012Q0VF49 1180 aa33.83■■■■□ 3.01
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP33.82■■■■□ 3
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MYD88Q99836 296 aa33.8■■■■□ 3
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP33.79■■■■□ 3
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP33.77■■■■□ 3
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CCDC27Q2M243 656 aa33.77■■■■□ 3
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CIAPIN1Q6FI81 312 aa33.77■■■■□ 3
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TSPYL6Q8N831 410 aa33.77■■■■□ 3
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CCDC191Q8NCU4 936 aa33.76■■■□□ 2.99
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP33.76■■■□□ 2.99
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP33.76■■■□□ 2.99
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TNIP1Q15025 636 aa33.75■■■□□ 2.99
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP33.75■■■□□ 2.99
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RAD17O75943 681 aa33.74■■■□□ 2.99
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP33.74■■■□□ 2.99
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 WWC1Q8IX03 1113 aa33.74■■■□□ 2.99
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP33.74■■■□□ 2.99
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP33.73■■■□□ 2.99
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 COL4A1P02462 1669 aa33.72■■■□□ 2.99
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP33.72■■■□□ 2.99
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RPS8P62241 208 aaKnown RBP33.72■■■□□ 2.99
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 WASHC4Q2M389 1173 aa33.72■■■□□ 2.99
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MRS2Q9HD23 443 aa33.72■■■□□ 2.99
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GPSM2P81274 684 aa33.71■■■□□ 2.99
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 BCL2L13Q9BXK5 485 aa33.71■■■□□ 2.99
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CDHR2Q9BYE9 1310 aa33.71■■■□□ 2.99
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 C6orf229H3BNL8 230 aa33.7■■■□□ 2.99
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 VEGFBP49765 207 aa33.7■■■□□ 2.99
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 STK31Q9BXU1 1019 aa33.7■■■□□ 2.99
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa33.7■■■□□ 2.99
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 YDJCA8MPS7 323 aa33.69■■■□□ 2.98
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ANP32CO43423 234 aa33.69■■■□□ 2.98
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP33.68■■■□□ 2.98
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PDE8AO60658 829 aa33.68■■■□□ 2.98
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CCDC152Q4G0S7 254 aa33.68■■■□□ 2.98
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KSR2Q6VAB6 950 aa33.68■■■□□ 2.98
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP33.68■■■□□ 2.98
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SEC31BQ9NQW1 1179 aa33.68■■■□□ 2.98
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 POLLQ9UGP5 575 aa33.68■■■□□ 2.98
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IL16Q14005 1332 aa33.68■■■□□ 2.98
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RASSF10A6NK89 507 aa33.67■■■□□ 2.98
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RIMBP2O15034 1052 aa33.67■■■□□ 2.98
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DEFB115Q30KQ5 88 aa33.67■■■□□ 2.98
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP33.67■■■□□ 2.98
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP33.67■■■□□ 2.98
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 EYA3Q99504 573 aa33.67■■■□□ 2.98
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP33.67■■■□□ 2.98
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PI4KAP2A4QPH2 592 aa33.66■■■□□ 2.98
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa33.66■■■□□ 2.98
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP33.65■■■□□ 2.98
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DBNDD1Q9H9R9 158 aa33.65■■■□□ 2.98
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TBC1D16Q8TBP0 767 aa33.64■■■□□ 2.98
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TRAF5O00463 557 aa33.63■■■□□ 2.97
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NEXNQ0ZGT2 675 aa33.63■■■□□ 2.97
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TNS4Q8IZW8 715 aa33.63■■■□□ 2.97
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP33.63■■■□□ 2.97
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP33.62■■■□□ 2.97
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PODXL2Q9NZ53 605 aa33.62■■■□□ 2.97
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 H7C1D1 291 aa33.61■■■□□ 2.97
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IGKV5-2P06315 115 aa33.61■■■□□ 2.97
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP33.61■■■□□ 2.97
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa33.61■■■□□ 2.97
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PSMD14O00487 310 aa33.6■■■□□ 2.97
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ECE2O60344 883 aa33.6■■■□□ 2.97
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SLC4A2P04920 1241 aa33.6■■■□□ 2.97
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DOK7Q18PE1 504 aa33.6■■■□□ 2.97
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP33.6■■■□□ 2.97
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PGAP2Q9UHJ9 254 aa33.6■■■□□ 2.97
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP33.6■■■□□ 2.97
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TRPM7Q96QT4 1865 aa33.6■■■□□ 2.97
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP33.59■■■□□ 2.97
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