RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000445150.3

SRP19-202, Transcript of signal recognition particle 19, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SRP19, Length 833 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP19-202ENST00000445150 RTKN2Q8IZC4 609 aa22.17■■□□□ 1.14
SRP19-202ENST00000445150 RCAN3Q9UKA8 241 aa22.17■■□□□ 1.14
SRP19-202ENST00000445150 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
SRP19-202ENST00000445150 ABCC4O15439 1325 aa22.16■■□□□ 1.14
SRP19-202ENST00000445150 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
SRP19-202ENST00000445150 CASP7P55210 303 aa22.16■■□□□ 1.14
SRP19-202ENST00000445150 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
SRP19-202ENST00000445150 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
SRP19-202ENST00000445150 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
SRP19-202ENST00000445150 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
SRP19-202ENST00000445150 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa22.15■■□□□ 1.14
SRP19-202ENST00000445150 UTYO14607 1347 aa22.14■■□□□ 1.14
SRP19-202ENST00000445150 RPS8P62241 208 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
SRP19-202ENST00000445150 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
SRP19-202ENST00000445150 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
SRP19-202ENST00000445150 TTLL11Q8NHH1 800 aa22.14■■□□□ 1.13
SRP19-202ENST00000445150 C7orf43Q8WVR3 580 aa22.14■■□□□ 1.13
SRP19-202ENST00000445150 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa22.14■■□□□ 1.13
SRP19-202ENST00000445150 TRIM27P14373 513 aa22.13■■□□□ 1.13
SRP19-202ENST00000445150 SP8Q8IXZ3 490 aa22.13■■□□□ 1.13
SRP19-202ENST00000445150 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
SRP19-202ENST00000445150 RTL9Q8NET4 1388 aa22.12■■□□□ 1.13
SRP19-202ENST00000445150 CSF1RP07333 972 aa22.12■■□□□ 1.13
SRP19-202ENST00000445150 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa22.12■■□□□ 1.13
SRP19-202ENST00000445150 LAMB2P55268 1798 aa22.12■■□□□ 1.13
SRP19-202ENST00000445150 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
SRP19-202ENST00000445150 LTBP3Q9NS15 1303 aa22.11■■□□□ 1.13
SRP19-202ENST00000445150 TAOK3Q9H2K8 898 aa22.11■■□□□ 1.13
SRP19-202ENST00000445150 GNAI3P08754 354 aa22.1■■□□□ 1.13
SRP19-202ENST00000445150 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
SRP19-202ENST00000445150 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
SRP19-202ENST00000445150 SUPT20HQ8NEM7 779 aa22.1■■□□□ 1.13
SRP19-202ENST00000445150 USP44Q9H0E7 712 aa22.1■■□□□ 1.13
SRP19-202ENST00000445150 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa22.09■■□□□ 1.13
SRP19-202ENST00000445150 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
SRP19-202ENST00000445150 LMNB1P20700 586 aa22.09■■□□□ 1.13
SRP19-202ENST00000445150 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
SRP19-202ENST00000445150 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP22.09■■□□□ 1.13
SRP19-202ENST00000445150 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
SRP19-202ENST00000445150 CLUAP1Q96AJ1 413 aa22.09■■□□□ 1.13
SRP19-202ENST00000445150 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
SRP19-202ENST00000445150 CHMP3Q9Y3E7 222 aa22.09■■□□□ 1.13
SRP19-202ENST00000445150 SLX4Q8IY92 1834 aa22.08■■□□□ 1.13
SRP19-202ENST00000445150 YY1P25490 414 aa22.08■■□□□ 1.13
SRP19-202ENST00000445150 FOXO4P98177 505 aa22.08■■□□□ 1.13
SRP19-202ENST00000445150 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
SRP19-202ENST00000445150 CCDC57Q2TAC2 916 aa22.08■■□□□ 1.13
SRP19-202ENST00000445150 PSMD1Q99460 953 aa22.08■■□□□ 1.13
SRP19-202ENST00000445150 GREM2Q9H772 168 aa22.08■■□□□ 1.13
SRP19-202ENST00000445150 SEC31BQ9NQW1 1179 aa22.08■■□□□ 1.13
SRP19-202ENST00000445150 ITGA6P23229 1130 aa22.07■■□□□ 1.12
SRP19-202ENST00000445150 LMBR1LQ6UX01 489 aa22.07■■□□□ 1.12
SRP19-202ENST00000445150 MPNDQ8N594 471 aa22.07■■□□□ 1.12
SRP19-202ENST00000445150 SUCLG2Q96I99 432 aa22.07■■□□□ 1.12
SRP19-202ENST00000445150 VPS33BQ9H267 617 aa22.07■■□□□ 1.12
SRP19-202ENST00000445150 NFKBIEO00221 500 aa22.06■■□□□ 1.12
SRP19-202ENST00000445150 TAF7LQ5H9L4 462 aa22.06■■□□□ 1.12
SRP19-202ENST00000445150 C9orf131Q5VYM1 1079 aa22.06■■□□□ 1.12
SRP19-202ENST00000445150 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
SRP19-202ENST00000445150 MPHOSPH8Q99549 860 aa22.06■■□□□ 1.12
SRP19-202ENST00000445150 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
SRP19-202ENST00000445150 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
SRP19-202ENST00000445150 RNF181Q9P0P0 153 aa22.05■■□□□ 1.12
SRP19-202ENST00000445150 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
SRP19-202ENST00000445150 RASSF7Q02833 373 aa22.04■■□□□ 1.12
SRP19-202ENST00000445150 FAM161AQ3B820 660 aa22.04■■□□□ 1.12
SRP19-202ENST00000445150 TMEM57Q8N5G2 664 aa22.04■■□□□ 1.12
SRP19-202ENST00000445150 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
SRP19-202ENST00000445150 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
SRP19-202ENST00000445150 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
SRP19-202ENST00000445150 CHD4Q14839 1912 aa22.02■■□□□ 1.12
SRP19-202ENST00000445150 EPHA10Q5JZY3 1008 aa22.02■■□□□ 1.12
SRP19-202ENST00000445150 ITPRIPQ8IWB1 547 aa22.02■■□□□ 1.12
SRP19-202ENST00000445150 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
SRP19-202ENST00000445150 CACNA1SQ13698 1873 aa22.02■■□□□ 1.12
SRP19-202ENST00000445150 NEFLP07196 543 aa22.01■■□□□ 1.11
SRP19-202ENST00000445150 OLFM4Q6UX06 510 aa22.01■■□□□ 1.11
SRP19-202ENST00000445150 KAZALD1Q96I82 304 aa22.01■■□□□ 1.11
SRP19-202ENST00000445150 EYA3Q99504 573 aa22.01■■□□□ 1.11
SRP19-202ENST00000445150 ANKRD2Q9GZV1 360 aa22.01■■□□□ 1.11
SRP19-202ENST00000445150 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa22.01■■□□□ 1.11
SRP19-202ENST00000445150 MYH3P11055 1940 aa22.01■■□□□ 1.11
SRP19-202ENST00000445150 GNAI2P04899 355 aa22■■□□□ 1.11
SRP19-202ENST00000445150 IARSP41252 1262 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
SRP19-202ENST00000445150 PDE3AQ14432 1141 aa22■■□□□ 1.11
SRP19-202ENST00000445150 JDP2Q8WYK2 163 aa22■■□□□ 1.11
SRP19-202ENST00000445150 MEIS3Q99687 375 aa22■■□□□ 1.11
SRP19-202ENST00000445150 PODXL2Q9NZ53 605 aa22■■□□□ 1.11
SRP19-202ENST00000445150 TNNQ9UQP3 1299 aa22■■□□□ 1.11
SRP19-202ENST00000445150 XDHP47989 1333 aa21.99■■□□□ 1.11
SRP19-202ENST00000445150 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa21.98■■□□□ 1.11
SRP19-202ENST00000445150 C6orf229H3BNL8 230 aa21.98■■□□□ 1.11
SRP19-202ENST00000445150 ATP2B4P23634 1241 aa21.98■■□□□ 1.11
SRP19-202ENST00000445150 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa21.98■■□□□ 1.11
SRP19-202ENST00000445150 ANKRD44Q8N8A2 993 aa21.98■■□□□ 1.11
SRP19-202ENST00000445150 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
SRP19-202ENST00000445150 CNNM1Q9NRU3 951 aa21.98■■□□□ 1.11
SRP19-202ENST00000445150 GGA1Q9UJY5 639 aa21.98■■□□□ 1.11
SRP19-202ENST00000445150 MINPP1Q9UNW1 487 aa21.98■■□□□ 1.11
SRP19-202ENST00000445150 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.6 ms