RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000440239.5

CHTF18-204, Transcript of chromosome transmission fidelity factor 18, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CHTF18, Length 1,801 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTF18-204ENST00000440239 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP29.01■■■□□ 2.23
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CHTF18-204ENST00000440239 CHMP3Q9Y3E7 222 aa29.01■■■□□ 2.23
CHTF18-204ENST00000440239 GPR162Q16538 588 aa29■■■□□ 2.23
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CHTF18-204ENST00000440239 MPHOSPH8Q99549 860 aa28.83■■■□□ 2.21
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CHTF18-204ENST00000440239 CCDC93Q567U6 631 aa28.8■■■□□ 2.2
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CHTF18-204ENST00000440239 SRGAP3O43295 1099 aa28.79■■■□□ 2.2
CHTF18-204ENST00000440239 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP28.79■■■□□ 2.2
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CHTF18-204ENST00000440239 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa28.78■■■□□ 2.2
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CHTF18-204ENST00000440239 CNNM1Q9NRU3 951 aa28.77■■■□□ 2.2
CHTF18-204ENST00000440239 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP28.77■■■□□ 2.2
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CHTF18-204ENST00000440239 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa28.76■■■□□ 2.19
CHTF18-204ENST00000440239 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa28.74■■■□□ 2.19
CHTF18-204ENST00000440239 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP28.74■■■□□ 2.19
CHTF18-204ENST00000440239 MPNDQ8N594 471 aa28.74■■■□□ 2.19
CHTF18-204ENST00000440239 SIL1Q9H173 461 aa28.74■■■□□ 2.19
CHTF18-204ENST00000440239 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP28.73■■■□□ 2.19
CHTF18-204ENST00000440239 TAOK3Q9H2K8 898 aa28.73■■■□□ 2.19
CHTF18-204ENST00000440239 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa28.73■■■□□ 2.19
CHTF18-204ENST00000440239 NFKBIEO00221 500 aa28.73■■■□□ 2.19
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