RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439695.1

RPSAP41-201, Transcript of ribosomal protein SA pseudogene 41, humanhuman

BASIC

Gene RPSAP41, Length 860 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPSAP41-201ENST00000439695 CCSER2Q9H7U1 834 aa11.51□□□□□ -0.57
RPSAP41-201ENST00000439695 DYRK1BQ9Y463 629 aa11.51□□□□□ -0.57
RPSAP41-201ENST00000439695 WIPF1O43516 503 aa11.5□□□□□ -0.57
RPSAP41-201ENST00000439695 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP11.5□□□□□ -0.57
RPSAP41-201ENST00000439695 UBXN4Q92575 508 aa11.5□□□□□ -0.57
RPSAP41-201ENST00000439695 PMEPA1Q969W9 287 aa11.5□□□□□ -0.57
RPSAP41-201ENST00000439695 OSBPL7Q9BZF2 842 aa11.5□□□□□ -0.57
RPSAP41-201ENST00000439695 LOC100996750A0A140TA64 210 aa11.49□□□□□ -0.57
RPSAP41-201ENST00000439695 FIGNL2A6NMB9 653 aa11.49□□□□□ -0.57
RPSAP41-201ENST00000439695 F11P03951 625 aa11.49□□□□□ -0.57
RPSAP41-201ENST00000439695 PI16Q6UXB8 463 aa11.49□□□□□ -0.57
RPSAP41-201ENST00000439695 NLRP13Q86W25 1043 aa11.49□□□□□ -0.57
RPSAP41-201ENST00000439695 PGBD3Q8N328 593 aa11.49□□□□□ -0.57
RPSAP41-201ENST00000439695 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa11.49□□□□□ -0.57
RPSAP41-201ENST00000439695 CHRDQ9H2X0 955 aa11.49□□□□□ -0.57
RPSAP41-201ENST00000439695 BRD7Q9NPI1 651 aa11.49□□□□□ -0.57
RPSAP41-201ENST00000439695 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
RPSAP41-201ENST00000439695 FAM8A1Q9UBU6 413 aa11.49□□□□□ -0.57
RPSAP41-201ENST00000439695 IRS1P35568 1242 aa11.48□□□□□ -0.57
RPSAP41-201ENST00000439695 GALNT12Q8IXK2 581 aa11.48□□□□□ -0.57
RPSAP41-201ENST00000439695 SLC43A3Q8NBI5 491 aa11.48□□□□□ -0.57
RPSAP41-201ENST00000439695 TINF2Q9BSI4 451 aa11.48□□□□□ -0.57
RPSAP41-201ENST00000439695 RUBCNLQ9H714 662 aa11.48□□□□□ -0.57
RPSAP41-201ENST00000439695 GPAMQ9HCL2 828 aa11.48□□□□□ -0.57
RPSAP41-201ENST00000439695 NPHS2Q9NP85 383 aa11.48□□□□□ -0.57
RPSAP41-201ENST00000439695 USP31Q70CQ4 1352 aa11.48□□□□□ -0.57
RPSAP41-201ENST00000439695 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP11.47□□□□□ -0.57
RPSAP41-201ENST00000439695 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP11.47□□□□□ -0.57
RPSAP41-201ENST00000439695 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP11.47□□□□□ -0.57
RPSAP41-201ENST00000439695 LBRQ14739 615 aaKnown RBP11.47□□□□□ -0.57
RPSAP41-201ENST00000439695 CTC1Q2NKJ3 1217 aa11.47□□□□□ -0.57
RPSAP41-201ENST00000439695 TRIM46Q7Z4K8 759 aa11.47□□□□□ -0.57
RPSAP41-201ENST00000439695 BMP1P13497 986 aa11.46□□□□□ -0.57
RPSAP41-201ENST00000439695 KCNQ4P56696 695 aa11.46□□□□□ -0.57
RPSAP41-201ENST00000439695 C1orf127Q8N9H9 656 aa11.46□□□□□ -0.57
RPSAP41-201ENST00000439695 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP11.46□□□□□ -0.57
RPSAP41-201ENST00000439695 EREGO14944 169 aa11.45□□□□□ -0.58
RPSAP41-201ENST00000439695 ST13P50502 369 aaKnown RBP11.45□□□□□ -0.58
RPSAP41-201ENST00000439695 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP11.45□□□□□ -0.58
RPSAP41-201ENST00000439695 EFHC2Q5JST6 749 aa11.45□□□□□ -0.58
RPSAP41-201ENST00000439695 CNTN3Q9P232 1028 aa11.45□□□□□ -0.58
RPSAP41-201ENST00000439695 VEGFBP49765 207 aa11.44□□□□□ -0.58
RPSAP41-201ENST00000439695 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP11.44□□□□□ -0.58
RPSAP41-201ENST00000439695 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP11.44□□□□□ -0.58
RPSAP41-201ENST00000439695 HS2ST1Q7LGA3 356 aa11.44□□□□□ -0.58
RPSAP41-201ENST00000439695 BCO2Q9BYV7 579 aa11.44□□□□□ -0.58
RPSAP41-201ENST00000439695 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP11.44□□□□□ -0.58
RPSAP41-201ENST00000439695 SUV39H2Q9H5I1 410 aa11.44□□□□□ -0.58
RPSAP41-201ENST00000439695 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP11.43□□□□□ -0.58
RPSAP41-201ENST00000439695 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP11.43□□□□□ -0.58
RPSAP41-201ENST00000439695 USP17L7P0C7H9 530 aa11.43□□□□□ -0.58
RPSAP41-201ENST00000439695 CES1P23141 567 aa11.43□□□□□ -0.58
RPSAP41-201ENST00000439695 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP11.43□□□□□ -0.58
RPSAP41-201ENST00000439695 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP11.43□□□□□ -0.58
RPSAP41-201ENST00000439695 ZNF654Q8IZM8 581 aa11.43□□□□□ -0.58
RPSAP41-201ENST00000439695 CRIPAKQ8N1N5 446 aa11.43□□□□□ -0.58
RPSAP41-201ENST00000439695 ZFP42Q96MM3 310 aa11.43□□□□□ -0.58
RPSAP41-201ENST00000439695 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP11.43□□□□□ -0.58
RPSAP41-201ENST00000439695 ACBD3Q9H3P7 528 aa11.43□□□□□ -0.58
RPSAP41-201ENST00000439695 CAPN10Q9HC96 672 aa11.43□□□□□ -0.58
RPSAP41-201ENST00000439695 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP11.43□□□□□ -0.58
RPSAP41-201ENST00000439695 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP11.43□□□□□ -0.58
RPSAP41-201ENST00000439695 DNMT3LQ9UJW3 386 aa11.43□□□□□ -0.58
RPSAP41-201ENST00000439695 KCNH4Q9UQ05 1017 aa11.43□□□□□ -0.58
RPSAP41-201ENST00000439695 FAM157BP0CG42 384 aa11.42□□□□□ -0.58
RPSAP41-201ENST00000439695 FIGNL1Q6PIW4 674 aa11.42□□□□□ -0.58
RPSAP41-201ENST00000439695 NXPE4Q6UWF7 544 aa11.42□□□□□ -0.58
RPSAP41-201ENST00000439695 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP11.42□□□□□ -0.58
RPSAP41-201ENST00000439695 MEI1Q5TIA1 1274 aa11.41□□□□□ -0.58
RPSAP41-201ENST00000439695 KIAA0319Q5VV43 1072 aa11.41□□□□□ -0.58
RPSAP41-201ENST00000439695 USP48Q86UV5 1035 aa11.41□□□□□ -0.58
RPSAP41-201ENST00000439695 DACH1Q9UI36 760 aa11.41□□□□□ -0.58
RPSAP41-201ENST00000439695 ZNF394Q53GI3 561 aa11.4□□□□□ -0.58
RPSAP41-201ENST00000439695 TANGO6Q9C0B7 1094 aa11.4□□□□□ -0.58
RPSAP41-201ENST00000439695 GGT7Q9UJ14 662 aa11.4□□□□□ -0.58
RPSAP41-201ENST00000439695 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa11.39□□□□□ -0.59
RPSAP41-201ENST00000439695 AXIN1O15169 862 aa11.39□□□□□ -0.59
RPSAP41-201ENST00000439695 EFSO43281 561 aa11.39□□□□□ -0.59
RPSAP41-201ENST00000439695 EDN3P14138 238 aa11.39□□□□□ -0.59
RPSAP41-201ENST00000439695 CCINQ13939 588 aa11.39□□□□□ -0.59
RPSAP41-201ENST00000439695 GRM2Q14416 872 aa11.39□□□□□ -0.59
RPSAP41-201ENST00000439695 PPP4R2Q9NY27 417 aa11.39□□□□□ -0.59
RPSAP41-201ENST00000439695 TRAK1Q9UPV9 953 aa11.39□□□□□ -0.59
RPSAP41-201ENST00000439695 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP11.38□□□□□ -0.59
RPSAP41-201ENST00000439695 GSTT1P30711 240 aa11.38□□□□□ -0.59
RPSAP41-201ENST00000439695 RACK1P63244 317 aaKnown RBP11.38□□□□□ -0.59
RPSAP41-201ENST00000439695 LAMC2Q13753 1193 aa11.38□□□□□ -0.59
RPSAP41-201ENST00000439695 GMLQ99445 158 aa11.38□□□□□ -0.59
RPSAP41-201ENST00000439695 GSX2Q9BZM3 304 aa11.38□□□□□ -0.59
RPSAP41-201ENST00000439695 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP11.38□□□□□ -0.59
RPSAP41-201ENST00000439695 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa11.38□□□□□ -0.59
RPSAP41-201ENST00000439695 PHF20L1A8MW92 1017 aa11.37□□□□□ -0.59
RPSAP41-201ENST00000439695 SASH3O75995 380 aa11.37□□□□□ -0.59
RPSAP41-201ENST00000439695 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP11.37□□□□□ -0.59
RPSAP41-201ENST00000439695 OR13H1Q8NG92 308 aa11.37□□□□□ -0.59
RPSAP41-201ENST00000439695 EFCC1Q9HA90 598 aa11.37□□□□□ -0.59
RPSAP41-201ENST00000439695 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa11.37□□□□□ -0.59
RPSAP41-201ENST00000439695 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa11.37□□□□□ -0.59
RPSAP41-201ENST00000439695 FAM181BA6NEQ2 426 aa11.36□□□□□ -0.59
RPSAP41-201ENST00000439695 TNNI2P48788 182 aa11.36□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.2 ms