RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426965.1

HOXD-AS2-201, HOXD cluster antisense RNA 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD-AS2, Length 927 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PDE8AO60658 829 aa31.82■■■□□ 2.68
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP31.82■■■□□ 2.68
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP31.81■■■□□ 2.68
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP31.8■■■□□ 2.68
HOXD-AS2-201ENST00000426965 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP31.8■■■□□ 2.68
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CASP7P55210 303 aa31.8■■■□□ 2.68
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ALDH1L2Q3SY69 923 aa31.8■■■□□ 2.68
HOXD-AS2-201ENST00000426965 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa31.8■■■□□ 2.68
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PSMD1Q99460 953 aa31.8■■■□□ 2.68
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TAF1P21675 1872 aa31.8■■■□□ 2.68
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa31.8■■■□□ 2.68
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP31.79■■■□□ 2.68
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SP8Q8IXZ3 490 aa31.79■■■□□ 2.68
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SEC31BQ9NQW1 1179 aa31.79■■■□□ 2.68
HOXD-AS2-201ENST00000426965 GRIPAP1Q4V328 841 aa31.77■■■□□ 2.68
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP31.77■■■□□ 2.68
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TIAM2Q8IVF5 1701 aa31.76■■■□□ 2.67
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CTSWP56202 376 aa31.76■■■□□ 2.67
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CCDC152Q4G0S7 254 aa31.76■■■□□ 2.67
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SMC4Q9NTJ3 1288 aa31.76■■■□□ 2.67
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PTPRCP08575 1304 aa31.75■■■□□ 2.67
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SLC4A10Q6U841 1118 aa31.75■■■□□ 2.67
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TTLL11Q8NHH1 800 aa31.75■■■□□ 2.67
HOXD-AS2-201ENST00000426965 IARSP41252 1262 aaKnown RBP31.74■■■□□ 2.67
HOXD-AS2-201ENST00000426965 NMRK2Q9NPI5 230 aa31.74■■■□□ 2.67
HOXD-AS2-201ENST00000426965 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP31.73■■■□□ 2.67
HOXD-AS2-201ENST00000426965 RPS8P62241 208 aaKnown RBP31.73■■■□□ 2.67
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TMC4Q7Z404 712 aa31.73■■■□□ 2.67
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PLA2G12BQ9BX93 195 aa31.73■■■□□ 2.67
HOXD-AS2-201ENST00000426965 GLTPD2A6NH11 291 aa31.72■■■□□ 2.67
HOXD-AS2-201ENST00000426965 KIF3CO14782 793 aa31.72■■■□□ 2.67
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP31.72■■■□□ 2.67
HOXD-AS2-201ENST00000426965 RARSP54136 660 aaKnown RBP31.71■■■□□ 2.67
HOXD-AS2-201ENST00000426965 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP31.71■■■□□ 2.67
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa31.71■■■□□ 2.67
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ZBED9Q6R2W3 1325 aa31.71■■■□□ 2.67
HOXD-AS2-201ENST00000426965 KDM2BQ8NHM5 1336 aa31.71■■■□□ 2.67
HOXD-AS2-201ENST00000426965 COL4A5P29400 1685 aa31.7■■■□□ 2.67
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ALDH1L1O75891 902 aa31.7■■■□□ 2.67
HOXD-AS2-201ENST00000426965 GREM2Q9H772 168 aa31.7■■■□□ 2.67
HOXD-AS2-201ENST00000426965 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP31.69■■■□□ 2.66
HOXD-AS2-201ENST00000426965 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP31.69■■■□□ 2.66
HOXD-AS2-201ENST00000426965 MPNDQ8N594 471 aa31.69■■■□□ 2.66
HOXD-AS2-201ENST00000426965 LRRC37AA6NMS7 1700 aa31.69■■■□□ 2.66
HOXD-AS2-201ENST00000426965 GRM8O00222 908 aa31.68■■■□□ 2.66
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CSF1RP07333 972 aa31.67■■■□□ 2.66
HOXD-AS2-201ENST00000426965 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP31.67■■■□□ 2.66
HOXD-AS2-201ENST00000426965 RTL9Q8NET4 1388 aa31.67■■■□□ 2.66
HOXD-AS2-201ENST00000426965 FOXO4P98177 505 aa31.66■■■□□ 2.66
HOXD-AS2-201ENST00000426965 RRAGCQ9HB90 399 aa31.66■■■□□ 2.66
HOXD-AS2-201ENST00000426965 DUOX1Q9NRD9 1551 aa31.65■■■□□ 2.66
HOXD-AS2-201ENST00000426965 GPSM2P81274 684 aa31.65■■■□□ 2.66
HOXD-AS2-201ENST00000426965 FZD9O00144 591 aa31.64■■■□□ 2.66
HOXD-AS2-201ENST00000426965 AOC3Q16853 763 aa31.64■■■□□ 2.66
HOXD-AS2-201ENST00000426965 EPHA10Q5JZY3 1008 aa31.64■■■□□ 2.66
HOXD-AS2-201ENST00000426965 DPY19L2Q6NUT2 758 aa31.64■■■□□ 2.66
HOXD-AS2-201ENST00000426965 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP31.64■■■□□ 2.66
HOXD-AS2-201ENST00000426965 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP31.64■■■□□ 2.66
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ZNF541Q9H0D2 1346 aa31.64■■■□□ 2.66
HOXD-AS2-201ENST00000426965 DDNO94850 711 aaPredicted RBP31.63■■■□□ 2.65
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa31.63■■■□□ 2.65
HOXD-AS2-201ENST00000426965 LARGE2Q8N3Y3 721 aa31.63■■■□□ 2.65
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SUPT20HQ8NEM7 779 aa31.63■■■□□ 2.65
HOXD-AS2-201ENST00000426965 MYH3P11055 1940 aa31.63■■■□□ 2.65
HOXD-AS2-201ENST00000426965 POTECB2RU33 542 aa31.62■■■□□ 2.65
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PPIP5K2O43314 1243 aa31.62■■■□□ 2.65
HOXD-AS2-201ENST00000426965 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP31.62■■■□□ 2.65
HOXD-AS2-201ENST00000426965 C1QTNF8P60827 252 aa31.62■■■□□ 2.65
HOXD-AS2-201ENST00000426965 FAM161AQ3B820 660 aa31.62■■■□□ 2.65
HOXD-AS2-201ENST00000426965 JDP2Q8WYK2 163 aa31.62■■■□□ 2.65
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP31.62■■■□□ 2.65
HOXD-AS2-201ENST00000426965 VPS33BQ9H267 617 aa31.62■■■□□ 2.65
HOXD-AS2-201ENST00000426965 UTYO14607 1347 aa31.61■■■□□ 2.65
HOXD-AS2-201ENST00000426965 POLLQ9UGP5 575 aa31.61■■■□□ 2.65
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ITGA6P23229 1130 aa31.6■■■□□ 2.65
HOXD-AS2-201ENST00000426965 KAZALD1Q96I82 304 aa31.6■■■□□ 2.65
HOXD-AS2-201ENST00000426965 LTBP1Q14766 1721 aa31.6■■■□□ 2.65
HOXD-AS2-201ENST00000426965 BCAR3O75815 825 aa31.59■■■□□ 2.65
HOXD-AS2-201ENST00000426965 KIAA2012Q0VF49 1180 aa31.59■■■□□ 2.65
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SUCLG2Q96I99 432 aa31.58■■■□□ 2.65
HOXD-AS2-201ENST00000426965 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP31.58■■■□□ 2.65
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PODXL2Q9NZ53 605 aa31.58■■■□□ 2.65
HOXD-AS2-201ENST00000426965 LMBR1LQ6UX01 489 aa31.57■■■□□ 2.64
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TBC1D16Q8TBP0 767 aa31.57■■■□□ 2.64
HOXD-AS2-201ENST00000426965 WDR90Q96KV7 1748 aa31.57■■■□□ 2.64
HOXD-AS2-201ENST00000426965 NIM1KQ8IY84 436 aa31.56■■■□□ 2.64
HOXD-AS2-201ENST00000426965 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP31.56■■■□□ 2.64
HOXD-AS2-201ENST00000426965 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP31.56■■■□□ 2.64
HOXD-AS2-201ENST00000426965 USP44Q9H0E7 712 aa31.56■■■□□ 2.64
HOXD-AS2-201ENST00000426965 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP31.55■■■□□ 2.64
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa31.55■■■□□ 2.64
HOXD-AS2-201ENST00000426965 MINPP1Q9UNW1 487 aa31.55■■■□□ 2.64
HOXD-AS2-201ENST00000426965 KIF16BQ96L93 1317 aa31.54■■■□□ 2.64
HOXD-AS2-201ENST00000426965 C6orf229H3BNL8 230 aa31.54■■■□□ 2.64
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ARHGAP45Q92619 1136 aa31.54■■■□□ 2.64
HOXD-AS2-201ENST00000426965 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP31.54■■■□□ 2.64
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TOMM70O94826 608 aa31.53■■■□□ 2.64
HOXD-AS2-201ENST00000426965 WASHC4Q2M389 1173 aa31.53■■■□□ 2.64
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa31.52■■■□□ 2.64
HOXD-AS2-201ENST00000426965 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP31.52■■■□□ 2.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.9 ms