RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426921.5

UBXN4-204, Transcript of UBX domain protein 4, humanhuman

TSL 4

Gene UBXN4, Length 568 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4-204ENST00000426921 GOLGA2Q08379 1002 aa26.96■■□□□ 1.91
UBXN4-204ENST00000426921 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP26.96■■□□□ 1.91
UBXN4-204ENST00000426921 C8orf58Q8NAV2 365 aa26.96■■□□□ 1.91
UBXN4-204ENST00000426921 GJA3Q9Y6H8 435 aa26.96■■□□□ 1.91
UBXN4-204ENST00000426921 MPNDQ8N594 471 aa26.95■■□□□ 1.9
UBXN4-204ENST00000426921 CHMP4AQ9BY43 222 aa26.95■■□□□ 1.9
UBXN4-204ENST00000426921 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP26.95■■□□□ 1.9
UBXN4-204ENST00000426921 TAF1P21675 1872 aa26.94■■□□□ 1.9
UBXN4-204ENST00000426921 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP26.94■■□□□ 1.9
UBXN4-204ENST00000426921 KIAA2012Q0VF49 1180 aa26.94■■□□□ 1.9
UBXN4-204ENST00000426921 RIC3Q7Z5B4 369 aa26.94■■□□□ 1.9
UBXN4-204ENST00000426921 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP26.93■■□□□ 1.9
UBXN4-204ENST00000426921 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP26.93■■□□□ 1.9
UBXN4-204ENST00000426921 ZNF428Q96B54 188 aa26.93■■□□□ 1.9
UBXN4-204ENST00000426921 ZNRF3Q9ULT6 936 aa26.93■■□□□ 1.9
UBXN4-204ENST00000426921 CCDC30Q5VVM6 783 aa26.92■■□□□ 1.9
UBXN4-204ENST00000426921 COL4A1P02462 1669 aa26.92■■□□□ 1.9
UBXN4-204ENST00000426921 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP26.91■■□□□ 1.9
UBXN4-204ENST00000426921 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP26.91■■□□□ 1.9
UBXN4-204ENST00000426921 CLEC11AQ9Y240 323 aa26.91■■□□□ 1.9
UBXN4-204ENST00000426921 CNTNAP1P78357 1384 aa26.9■■□□□ 1.9
UBXN4-204ENST00000426921 EPS15P42566 896 aa26.9■■□□□ 1.9
UBXN4-204ENST00000426921 CXCL9Q07325 125 aa26.9■■□□□ 1.9
UBXN4-204ENST00000426921 TSPYL6Q8N831 410 aa26.9■■□□□ 1.9
UBXN4-204ENST00000426921 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP26.9■■□□□ 1.9
UBXN4-204ENST00000426921 TMEM88BA6NKF7 163 aa26.89■■□□□ 1.9
UBXN4-204ENST00000426921 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP26.89■■□□□ 1.9
UBXN4-204ENST00000426921 WWC1Q8IX03 1113 aa26.89■■□□□ 1.9
UBXN4-204ENST00000426921 CNTROBQ8N137 903 aa26.89■■□□□ 1.9
UBXN4-204ENST00000426921 CCDC191Q8NCU4 936 aa26.89■■□□□ 1.9
UBXN4-204ENST00000426921 CDHR2Q9BYE9 1310 aa26.89■■□□□ 1.89
UBXN4-204ENST00000426921 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP26.88■■□□□ 1.89
UBXN4-204ENST00000426921 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP26.88■■□□□ 1.89
UBXN4-204ENST00000426921 MYD88Q99836 296 aa26.88■■□□□ 1.89
UBXN4-204ENST00000426921 IL16Q14005 1332 aa26.88■■□□□ 1.89
UBXN4-204ENST00000426921 DDX58O95786 925 aaKnown RBP26.87■■□□□ 1.89
UBXN4-204ENST00000426921 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP26.87■■□□□ 1.89
UBXN4-204ENST00000426921 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP26.87■■□□□ 1.89
UBXN4-204ENST00000426921 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP26.87■■□□□ 1.89
UBXN4-204ENST00000426921 GPRC5DQ9NZD1 345 aa26.87■■□□□ 1.89
UBXN4-204ENST00000426921 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP26.87■■□□□ 1.89
UBXN4-204ENST00000426921 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP26.86■■□□□ 1.89
UBXN4-204ENST00000426921 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP26.86■■□□□ 1.89
UBXN4-204ENST00000426921 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP26.86■■□□□ 1.89
UBXN4-204ENST00000426921 CIAPIN1Q6FI81 312 aa26.85■■□□□ 1.89
UBXN4-204ENST00000426921 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP26.85■■□□□ 1.89
UBXN4-204ENST00000426921 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP26.85■■□□□ 1.89
UBXN4-204ENST00000426921 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP26.84■■□□□ 1.89
UBXN4-204ENST00000426921 MRS2Q9HD23 443 aa26.84■■□□□ 1.89
UBXN4-204ENST00000426921 YDJCA8MPS7 323 aa26.83■■□□□ 1.89
UBXN4-204ENST00000426921 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP26.82■■□□□ 1.88
UBXN4-204ENST00000426921 RPS8P62241 208 aaKnown RBP26.82■■□□□ 1.88
UBXN4-204ENST00000426921 TNIP1Q15025 636 aa26.82■■□□□ 1.88
UBXN4-204ENST00000426921 KSR2Q6VAB6 950 aa26.82■■□□□ 1.88
UBXN4-204ENST00000426921 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP26.82■■□□□ 1.88
UBXN4-204ENST00000426921 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa26.82■■□□□ 1.88
UBXN4-204ENST00000426921 ANP32CO43423 234 aa26.81■■□□□ 1.88
UBXN4-204ENST00000426921 PDE8AO60658 829 aa26.81■■□□□ 1.88
UBXN4-204ENST00000426921 GPSM2P81274 684 aa26.81■■□□□ 1.88
UBXN4-204ENST00000426921 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP26.81■■□□□ 1.88
UBXN4-204ENST00000426921 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP26.81■■□□□ 1.88
UBXN4-204ENST00000426921 RASSF10A6NK89 507 aa26.8■■□□□ 1.88
UBXN4-204ENST00000426921 RAD17O75943 681 aa26.8■■□□□ 1.88
UBXN4-204ENST00000426921 WASHC4Q2M389 1173 aa26.8■■□□□ 1.88
UBXN4-204ENST00000426921 STK31Q9BXU1 1019 aa26.8■■□□□ 1.88
UBXN4-204ENST00000426921 POLLQ9UGP5 575 aa26.8■■□□□ 1.88
UBXN4-204ENST00000426921 PI4KAP2A4QPH2 592 aa26.79■■□□□ 1.88
UBXN4-204ENST00000426921 CCDC152Q4G0S7 254 aa26.79■■□□□ 1.88
UBXN4-204ENST00000426921 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa26.79■■□□□ 1.88
UBXN4-204ENST00000426921 SEC31BQ9NQW1 1179 aa26.79■■□□□ 1.88
UBXN4-204ENST00000426921 PODXL2Q9NZ53 605 aa26.79■■□□□ 1.88
UBXN4-204ENST00000426921 IGKV5-2P06315 115 aa26.78■■□□□ 1.88
UBXN4-204ENST00000426921 VEGFBP49765 207 aa26.77■■□□□ 1.88
UBXN4-204ENST00000426921 TBC1D16Q8TBP0 767 aa26.77■■□□□ 1.88
UBXN4-204ENST00000426921 EYA3Q99504 573 aa26.77■■□□□ 1.88
UBXN4-204ENST00000426921 PGAP2Q9UHJ9 254 aa26.77■■□□□ 1.88
UBXN4-204ENST00000426921 FANCIQ9NVI1 1328 aa26.76■■□□□ 1.87
UBXN4-204ENST00000426921 C6orf229H3BNL8 230 aa26.76■■□□□ 1.87
UBXN4-204ENST00000426921 BCL2L13Q9BXK5 485 aa26.76■■□□□ 1.87
UBXN4-204ENST00000426921 WDR63Q8IWG1 891 aa26.75■■□□□ 1.87
UBXN4-204ENST00000426921 TRPM7Q96QT4 1865 aa26.74■■□□□ 1.87
UBXN4-204ENST00000426921 NEXNQ0ZGT2 675 aa26.74■■□□□ 1.87
UBXN4-204ENST00000426921 G2E3Q7L622 706 aa26.74■■□□□ 1.87
UBXN4-204ENST00000426921 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP26.74■■□□□ 1.87
UBXN4-204ENST00000426921 DPF2Q92785 391 aa26.74■■□□□ 1.87
UBXN4-204ENST00000426921 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP26.74■■□□□ 1.87
UBXN4-204ENST00000426921 DBNDD1Q9H9R9 158 aa26.74■■□□□ 1.87
UBXN4-204ENST00000426921 PSMD14O00487 310 aa26.73■■□□□ 1.87
UBXN4-204ENST00000426921 SLC4A2P04920 1241 aa26.73■■□□□ 1.87
UBXN4-204ENST00000426921 CTSWP56202 376 aa26.73■■□□□ 1.87
UBXN4-204ENST00000426921 DEFB115Q30KQ5 88 aa26.73■■□□□ 1.87
UBXN4-204ENST00000426921 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP26.73■■□□□ 1.87
UBXN4-204ENST00000426921 RTL9Q8NET4 1388 aa26.72■■□□□ 1.87
UBXN4-204ENST00000426921 THSD7BQ9C0I4 1608 aa26.72■■□□□ 1.87
UBXN4-204ENST00000426921 NEURL1BA8MQ27 555 aa26.72■■□□□ 1.87
UBXN4-204ENST00000426921 TRAF5O00463 557 aa26.72■■□□□ 1.87
UBXN4-204ENST00000426921 RIMBP2O15034 1052 aa26.72■■□□□ 1.87
UBXN4-204ENST00000426921 ECE2O60344 883 aa26.72■■□□□ 1.87
UBXN4-204ENST00000426921 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP26.72■■□□□ 1.87
UBXN4-204ENST00000426921 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP26.72■■□□□ 1.872e-11■□□□□ 10.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 80.7 ms