RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424161.5

TTC28-AS1-204, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 4

Gene TTC28-AS1, Length 556 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-204ENST00000424161 LMBR1LQ6UX01 489 aa16.8■□□□□ 0.28
TTC28-AS1-204ENST00000424161 TTLL11Q8NHH1 800 aa16.8■□□□□ 0.28
TTC28-AS1-204ENST00000424161 C1orf115Q9H7X2 142 aa16.8■□□□□ 0.28
TTC28-AS1-204ENST00000424161 CEP85Q6P2H3 762 aa16.79■□□□□ 0.28
TTC28-AS1-204ENST00000424161 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP16.79■□□□□ 0.28
TTC28-AS1-204ENST00000424161 C3orf67Q6ZVT6 689 aa16.78■□□□□ 0.28
TTC28-AS1-204ENST00000424161 ATP8B2P98198 1209 aa16.77■□□□□ 0.28
TTC28-AS1-204ENST00000424161 CHMP3Q9Y3E7 222 aa16.77■□□□□ 0.28
TTC28-AS1-204ENST00000424161 CD2APQ9Y5K6 639 aa16.77■□□□□ 0.28
TTC28-AS1-204ENST00000424161 SRGNP10124 158 aa16.76■□□□□ 0.27
TTC28-AS1-204ENST00000424161 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP16.76■□□□□ 0.27
TTC28-AS1-204ENST00000424161 TGFB2P61812 414 aa16.76■□□□□ 0.27
TTC28-AS1-204ENST00000424161 FAM161AQ3B820 660 aa16.76■□□□□ 0.27
TTC28-AS1-204ENST00000424161 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
TTC28-AS1-204ENST00000424161 GREM2Q9H772 168 aa16.76■□□□□ 0.27
TTC28-AS1-204ENST00000424161 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa16.76■□□□□ 0.27
TTC28-AS1-204ENST00000424161 LRP5O75197 1615 aa16.76■□□□□ 0.27
TTC28-AS1-204ENST00000424161 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP16.76■□□□□ 0.27
TTC28-AS1-204ENST00000424161 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa16.75■□□□□ 0.27
TTC28-AS1-204ENST00000424161 H0YIN7 160 aa16.75■□□□□ 0.27
TTC28-AS1-204ENST00000424161 SRGAP3O43295 1099 aa16.75■□□□□ 0.27
TTC28-AS1-204ENST00000424161 HMMRO75330 724 aa16.75■□□□□ 0.27
TTC28-AS1-204ENST00000424161 NPR1P16066 1061 aa16.75■□□□□ 0.27
TTC28-AS1-204ENST00000424161 ITGA6P23229 1130 aa16.75■□□□□ 0.27
TTC28-AS1-204ENST00000424161 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
TTC28-AS1-204ENST00000424161 CCDC57Q2TAC2 916 aa16.75■□□□□ 0.27
TTC28-AS1-204ENST00000424161 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
TTC28-AS1-204ENST00000424161 SSH3Q8TE77 659 aa16.75■□□□□ 0.27
TTC28-AS1-204ENST00000424161 DLEC1Q9Y238 1755 aa16.74■□□□□ 0.27
TTC28-AS1-204ENST00000424161 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa16.74■□□□□ 0.27
TTC28-AS1-204ENST00000424161 POLA2Q14181 598 aa16.74■□□□□ 0.27
TTC28-AS1-204ENST00000424161 C2CD5Q86YS7 1000 aa16.74■□□□□ 0.27
TTC28-AS1-204ENST00000424161 SIRT2Q8IXJ6 389 aa16.74■□□□□ 0.27
TTC28-AS1-204ENST00000424161 MASTLQ96GX5 879 aa16.74■□□□□ 0.27
TTC28-AS1-204ENST00000424161 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP16.74■□□□□ 0.27
TTC28-AS1-204ENST00000424161 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP16.74■□□□□ 0.27
TTC28-AS1-204ENST00000424161 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP16.74■□□□□ 0.27
TTC28-AS1-204ENST00000424161 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa16.73■□□□□ 0.27
TTC28-AS1-204ENST00000424161 STYK1Q6J9G0 422 aa16.73■□□□□ 0.27
TTC28-AS1-204ENST00000424161 CRAMP1Q96RY5 1269 aa16.73■□□□□ 0.27
TTC28-AS1-204ENST00000424161 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP16.73■□□□□ 0.27
TTC28-AS1-204ENST00000424161 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP16.72■□□□□ 0.27
TTC28-AS1-204ENST00000424161 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP16.72■□□□□ 0.27
TTC28-AS1-204ENST00000424161 GRAPQ13588 217 aa16.72■□□□□ 0.27
TTC28-AS1-204ENST00000424161 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP16.72■□□□□ 0.27
TTC28-AS1-204ENST00000424161 SEC31BQ9NQW1 1179 aa16.72■□□□□ 0.27
TTC28-AS1-204ENST00000424161 CHRNA5P30532 468 aa16.71■□□□□ 0.27
TTC28-AS1-204ENST00000424161 ALDH1B1P30837 517 aa16.71■□□□□ 0.27
TTC28-AS1-204ENST00000424161 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP16.71■□□□□ 0.27
TTC28-AS1-204ENST00000424161 TAF7LQ5H9L4 462 aa16.71■□□□□ 0.27
TTC28-AS1-204ENST00000424161 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa16.71■□□□□ 0.27
TTC28-AS1-204ENST00000424161 CNKSR1Q969H4 720 aa16.71■□□□□ 0.27
TTC28-AS1-204ENST00000424161 COPRSQ9NQ92 184 aa16.71■□□□□ 0.27
TTC28-AS1-204ENST00000424161 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP16.7■□□□□ 0.26
TTC28-AS1-204ENST00000424161 RPS8P62241 208 aaKnown RBP16.7■□□□□ 0.26
TTC28-AS1-204ENST00000424161 KLHL34Q8N239 644 aa16.7■□□□□ 0.26
TTC28-AS1-204ENST00000424161 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP16.7■□□□□ 0.26
TTC28-AS1-204ENST00000424161 FBXO3Q9UK99 471 aa16.7■□□□□ 0.26
TTC28-AS1-204ENST00000424161 A0A0G2JLW4 131 aa16.69■□□□□ 0.26
TTC28-AS1-204ENST00000424161 BBOX1O75936 387 aa16.69■□□□□ 0.26
TTC28-AS1-204ENST00000424161 DPEP1P16444 411 aa16.69■□□□□ 0.26
TTC28-AS1-204ENST00000424161 KCNA3P22001 575 aa16.69■□□□□ 0.26
TTC28-AS1-204ENST00000424161 TMC4Q7Z404 712 aa16.69■□□□□ 0.26
TTC28-AS1-204ENST00000424161 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP16.69■□□□□ 0.26
TTC28-AS1-204ENST00000424161 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP16.69■□□□□ 0.26
TTC28-AS1-204ENST00000424161 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP16.69■□□□□ 0.26
TTC28-AS1-204ENST00000424161 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP16.69■□□□□ 0.26
TTC28-AS1-204ENST00000424161 CIAO1O76071 339 aa16.68■□□□□ 0.26
TTC28-AS1-204ENST00000424161 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa16.68■□□□□ 0.26
TTC28-AS1-204ENST00000424161 MPHOSPH8Q99549 860 aa16.68■□□□□ 0.26
TTC28-AS1-204ENST00000424161 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP16.68■□□□□ 0.26
TTC28-AS1-204ENST00000424161 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP16.68■□□□□ 0.26
TTC28-AS1-204ENST00000424161 COL4A1P02462 1669 aa16.68■□□□□ 0.26
TTC28-AS1-204ENST00000424161 TAF1P21675 1872 aa16.67■□□□□ 0.26
TTC28-AS1-204ENST00000424161 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP16.67■□□□□ 0.26
TTC28-AS1-204ENST00000424161 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa16.67■□□□□ 0.26
TTC28-AS1-204ENST00000424161 TTLL6Q8N841 843 aa16.67■□□□□ 0.26
TTC28-AS1-204ENST00000424161 KLHDC4Q8TBB5 520 aa16.67■□□□□ 0.26
TTC28-AS1-204ENST00000424161 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP16.67■□□□□ 0.26
TTC28-AS1-204ENST00000424161 PPP4R2Q9NY27 417 aa16.67■□□□□ 0.26
TTC28-AS1-204ENST00000424161 PIM2Q9P1W9 311 aa16.67■□□□□ 0.26
TTC28-AS1-204ENST00000424161 EYA2O00167 538 aa16.66■□□□□ 0.26
TTC28-AS1-204ENST00000424161 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP16.66■□□□□ 0.26
TTC28-AS1-204ENST00000424161 NLGN2Q8NFZ4 835 aa16.66■□□□□ 0.26
TTC28-AS1-204ENST00000424161 SYT17Q9BSW7 474 aa16.66■□□□□ 0.26
TTC28-AS1-204ENST00000424161 DCTPP1Q9H773 170 aa16.66■□□□□ 0.26
TTC28-AS1-204ENST00000424161 SPEF2Q9C093 1822 aa16.66■□□□□ 0.26
TTC28-AS1-204ENST00000424161 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP16.65■□□□□ 0.26
TTC28-AS1-204ENST00000424161 SURF6O75683 361 aaKnown RBP16.65■□□□□ 0.26
TTC28-AS1-204ENST00000424161 IL15P40933 162 aaPredicted RBP16.65■□□□□ 0.26
TTC28-AS1-204ENST00000424161 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP16.65■□□□□ 0.26
TTC28-AS1-204ENST00000424161 GCC1Q96CN9 775 aa16.65■□□□□ 0.26
TTC28-AS1-204ENST00000424161 SIL1Q9H173 461 aa16.65■□□□□ 0.26
TTC28-AS1-204ENST00000424161 CNNM1Q9NRU3 951 aa16.65■□□□□ 0.26
TTC28-AS1-204ENST00000424161 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa16.65■□□□□ 0.26
TTC28-AS1-204ENST00000424161 CACNA1SQ13698 1873 aa16.65■□□□□ 0.26
TTC28-AS1-204ENST00000424161 LRRC37AA6NMS7 1700 aa16.65■□□□□ 0.26
TTC28-AS1-204ENST00000424161 SLX4Q8IY92 1834 aa16.64■□□□□ 0.25
TTC28-AS1-204ENST00000424161 RAB11FIP3O75154 756 aa16.64■□□□□ 0.25
TTC28-AS1-204ENST00000424161 IGHDP01880 384 aa16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.1 ms