RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423971.2

ACTBP13-201, Transcript of actin, beta pseudogene 13, humanhuman

BASIC

Gene ACTBP13, Length 3,959 nt, Biotype unitary pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP13-201ENST00000423971 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP10.25□□□□□ -0.77
ACTBP13-201ENST00000423971 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP10.25□□□□□ -0.77
ACTBP13-201ENST00000423971 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP10.25□□□□□ -0.77
ACTBP13-201ENST00000423971 TOM1O60784 492 aa10.25□□□□□ -0.77
ACTBP13-201ENST00000423971 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa10.25□□□□□ -0.77
ACTBP13-201ENST00000423971 FERMT3Q86UX7 667 aa10.25□□□□□ -0.77
ACTBP13-201ENST00000423971 KAZALD1Q96I82 304 aa10.25□□□□□ -0.77
ACTBP13-201ENST00000423971 KIF3AQ9Y496 699 aa10.25□□□□□ -0.77
ACTBP13-201ENST00000423971 PTH1RQ03431 593 aa10.25□□□□□ -0.77
ACTBP13-201ENST00000423971 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP10.25□□□□□ -0.77
ACTBP13-201ENST00000423971 TRIM34Q9BYJ4 488 aa10.25□□□□□ -0.77
ACTBP13-201ENST00000423971 CEP126Q9P2H0 1117 aa10.25□□□□□ -0.77
ACTBP13-201ENST00000423971 IDH1O75874 414 aaKnown RBP10.24□□□□□ -0.77
ACTBP13-201ENST00000423971 ALDH1L1O75891 902 aa10.24□□□□□ -0.77
ACTBP13-201ENST00000423971 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP10.24□□□□□ -0.77
ACTBP13-201ENST00000423971 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP10.24□□□□□ -0.77
ACTBP13-201ENST00000423971 ATG3Q9NT62 314 aa10.24□□□□□ -0.77
ACTBP13-201ENST00000423971 UTRNP46939 3433 aa10.24□□□□□ -0.77
ACTBP13-201ENST00000423971 DRC7Q8IY82 874 aa10.24□□□□□ -0.77
ACTBP13-201ENST00000423971 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP10.24□□□□□ -0.77
ACTBP13-201ENST00000423971 ZBTB22O15209 634 aa10.24□□□□□ -0.77
ACTBP13-201ENST00000423971 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP10.24□□□□□ -0.77
ACTBP13-201ENST00000423971 CCDC83Q8IWF9 413 aa10.24□□□□□ -0.77
ACTBP13-201ENST00000423971 MTMR7Q9Y216 660 aa10.24□□□□□ -0.77
ACTBP13-201ENST00000423971 KNDC1Q76NI1 1749 aa10.23□□□□□ -0.77
ACTBP13-201ENST00000423971 RAB11FIP3O75154 756 aa10.23□□□□□ -0.77
ACTBP13-201ENST00000423971 ADORA1P30542 326 aa10.23□□□□□ -0.77
ACTBP13-201ENST00000423971 RASEFQ8IZ41 740 aa10.23□□□□□ -0.77
ACTBP13-201ENST00000423971 PLBD2Q8NHP8 589 aa10.23□□□□□ -0.77
ACTBP13-201ENST00000423971 DDX11Q96FC9 970 aa10.23□□□□□ -0.77
ACTBP13-201ENST00000423971 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP10.23□□□□□ -0.77
ACTBP13-201ENST00000423971 RABEP1Q15276 862 aa10.23□□□□□ -0.77
ACTBP13-201ENST00000423971 TTC39AQ5SRH9 613 aa10.23□□□□□ -0.77
ACTBP13-201ENST00000423971 TIGD1Q96MW7 591 aa10.23□□□□□ -0.77
ACTBP13-201ENST00000423971 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP10.23□□□□□ -0.77
ACTBP13-201ENST00000423971 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP10.23□□□□□ -0.77
ACTBP13-201ENST00000423971 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP10.23□□□□□ -0.77
ACTBP13-201ENST00000423971 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP10.23□□□□□ -0.77
ACTBP13-201ENST00000423971 ANTXR1Q9H6X2 564 aa10.23□□□□□ -0.77
ACTBP13-201ENST00000423971 HDAC5Q9UQL6 1122 aa10.23□□□□□ -0.77
ACTBP13-201ENST00000423971 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP10.23□□□□□ -0.77
ACTBP13-201ENST00000423971 FMN2Q9NZ56 1722 aa10.23□□□□□ -0.77
ACTBP13-201ENST00000423971 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP10.22□□□□□ -0.77
ACTBP13-201ENST00000423971 KIF2CQ99661 725 aa10.22□□□□□ -0.77
ACTBP13-201ENST00000423971 A0A0D9SFI3 127 aa10.22□□□□□ -0.77
ACTBP13-201ENST00000423971 GPATCH11Q8N954 259 aa10.22□□□□□ -0.77
ACTBP13-201ENST00000423971 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP10.22□□□□□ -0.77
ACTBP13-201ENST00000423971 ABCF2Q9UG63 623 aa10.22□□□□□ -0.77
ACTBP13-201ENST00000423971 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP10.22□□□□□ -0.77
ACTBP13-201ENST00000423971 LTN1O94822 1766 aa10.22□□□□□ -0.77
ACTBP13-201ENST00000423971 ERBB4Q15303 1308 aa10.22□□□□□ -0.77
ACTBP13-201ENST00000423971 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP10.22□□□□□ -0.77
ACTBP13-201ENST00000423971 MPHOSPH8Q99549 860 aa10.22□□□□□ -0.77
ACTBP13-201ENST00000423971 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP10.22□□□□□ -0.77
ACTBP13-201ENST00000423971 EP400Q96L91 3159 aa10.22□□□□□ -0.77
ACTBP13-201ENST00000423971 ADAMTSL3P82987 1691 aa10.22□□□□□ -0.77
ACTBP13-201ENST00000423971 KIF24Q5T7B8 1368 aa10.21□□□□□ -0.77
ACTBP13-201ENST00000423971 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP10.21□□□□□ -0.77
ACTBP13-201ENST00000423971 ADCK5Q3MIX3 580 aa10.21□□□□□ -0.77
ACTBP13-201ENST00000423971 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP10.21□□□□□ -0.77
ACTBP13-201ENST00000423971 ERC1Q8IUD2 1116 aa10.21□□□□□ -0.77
ACTBP13-201ENST00000423971 ZNF592Q92610 1267 aa10.21□□□□□ -0.77
ACTBP13-201ENST00000423971 TMX3Q96JJ7 454 aa10.21□□□□□ -0.77
ACTBP13-201ENST00000423971 SEC31BQ9NQW1 1179 aa10.21□□□□□ -0.77
ACTBP13-201ENST00000423971 HOXB7P09629 217 aa10.21□□□□□ -0.78
ACTBP13-201ENST00000423971 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP10.21□□□□□ -0.78
ACTBP13-201ENST00000423971 TSC1Q92574 1164 aa10.21□□□□□ -0.78
ACTBP13-201ENST00000423971 GREM2Q9H772 168 aa10.21□□□□□ -0.78
ACTBP13-201ENST00000423971 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP10.21□□□□□ -0.78
ACTBP13-201ENST00000423971 TNNI3KQ59H18 835 aa10.21□□□□□ -0.78
ACTBP13-201ENST00000423971 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP10.21□□□□□ -0.78
ACTBP13-201ENST00000423971 RUFY2Q8WXA3 655 aa10.21□□□□□ -0.78
ACTBP13-201ENST00000423971 TAF6LQ9Y6J9 622 aa10.21□□□□□ -0.78
ACTBP13-201ENST00000423971 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa10.21□□□□□ -0.78
ACTBP13-201ENST00000423971 HEG1Q9ULI3 1381 aa10.2□□□□□ -0.78
ACTBP13-201ENST00000423971 A0A1B0GUL7 405 aa10.2□□□□□ -0.78
ACTBP13-201ENST00000423971 GUCY1B3Q02153 619 aa10.2□□□□□ -0.78
ACTBP13-201ENST00000423971 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP10.2□□□□□ -0.78
ACTBP13-201ENST00000423971 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
ACTBP13-201ENST00000423971 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
ACTBP13-201ENST00000423971 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa10.2□□□□□ -0.78
ACTBP13-201ENST00000423971 PI4K2BQ8TCG2 481 aa10.2□□□□□ -0.78
ACTBP13-201ENST00000423971 FBXW7Q969H0 707 aa10.2□□□□□ -0.78
ACTBP13-201ENST00000423971 BABAM1Q9NWV8 329 aa10.2□□□□□ -0.78
ACTBP13-201ENST00000423971 RGPD5Q99666 1765 aa10.2□□□□□ -0.78
ACTBP13-201ENST00000423971 NFAT5O94916 1531 aa10.2□□□□□ -0.78
ACTBP13-201ENST00000423971 FIBPO43427 364 aa10.2□□□□□ -0.78
ACTBP13-201ENST00000423971 TNNT1P13805 278 aa10.2□□□□□ -0.78
ACTBP13-201ENST00000423971 ITGA6P23229 1130 aa10.2□□□□□ -0.78
ACTBP13-201ENST00000423971 RBM25P49756 843 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
ACTBP13-201ENST00000423971 FAM173BQ6P4H8 233 aa10.2□□□□□ -0.78
ACTBP13-201ENST00000423971 ZBTB9Q96C00 473 aa10.2□□□□□ -0.78
ACTBP13-201ENST00000423971 SLC4A9Q96Q91 983 aa10.2□□□□□ -0.78
ACTBP13-201ENST00000423971 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
ACTBP13-201ENST00000423971 USP21Q9UK80 565 aa10.2□□□□□ -0.78
ACTBP13-201ENST00000423971 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa10.2□□□□□ -0.78
ACTBP13-201ENST00000423971 ERVV-2B6SEH9 535 aa10.19□□□□□ -0.78
ACTBP13-201ENST00000423971 CCT2P78371 535 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
ACTBP13-201ENST00000423971 VPS37DQ86XT2 251 aa10.19□□□□□ -0.78
ACTBP13-201ENST00000423971 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP10.19□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.5 ms