RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000403904.5

CSNK1E-204, Transcript of casein kinase 1 epsilon, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene CSNK1E, Length 1,580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1E-204ENST00000403904 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP41.66■■■■■ 4.26
CSNK1E-204ENST00000403904 CHMP3Q9Y3E7 222 aa41.65■■■■■ 4.26
CSNK1E-204ENST00000403904 CRY2Q49AN0 593 aa41.63■■■■■ 4.26
CSNK1E-204ENST00000403904 CCDC152Q4G0S7 254 aa41.63■■■■■ 4.25
CSNK1E-204ENST00000403904 GREM2Q9H772 168 aa41.63■■■■■ 4.25
CSNK1E-204ENST00000403904 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP41.61■■■■■ 4.25
CSNK1E-204ENST00000403904 FAM161AQ3B820 660 aa41.61■■■■■ 4.25
CSNK1E-204ENST00000403904 C2CD5Q86YS7 1000 aa41.61■■■■■ 4.25
CSNK1E-204ENST00000403904 CD2APQ9Y5K6 639 aa41.61■■■■■ 4.25
CSNK1E-204ENST00000403904 CHRNA5P30532 468 aa41.6■■■■■ 4.25
CSNK1E-204ENST00000403904 AAMPQ13685 434 aa41.59■■■■■ 4.25
CSNK1E-204ENST00000403904 CEP85Q6P2H3 762 aa41.59■■■■■ 4.25
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CSNK1E-204ENST00000403904 H0YIN7 160 aa41.59■■■■■ 4.25
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CSNK1E-204ENST00000403904 TAF1P21675 1872 aa41.58■■■■■ 4.25
CSNK1E-204ENST00000403904 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa41.58■■■■■ 4.25
CSNK1E-204ENST00000403904 MTX1Q13505 466 aa41.57■■■■■ 4.25
CSNK1E-204ENST00000403904 SEC31BQ9NQW1 1179 aa41.57■■■■■ 4.25
CSNK1E-204ENST00000403904 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa41.56■■■■■ 4.24
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CSNK1E-204ENST00000403904 ATP8B2P98198 1209 aa41.56■■■■■ 4.24
CSNK1E-204ENST00000403904 ITGA6P23229 1130 aa41.55■■■■■ 4.24
CSNK1E-204ENST00000403904 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP41.55■■■■■ 4.24
CSNK1E-204ENST00000403904 A0A0G2JLW4 131 aa41.54■■■■■ 4.24
CSNK1E-204ENST00000403904 TGFB2P61812 414 aa41.54■■■■■ 4.24
CSNK1E-204ENST00000403904 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa41.54■■■■■ 4.24
CSNK1E-204ENST00000403904 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa41.54■■■■■ 4.24
CSNK1E-204ENST00000403904 NPR1P16066 1061 aa41.54■■■■■ 4.24
CSNK1E-204ENST00000403904 DPEP1P16444 411 aa41.54■■■■■ 4.24
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CSNK1E-204ENST00000403904 SIRT2Q8IXJ6 389 aa41.53■■■■■ 4.24
CSNK1E-204ENST00000403904 MASTLQ96GX5 879 aa41.53■■■■■ 4.24
CSNK1E-204ENST00000403904 LRP5O75197 1615 aa41.53■■■■■ 4.24
CSNK1E-204ENST00000403904 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP41.52■■■■■ 4.24
CSNK1E-204ENST00000403904 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP41.52■■■■■ 4.245e-7■■□□□ 13.7
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CSNK1E-204ENST00000403904 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa41.5■■■■■ 4.23
CSNK1E-204ENST00000403904 COL4A1P02462 1669 aa41.5■■■■■ 4.23
CSNK1E-204ENST00000403904 NLGN2Q8NFZ4 835 aa41.5■■■■■ 4.23
CSNK1E-204ENST00000403904 DLEC1Q9Y238 1755 aa41.5■■■■■ 4.23
CSNK1E-204ENST00000403904 KCNA3P22001 575 aa41.49■■■■■ 4.23
CSNK1E-204ENST00000403904 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP41.48■■■■■ 4.23
CSNK1E-204ENST00000403904 STYK1Q6J9G0 422 aa41.48■■■■■ 4.23
CSNK1E-204ENST00000403904 KLHDC4Q8TBB5 520 aa41.48■■■■■ 4.23
CSNK1E-204ENST00000403904 SSH3Q8TE77 659 aa41.48■■■■■ 4.23
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CSNK1E-204ENST00000403904 POLA2Q14181 598 aa41.46■■■■■ 4.23
CSNK1E-204ENST00000403904 CACNA1SQ13698 1873 aa41.46■■■■■ 4.23
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CSNK1E-204ENST00000403904 TAF7LQ5H9L4 462 aa41.45■■■■■ 4.23
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CSNK1E-204ENST00000403904 ALDH1B1P30837 517 aa41.44■■■■■ 4.22
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CSNK1E-204ENST00000403904 CNKSR1Q969H4 720 aa41.41■■■■■ 4.22
CSNK1E-204ENST00000403904 WWC3Q9ULE0 1092 aa41.41■■■■■ 4.22
CSNK1E-204ENST00000403904 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP41.4■■■■■ 4.22
CSNK1E-204ENST00000403904 SIL1Q9H173 461 aa41.39■■■■■ 4.22
CSNK1E-204ENST00000403904 COPRSQ9NQ92 184 aa41.39■■■■■ 4.22
CSNK1E-204ENST00000403904 PIM2Q9P1W9 311 aa41.39■■■■■ 4.22
CSNK1E-204ENST00000403904 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP41.39■■■■■ 4.22
CSNK1E-204ENST00000403904 MPHOSPH8Q99549 860 aa41.38■■■■■ 4.22
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CSNK1E-204ENST00000403904 BBOX1O75936 387 aa41.37■■■■■ 4.21
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CSNK1E-204ENST00000403904 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP41.31■■■■■ 4.2
CSNK1E-204ENST00000403904 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa41.31■■■■■ 4.2
CSNK1E-204ENST00000403904 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP41.3■■■■■ 4.2
CSNK1E-204ENST00000403904 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP41.3■■■■■ 4.2
CSNK1E-204ENST00000403904 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP41.29■■■■■ 4.2
CSNK1E-204ENST00000403904 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa41.29■■■■■ 4.2
CSNK1E-204ENST00000403904 ATG9AQ7Z3C6 839 aa41.29■■■■■ 4.2
CSNK1E-204ENST00000403904 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP41.28■■■■■ 4.2
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