RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368547.3

ECHS1-201, Transcript of enoyl-CoA hydratase, short chain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ECHS1, Length 1,617 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHS1-201ENST00000368547 CSF1RP07333 972 aa36.96■■■■□ 3.51
ECHS1-201ENST00000368547 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP36.95■■■■□ 3.51
ECHS1-201ENST00000368547 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa36.95■■■■□ 3.51
ECHS1-201ENST00000368547 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP36.94■■■■□ 3.5
ECHS1-201ENST00000368547 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP36.94■■■■□ 3.5
ECHS1-201ENST00000368547 CHMP3Q9Y3E7 222 aa36.94■■■■□ 3.5
ECHS1-201ENST00000368547 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP36.93■■■■□ 3.5
ECHS1-201ENST00000368547 CRY2Q49AN0 593 aa36.92■■■■□ 3.5
ECHS1-201ENST00000368547 CCDC152Q4G0S7 254 aa36.92■■■■□ 3.5
ECHS1-201ENST00000368547 KLHL34Q8N239 644 aa36.92■■■■□ 3.5
ECHS1-201ENST00000368547 CEP85Q6P2H3 762 aa36.92■■■■□ 3.5
ECHS1-201ENST00000368547 GREM2Q9H772 168 aa36.92■■■■□ 3.5
ECHS1-201ENST00000368547 FAM161AQ3B820 660 aa36.91■■■■□ 3.5
ECHS1-201ENST00000368547 MTX1Q13505 466 aa36.89■■■■□ 3.5
ECHS1-201ENST00000368547 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa36.89■■■■□ 3.5
ECHS1-201ENST00000368547 C2CD5Q86YS7 1000 aa36.88■■■■□ 3.5
ECHS1-201ENST00000368547 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP36.88■■■■□ 3.5
ECHS1-201ENST00000368547 CD2APQ9Y5K6 639 aa36.88■■■■□ 3.5
ECHS1-201ENST00000368547 TAF1P21675 1872 aa36.88■■■■□ 3.49
ECHS1-201ENST00000368547 SRGNP10124 158 aa36.88■■■■□ 3.49
ECHS1-201ENST00000368547 ATP8B2P98198 1209 aa36.88■■■■□ 3.49
ECHS1-201ENST00000368547 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP36.88■■■■□ 3.49
ECHS1-201ENST00000368547 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa36.87■■■■□ 3.49
ECHS1-201ENST00000368547 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa36.87■■■■□ 3.49
ECHS1-201ENST00000368547 H0YIN7 160 aa36.87■■■■□ 3.49
ECHS1-201ENST00000368547 SRGAP3O43295 1099 aa36.87■■■■□ 3.49
ECHS1-201ENST00000368547 CHRNA5P30532 468 aa36.87■■■■□ 3.49
ECHS1-201ENST00000368547 RTL9Q8NET4 1388 aa36.87■■■■□ 3.49
ECHS1-201ENST00000368547 SEC31BQ9NQW1 1179 aa36.86■■■■□ 3.49
ECHS1-201ENST00000368547 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa36.86■■■■□ 3.49
ECHS1-201ENST00000368547 DLEC1Q9Y238 1755 aa36.85■■■■□ 3.49
ECHS1-201ENST00000368547 ITGA6P23229 1130 aa36.85■■■■□ 3.49
ECHS1-201ENST00000368547 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP36.85■■■■□ 3.49
ECHS1-201ENST00000368547 CCDC57Q2TAC2 916 aa36.85■■■■□ 3.49
ECHS1-201ENST00000368547 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP36.85■■■■□ 3.49
ECHS1-201ENST00000368547 SIRT2Q8IXJ6 389 aa36.85■■■■□ 3.49
ECHS1-201ENST00000368547 LRP5O75197 1615 aa36.84■■■■□ 3.49
ECHS1-201ENST00000368547 TGFB2P61812 414 aa36.84■■■■□ 3.49
ECHS1-201ENST00000368547 NPR1P16066 1061 aa36.83■■■■□ 3.49
ECHS1-201ENST00000368547 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa36.82■■■■□ 3.49
ECHS1-201ENST00000368547 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP36.82■■■■□ 3.49
ECHS1-201ENST00000368547 MASTLQ96GX5 879 aa36.82■■■■□ 3.49
ECHS1-201ENST00000368547 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP36.82■■■■□ 3.49
ECHS1-201ENST00000368547 COL4A1P02462 1669 aa36.82■■■■□ 3.48
ECHS1-201ENST00000368547 A0A0G2JLW4 131 aa36.81■■■■□ 3.48
ECHS1-201ENST00000368547 DPEP1P16444 411 aa36.81■■■■□ 3.48
ECHS1-201ENST00000368547 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP36.81■■■■□ 3.48
ECHS1-201ENST00000368547 SSH3Q8TE77 659 aa36.81■■■■□ 3.48
ECHS1-201ENST00000368547 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP36.81■■■■□ 3.48
ECHS1-201ENST00000368547 CACNA1SQ13698 1873 aa36.8■■■■□ 3.48
ECHS1-201ENST00000368547 SPEF2Q9C093 1822 aa36.8■■■■□ 3.48
ECHS1-201ENST00000368547 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa36.8■■■■□ 3.48
ECHS1-201ENST00000368547 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP36.8■■■■□ 3.48
ECHS1-201ENST00000368547 POLA2Q14181 598 aa36.8■■■■□ 3.48
ECHS1-201ENST00000368547 STYK1Q6J9G0 422 aa36.79■■■■□ 3.48
ECHS1-201ENST00000368547 KLHDC4Q8TBB5 520 aa36.78■■■■□ 3.48
ECHS1-201ENST00000368547 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP36.78■■■■□ 3.48
ECHS1-201ENST00000368547 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP36.78■■■■□ 3.48
ECHS1-201ENST00000368547 CRAMP1Q96RY5 1269 aa36.78■■■■□ 3.48
ECHS1-201ENST00000368547 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP36.78■■■■□ 3.48
ECHS1-201ENST00000368547 HMMRO75330 724 aa36.77■■■■□ 3.48
ECHS1-201ENST00000368547 KCNA3P22001 575 aa36.77■■■■□ 3.48
ECHS1-201ENST00000368547 GRAPQ13588 217 aa36.77■■■■□ 3.48
ECHS1-201ENST00000368547 TAF7LQ5H9L4 462 aa36.77■■■■□ 3.48
ECHS1-201ENST00000368547 NLGN2Q8NFZ4 835 aa36.77■■■■□ 3.48
ECHS1-201ENST00000368547 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP36.77■■■■□ 3.48
ECHS1-201ENST00000368547 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP36.76■■■■□ 3.48
ECHS1-201ENST00000368547 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP36.76■■■■□ 3.48
ECHS1-201ENST00000368547 ALDH1B1P30837 517 aa36.75■■■■□ 3.47
ECHS1-201ENST00000368547 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP36.75■■■■□ 3.47
ECHS1-201ENST00000368547 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa36.74■■■■□ 3.47
ECHS1-201ENST00000368547 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP36.74■■■■□ 3.47
ECHS1-201ENST00000368547 RPS8P62241 208 aaKnown RBP36.74■■■■□ 3.47
ECHS1-201ENST00000368547 COPRSQ9NQ92 184 aa36.73■■■■□ 3.47
ECHS1-201ENST00000368547 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP36.72■■■■□ 3.47
ECHS1-201ENST00000368547 CNKSR1Q969H4 720 aa36.72■■■■□ 3.47
ECHS1-201ENST00000368547 SYT17Q9BSW7 474 aa36.72■■■■□ 3.47
ECHS1-201ENST00000368547 SLX4Q8IY92 1834 aa36.7■■■■□ 3.47
ECHS1-201ENST00000368547 MPHOSPH8Q99549 860 aa36.7■■■■□ 3.47
ECHS1-201ENST00000368547 SIL1Q9H173 461 aa36.7■■■■□ 3.47
ECHS1-201ENST00000368547 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP36.7■■■■□ 3.47
ECHS1-201ENST00000368547 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa36.7■■■■□ 3.47
ECHS1-201ENST00000368547 PIM2Q9P1W9 311 aa36.7■■■■□ 3.47
ECHS1-201ENST00000368547 BBOX1O75936 387 aa36.69■■■■□ 3.46
ECHS1-201ENST00000368547 KDM2BQ8NHM5 1336 aa36.69■■■■□ 3.46
ECHS1-201ENST00000368547 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP36.68■■■■□ 3.46
ECHS1-201ENST00000368547 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP36.68■■■■□ 3.46
ECHS1-201ENST00000368547 TTLL6Q8N841 843 aa36.68■■■■□ 3.46
ECHS1-201ENST00000368547 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP36.68■■■■□ 3.46
ECHS1-201ENST00000368547 SURF6O75683 361 aaKnown RBP36.67■■■■□ 3.46
ECHS1-201ENST00000368547 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP36.67■■■■□ 3.46
ECHS1-201ENST00000368547 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP36.67■■■■□ 3.46
ECHS1-201ENST00000368547 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP36.67■■■■□ 3.46
ECHS1-201ENST00000368547 CNNM1Q9NRU3 951 aa36.67■■■■□ 3.46
ECHS1-201ENST00000368547 WWC3Q9ULE0 1092 aa36.67■■■■□ 3.46
ECHS1-201ENST00000368547 IGHDP01880 384 aa36.66■■■■□ 3.46
ECHS1-201ENST00000368547 LRRC24Q50LG9 513 aa36.66■■■■□ 3.46
ECHS1-201ENST00000368547 EYA2O00167 538 aa36.65■■■■□ 3.46
ECHS1-201ENST00000368547 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa36.65■■■■□ 3.46
ECHS1-201ENST00000368547 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP36.65■■■■□ 3.46
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