RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345348.9

TM7SF2-202, Transcript of transmembrane 7 superfamily member 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TM7SF2, Length 1,490 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF2-202ENST00000345348 PLA2G12BQ9BX93 195 aa25.18■■□□□ 1.62
TM7SF2-202ENST00000345348 GRIN3BO60391 1043 aa25.17■■□□□ 1.62
TM7SF2-202ENST00000345348 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
TM7SF2-202ENST00000345348 CTSWP56202 376 aa25.17■■□□□ 1.62
TM7SF2-202ENST00000345348 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
TM7SF2-202ENST00000345348 USP44Q9H0E7 712 aa25.17■■□□□ 1.62
TM7SF2-202ENST00000345348 UTYO14607 1347 aa25.17■■□□□ 1.62
TM7SF2-202ENST00000345348 CCDC152Q4G0S7 254 aa25.16■■□□□ 1.62
TM7SF2-202ENST00000345348 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
TM7SF2-202ENST00000345348 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
TM7SF2-202ENST00000345348 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
TM7SF2-202ENST00000345348 TMEM57Q8N5G2 664 aa25.15■■□□□ 1.62
TM7SF2-202ENST00000345348 TTLL11Q8NHH1 800 aa25.15■■□□□ 1.62
TM7SF2-202ENST00000345348 C21orf2O43822 256 aa25.14■■□□□ 1.61
TM7SF2-202ENST00000345348 PLIN1O60240 522 aa25.13■■□□□ 1.61
TM7SF2-202ENST00000345348 GRAPQ13588 217 aa25.13■■□□□ 1.61
TM7SF2-202ENST00000345348 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
TM7SF2-202ENST00000345348 SUCLG2Q96I99 432 aa25.13■■□□□ 1.61
TM7SF2-202ENST00000345348 CHD4Q14839 1912 aa25.12■■□□□ 1.61
TM7SF2-202ENST00000345348 RLBP1P12271 317 aa25.12■■□□□ 1.61
TM7SF2-202ENST00000345348 FOXO4P98177 505 aa25.12■■□□□ 1.61
TM7SF2-202ENST00000345348 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
TM7SF2-202ENST00000345348 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
TM7SF2-202ENST00000345348 CSF1RP07333 972 aa25.11■■□□□ 1.61
TM7SF2-202ENST00000345348 MS4A1P11836 297 aa25.11■■□□□ 1.61
TM7SF2-202ENST00000345348 EPHA10Q5JZY3 1008 aa25.11■■□□□ 1.61
TM7SF2-202ENST00000345348 C7orf43Q8WVR3 580 aa25.11■■□□□ 1.61
TM7SF2-202ENST00000345348 GREM2Q9H772 168 aa25.11■■□□□ 1.61
TM7SF2-202ENST00000345348 SEC31BQ9NQW1 1179 aa25.11■■□□□ 1.61
TM7SF2-202ENST00000345348 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa25.1■■□□□ 1.61
TM7SF2-202ENST00000345348 BBOX1O75936 387 aa25.1■■□□□ 1.61
TM7SF2-202ENST00000345348 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
TM7SF2-202ENST00000345348 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa25.1■■□□□ 1.61
TM7SF2-202ENST00000345348 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
TM7SF2-202ENST00000345348 KAZALD1Q96I82 304 aa25.1■■□□□ 1.61
TM7SF2-202ENST00000345348 RTL9Q8NET4 1388 aa25.1■■□□□ 1.61
TM7SF2-202ENST00000345348 COL4A1P02462 1669 aa25.1■■□□□ 1.61
TM7SF2-202ENST00000345348 SOGA3Q5TF21 947 aa25.09■■□□□ 1.61
TM7SF2-202ENST00000345348 PANK1Q8TE04 598 aa25.09■■□□□ 1.61
TM7SF2-202ENST00000345348 MEIS3Q99687 375 aa25.09■■□□□ 1.61
TM7SF2-202ENST00000345348 SPEF2Q9C093 1822 aa25.09■■□□□ 1.61
TM7SF2-202ENST00000345348 LMBR1LQ6UX01 489 aa25.09■■□□□ 1.61
TM7SF2-202ENST00000345348 ITPRIPQ8IWB1 547 aa25.09■■□□□ 1.61
TM7SF2-202ENST00000345348 CHMP3Q9Y3E7 222 aa25.09■■□□□ 1.61
TM7SF2-202ENST00000345348 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa25.08■■□□□ 1.61
TM7SF2-202ENST00000345348 RPS8P62241 208 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.6
TM7SF2-202ENST00000345348 FAM161AQ3B820 660 aa25.08■■□□□ 1.6
TM7SF2-202ENST00000345348 OLFM4Q6UX06 510 aa25.08■■□□□ 1.6
TM7SF2-202ENST00000345348 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.6
TM7SF2-202ENST00000345348 SBF1O95248 1867 aa25.07■■□□□ 1.6
TM7SF2-202ENST00000345348 GNAI3P08754 354 aa25.07■■□□□ 1.6
TM7SF2-202ENST00000345348 ITGA6P23229 1130 aa25.07■■□□□ 1.6
TM7SF2-202ENST00000345348 CCDC93Q567U6 631 aa25.07■■□□□ 1.6
TM7SF2-202ENST00000345348 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
TM7SF2-202ENST00000345348 HDAC5Q9UQL6 1122 aa25.07■■□□□ 1.6
TM7SF2-202ENST00000345348 TMC4Q7Z404 712 aa25.06■■□□□ 1.6
TM7SF2-202ENST00000345348 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
TM7SF2-202ENST00000345348 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa25.06■■□□□ 1.6
TM7SF2-202ENST00000345348 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa25.05■■□□□ 1.6
TM7SF2-202ENST00000345348 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa25.05■■□□□ 1.6
TM7SF2-202ENST00000345348 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
TM7SF2-202ENST00000345348 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
TM7SF2-202ENST00000345348 SLC51AQ86UW1 340 aa25.04■■□□□ 1.6
TM7SF2-202ENST00000345348 SP8Q8IXZ3 490 aa25.04■■□□□ 1.6
TM7SF2-202ENST00000345348 ANKRD44Q8N8A2 993 aa25.04■■□□□ 1.6
TM7SF2-202ENST00000345348 LRRC37AA6NMS7 1700 aa25.04■■□□□ 1.6
TM7SF2-202ENST00000345348 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa25.03■■□□□ 1.6
TM7SF2-202ENST00000345348 RTKN2Q8IZC4 609 aa25.03■■□□□ 1.6
TM7SF2-202ENST00000345348 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP25.03■■□□□ 1.6
TM7SF2-202ENST00000345348 PDE3AQ14432 1141 aa25.02■■□□□ 1.6
TM7SF2-202ENST00000345348 CCDC57Q2TAC2 916 aa25.02■■□□□ 1.6
TM7SF2-202ENST00000345348 NFKBIEO00221 500 aa25.02■■□□□ 1.6
TM7SF2-202ENST00000345348 RRP1P56182 461 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
TM7SF2-202ENST00000345348 RASSF7Q02833 373 aa25.02■■□□□ 1.6
TM7SF2-202ENST00000345348 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP25.01■■□□□ 1.59
TM7SF2-202ENST00000345348 MVPQ14764 893 aaKnown RBP25.01■■□□□ 1.59
TM7SF2-202ENST00000345348 GRIPAP1Q4V328 841 aa25.01■■□□□ 1.59
TM7SF2-202ENST00000345348 C20orf194Q5TEA3 1177 aa25.01■■□□□ 1.59
TM7SF2-202ENST00000345348 TAOK3Q9H2K8 898 aa25.01■■□□□ 1.59
TM7SF2-202ENST00000345348 COG6Q9Y2V7 657 aa25.01■■□□□ 1.59
TM7SF2-202ENST00000345348 SNED1Q8TER0 1413 aa25■■□□□ 1.59
TM7SF2-202ENST00000345348 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP25■■□□□ 1.59
TM7SF2-202ENST00000345348 GNAI2P04899 355 aa24.99■■□□□ 1.59
TM7SF2-202ENST00000345348 TAF7LQ5H9L4 462 aa24.99■■□□□ 1.59
TM7SF2-202ENST00000345348 MPHOSPH8Q99549 860 aa24.99■■□□□ 1.59
TM7SF2-202ENST00000345348 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP24.99■■□□□ 1.59
TM7SF2-202ENST00000345348 LTBP3Q9NS15 1303 aa24.99■■□□□ 1.59
TM7SF2-202ENST00000345348 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP24.98■■□□□ 1.59
TM7SF2-202ENST00000345348 DDX19BQ9UMR2 479 aa24.98■■□□□ 1.59
TM7SF2-202ENST00000345348 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP24.98■■□□□ 1.59
TM7SF2-202ENST00000345348 MPNDQ8N594 471 aa24.97■■□□□ 1.59
TM7SF2-202ENST00000345348 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP24.97■■□□□ 1.59
TM7SF2-202ENST00000345348 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP24.96■■□□□ 1.59
TM7SF2-202ENST00000345348 PSMD1Q99460 953 aa24.96■■□□□ 1.59
TM7SF2-202ENST00000345348 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP24.96■■□□□ 1.59
TM7SF2-202ENST00000345348 LMNB1P20700 586 aa24.95■■□□□ 1.58
TM7SF2-202ENST00000345348 GPSM2P81274 684 aa24.95■■□□□ 1.58
TM7SF2-202ENST00000345348 MINPP1Q9UNW1 487 aa24.95■■□□□ 1.58
TM7SF2-202ENST00000345348 LTBP1Q14766 1721 aa24.94■■□□□ 1.58
TM7SF2-202ENST00000345348 PRELPP51888 382 aa24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 77.8 ms