RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000323374.8

SPHK1-201, Transcript of sphingosine kinase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPHK1, Length 2,138 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHK1-201ENST00000323374 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP26.09■■□□□ 1.77
SPHK1-201ENST00000323374 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP26.09■■□□□ 1.77
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SPHK1-201ENST00000323374 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP26.09■■□□□ 1.77
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SPHK1-201ENST00000323374 JCADQ9P266 1359 aa26.08■■□□□ 1.77
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SPHK1-201ENST00000323374 SMC3Q9UQE7 1217 aa26.02■■□□□ 1.76
SPHK1-201ENST00000323374 A0A1B0GUL7 405 aa26.02■■□□□ 1.76
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SPHK1-201ENST00000323374 ADAMTS2O95450 1211 aa25.97■■□□□ 1.75
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SPHK1-201ENST00000323374 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP25.96■■□□□ 1.75
SPHK1-201ENST00000323374 DDB1Q16531 1140 aa25.96■■□□□ 1.75
SPHK1-201ENST00000323374 TPCN1Q9ULQ1 816 aa25.96■■□□□ 1.75
SPHK1-201ENST00000323374 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa25.95■■□□□ 1.74
SPHK1-201ENST00000323374 CCDC158Q5M9N0 1113 aa25.95■■□□□ 1.74
SPHK1-201ENST00000323374 GJB2P29033 226 aa25.94■■□□□ 1.74
SPHK1-201ENST00000323374 KAT6BQ8WYB5 2073 aa25.94■■□□□ 1.74
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