RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000308271.13

USP48-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 48, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP48, Length 4,595 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP48-201ENST00000308271 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
USP48-201ENST00000308271 MTMR7Q9Y216 660 aa22.25■■□□□ 1.15
USP48-201ENST00000308271 SLC12A7Q9Y666 1083 aa22.25■■□□□ 1.15
USP48-201ENST00000308271 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
USP48-201ENST00000308271 ODF2Q5BJF6 829 aa22.25■■□□□ 1.15
USP48-201ENST00000308271 NPATQ14207 1427 aa22.25■■□□□ 1.15
USP48-201ENST00000308271 NCOA7Q8NI08 942 aa22.25■■□□□ 1.15
USP48-201ENST00000308271 GOLGA1Q92805 767 aa22.25■■□□□ 1.15
USP48-201ENST00000308271 TANGO6Q9C0B7 1094 aa22.25■■□□□ 1.15
USP48-201ENST00000308271 IFNKQ9P0W0 207 aa22.25■■□□□ 1.15
USP48-201ENST00000308271 ANXA1P04083 346 aa22.24■■□□□ 1.15
USP48-201ENST00000308271 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa22.24■■□□□ 1.15
USP48-201ENST00000308271 SSH2Q76I76 1423 aa22.24■■□□□ 1.15
USP48-201ENST00000308271 SPTLC2O15270 562 aa22.24■■□□□ 1.15
USP48-201ENST00000308271 PPFIA3O75145 1194 aa22.24■■□□□ 1.15
USP48-201ENST00000308271 ATF3P18847 181 aa22.24■■□□□ 1.15
USP48-201ENST00000308271 IL13P35225 146 aa22.24■■□□□ 1.15
USP48-201ENST00000308271 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa22.24■■□□□ 1.15
USP48-201ENST00000308271 TSC1Q92574 1164 aa22.24■■□□□ 1.15
USP48-201ENST00000308271 MCM6Q14566 821 aa22.23■■□□□ 1.15
USP48-201ENST00000308271 NAPBQ9H115 298 aa22.23■■□□□ 1.15
USP48-201ENST00000308271 ZRANB1Q9UGI0 708 aa22.23■■□□□ 1.15
USP48-201ENST00000308271 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
USP48-201ENST00000308271 CTR9Q6PD62 1173 aa22.23■■□□□ 1.15
USP48-201ENST00000308271 G2E3Q7L622 706 aa22.23■■□□□ 1.15
USP48-201ENST00000308271 FAM160A1Q05DH4 1040 aa22.23■■□□□ 1.15
USP48-201ENST00000308271 METTL24Q5JXM2 366 aa22.23■■□□□ 1.15
USP48-201ENST00000308271 GRM8O00222 908 aa22.23■■□□□ 1.15
USP48-201ENST00000308271 PAFAH1B1P43034 410 aa22.23■■□□□ 1.15
USP48-201ENST00000308271 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
USP48-201ENST00000308271 CEP112Q8N8E3 955 aa22.23■■□□□ 1.15
USP48-201ENST00000308271 ABCC1P33527 1531 aa22.22■■□□□ 1.15
USP48-201ENST00000308271 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa22.22■■□□□ 1.15
USP48-201ENST00000308271 CTAGE15A4D2H0 777 aa22.22■■□□□ 1.15
USP48-201ENST00000308271 RAD21O60216 631 aa22.22■■□□□ 1.15
USP48-201ENST00000308271 CTAGE8P0CG41 777 aa22.22■■□□□ 1.15
USP48-201ENST00000308271 CTAGE6Q86UF2 777 aa22.22■■□□□ 1.15
USP48-201ENST00000308271 CTAGE4Q8IX94 777 aa22.22■■□□□ 1.15
USP48-201ENST00000308271 TTC21AQ8NDW8 1320 aa22.22■■□□□ 1.15
USP48-201ENST00000308271 USO1O60763 962 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
USP48-201ENST00000308271 KSR2Q6VAB6 950 aa22.22■■□□□ 1.15
USP48-201ENST00000308271 TAF4BQ92750 862 aa22.22■■□□□ 1.15
USP48-201ENST00000308271 MPHOSPH8Q99549 860 aa22.22■■□□□ 1.15
USP48-201ENST00000308271 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP22.21■■□□□ 1.15
USP48-201ENST00000308271 ANKRD24Q8TF21 1146 aa22.21■■□□□ 1.15
USP48-201ENST00000308271 MICALCLQ6ZW33 695 aa22.21■■□□□ 1.15
USP48-201ENST00000308271 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
USP48-201ENST00000308271 CCDC175P0C221 793 aa22.21■■□□□ 1.15
USP48-201ENST00000308271 FKBP15Q5T1M5 1219 aa22.2■■□□□ 1.14
USP48-201ENST00000308271 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
USP48-201ENST00000308271 HAND2P61296 217 aa22.2■■□□□ 1.14
USP48-201ENST00000308271 GIMAP7Q8NHV1 300 aa22.2■■□□□ 1.14
USP48-201ENST00000308271 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
USP48-201ENST00000308271 GTF3C6Q969F1 213 aa22.2■■□□□ 1.14
USP48-201ENST00000308271 PTPDC1A2A3K4 754 aa22.19■■□□□ 1.14
USP48-201ENST00000308271 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa22.19■■□□□ 1.14
USP48-201ENST00000308271 CTAGE1Q96RT6 745 aa22.19■■□□□ 1.14
USP48-201ENST00000308271 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
USP48-201ENST00000308271 ARHGEF5Q12774 1597 aa22.19■■□□□ 1.14
USP48-201ENST00000308271 TUBBP07437 444 aa22.19■■□□□ 1.14
USP48-201ENST00000308271 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
USP48-201ENST00000308271 EHBP1Q8NDI1 1231 aa22.19■■□□□ 1.14
USP48-201ENST00000308271 TM6SF1Q9BZW5 370 aa22.19■■□□□ 1.14
USP48-201ENST00000308271 BCORL1Q5H9F3 1711 aa22.19■■□□□ 1.14
USP48-201ENST00000308271 CAPN2P17655 700 aa22.19■■□□□ 1.14
USP48-201ENST00000308271 LINS1Q8NG48 757 aa22.19■■□□□ 1.14
USP48-201ENST00000308271 RPS6KB1P23443 525 aa22.19■■□□□ 1.14
USP48-201ENST00000308271 FAM173BQ6P4H8 233 aa22.19■■□□□ 1.14
USP48-201ENST00000308271 ERBB4Q15303 1308 aa22.19■■□□□ 1.14
USP48-201ENST00000308271 KRT18P05783 430 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
USP48-201ENST00000308271 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
USP48-201ENST00000308271 ELF2Q15723 593 aa22.18■■□□□ 1.14
USP48-201ENST00000308271 MICU3Q86XE3 530 aa22.18■■□□□ 1.14
USP48-201ENST00000308271 IMPACTQ9P2X3 320 aa22.18■■□□□ 1.14
USP48-201ENST00000308271 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
USP48-201ENST00000308271 N4BP3O15049 544 aa22.18■■□□□ 1.14
USP48-201ENST00000308271 BRAPQ7Z569 592 aa22.18■■□□□ 1.14
USP48-201ENST00000308271 ALG1Q9BT22 464 aa22.18■■□□□ 1.14
USP48-201ENST00000308271 LRP2BPQ9P2M1 347 aa22.18■■□□□ 1.14
USP48-201ENST00000308271 ABCC10Q5T3U5 1492 aa22.17■■□□□ 1.14
USP48-201ENST00000308271 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa22.17■■□□□ 1.14
USP48-201ENST00000308271 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
USP48-201ENST00000308271 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
USP48-201ENST00000308271 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
USP48-201ENST00000308271 CCDC82Q8N4S0 544 aa22.17■■□□□ 1.14
USP48-201ENST00000308271 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP22.17■■□□□ 1.148e-9■■□□□ 11.7
USP48-201ENST00000308271 PLEKHF1Q96S99 279 aa22.17■■□□□ 1.14
USP48-201ENST00000308271 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
USP48-201ENST00000308271 SOGA3Q5TF21 947 aa22.16■■□□□ 1.14
USP48-201ENST00000308271 KIAA0232Q92628 1395 aa22.16■■□□□ 1.14
USP48-201ENST00000308271 EVCP57679 992 aa22.16■■□□□ 1.14
USP48-201ENST00000308271 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
USP48-201ENST00000308271 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
USP48-201ENST00000308271 FLT4P35916 1363 aa22.16■■□□□ 1.14
USP48-201ENST00000308271 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa22.16■■□□□ 1.14
USP48-201ENST00000308271 FOXO3O43524 673 aa22.16■■□□□ 1.14
USP48-201ENST00000308271 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
USP48-201ENST00000308271 SPAG1Q07617 926 aa22.16■■□□□ 1.14
USP48-201ENST00000308271 TMEM67Q5HYA8 995 aa22.16■■□□□ 1.14
USP48-201ENST00000308271 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.9 ms