RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293861.7

SNRNP25-201, Transcript of small nuclear ribonucleoprotein U11/U12 subunit 25, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best)

Gene SNRNP25, Length 1,905 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRNP25-201ENST00000293861 BOLA2Q9H3K6 86 aa26.04■■□□□ 1.76
SNRNP25-201ENST00000293861 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa26.04■■□□□ 1.76
SNRNP25-201ENST00000293861 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP26.03■■□□□ 1.76
SNRNP25-201ENST00000293861 GPTP24298 496 aa26.03■■□□□ 1.76
SNRNP25-201ENST00000293861 HSPA1LP34931 641 aa26.03■■□□□ 1.76
SNRNP25-201ENST00000293861 ZNF34Q8IZ26 560 aa26.03■■□□□ 1.76
SNRNP25-201ENST00000293861 CCDC57Q2TAC2 916 aa26.02■■□□□ 1.76
SNRNP25-201ENST00000293861 RFX7Q2KHR2 1363 aa26.02■■□□□ 1.76
SNRNP25-201ENST00000293861 NEK4P51957 841 aa26.01■■□□□ 1.75
SNRNP25-201ENST00000293861 NHSQ6T4R5 1651 aa26■■□□□ 1.75
SNRNP25-201ENST00000293861 ZNF609O15014 1411 aa26■■□□□ 1.75
SNRNP25-201ENST00000293861 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP26■■□□□ 1.75
SNRNP25-201ENST00000293861 DBNDD2Q9BQY9 259 aa26■■□□□ 1.75
SNRNP25-201ENST00000293861 SPEF2Q9C093 1822 aa26■■□□□ 1.75
SNRNP25-201ENST00000293861 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP25.99■■□□□ 1.75
SNRNP25-201ENST00000293861 RAB3GAP1Q15042 981 aa25.98■■□□□ 1.75
SNRNP25-201ENST00000293861 AFF2P51816 1311 aa25.98■■□□□ 1.75
SNRNP25-201ENST00000293861 UBN2Q6ZU65 1347 aa25.98■■□□□ 1.75
SNRNP25-201ENST00000293861 CAMTA2O94983 1202 aa25.98■■□□□ 1.75
SNRNP25-201ENST00000293861 LRRC24Q50LG9 513 aa25.98■■□□□ 1.75
SNRNP25-201ENST00000293861 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP25.98■■□□□ 1.75
SNRNP25-201ENST00000293861 HAUS7Q99871 368 aa25.98■■□□□ 1.75
SNRNP25-201ENST00000293861 FSD1Q9BTV5 496 aa25.98■■□□□ 1.75
SNRNP25-201ENST00000293861 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP25.97■■□□□ 1.75
SNRNP25-201ENST00000293861 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP25.97■■□□□ 1.75
SNRNP25-201ENST00000293861 TICAM2Q86XR7 235 aa25.97■■□□□ 1.75
SNRNP25-201ENST00000293861 AK7Q96M32 723 aa25.97■■□□□ 1.75
SNRNP25-201ENST00000293861 ATRNO75882 1429 aa25.97■■□□□ 1.75
SNRNP25-201ENST00000293861 CTSWP56202 376 aa25.96■■□□□ 1.75
SNRNP25-201ENST00000293861 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP25.96■■□□□ 1.75
SNRNP25-201ENST00000293861 KCNB2Q92953 911 aa25.96■■□□□ 1.75
SNRNP25-201ENST00000293861 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
SNRNP25-201ENST00000293861 SNX14Q9Y5W7 946 aa25.96■■□□□ 1.75
SNRNP25-201ENST00000293861 MCM4P33991 863 aa25.96■■□□□ 1.75
SNRNP25-201ENST00000293861 DEKP35659 375 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
SNRNP25-201ENST00000293861 TTLL11Q8NHH1 800 aa25.96■■□□□ 1.75
SNRNP25-201ENST00000293861 BTAF1O14981 1849 aa25.95■■□□□ 1.75
SNRNP25-201ENST00000293861 BCORQ6W2J9 1755 aa25.95■■□□□ 1.75
SNRNP25-201ENST00000293861 CCDC171Q6TFL3 1326 aa25.95■■□□□ 1.75
SNRNP25-201ENST00000293861 PDE8AO60658 829 aa25.95■■□□□ 1.74
SNRNP25-201ENST00000293861 PARP10Q53GL7 1025 aa25.95■■□□□ 1.74
SNRNP25-201ENST00000293861 MED23Q9ULK4 1368 aa25.95■■□□□ 1.74
SNRNP25-201ENST00000293861 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa25.95■■□□□ 1.74
SNRNP25-201ENST00000293861 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP25.94■■□□□ 1.74
SNRNP25-201ENST00000293861 TAF7LQ5H9L4 462 aa25.94■■□□□ 1.74
SNRNP25-201ENST00000293861 SYNE4Q8N205 404 aa25.94■■□□□ 1.74
SNRNP25-201ENST00000293861 FOXD4L1Q9NU39 408 aa25.94■■□□□ 1.74
SNRNP25-201ENST00000293861 CEP126Q9P2H0 1117 aa25.94■■□□□ 1.74
SNRNP25-201ENST00000293861 PTH1RQ03431 593 aa25.94■■□□□ 1.74
SNRNP25-201ENST00000293861 FAM227BQ96M60 508 aa25.94■■□□□ 1.74
SNRNP25-201ENST00000293861 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP25.94■■□□□ 1.74
SNRNP25-201ENST00000293861 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP25.94■■□□□ 1.74
SNRNP25-201ENST00000293861 LINC00116Q8NCU8 138 aa25.93■■□□□ 1.74
SNRNP25-201ENST00000293861 LAMB2P55268 1798 aa25.93■■□□□ 1.74
SNRNP25-201ENST00000293861 MAP4K1Q92918 833 aa25.92■■□□□ 1.74
SNRNP25-201ENST00000293861 AKAP2Q9Y2D5 859 aa25.92■■□□□ 1.74
SNRNP25-201ENST00000293861 A0A0D9SFI3 127 aa25.92■■□□□ 1.74
SNRNP25-201ENST00000293861 RGL2O15211 777 aa25.92■■□□□ 1.74
SNRNP25-201ENST00000293861 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP25.92■■□□□ 1.74
SNRNP25-201ENST00000293861 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP25.92■■□□□ 1.74
SNRNP25-201ENST00000293861 TMX3Q96JJ7 454 aa25.92■■□□□ 1.74
SNRNP25-201ENST00000293861 NEUROD6Q96NK8 337 aa25.92■■□□□ 1.74
SNRNP25-201ENST00000293861 ZNF652Q9Y2D9 606 aa25.92■■□□□ 1.74
SNRNP25-201ENST00000293861 SH3TC1Q8TE82 1336 aa25.91■■□□□ 1.74
SNRNP25-201ENST00000293861 A0A1B0GUL7 405 aa25.91■■□□□ 1.74
SNRNP25-201ENST00000293861 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa25.91■■□□□ 1.74
SNRNP25-201ENST00000293861 ITGA6P23229 1130 aa25.91■■□□□ 1.74
SNRNP25-201ENST00000293861 TIMM10P62072 90 aa25.91■■□□□ 1.74
SNRNP25-201ENST00000293861 CUL4AQ13619 759 aa25.91■■□□□ 1.74
SNRNP25-201ENST00000293861 NECTIN1Q15223 517 aa25.91■■□□□ 1.74
SNRNP25-201ENST00000293861 RASEFQ8IZ41 740 aa25.91■■□□□ 1.74
SNRNP25-201ENST00000293861 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
SNRNP25-201ENST00000293861 CLEC4GQ6UXB4 293 aa25.9■■□□□ 1.74
SNRNP25-201ENST00000293861 GREM2Q9H772 168 aa25.9■■□□□ 1.74
SNRNP25-201ENST00000293861 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP25.9■■□□□ 1.74
SNRNP25-201ENST00000293861 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP25.9■■□□□ 1.74
SNRNP25-201ENST00000293861 SUSD4Q5VX71 490 aa25.9■■□□□ 1.74
SNRNP25-201ENST00000293861 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP25.9■■□□□ 1.74
SNRNP25-201ENST00000293861 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP25.9■■□□□ 1.74
SNRNP25-201ENST00000293861 LRP5O75197 1615 aa25.9■■□□□ 1.74
SNRNP25-201ENST00000293861 NUCB2P80303 420 aa25.89■■□□□ 1.74
SNRNP25-201ENST00000293861 CLEC17AQ6ZS10 378 aa25.89■■□□□ 1.74
SNRNP25-201ENST00000293861 KBTBD3Q8NAB2 608 aa25.89■■□□□ 1.74
SNRNP25-201ENST00000293861 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP25.89■■□□□ 1.74
SNRNP25-201ENST00000293861 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP25.89■■□□□ 1.74
SNRNP25-201ENST00000293861 TM6SF1Q9BZW5 370 aa25.89■■□□□ 1.74
SNRNP25-201ENST00000293861 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP25.88■■□□□ 1.73
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SNRNP25-201ENST00000293861 RIC1Q4ADV7 1423 aa25.88■■□□□ 1.73
SNRNP25-201ENST00000293861 PTF1AQ7RTS3 328 aa25.88■■□□□ 1.73
SNRNP25-201ENST00000293861 GBP4Q96PP9 640 aa25.88■■□□□ 1.73
SNRNP25-201ENST00000293861 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP25.88■■□□□ 1.73
SNRNP25-201ENST00000293861 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa25.88■■□□□ 1.73
SNRNP25-201ENST00000293861 SBF2Q86WG5 1849 aa25.87■■□□□ 1.73
SNRNP25-201ENST00000293861 DDX11L8A8MPP1 907 aa25.87■■□□□ 1.73
SNRNP25-201ENST00000293861 GSE1Q14687 1217 aa25.87■■□□□ 1.73
SNRNP25-201ENST00000293861 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP25.87■■□□□ 1.73
SNRNP25-201ENST00000293861 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP25.86■■□□□ 1.73
SNRNP25-201ENST00000293861 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP25.86■■□□□ 1.73
SNRNP25-201ENST00000293861 LY75O60449 1722 aa25.86■■□□□ 1.73
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