RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000287543.4

MALSU1-201, Transcript of mitochondrial assembly of ribosomal large subunit 1, humanhuman

TSL 2

Gene MALSU1, Length 572 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MALSU1-201ENST00000287543 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa24.18■■□□□ 1.46
MALSU1-201ENST00000287543 PDE8AO60658 829 aa24.18■■□□□ 1.46
MALSU1-201ENST00000287543 DDNO94850 711 aaPredicted RBP24.18■■□□□ 1.46
MALSU1-201ENST00000287543 G2E3Q7L622 706 aa24.18■■□□□ 1.46
MALSU1-201ENST00000287543 LARGE2Q8N3Y3 721 aa24.18■■□□□ 1.46
MALSU1-201ENST00000287543 MPNDQ8N594 471 aa24.18■■□□□ 1.46
MALSU1-201ENST00000287543 E9PSI1 815 aa24.17■■□□□ 1.46
MALSU1-201ENST00000287543 IGKV5-2P06315 115 aa24.17■■□□□ 1.46
MALSU1-201ENST00000287543 EIF6P56537 245 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
MALSU1-201ENST00000287543 CCDC152Q4G0S7 254 aa24.17■■□□□ 1.46
MALSU1-201ENST00000287543 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP24.17■■□□□ 1.46
MALSU1-201ENST00000287543 CDHR2Q9BYE9 1310 aa24.16■■□□□ 1.46
MALSU1-201ENST00000287543 DNAAF4Q8WXU2 420 aa24.16■■□□□ 1.46
MALSU1-201ENST00000287543 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa24.16■■□□□ 1.46
MALSU1-201ENST00000287543 NEURL1BA8MQ27 555 aa24.15■■□□□ 1.46
MALSU1-201ENST00000287543 RPS8P62241 208 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
MALSU1-201ENST00000287543 NIM1KQ8IY84 436 aa24.15■■□□□ 1.46
MALSU1-201ENST00000287543 POTECB2RU33 542 aa24.14■■□□□ 1.45
MALSU1-201ENST00000287543 PPIP5K2O43314 1243 aa24.14■■□□□ 1.45
MALSU1-201ENST00000287543 APLP1P51693 650 aa24.14■■□□□ 1.45
MALSU1-201ENST00000287543 GPC2Q8N158 579 aa24.14■■□□□ 1.45
MALSU1-201ENST00000287543 LINS1Q8NG48 757 aa24.14■■□□□ 1.45
MALSU1-201ENST00000287543 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
MALSU1-201ENST00000287543 ZNF541Q9H0D2 1346 aa24.11■■□□□ 1.45
MALSU1-201ENST00000287543 H7C1W4 665 aa24.11■■□□□ 1.45
MALSU1-201ENST00000287543 GCKRQ14397 625 aa24.11■■□□□ 1.45
MALSU1-201ENST00000287543 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
MALSU1-201ENST00000287543 KIAA2012Q0VF49 1180 aa24.1■■□□□ 1.45
MALSU1-201ENST00000287543 AOC3Q16853 763 aa24.1■■□□□ 1.45
MALSU1-201ENST00000287543 HACL1Q9UJ83 578 aa24.1■■□□□ 1.45
MALSU1-201ENST00000287543 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
MALSU1-201ENST00000287543 CTSWP56202 376 aa24.09■■□□□ 1.45
MALSU1-201ENST00000287543 SLFN5Q08AF3 891 aa24.09■■□□□ 1.45
MALSU1-201ENST00000287543 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP24.09■■□□□ 1.45
MALSU1-201ENST00000287543 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
MALSU1-201ENST00000287543 ZNRF3Q9ULT6 936 aa24.09■■□□□ 1.45
MALSU1-201ENST00000287543 TIAM2Q8IVF5 1701 aa24.08■■□□□ 1.45
MALSU1-201ENST00000287543 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa24.08■■□□□ 1.45
MALSU1-201ENST00000287543 EYA3Q99504 573 aa24.08■■□□□ 1.45
MALSU1-201ENST00000287543 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.45
MALSU1-201ENST00000287543 WDR90Q96KV7 1748 aa24.07■■□□□ 1.44
MALSU1-201ENST00000287543 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa24.07■■□□□ 1.44
MALSU1-201ENST00000287543 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP24.07■■□□□ 1.44
MALSU1-201ENST00000287543 PLA2G12BQ9BX93 195 aa24.07■■□□□ 1.44
MALSU1-201ENST00000287543 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
MALSU1-201ENST00000287543 WASHC4Q2M389 1173 aa24.06■■□□□ 1.44
MALSU1-201ENST00000287543 SLC51AQ86UW1 340 aa24.06■■□□□ 1.44
MALSU1-201ENST00000287543 TTLL11Q8NHH1 800 aa24.06■■□□□ 1.44
MALSU1-201ENST00000287543 SEC31BQ9NQW1 1179 aa24.06■■□□□ 1.44
MALSU1-201ENST00000287543 GJA3Q9Y6H8 435 aa24.06■■□□□ 1.44
MALSU1-201ENST00000287543 CACNA1SQ13698 1873 aa24.05■■□□□ 1.44
MALSU1-201ENST00000287543 C6orf229H3BNL8 230 aa24.05■■□□□ 1.44
MALSU1-201ENST00000287543 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
MALSU1-201ENST00000287543 CHADLQ6NUI6 762 aa24.05■■□□□ 1.44
MALSU1-201ENST00000287543 LDHDQ86WU2 507 aa24.05■■□□□ 1.44
MALSU1-201ENST00000287543 PODXL2Q9NZ53 605 aa24.05■■□□□ 1.44
MALSU1-201ENST00000287543 RTL9Q8NET4 1388 aa24.04■■□□□ 1.44
MALSU1-201ENST00000287543 EPHX2P34913 555 aa24.04■■□□□ 1.44
MALSU1-201ENST00000287543 GPSM2P81274 684 aa24.04■■□□□ 1.44
MALSU1-201ENST00000287543 TNIP1Q15025 636 aa24.04■■□□□ 1.44
MALSU1-201ENST00000287543 BEND3Q5T5X7 828 aa24.04■■□□□ 1.44
MALSU1-201ENST00000287543 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP24.04■■□□□ 1.44
MALSU1-201ENST00000287543 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
MALSU1-201ENST00000287543 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa24.03■■□□□ 1.44
MALSU1-201ENST00000287543 F6X3S4 739 aa24.02■■□□□ 1.44
MALSU1-201ENST00000287543 ALDH1L1O75891 902 aa24.02■■□□□ 1.44
MALSU1-201ENST00000287543 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP24.02■■□□□ 1.44
MALSU1-201ENST00000287543 CASP7P55210 303 aa24.02■■□□□ 1.44
MALSU1-201ENST00000287543 CIAPIN1Q6FI81 312 aa24.02■■□□□ 1.44
MALSU1-201ENST00000287543 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP24.02■■□□□ 1.44
MALSU1-201ENST00000287543 GGA1Q9UJY5 639 aa24.02■■□□□ 1.44
MALSU1-201ENST00000287543 CXCL9Q07325 125 aa24.01■■□□□ 1.43
MALSU1-201ENST00000287543 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP24.01■■□□□ 1.43
MALSU1-201ENST00000287543 TBC1D16Q8TBP0 767 aa24.01■■□□□ 1.43
MALSU1-201ENST00000287543 GREM2Q9H772 168 aa24.01■■□□□ 1.43
MALSU1-201ENST00000287543 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP24.01■■□□□ 1.43
MALSU1-201ENST00000287543 POLLQ9UGP5 575 aa24.01■■□□□ 1.43
MALSU1-201ENST00000287543 CSF1RP07333 972 aa24■■□□□ 1.43
MALSU1-201ENST00000287543 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP24■■□□□ 1.43
MALSU1-201ENST00000287543 ALDH1L2Q3SY69 923 aa24■■□□□ 1.43
MALSU1-201ENST00000287543 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP24■■□□□ 1.43
MALSU1-201ENST00000287543 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP24■■□□□ 1.43
MALSU1-201ENST00000287543 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa24■■□□□ 1.43
MALSU1-201ENST00000287543 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP24■■□□□ 1.43
MALSU1-201ENST00000287543 PTPRCP08575 1304 aa24■■□□□ 1.43
MALSU1-201ENST00000287543 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa23.99■■□□□ 1.43
MALSU1-201ENST00000287543 ATP2B4P23634 1241 aa23.99■■□□□ 1.43
MALSU1-201ENST00000287543 CLEC11AQ9Y240 323 aa23.99■■□□□ 1.43
MALSU1-201ENST00000287543 XDHP47989 1333 aa23.99■■□□□ 1.43
MALSU1-201ENST00000287543 UFL1O94874 794 aa23.98■■□□□ 1.43
MALSU1-201ENST00000287543 SCNN1DP51172 638 aa23.98■■□□□ 1.43
MALSU1-201ENST00000287543 SLC4A10Q6U841 1118 aa23.98■■□□□ 1.43
MALSU1-201ENST00000287543 CDCA7LQ96GN5 454 aa23.98■■□□□ 1.43
MALSU1-201ENST00000287543 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP23.98■■□□□ 1.43
MALSU1-201ENST00000287543 G3V3G9 751 aa23.97■■□□□ 1.43
MALSU1-201ENST00000287543 GRM8O00222 908 aa23.97■■□□□ 1.43
MALSU1-201ENST00000287543 RIMBP2O15034 1052 aa23.97■■□□□ 1.43
MALSU1-201ENST00000287543 COL4A5P29400 1685 aa23.97■■□□□ 1.43
MALSU1-201ENST00000287543 LAMB2P55268 1798 aa23.97■■□□□ 1.43
MALSU1-201ENST00000287543 DCAF8Q5TAQ9 597 aa23.97■■□□□ 1.43
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