RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000270792.9

SH3BGRL3-201, Transcript of SH3 domain binding glutamate rich protein like 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BGRL3, Length 1,661 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PDE8AO60658 829 aa25.3■■□□□ 1.64
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 DCTPP1Q9H773 170 aa25.29■■□□□ 1.64
SH3BGRL3-201ENST00000270792 NUCB1Q02818 461 aa25.29■■□□□ 1.64
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CTSWP56202 376 aa25.28■■□□□ 1.64
SH3BGRL3-201ENST00000270792 LMBR1LQ6UX01 489 aa25.28■■□□□ 1.64
SH3BGRL3-201ENST00000270792 HDAC5Q9UQL6 1122 aa25.28■■□□□ 1.64
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 KLHL34Q8N239 644 aa25.27■■□□□ 1.64
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 BRIP1Q9BX63 1249 aa25.27■■□□□ 1.64
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 TTLL11Q8NHH1 800 aa25.26■■□□□ 1.63
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CHMP3Q9Y3E7 222 aa25.26■■□□□ 1.63
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CHD1LQ86WJ1 897 aa25.25■■□□□ 1.63
SH3BGRL3-201ENST00000270792 C10orf71Q711Q0 1435 aa25.25■■□□□ 1.63
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 FAM161AQ3B820 660 aa25.24■■□□□ 1.63
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 GREM2Q9H772 168 aa25.24■■□□□ 1.63
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa25.24■■□□□ 1.63
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa25.23■■□□□ 1.63
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 CHRNA5P30532 468 aa25.23■■□□□ 1.63
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ANKRD45Q5TZF3 282 aa25.23■■□□□ 1.63
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SEC31BQ9NQW1 1179 aa25.23■■□□□ 1.63
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PDE4AP27815 886 aa25.22■■□□□ 1.63
SH3BGRL3-201ENST00000270792 RIC1Q4ADV7 1423 aa25.21■■□□□ 1.63
SH3BGRL3-201ENST00000270792 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PDE6BP35913 854 aa25.21■■□□□ 1.63
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CCDC152Q4G0S7 254 aa25.21■■□□□ 1.63
SH3BGRL3-201ENST00000270792 LAMB2P55268 1798 aa25.21■■□□□ 1.63
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SRGAP3O43295 1099 aa25.2■■□□□ 1.63
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CRY2Q49AN0 593 aa25.2■■□□□ 1.63
SH3BGRL3-201ENST00000270792 C2CD5Q86YS7 1000 aa25.2■■□□□ 1.63
SH3BGRL3-201ENST00000270792 LNPKQ9C0E8 428 aa25.2■■□□□ 1.63
SH3BGRL3-201ENST00000270792 KLHDC4Q8TBB5 520 aa25.2■■□□□ 1.62
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SSH3Q8TE77 659 aa25.2■■□□□ 1.62
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ITGA6P23229 1130 aa25.19■■□□□ 1.62
SH3BGRL3-201ENST00000270792 MTX1Q13505 466 aa25.19■■□□□ 1.62
SH3BGRL3-201ENST00000270792 A0A0G2JLW4 131 aa25.18■■□□□ 1.62
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SRGNP10124 158 aa25.18■■□□□ 1.62
SH3BGRL3-201ENST00000270792 POLA2Q14181 598 aa25.18■■□□□ 1.62
SH3BGRL3-201ENST00000270792 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
SH3BGRL3-201ENST00000270792 MYH3P11055 1940 aa25.17■■□□□ 1.62
SH3BGRL3-201ENST00000270792 DPEP1P16444 411 aa25.17■■□□□ 1.62
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
SH3BGRL3-201ENST00000270792 COL4A1P02462 1669 aa25.17■■□□□ 1.62
SH3BGRL3-201ENST00000270792 H0YIN7 160 aa25.17■■□□□ 1.62
SH3BGRL3-201ENST00000270792 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP25.17■■□□□ 1.62
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 CCDC57Q2TAC2 916 aa25.16■■□□□ 1.62
SH3BGRL3-201ENST00000270792 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
SH3BGRL3-201ENST00000270792 BACH2Q9BYV9 841 aa25.16■■□□□ 1.62
SH3BGRL3-201ENST00000270792 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
SH3BGRL3-201ENST00000270792 WWC3Q9ULE0 1092 aa25.16■■□□□ 1.62
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CD2APQ9Y5K6 639 aa25.16■■□□□ 1.62
SH3BGRL3-201ENST00000270792 NLGN2Q8NFZ4 835 aa25.15■■□□□ 1.62
SH3BGRL3-201ENST00000270792 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa25.14■■□□□ 1.62
SH3BGRL3-201ENST00000270792 NPR1P16066 1061 aa25.14■■□□□ 1.62
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SLC51AQ86UW1 340 aa25.14■■□□□ 1.62
SH3BGRL3-201ENST00000270792 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.62
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TAF1P21675 1872 aa25.14■■□□□ 1.62
SH3BGRL3-201ENST00000270792 RTL9Q8NET4 1388 aa25.13■■□□□ 1.61
SH3BGRL3-201ENST00000270792 MASTLQ96GX5 879 aa25.13■■□□□ 1.61
SH3BGRL3-201ENST00000270792 KIF13BQ9NQT8 1826 aa25.13■■□□□ 1.61
SH3BGRL3-201ENST00000270792 KCNA3P22001 575 aa25.13■■□□□ 1.61
SH3BGRL3-201ENST00000270792 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
SH3BGRL3-201ENST00000270792 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TGFB2P61812 414 aa25.12■■□□□ 1.61
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TAF7LQ5H9L4 462 aa25.12■■□□□ 1.61
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SIL1Q9H173 461 aa25.12■■□□□ 1.61
SH3BGRL3-201ENST00000270792 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa25.12■■□□□ 1.61
SH3BGRL3-201ENST00000270792 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CRAMP1Q96RY5 1269 aa25.1■■□□□ 1.61
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 C8orf34Q49A92 452 aa25.1■■□□□ 1.61
SH3BGRL3-201ENST00000270792 STYK1Q6J9G0 422 aa25.1■■□□□ 1.61
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa25.1■■□□□ 1.61
SH3BGRL3-201ENST00000270792 LRRC24Q50LG9 513 aa25.09■■□□□ 1.61
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SYT17Q9BSW7 474 aa25.09■■□□□ 1.61
SH3BGRL3-201ENST00000270792 APBB1O00213 710 aa25.08■■□□□ 1.61
SH3BGRL3-201ENST00000270792 RAB11FIP3O75154 756 aa25.08■■□□□ 1.61
SH3BGRL3-201ENST00000270792 LRRCC1Q9C099 1032 aa25.08■■□□□ 1.61
SH3BGRL3-201ENST00000270792 COPRSQ9NQ92 184 aa25.08■■□□□ 1.61
SH3BGRL3-201ENST00000270792 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa25.08■■□□□ 1.6
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SURF6O75683 361 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
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