RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000057742.14

Cpne4-201, Transcript of Copine-4, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Cpne4, Length 3,959 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne4-201ENSMUST00000057742 Fam53cQ8BXQ8 393 aa16■□□□□ 0.15
Cpne4-201ENSMUST00000057742 Tbc1d4Q8BYJ6 1307 aa16■□□□□ 0.15
Cpne4-201ENSMUST00000057742 Ifit1Q64282 463 aa16■□□□□ 0.15
Cpne4-201ENSMUST00000057742 Robo2Q7TPD3 1470 aa16■□□□□ 0.15
Cpne4-201ENSMUST00000057742 Aox4Q3TYQ9 1336 aa16■□□□□ 0.15
Cpne4-201ENSMUST00000057742 Tsen34Q8BMZ5 316 aa16■□□□□ 0.15
Cpne4-201ENSMUST00000057742 Ankrd1Q9CR42 319 aa16■□□□□ 0.15
Cpne4-201ENSMUST00000057742 Mrpl44Q9CY73 333 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
Cpne4-201ENSMUST00000057742 Chaf1aQ9QWF0 911 aa16■□□□□ 0.15
Cpne4-201ENSMUST00000057742 Dpf1Q9QX66 387 aa16■□□□□ 0.15
Cpne4-201ENSMUST00000057742 Prr29B1ARI9 187 aa15.99■□□□□ 0.15
Cpne4-201ENSMUST00000057742 Tpm3-rs7D3Z2H9 248 aa15.99■□□□□ 0.15
Cpne4-201ENSMUST00000057742 Bcl2l13P59017 434 aa15.99■□□□□ 0.15
Cpne4-201ENSMUST00000057742 Cplx1P63040 134 aa15.99■□□□□ 0.15
Cpne4-201ENSMUST00000057742 Rps6kb1Q8BSK8 525 aa15.99■□□□□ 0.15
Cpne4-201ENSMUST00000057742 OptnQ8K3K8 584 aa15.99■□□□□ 0.15
Cpne4-201ENSMUST00000057742 Snap23O09044 210 aa15.99■□□□□ 0.15
Cpne4-201ENSMUST00000057742 Ppp1r10Q80W00 888 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
Cpne4-201ENSMUST00000057742 Mei4Q8BRM6 389 aa15.99■□□□□ 0.15
Cpne4-201ENSMUST00000057742 Evc2Q8K1G2 1220 aa15.99■□□□□ 0.15
Cpne4-201ENSMUST00000057742 Bag3Q9JLV1 577 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
Cpne4-201ENSMUST00000057742 Exoc3l2D3YUP5 789 aa15.99■□□□□ 0.15
Cpne4-201ENSMUST00000057742 H2afxP27661 143 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
Cpne4-201ENSMUST00000057742 Ccdc73Q8CDM4 1066 aa15.99■□□□□ 0.15
Cpne4-201ENSMUST00000057742 Ttc37F8VPK0 1563 aa15.98■□□□□ 0.15
Cpne4-201ENSMUST00000057742 Trpm1Q2TV84 1622 aa15.98■□□□□ 0.15
Cpne4-201ENSMUST00000057742 Recql4Q75NR7 1216 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
Cpne4-201ENSMUST00000057742 Abcb6Q9DC29 842 aa15.98■□□□□ 0.15
Cpne4-201ENSMUST00000057742 Mdm2P23804 489 aa15.98■□□□□ 0.15
Cpne4-201ENSMUST00000057742 MycbpQ9EQS3 103 aa15.98■□□□□ 0.15
Cpne4-201ENSMUST00000057742 Fkbp4P30416 458 aa15.98■□□□□ 0.15
Cpne4-201ENSMUST00000057742 Atp1a2Q6PIE5 1020 aa15.98■□□□□ 0.15
Cpne4-201ENSMUST00000057742 Brd3Q8K2F0 726 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
Cpne4-201ENSMUST00000057742 Ints4Q8CIM8 964 aa15.97■□□□□ 0.15
Cpne4-201ENSMUST00000057742 Pms1Q8K119 917 aa15.97■□□□□ 0.15
Cpne4-201ENSMUST00000057742 Gm32742A0A1B0GT42 1604 aa15.97■□□□□ 0.15
Cpne4-201ENSMUST00000057742 Pa2g4P50580 394 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
Cpne4-201ENSMUST00000057742 Usp28Q5I043 1051 aa15.97■□□□□ 0.15
Cpne4-201ENSMUST00000057742 Ddx58Q6Q899 926 aa15.97■□□□□ 0.15
Cpne4-201ENSMUST00000057742 Tmx4Q8C0L0 335 aa15.97■□□□□ 0.15
Cpne4-201ENSMUST00000057742 Add2Q9QYB8 725 aa15.97■□□□□ 0.15
Cpne4-201ENSMUST00000057742 Neurl4Q5NCX5 1563 aa15.97■□□□□ 0.15
Cpne4-201ENSMUST00000057742 Abca8bQ8K440 1620 aa15.97■□□□□ 0.15
Cpne4-201ENSMUST00000057742 Smarcc1P97496 1104 aa15.97■□□□□ 0.15
Cpne4-201ENSMUST00000057742 Cep112Q5PR68 954 aa15.97■□□□□ 0.15
Cpne4-201ENSMUST00000057742 Efcab8Q8C9R9 203 aa15.97■□□□□ 0.15
Cpne4-201ENSMUST00000057742 Nol7Q9D7Z3 254 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
Cpne4-201ENSMUST00000057742 Rufy2Q8R4C2 606 aa15.96■□□□□ 0.15
Cpne4-201ENSMUST00000057742 Map3k19E9Q3S4 1311 aa15.96■□□□□ 0.15
Cpne4-201ENSMUST00000057742 TrhQ62361 256 aa15.96■□□□□ 0.15
Cpne4-201ENSMUST00000057742 Hmg20bQ9Z104 317 aa15.96■□□□□ 0.15
Cpne4-201ENSMUST00000057742 Ppp2r3dQ9Z176 491 aa15.96■□□□□ 0.15
Cpne4-201ENSMUST00000057742 Ccdc191J3QQ27 883 aa15.96■□□□□ 0.15
Cpne4-201ENSMUST00000057742 Q8CEZ4 452 aa15.96■□□□□ 0.15
Cpne4-201ENSMUST00000057742 Trim30cD3YVI9 513 aa15.95■□□□□ 0.14
Cpne4-201ENSMUST00000057742 Psme1P97371 249 aa15.95■□□□□ 0.14
Cpne4-201ENSMUST00000057742 Rhot2Q8JZN7 620 aa15.95■□□□□ 0.14
Cpne4-201ENSMUST00000057742 Evi5P97366 809 aa15.95■□□□□ 0.14
Cpne4-201ENSMUST00000057742 Zswim4Q8C7B8 1101 aa15.95■□□□□ 0.14
Cpne4-201ENSMUST00000057742 Ncoa7Q6DFV7 943 aa15.95■□□□□ 0.14
Cpne4-201ENSMUST00000057742 NpatQ8BMA5 1420 aa15.95■□□□□ 0.14
Cpne4-201ENSMUST00000057742 CoblQ5NBX1 1337 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
Cpne4-201ENSMUST00000057742 Ccdc93Q7TQK5 629 aa15.94■□□□□ 0.14
Cpne4-201ENSMUST00000057742 Col4a3bpQ9EQG9 624 aa15.94■□□□□ 0.14
Cpne4-201ENSMUST00000057742 Adgrl1Q80TR1 1466 aa15.94■□□□□ 0.14
Cpne4-201ENSMUST00000057742 Ythdc2B2RR83 1445 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
Cpne4-201ENSMUST00000057742 Pdcd11Q6NS46 1862 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
Cpne4-201ENSMUST00000057742 Diaph1O08808 1255 aa15.94■□□□□ 0.14
Cpne4-201ENSMUST00000057742 EmbP21995 330 aa15.94■□□□□ 0.14
Cpne4-201ENSMUST00000057742 Prpf4bQ61136 1007 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
Cpne4-201ENSMUST00000057742 Zfp317Q8C0Q5 607 aa15.94■□□□□ 0.14
Cpne4-201ENSMUST00000057742 Ugt1a5B2RT14 529 aa15.94■□□□□ 0.14
Cpne4-201ENSMUST00000057742 AppP12023 770 aa15.94■□□□□ 0.14
Cpne4-201ENSMUST00000057742 LyarQ08288 388 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
Cpne4-201ENSMUST00000057742 Ccdc114Q3UX62 658 aa15.94■□□□□ 0.14
Cpne4-201ENSMUST00000057742 Map3k11Q80XI6 850 aa15.94■□□□□ 0.14
Cpne4-201ENSMUST00000057742 Nos1Q9Z0J4 1429 aa15.94■□□□□ 0.14
Cpne4-201ENSMUST00000057742 AW822073A0A0N4SUK1 652 aa15.94■□□□□ 0.14
Cpne4-201ENSMUST00000057742 TrdnE9Q9K5 693 aa15.93■□□□□ 0.14
Cpne4-201ENSMUST00000057742 Eif3aP23116 1344 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
Cpne4-201ENSMUST00000057742 Dnajc25A2ALW5 357 aa15.93■□□□□ 0.14
Cpne4-201ENSMUST00000057742 Pde11aP0C1Q2 933 aa15.93■□□□□ 0.14
Cpne4-201ENSMUST00000057742 Arl8aQ8VEH3 186 aa15.93■□□□□ 0.14
Cpne4-201ENSMUST00000057742 Gm21190A0A0G2JGJ6 266 aa15.93■□□□□ 0.14
Cpne4-201ENSMUST00000057742 CalrP14211 416 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
Cpne4-201ENSMUST00000057742 Rfc1P35601 1131 aa15.93■□□□□ 0.14
Cpne4-201ENSMUST00000057742 Ccdc82Q6PG04 518 aa15.93■□□□□ 0.14
Cpne4-201ENSMUST00000057742 Golph3lQ8R088 285 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
Cpne4-201ENSMUST00000057742 SelenooQ9DBC0 667 aa15.93■□□□□ 0.14
Cpne4-201ENSMUST00000057742 Zrsr2Q62377 462 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
Cpne4-201ENSMUST00000057742 Q66JV7 365 aa15.92■□□□□ 0.14
Cpne4-201ENSMUST00000057742 Dhx40Q6PE54 779 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
Cpne4-201ENSMUST00000057742 Klhl30Q8C3F7 581 aa15.92■□□□□ 0.14
Cpne4-201ENSMUST00000057742 Prc1Q99K43 603 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
Cpne4-201ENSMUST00000057742 ShprhQ7TPQ3 1674 aa15.92■□□□□ 0.14
Cpne4-201ENSMUST00000057742 Plcb3P51432 1234 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
Cpne4-201ENSMUST00000057742 Txndc2Q6P902 515 aa15.92■□□□□ 0.14
Cpne4-201ENSMUST00000057742 Ccdc158Q8CDI6 1109 aa15.92■□□□□ 0.14
Cpne4-201ENSMUST00000057742 Irx5Q9JKQ4 484 aa15.92■□□□□ 0.14
Cpne4-201ENSMUST00000057742 Znf541Q0GGX2 1363 aa15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 64.1 ms