RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495357.1

CCDC39-AS1-201, CCDC39 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CCDC39-AS1, Length 283 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RSPO3Q9BXY4 272 aaPredicted RBP2.5□□□□□ -2.01
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CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GNPTGQ9UJJ9 305 aa2.47□□□□□ -2.01
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 STAP1Q9ULZ2 295 aa2.47□□□□□ -2.01
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa2.47□□□□□ -2.01
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP2.46□□□□□ -2.02
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CLDN3O15551 220 aa2.46□□□□□ -2.02
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MBTPS2O43462 519 aa2.46□□□□□ -2.02
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TM7SF2O76062 418 aa2.46□□□□□ -2.02
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TRIM16O95361 564 aa2.46□□□□□ -2.02
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP2.46□□□□□ -2.02
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP2.46□□□□□ -2.02
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CALCBP10092 127 aa2.46□□□□□ -2.02
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 COX5AP20674 150 aa2.46□□□□□ -2.02
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CALCRP30988 508 aa2.46□□□□□ -2.02
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