RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488013.1

HDLBP-242, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 2

Gene HDLBP, Length 651 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-242ENST00000488013 SLC35A1P78382 337 aa9.96□□□□□ -0.82
HDLBP-242ENST00000488013 SEC23BQ15437 767 aa9.96□□□□□ -0.82
HDLBP-242ENST00000488013 ZNF74Q16587 644 aa9.96□□□□□ -0.82
HDLBP-242ENST00000488013 ST3GAL2Q16842 350 aa9.96□□□□□ -0.82
HDLBP-242ENST00000488013 TMEM176BQ3YBM2 270 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
HDLBP-242ENST00000488013 WIPI1Q5MNZ9 446 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
HDLBP-242ENST00000488013 KDM4DQ6B0I6 523 aa9.96□□□□□ -0.82
HDLBP-242ENST00000488013 PGBD2Q6P3X8 592 aa9.96□□□□□ -0.82
HDLBP-242ENST00000488013 POMZP3Q6PJE2 187 aa9.96□□□□□ -0.82
HDLBP-242ENST00000488013 WDR88Q6ZMY6 472 aa9.96□□□□□ -0.82
HDLBP-242ENST00000488013 TMPPEQ6ZT21 453 aa9.96□□□□□ -0.82
HDLBP-242ENST00000488013 TRILQ7L0X0 811 aa9.96□□□□□ -0.82
HDLBP-242ENST00000488013 ZER1Q7Z7L7 766 aa9.96□□□□□ -0.82
HDLBP-242ENST00000488013 PM20D2Q8IYS1 436 aa9.96□□□□□ -0.82
HDLBP-242ENST00000488013 C10orf53Q8N6V4 93 aa9.96□□□□□ -0.82
HDLBP-242ENST00000488013 CLDN22Q8N7P3 220 aa9.96□□□□□ -0.82
HDLBP-242ENST00000488013 OSTF1Q92882 214 aa9.96□□□□□ -0.82
HDLBP-242ENST00000488013 MIB2Q96AX9 1013 aa9.96□□□□□ -0.82
HDLBP-242ENST00000488013 ASPNQ9BXN1 380 aa9.96□□□□□ -0.82
HDLBP-242ENST00000488013 UCK2Q9BZX2 261 aa9.96□□□□□ -0.82
HDLBP-242ENST00000488013 COQ10BQ9H8M1 238 aa9.96□□□□□ -0.82
HDLBP-242ENST00000488013 KRT84Q9NSB2 600 aa9.96□□□□□ -0.82
HDLBP-242ENST00000488013 ALKBH4Q9NXW9 302 aa9.96□□□□□ -0.82
HDLBP-242ENST00000488013 VNN3Q9NY84 501 aa9.96□□□□□ -0.82
HDLBP-242ENST00000488013 B3GALT5Q9Y2C3 310 aa9.96□□□□□ -0.82
HDLBP-242ENST00000488013 ENO4A6NNW6 628 aa9.95□□□□□ -0.82
HDLBP-242ENST00000488013 K7EM74 188 aa9.95□□□□□ -0.82
HDLBP-242ENST00000488013 EI24O14681 340 aa9.95□□□□□ -0.82
HDLBP-242ENST00000488013 BCKDKO14874 412 aa9.95□□□□□ -0.82
HDLBP-242ENST00000488013 SEC14L5O43304 696 aa9.95□□□□□ -0.82
HDLBP-242ENST00000488013 FZD7O75084 574 aa9.95□□□□□ -0.82
HDLBP-242ENST00000488013 OR7A10O76100 309 aa9.95□□□□□ -0.82
HDLBP-242ENST00000488013 VAMP5O95183 116 aa9.95□□□□□ -0.82
HDLBP-242ENST00000488013 OR6A2O95222 327 aa9.95□□□□□ -0.82
HDLBP-242ENST00000488013 GASTP01350 101 aa9.95□□□□□ -0.82
HDLBP-242ENST00000488013 CPN1P15169 458 aa9.95□□□□□ -0.82
HDLBP-242ENST00000488013 ZNF26P17031 533 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
HDLBP-242ENST00000488013 BMP7P18075 431 aa9.95□□□□□ -0.82
HDLBP-242ENST00000488013 FUT1P19526 365 aa9.95□□□□□ -0.82
HDLBP-242ENST00000488013 CCNA2P20248 432 aa9.95□□□□□ -0.82
HDLBP-242ENST00000488013 PEX2P28328 305 aa9.95□□□□□ -0.82
HDLBP-242ENST00000488013 PTGER4P35408 488 aa9.95□□□□□ -0.82
HDLBP-242ENST00000488013 RFC3P40938 356 aa9.95□□□□□ -0.82
HDLBP-242ENST00000488013 GSSP48637 474 aa9.95□□□□□ -0.82
HDLBP-242ENST00000488013 RPS6KA3P51812 740 aa9.95□□□□□ -0.82
HDLBP-242ENST00000488013 RAC3P60763 192 aa9.95□□□□□ -0.82
HDLBP-242ENST00000488013 EGR4Q05215 589 aa9.95□□□□□ -0.82
HDLBP-242ENST00000488013 MYBPHQ13203 477 aa9.95□□□□□ -0.82
HDLBP-242ENST00000488013 NADK2Q4G0N4 442 aa9.95□□□□□ -0.82
HDLBP-242ENST00000488013 CMPK2Q5EBM0 449 aa9.95□□□□□ -0.82
HDLBP-242ENST00000488013 VASNQ6EMK4 673 aa9.95□□□□□ -0.82
HDLBP-242ENST00000488013 C19orf48Q6RUI8 117 aa9.95□□□□□ -0.82
HDLBP-242ENST00000488013 TBPL2Q6SJ96 375 aa9.95□□□□□ -0.82
HDLBP-242ENST00000488013 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa9.95□□□□□ -0.82
HDLBP-242ENST00000488013 CHMP1BQ7LBR1 199 aa9.95□□□□□ -0.82
HDLBP-242ENST00000488013 TMEM179BQ7Z7N9 219 aa9.95□□□□□ -0.82
HDLBP-242ENST00000488013 OAFQ86UD1 273 aa9.95□□□□□ -0.82
HDLBP-242ENST00000488013 SIAH3Q8IW03 269 aa9.95□□□□□ -0.82
HDLBP-242ENST00000488013 GHDCQ8N2G8 530 aa9.95□□□□□ -0.82
HDLBP-242ENST00000488013 ADPRHL1Q8NDY3 354 aa9.95□□□□□ -0.82
HDLBP-242ENST00000488013 MAGEE2Q8TD90 523 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
HDLBP-242ENST00000488013 ZNF524Q96C55 264 aa9.95□□□□□ -0.82
HDLBP-242ENST00000488013 GPR137Q96N19 417 aa9.95□□□□□ -0.82
HDLBP-242ENST00000488013 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa9.95□□□□□ -0.82
HDLBP-242ENST00000488013 OR5B2Q96R09 309 aa9.95□□□□□ -0.82
HDLBP-242ENST00000488013 TAAR6Q96RI8 345 aa9.95□□□□□ -0.82
HDLBP-242ENST00000488013 NAA11Q9BSU3 229 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
HDLBP-242ENST00000488013 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa9.95□□□□□ -0.82
HDLBP-242ENST00000488013 PRRG3Q9BZD7 231 aa9.95□□□□□ -0.82
HDLBP-242ENST00000488013 DEFB127Q9H1M4 99 aa9.95□□□□□ -0.82
HDLBP-242ENST00000488013 MEPEQ9NQ76 525 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
HDLBP-242ENST00000488013 SMPD3Q9NY59 655 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
HDLBP-242ENST00000488013 MRPL39Q9NYK5 338 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
HDLBP-242ENST00000488013 HRH3Q9Y5N1 445 aa9.95□□□□□ -0.82
HDLBP-242ENST00000488013 FRYQ5TBA9 3013 aa9.95□□□□□ -0.82
HDLBP-242ENST00000488013 MED13Q9UHV7 2174 aa9.94□□□□□ -0.82
HDLBP-242ENST00000488013 UNC119BA6NIH7 251 aa9.94□□□□□ -0.82
HDLBP-242ENST00000488013 LIPT2A6NK58 231 aa9.94□□□□□ -0.82
HDLBP-242ENST00000488013 NPIPA5E9PKD4 350 aa9.94□□□□□ -0.82
HDLBP-242ENST00000488013 H3BML4 177 aa9.94□□□□□ -0.82
HDLBP-242ENST00000488013 PDLIM1O00151 329 aa9.94□□□□□ -0.82
HDLBP-242ENST00000488013 SULT2B1O00204 365 aa9.94□□□□□ -0.82
HDLBP-242ENST00000488013 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
HDLBP-242ENST00000488013 KLF4O43474 513 aa9.94□□□□□ -0.82
HDLBP-242ENST00000488013 CH25HO95992 272 aa9.94□□□□□ -0.82
HDLBP-242ENST00000488013 HOXD4P09016 255 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
HDLBP-242ENST00000488013 OSMP13725 252 aa9.94□□□□□ -0.82
HDLBP-242ENST00000488013 ZNF708P17019 499 aa9.94□□□□□ -0.82
HDLBP-242ENST00000488013 PRKACGP22612 351 aa9.94□□□□□ -0.82
HDLBP-242ENST00000488013 CARD18P57730 90 aa9.94□□□□□ -0.82
HDLBP-242ENST00000488013 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
HDLBP-242ENST00000488013 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
HDLBP-242ENST00000488013 SGCBQ16585 318 aa9.94□□□□□ -0.82
HDLBP-242ENST00000488013 LRRC36Q1X8D7 754 aa9.94□□□□□ -0.82
HDLBP-242ENST00000488013 RNFT1Q5M7Z0 435 aa9.94□□□□□ -0.82
HDLBP-242ENST00000488013 WLSQ5T9L3 541 aa9.94□□□□□ -0.82
HDLBP-242ENST00000488013 LPCAT4Q643R3 524 aa9.94□□□□□ -0.82
HDLBP-242ENST00000488013 GTF2IRD2BQ6EKJ0 949 aa9.94□□□□□ -0.82
HDLBP-242ENST00000488013 PAQR6Q6TCH4 344 aa9.94□□□□□ -0.82
HDLBP-242ENST00000488013 H1FNTQ75WM6 255 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
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