RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480525.5

HDAC6-223, Transcript of histone deacetylase 6, human

TSL 3

Gene HDAC6, Length 412 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDAC6-223	ENST00000480525	CAPRIN1	Q14444	709 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	TOMM20	Q15388	145 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	TAF11	Q15544	211 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	TOMM34	Q15785	309 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	NRN1L	Q496H8	165 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	IQCC	Q4KMZ1	466 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	IFI44L	Q53G44	452 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	CYBRD1	Q53TN4	286 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	ALG10B	Q5I7T1	473 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	RPS26P11	Q5JNZ5	115 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	ZNF585A	Q6P3V2	769 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	BEND4	Q6ZU67	534 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	FKBP9P1	Q75LS8	142 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	HDDC2	Q7Z4H3	204 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	PXK	Q7Z7A4	578 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	GALNT10	Q86SR1	603 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	P2RY8	Q86VZ1	359 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	AQP12A	Q8IXF9	295 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	C10orf67	Q8IYJ2	551 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	DEFB107A	Q8IZN7	70 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	TMCO5A	Q8N6Q1	288 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	POU5F2	Q8N7G0	328 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	RBM15B	Q8NDT2	890 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	C1orf162	Q8NEQ5	155 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	OR6T1	Q8NGN1	323 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	FNDC8	Q8TC99	324 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	SLC26A7	Q8TE54	656 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	ADAMTS16	Q8TE57	1224 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	CA5BP1	Q8WTZ4	195 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	OSTF1	Q92882	214 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	RNASE6	Q93091	150 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	C14orf79	Q96F83	325 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	OTUB1	Q96FW1	271 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	DUS3L	Q96G46	650 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	SH3YL1	Q96HL8	342 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	C7orf34	Q96L11	122 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	LRR1	Q96L50	414 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	ZNF347	Q96SE7	839 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	PSD2	Q9BQI7	771 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	BTBD10	Q9BSF8	475 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	NAA11	Q9BSU3	229 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	OSBPL10	Q9BXB5	764 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	HDHD5	Q9BXW7	423 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	AMBRA1	Q9C0C7	1298 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	TSPAN10	Q9H1Z9	355 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	LRMDA	Q9H2I8	198 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	FKRP	Q9H9S5	495 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	IL1RAP	Q9NPH3	570 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	KCNJ16	Q9NPI9	418 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	CTPS2	Q9NRF8	586 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	RLIM	Q9NVW2	624 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	PARPBP	Q9NWS1	579 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	MRPL39	Q9NYK5	338 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	SELENON	Q9NZV5	590 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	RPS6KB2	Q9UBS0	482 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525		Q9UFV3	132 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	KCNN3	Q9UGI6	736 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	ZNF229	Q9UJW7	825 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	RALY	Q9UKM9	306 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	CAMK2A	Q9UQM7	478 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	RNF6	Q9Y252	685 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	RPH3A	Q9Y2J0	694 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	SLC6A5	Q9Y345	797 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	TMED7	Q9Y3B3	224 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	EMC9	Q9Y3B6	208 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	CRYBG3	Q68DQ2	2970 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	HEATR1	Q9H583	2144 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	IGKV1D-42	A0A075B6H8	117 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	FAM221A	A4D161	298 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	C2orf72	A6NCS6	295 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	ELOA3D	A6NLF2	546 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	CLDN24	A6NM45	220 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525		B2RBV5	119 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	RPL36A-HNRNPH2	H7BZ11	118 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	EIF1AY	O14602	144 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	ACOT8	O14734	319 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	ARPC2	O15144	300 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	SMAD9	O15198	467 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	AKAP8	O43823	692 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	AHCYL1	O43865	530 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	TPST2	O60704	377 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	ENTPD5	O75356	428 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	DNAJC8	O75937	253 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	WISP2	O76076	250 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	LYPD3	O95274	346 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	AHSA1	O95433	338 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	ZNF682	O95780	498 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	MT-ND1	P03886	318 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	ASAH2B	P0C7U1	165 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	TMIGD3	P0DMS9	266 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	EPX	P11678	715 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	APEH	P13798	732 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	HOXB1	P14653	301 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	COX5A	P20674	150 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	AGTR1	P30556	359 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	KIR2DL2	P43627	348 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	EIF1AX	P47813	144 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	OR3A2	P47893	321 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	P2RY4	P51582	365 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	CCR4	P51679	360 aa		4.54	□□□□□ -1.68

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