RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497511.5

SKAP2-209, Transcript of src kinase associated phosphoprotein 2, human

TSL 4

Gene SKAP2, Length 585 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SKAP2-209	ENST00000497511	MTERF4	Q7Z6M4	381 aa	Known RBP	9.48	□□□□□ -0.89
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC16A11	Q8NCK7	471 aa		9.48	□□□□□ -0.89
SKAP2-209	ENST00000497511	SGMS2	Q8NHU3	365 aa		9.48	□□□□□ -0.89
SKAP2-209	ENST00000497511	MZB1	Q8WU39	189 aa		9.48	□□□□□ -0.89
SKAP2-209	ENST00000497511	ZHX1-C8orf76	Q96EF9	292 aa		9.48	□□□□□ -0.89
SKAP2-209	ENST00000497511	MRGPRX4	Q96LA9	322 aa		9.48	□□□□□ -0.89
SKAP2-209	ENST00000497511	SORCS2	Q96PQ0	1159 aa		9.48	□□□□□ -0.89
SKAP2-209	ENST00000497511	TMEM237	Q96Q45	408 aa		9.48	□□□□□ -0.89
SKAP2-209	ENST00000497511	KCNA7	Q96RP8	456 aa		9.48	□□□□□ -0.89
SKAP2-209	ENST00000497511	KCNS3	Q9BQ31	491 aa		9.48	□□□□□ -0.89
SKAP2-209	ENST00000497511	MYOZ1	Q9NP98	299 aa	Predicted RBP	9.48	□□□□□ -0.89
SKAP2-209	ENST00000497511	SERINC1	Q9NRX5	453 aa		9.48	□□□□□ -0.89
SKAP2-209	ENST00000497511	TAS2R16	Q9NYV7	291 aa		9.48	□□□□□ -0.89
SKAP2-209	ENST00000497511	TMEFF2	Q9UIK5	374 aa	Predicted RBP	9.48	□□□□□ -0.89
SKAP2-209	ENST00000497511	WBP11	Q9Y2W2	641 aa	Known RBP	9.48	□□□□□ -0.89
SKAP2-209	ENST00000497511	IGF2BP2	Q9Y6M1	599 aa	Known RBP eCLIP	9.48	□□□□□ -0.89
SKAP2-209	ENST00000497511	PCNX3	Q9H6A9	2034 aa		9.48	□□□□□ -0.89
SKAP2-209	ENST00000497511	LRP5L	A4QPB2	252 aa		9.47	□□□□□ -0.89
SKAP2-209	ENST00000497511	ATP6V1G2-DDX39B	F2Z307	99 aa		9.47	□□□□□ -0.89
SKAP2-209	ENST00000497511	SULT2B1	O00204	365 aa		9.47	□□□□□ -0.89
SKAP2-209	ENST00000497511	KCNAB3	O43448	404 aa		9.47	□□□□□ -0.89
SKAP2-209	ENST00000497511	EFNA2	O43921	213 aa		9.47	□□□□□ -0.89
SKAP2-209	ENST00000497511	CYP7B1	O75881	506 aa		9.47	□□□□□ -0.89
SKAP2-209	ENST00000497511	SNUPN	O95149	360 aa	Known RBP	9.47	□□□□□ -0.89
SKAP2-209	ENST00000497511	SCG5	P05408	212 aa		9.47	□□□□□ -0.89
SKAP2-209	ENST00000497511	GSTA1	P08263	222 aa		9.47	□□□□□ -0.89
SKAP2-209	ENST00000497511	IFI6	P09912	130 aa		9.47	□□□□□ -0.89
SKAP2-209	ENST00000497511	TFPI	P10646	304 aa		9.47	□□□□□ -0.89
SKAP2-209	ENST00000497511	APEX1	P27695	318 aa	Known RBP	9.47	□□□□□ -0.89
SKAP2-209	ENST00000497511	CSNK2A1	P68400	391 aa	Predicted RBP	9.47	□□□□□ -0.89
SKAP2-209	ENST00000497511	LCP2	Q13094	533 aa		9.47	□□□□□ -0.89
SKAP2-209	ENST00000497511	TRADD	Q15628	312 aa		9.47	□□□□□ -0.89
SKAP2-209	ENST00000497511	TOMM34	Q15785	309 aa	Predicted RBP	9.47	□□□□□ -0.89
SKAP2-209	ENST00000497511	C9orf135	Q5VTT2	229 aa		9.47	□□□□□ -0.89
SKAP2-209	ENST00000497511	NOXRED1	Q6NXP6	359 aa		9.47	□□□□□ -0.89
SKAP2-209	ENST00000497511	KLHL24	Q6TFL4	600 aa		9.47	□□□□□ -0.89
SKAP2-209	ENST00000497511	SPATA19	Q7Z5L4	167 aa		9.47	□□□□□ -0.89
SKAP2-209	ENST00000497511	SPATA4	Q8NEY3	305 aa		9.47	□□□□□ -0.89
SKAP2-209	ENST00000497511	CIDEC	Q96AQ7	238 aa	Predicted RBP	9.47	□□□□□ -0.89
SKAP2-209	ENST00000497511	PPCDC	Q96CD2	204 aa		9.47	□□□□□ -0.89
SKAP2-209	ENST00000497511	C16orf58	Q96GQ5	468 aa		9.47	□□□□□ -0.89
SKAP2-209	ENST00000497511	BTBD2	Q9BX70	525 aa		9.47	□□□□□ -0.89
SKAP2-209	ENST00000497511	BPESC1	Q9GZL8	116 aa		9.47	□□□□□ -0.89
SKAP2-209	ENST00000497511	HOXD1	Q9GZZ0	328 aa		9.47	□□□□□ -0.89
SKAP2-209	ENST00000497511	ANKZF1	Q9H8Y5	726 aa		9.47	□□□□□ -0.89
SKAP2-209	ENST00000497511	MID1IP1	Q9NPA3	183 aa		9.47	□□□□□ -0.89
SKAP2-209	ENST00000497511	RRAGD	Q9NQL2	400 aa	Predicted RBP	9.47	□□□□□ -0.89
SKAP2-209	ENST00000497511	SH3BP4	Q9P0V3	963 aa		9.47	□□□□□ -0.89
SKAP2-209	ENST00000497511	UPB1	Q9UBR1	384 aa		9.47	□□□□□ -0.89
SKAP2-209	ENST00000497511	ING1	Q9UK53	422 aa	Predicted RBP	9.47	□□□□□ -0.89
SKAP2-209	ENST00000497511	MALRD1	Q5VYJ5	2156 aa		9.47	□□□□□ -0.89
SKAP2-209	ENST00000497511	TRIM49D1	C9J1S8	452 aa		9.46	□□□□□ -0.9
SKAP2-209	ENST00000497511	POC1B-GALNT4	F8VUJ3	575 aa		9.46	□□□□□ -0.9
SKAP2-209	ENST00000497511	AKAP10	O43572	662 aa		9.46	□□□□□ -0.9
SKAP2-209	ENST00000497511	MRPL33	O75394	65 aa	Known RBP	9.46	□□□□□ -0.9
SKAP2-209	ENST00000497511	ERCC1	P07992	297 aa	Predicted RBP	9.46	□□□□□ -0.9
SKAP2-209	ENST00000497511	PCMT1	P22061	227 aa		9.46	□□□□□ -0.9
SKAP2-209	ENST00000497511	MAGEA12	P43365	314 aa		9.46	□□□□□ -0.9
SKAP2-209	ENST00000497511	DIO1	P49895	249 aa		9.46	□□□□□ -0.9
SKAP2-209	ENST00000497511	CHN2	P52757	468 aa		9.46	□□□□□ -0.9
SKAP2-209	ENST00000497511	CBFB	Q13951	182 aa		9.46	□□□□□ -0.9
SKAP2-209	ENST00000497511	QPRT	Q15274	297 aa		9.46	□□□□□ -0.9
SKAP2-209	ENST00000497511	NDUFAF6	Q330K2	333 aa		9.46	□□□□□ -0.9
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM174B	Q3ZCQ3	159 aa		9.46	□□□□□ -0.9
SKAP2-209	ENST00000497511	TIGD2	Q4W5G0	525 aa		9.46	□□□□□ -0.9
SKAP2-209	ENST00000497511	CDC73	Q6P1J9	531 aa		9.46	□□□□□ -0.9
SKAP2-209	ENST00000497511	ZDHHC24	Q6UX98	284 aa		9.46	□□□□□ -0.9
SKAP2-209	ENST00000497511	C1QL4	Q86Z23	238 aa		9.46	□□□□□ -0.9
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC22A9	Q8IVM8	553 aa		9.46	□□□□□ -0.9
SKAP2-209	ENST00000497511	CCNYL1	Q8N7R7	359 aa		9.46	□□□□□ -0.9
SKAP2-209	ENST00000497511	LINC01356	Q8N9X3	169 aa		9.46	□□□□□ -0.9
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM76A	Q8TAV0	307 aa		9.46	□□□□□ -0.9
SKAP2-209	ENST00000497511	GPR119	Q8TDV5	335 aa		9.46	□□□□□ -0.9
SKAP2-209	ENST00000497511	CDS1	Q92903	461 aa		9.46	□□□□□ -0.9
SKAP2-209	ENST00000497511	GCDH	Q92947	438 aa	Predicted RBP	9.46	□□□□□ -0.9
SKAP2-209	ENST00000497511	PAFAH2	Q99487	392 aa		9.46	□□□□□ -0.9
SKAP2-209	ENST00000497511	ZCCHC3	Q9NUD5	404 aa	Known RBP	9.46	□□□□□ -0.9
SKAP2-209	ENST00000497511	ICAM5	Q9UMF0	924 aa		9.46	□□□□□ -0.9
SKAP2-209	ENST00000497511	MOK	Q9UQ07	419 aa		9.46	□□□□□ -0.9
SKAP2-209	ENST00000497511	AMDHD2	Q9Y303	409 aa		9.46	□□□□□ -0.9
SKAP2-209	ENST00000497511	PLCE1	Q9P212	2302 aa		9.45	□□□□□ -0.9
SKAP2-209	ENST00000497511	GIMAP1-GIMAP5	A0A087WTJ2	511 aa		9.45	□□□□□ -0.9
SKAP2-209	ENST00000497511	GPR171	O14626	319 aa		9.45	□□□□□ -0.9
SKAP2-209	ENST00000497511	SEC22B	O75396	215 aa		9.45	□□□□□ -0.9
SKAP2-209	ENST00000497511	H6PD	O95479	791 aa		9.45	□□□□□ -0.9
SKAP2-209	ENST00000497511	SBK3	P0C264	359 aa		9.45	□□□□□ -0.9
SKAP2-209	ENST00000497511	UBL4A	P11441	157 aa		9.45	□□□□□ -0.9
SKAP2-209	ENST00000497511	IMPDH1	P20839	514 aa		9.45	□□□□□ -0.9
SKAP2-209	ENST00000497511	ATP5F1	P24539	256 aa	Predicted RBP	9.45	□□□□□ -0.9
SKAP2-209	ENST00000497511	MAP3K8	P41279	467 aa		9.45	□□□□□ -0.9
SKAP2-209	ENST00000497511	TGFBR3	Q03167	851 aa		9.45	□□□□□ -0.9
SKAP2-209	ENST00000497511	MERTK	Q12866	999 aa		9.45	□□□□□ -0.9
SKAP2-209	ENST00000497511	SCGB2A2	Q13296	93 aa		9.45	□□□□□ -0.9
SKAP2-209	ENST00000497511	LASP1	Q14847	261 aa	Known RBP	9.45	□□□□□ -0.9
SKAP2-209	ENST00000497511	GABRA6	Q16445	453 aa		9.45	□□□□□ -0.9
SKAP2-209	ENST00000497511	ZCCHC12	Q6PEW1	402 aa		9.45	□□□□□ -0.9
SKAP2-209	ENST00000497511	SHQ1	Q6PI26	577 aa	Known RBP	9.45	□□□□□ -0.9
SKAP2-209	ENST00000497511	CASP12	Q6UXS9	341 aa		9.45	□□□□□ -0.9
SKAP2-209	ENST00000497511	CELF2-AS1	Q8N7Q2	184 aa		9.45	□□□□□ -0.9
SKAP2-209	ENST00000497511	OR5W2	Q8NH69	310 aa		9.45	□□□□□ -0.9

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