RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516584.1

RNU6-1004P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1004, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1004P, Length 111 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CD55P08174 381 aa4□□□□□ -1.77
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ZNF26P17031 533 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
RNU6-1004P-201ENST00000516584 GSTM3P21266 225 aa4□□□□□ -1.77
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CPN2P22792 545 aa4□□□□□ -1.77
RNU6-1004P-201ENST00000516584 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
RNU6-1004P-201ENST00000516584 OXTRP30559 389 aa4□□□□□ -1.77
RNU6-1004P-201ENST00000516584 UQCRFS1P47985 274 aa4□□□□□ -1.77
RNU6-1004P-201ENST00000516584 KCNJ2P63252 427 aa4□□□□□ -1.77
RNU6-1004P-201ENST00000516584 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ABRAXAS2Q15018 415 aa4□□□□□ -1.77
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ZNF77Q15935 545 aa4□□□□□ -1.77
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ISXQ2M1V0 245 aa4□□□□□ -1.77
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SASS6Q6UVJ0 657 aa4□□□□□ -1.77
RNU6-1004P-201ENST00000516584 LRRC74BQ6ZQY2 392 aa4□□□□□ -1.77
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SCD5Q86SK9 330 aa4□□□□□ -1.77
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CATSPER3Q86XQ3 398 aa4□□□□□ -1.77
RNU6-1004P-201ENST00000516584 MICU2Q8IYU8 434 aa4□□□□□ -1.77
RNU6-1004P-201ENST00000516584 MCOLN2Q8IZK6 566 aa4□□□□□ -1.77
RNU6-1004P-201ENST00000516584 BBS1Q8NFJ9 593 aa4□□□□□ -1.77
RNU6-1004P-201ENST00000516584 OR13F1Q8NGS4 319 aa4□□□□□ -1.77
RNU6-1004P-201ENST00000516584 GPX8Q8TED1 209 aa4□□□□□ -1.77
RNU6-1004P-201ENST00000516584 GLYATL2Q8WU03 294 aa4□□□□□ -1.77
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP4□□□□□ -1.77
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CCDC28BQ9BUN5 200 aa4□□□□□ -1.77
RNU6-1004P-201ENST00000516584 HCAR1Q9BXC0 346 aa4□□□□□ -1.77
RNU6-1004P-201ENST00000516584 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa4□□□□□ -1.77
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ANKRD60Q9BZ19 345 aa4□□□□□ -1.77
RNU6-1004P-201ENST00000516584 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
RNU6-1004P-201ENST00000516584 RGCCQ9H4X1 137 aa4□□□□□ -1.77
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa4□□□□□ -1.77
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PNO1Q9NRX1 252 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
RNU6-1004P-201ENST00000516584 COPS3Q9UNS2 423 aa4□□□□□ -1.77
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ERVW-1Q9UQF0 538 aa4□□□□□ -1.77
RNU6-1004P-201ENST00000516584 STK38LQ9Y2H1 464 aa4□□□□□ -1.77
RNU6-1004P-201ENST00000516584 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-1004P-201ENST00000516584 MEX3AA1L020 520 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
RNU6-1004P-201ENST00000516584 IDSB3KWA1 339 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-1004P-201ENST00000516584 E7ESA3 106 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-1004P-201ENST00000516584 E9PLD3 99 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-1004P-201ENST00000516584 HIP1O00291 1037 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TOM1O60784 492 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-1004P-201ENST00000516584 GNA14O95837 355 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-1004P-201ENST00000516584 RHOXF2BP0C7M4 288 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CCNB1P14635 433 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-1004P-201ENST00000516584 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
RNU6-1004P-201ENST00000516584 OR1D4P47884 311 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-1004P-201ENST00000516584 GSK3BP49841 420 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ARHGDIBP52566 201 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PKNOX1P55347 436 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-1004P-201ENST00000516584 GSCP56915 257 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
RNU6-1004P-201ENST00000516584 IRF8Q02556 426 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ACY1Q03154 408 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-1004P-201ENST00000516584 KCNJ11Q14654 390 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SLC10A1Q14973 349 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ZFP69Q49AA0 526 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-1004P-201ENST00000516584 FBXO48Q5FWF7 155 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-1004P-201ENST00000516584 EMBQ6PCB8 327 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PGAP1Q75T13 922 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CSNK1A1LQ8N752 337 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-1004P-201ENST00000516584 B3GNT7Q8NFL0 401 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-1004P-201ENST00000516584 BEST4Q8NFU0 473 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-1004P-201ENST00000516584 OR4K14Q8NGD5 310 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-1004P-201ENST00000516584 FLVCR1-AS1Q8TAF5 88 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ARNTL2Q8WYA1 636 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-1004P-201ENST00000516584 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
RNU6-1004P-201ENST00000516584 UFD1Q92890 307 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-1004P-201ENST00000516584 LRRC39Q96DD0 335 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-1004P-201ENST00000516584 RHOXF2Q9BQY4 288 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-1004P-201ENST00000516584 RBKSQ9H477 322 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-1004P-201ENST00000516584 REEP4Q9H6H4 257 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SMYD3Q9H7B4 428 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TIGARQ9NQ88 270 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-1004P-201ENST00000516584 WARS2Q9UGM6 360 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-1004P-201ENST00000516584 NUP50Q9UKX7 468 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-1004P-201ENST00000516584 KCNIP3Q9Y2W7 256 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-1004P-201ENST00000516584 RHBDD3Q9Y3P4 386 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-1004P-201ENST00000516584 L3MBTL1Q9Y468 752 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PIK3R4Q99570 1358 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CLSPNQ9HAW4 1339 aa3.98□□□□□ -1.77
RNU6-1004P-201ENST00000516584 KIF27Q86VH2 1401 aa3.98□□□□□ -1.77
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SNED1Q8TER0 1413 aa3.98□□□□□ -1.77
RNU6-1004P-201ENST00000516584 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa3.98□□□□□ -1.77
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CCDC182A6NF36 153 aa3.98□□□□□ -1.77
RNU6-1004P-201ENST00000516584 RPL37AP8A6NKH3 93 aa3.98□□□□□ -1.77
RNU6-1004P-201ENST00000516584 G3V3Y1 287 aa3.98□□□□□ -1.77
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SULT2B1O00204 365 aa3.98□□□□□ -1.77
RNU6-1004P-201ENST00000516584 NVLO15381 856 aaKnown RBP3.98□□□□□ -1.77
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SH3BGRLO75368 114 aa3.98□□□□□ -1.77
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SCRG1O75711 98 aa3.98□□□□□ -1.77
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ZFAND5O76080 213 aa3.98□□□□□ -1.77
RNU6-1004P-201ENST00000516584 LYPD3O95274 346 aa3.98□□□□□ -1.77
RNU6-1004P-201ENST00000516584 POP4O95707 220 aaKnown RBP3.98□□□□□ -1.77
RNU6-1004P-201ENST00000516584 AMBPP02760 352 aa3.98□□□□□ -1.77
RNU6-1004P-201ENST00000516584 LGALS2P05162 132 aa3.98□□□□□ -1.77
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ANXA5P08758 320 aa3.98□□□□□ -1.77
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CCDC172P0C7W6 258 aa3.98□□□□□ -1.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.5 ms