RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473154.1

CYCSP20-201, Transcript of cytochrome c, somatic pseudogene 20, humanhuman

BASIC

Gene CYCSP20, Length 315 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYCSP20-201ENST00000473154 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP3.8□□□□□ -1.8
CYCSP20-201ENST00000473154 LY9Q9HBG7 655 aa3.8□□□□□ -1.8
CYCSP20-201ENST00000473154 TMBIM4Q9HC24 238 aa3.8□□□□□ -1.8
CYCSP20-201ENST00000473154 TMOD2Q9NZR1 351 aa3.8□□□□□ -1.8
CYCSP20-201ENST00000473154 EPS15L1Q9UBC2 864 aa3.8□□□□□ -1.8
CYCSP20-201ENST00000473154 GALPQ9UBC7 116 aa3.8□□□□□ -1.8
CYCSP20-201ENST00000473154 LAMP5Q9UJQ1 280 aa3.8□□□□□ -1.8
CYCSP20-201ENST00000473154 B9D1Q9UPM9 204 aa3.8□□□□□ -1.8
CYCSP20-201ENST00000473154 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP3.8□□□□□ -1.8
CYCSP20-201ENST00000473154 SLC17A2O00624 439 aa3.79□□□□□ -1.8
CYCSP20-201ENST00000473154 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP3.79□□□□□ -1.8
CYCSP20-201ENST00000473154 IDH1O75874 414 aaKnown RBP3.79□□□□□ -1.8
CYCSP20-201ENST00000473154 PCCBP05166 539 aa3.79□□□□□ -1.8
CYCSP20-201ENST00000473154 BCKDHAP12694 445 aa3.79□□□□□ -1.8
CYCSP20-201ENST00000473154 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP3.79□□□□□ -1.8
CYCSP20-201ENST00000473154 PSMA2P25787 234 aa3.79□□□□□ -1.8
CYCSP20-201ENST00000473154 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP3.79□□□□□ -1.8
CYCSP20-201ENST00000473154 GDF1P27539 372 aa3.79□□□□□ -1.8
CYCSP20-201ENST00000473154 HTR2AP28223 471 aa3.79□□□□□ -1.8
CYCSP20-201ENST00000473154 GNA11P29992 359 aa3.79□□□□□ -1.8
CYCSP20-201ENST00000473154 GCKP35557 465 aa3.79□□□□□ -1.8
CYCSP20-201ENST00000473154 RPL4P36578 427 aaKnown RBP3.79□□□□□ -1.8
CYCSP20-201ENST00000473154 SLC18A1P54219 525 aa3.79□□□□□ -1.8
CYCSP20-201ENST00000473154 BDH1Q02338 343 aa3.79□□□□□ -1.8
CYCSP20-201ENST00000473154 RGS1Q08116 209 aa3.79□□□□□ -1.8
CYCSP20-201ENST00000473154 IFT88Q13099 833 aa3.79□□□□□ -1.8
CYCSP20-201ENST00000473154 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP3.79□□□□□ -1.8
CYCSP20-201ENST00000473154 ZNF239Q16600 458 aaKnown RBP3.79□□□□□ -1.8
CYCSP20-201ENST00000473154 GSG1Q2KHT4 349 aa3.79□□□□□ -1.8
CYCSP20-201ENST00000473154 QRICH1Q2TAL8 776 aa3.79□□□□□ -1.8
CYCSP20-201ENST00000473154 TEX44Q53QW1 395 aa3.79□□□□□ -1.8
CYCSP20-201ENST00000473154 ZNF57Q68EA5 555 aaPredicted RBP3.79□□□□□ -1.8
CYCSP20-201ENST00000473154 OR8G2PQ6IF36 304 aa3.79□□□□□ -1.8
CYCSP20-201ENST00000473154 CENPPQ6IPU0 288 aa3.79□□□□□ -1.8
CYCSP20-201ENST00000473154 BAIAP2L2Q6UXY1 529 aa3.79□□□□□ -1.8
CYCSP20-201ENST00000473154 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa3.79□□□□□ -1.8
CYCSP20-201ENST00000473154 CSNK1A1LQ8N752 337 aa3.79□□□□□ -1.8
CYCSP20-201ENST00000473154 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa3.79□□□□□ -1.8
CYCSP20-201ENST00000473154 CNIH3Q8TBE1 160 aa3.79□□□□□ -1.8
CYCSP20-201ENST00000473154 NELFBQ8WX92 580 aa3.79□□□□□ -1.8
CYCSP20-201ENST00000473154 PPP1R14BQ96C90 147 aa3.79□□□□□ -1.8
CYCSP20-201ENST00000473154 CHMP6Q96FZ7 201 aa3.79□□□□□ -1.8
CYCSP20-201ENST00000473154 TMEM121Q9BTD3 319 aa3.79□□□□□ -1.8
CYCSP20-201ENST00000473154 TM2D1Q9BX74 207 aa3.79□□□□□ -1.8
CYCSP20-201ENST00000473154 VCXQ9H320 206 aa3.79□□□□□ -1.8
CYCSP20-201ENST00000473154 RHOJQ9H4E5 214 aa3.79□□□□□ -1.8
CYCSP20-201ENST00000473154 FARSBQ9NSD9 589 aaKnown RBP3.79□□□□□ -1.8
CYCSP20-201ENST00000473154 EHFQ9NZC4 300 aa3.79□□□□□ -1.8
CYCSP20-201ENST00000473154 AIPL1Q9NZN9 384 aa3.79□□□□□ -1.8
CYCSP20-201ENST00000473154 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP3.79□□□□□ -1.8
CYCSP20-201ENST00000473154 LRRC42Q9Y546 428 aa3.79□□□□□ -1.8
CYCSP20-201ENST00000473154 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa3.79□□□□□ -1.8
CYCSP20-201ENST00000473154 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP3.79□□□□□ -1.8
CYCSP20-201ENST00000473154 C1orf167Q5SNV9 1468 aa3.79□□□□□ -1.8
CYCSP20-201ENST00000473154 ATRNO75882 1429 aa3.78□□□□□ -1.8
CYCSP20-201ENST00000473154 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa3.78□□□□□ -1.8
CYCSP20-201ENST00000473154 PEAK1Q9H792 1746 aa3.78□□□□□ -1.8
CYCSP20-201ENST00000473154 E9PLD3 99 aa3.78□□□□□ -1.8
CYCSP20-201ENST00000473154 CLDN5O00501 218 aa3.78□□□□□ -1.8
CYCSP20-201ENST00000473154 PHOX2AO14813 284 aa3.78□□□□□ -1.8
CYCSP20-201ENST00000473154 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP3.78□□□□□ -1.8
CYCSP20-201ENST00000473154 AGTP01019 485 aa3.78□□□□□ -1.8
CYCSP20-201ENST00000473154 ASNSP08243 561 aa3.78□□□□□ -1.8
CYCSP20-201ENST00000473154 ATP5A1P25705 553 aaKnown RBP3.78□□□□□ -1.8
CYCSP20-201ENST00000473154 ALDH3A1P30838 453 aa3.78□□□□□ -1.8
CYCSP20-201ENST00000473154 ACAA2P42765 397 aaKnown RBP3.78□□□□□ -1.8
CYCSP20-201ENST00000473154 CXCL6P80162 114 aa3.78□□□□□ -1.8
CYCSP20-201ENST00000473154 CAV1Q03135 178 aa3.78□□□□□ -1.8
CYCSP20-201ENST00000473154 KCNJ11Q14654 390 aa3.78□□□□□ -1.8
CYCSP20-201ENST00000473154 CHI3L2Q15782 390 aa3.78□□□□□ -1.8
CYCSP20-201ENST00000473154 LINC01620Q4KN68 170 aa3.78□□□□□ -1.8
CYCSP20-201ENST00000473154 SLC22A10Q63ZE4 541 aa3.78□□□□□ -1.8
CYCSP20-201ENST00000473154 SPINK14Q6IE38 97 aa3.78□□□□□ -1.8
CYCSP20-201ENST00000473154 WDR59Q6PJI9 974 aa3.78□□□□□ -1.8
CYCSP20-201ENST00000473154 STAC2Q6ZMT1 411 aa3.78□□□□□ -1.8
CYCSP20-201ENST00000473154 ZBED8Q8IZ13 594 aa3.78□□□□□ -1.8
CYCSP20-201ENST00000473154 CD177Q8N6Q3 437 aa3.78□□□□□ -1.8
CYCSP20-201ENST00000473154 ADAMTS16Q8TE57 1224 aa3.78□□□□□ -1.8
CYCSP20-201ENST00000473154 MAIP1Q8WWC4 291 aa3.78□□□□□ -1.8
CYCSP20-201ENST00000473154 THRSPQ92748 146 aa3.78□□□□□ -1.8
CYCSP20-201ENST00000473154 CASD1Q96PB1 797 aa3.78□□□□□ -1.8
CYCSP20-201ENST00000473154 SIGLEC12Q96PQ1 595 aa3.78□□□□□ -1.8
CYCSP20-201ENST00000473154 CHP1Q99653 195 aa3.78□□□□□ -1.8
CYCSP20-201ENST00000473154 CCDC77Q9BR77 488 aa3.78□□□□□ -1.8
CYCSP20-201ENST00000473154 TSSK1BQ9BXA7 367 aa3.78□□□□□ -1.8
CYCSP20-201ENST00000473154 SPZ1Q9BXG8 430 aa3.78□□□□□ -1.8
CYCSP20-201ENST00000473154 FAM192AQ9GZU8 254 aa3.78□□□□□ -1.8
CYCSP20-201ENST00000473154 SLC40A1Q9NP59 571 aa3.78□□□□□ -1.8
CYCSP20-201ENST00000473154 MIEF1Q9NQG6 463 aa3.78□□□□□ -1.8
CYCSP20-201ENST00000473154 SLC7A10Q9NS82 523 aa3.78□□□□□ -1.8
CYCSP20-201ENST00000473154 SPACA6W5XKT8 324 aa3.78□□□□□ -1.8
CYCSP20-201ENST00000473154 DISP2A7MBM2 1401 aa3.78□□□□□ -1.8
CYCSP20-201ENST00000473154 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa3.78□□□□□ -1.81
CYCSP20-201ENST00000473154 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa3.77□□□□□ -1.81
CYCSP20-201ENST00000473154 NWD1Q149M9 1564 aa3.77□□□□□ -1.81
CYCSP20-201ENST00000473154 A0A1B0GWJ7 208 aa3.77□□□□□ -1.81
CYCSP20-201ENST00000473154 SAGE2PA6NJ88 616 aa3.77□□□□□ -1.81
CYCSP20-201ENST00000473154 ZNF233A6NK53 670 aa3.77□□□□□ -1.81
CYCSP20-201ENST00000473154 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP3.77□□□□□ -1.81
CYCSP20-201ENST00000473154 ERVV-1B6SEH8 477 aa3.77□□□□□ -1.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.9 ms