RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453216.1

TRAM2-AS1-201, Transcript of TRAM2 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene TRAM2-AS1, Length 664 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KBTBD8Q8NFY9 601 aa23.15■■□□□ 1.3
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP23.15■■□□□ 1.3
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZBTB9Q96C00 473 aa23.15■■□□□ 1.3
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 AIG1Q9NVV5 245 aa23.15■■□□□ 1.3
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HDGFL3Q9Y3E1 203 aa23.15■■□□□ 1.3
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HIVEP2P31629 2446 aa23.15■■□□□ 1.3
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CSPG4Q6UVK1 2322 aa23.15■■□□□ 1.3
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 JMJD1CQ15652 2540 aa23.14■■□□□ 1.3
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 A0A1W2PP18 115 aa23.14■■□□□ 1.29
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CCDC154A6NI56 674 aa23.14■■□□□ 1.29
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CLDN24A6NM45 220 aa23.14■■□□□ 1.29
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PMS2P2O95744 297 aa23.14■■□□□ 1.29
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 C1QCP02747 245 aa23.14■■□□□ 1.29
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ALDOCP09972 364 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.29
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CLK1P49759 484 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.29
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ANXA11P50995 505 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.29
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TIMM23BQ5SRD1 257 aa23.14■■□□□ 1.29
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HHATQ5VTY9 493 aa23.14■■□□□ 1.29
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SPATA19Q7Z5L4 167 aa23.14■■□□□ 1.29
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 P2RY8Q86VZ1 359 aa23.14■■□□□ 1.29
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CNOT9Q92600 299 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.29
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DNAJA3Q96EY1 480 aa23.14■■□□□ 1.29
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ARL5BQ96KC2 179 aa23.14■■□□□ 1.29
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TRNT1Q96Q11 434 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.29
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PANX1Q96RD7 426 aa23.14■■□□□ 1.29
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LIPT1Q9Y234 373 aa23.14■■□□□ 1.29
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NOSIPQ9Y314 301 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.29
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF716A6NP11 495 aa23.13■■□□□ 1.29
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SDHDO14521 159 aa23.13■■□□□ 1.29
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DNPH1O43598 174 aa23.13■■□□□ 1.29
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IDH2P48735 452 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PLAURQ03405 335 aa23.13■■□□□ 1.29
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TNK1Q13470 666 aa23.13■■□□□ 1.29
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SYPL1Q16563 259 aa23.13■■□□□ 1.29
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FBXW9Q5XUX1 488 aa23.13■■□□□ 1.29
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP23.13■■□□□ 1.29
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ADGRG3Q86Y34 549 aa23.13■■□□□ 1.29
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 UBE2J2Q8N2K1 259 aa23.13■■□□□ 1.29
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF433Q8N7K0 673 aaPredicted RBP23.13■■□□□ 1.29
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ANKFN1Q8N957 763 aa23.13■■□□□ 1.29
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PIGXQ8TBF5 258 aa23.13■■□□□ 1.29
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 APH1AQ96BI3 265 aa23.13■■□□□ 1.29
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TRIM2Q9C040 744 aa23.13■■□□□ 1.29
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OR11A1Q9GZK7 315 aa23.13■■□□□ 1.29
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MAGED1Q9Y5V3 778 aaPredicted RBP23.13■■□□□ 1.29
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OR5H1A6NKK0 313 aa23.12■■□□□ 1.29
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GPR171O14626 319 aa23.12■■□□□ 1.29
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PGM3O95394 542 aa23.12■■□□□ 1.29
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IGHV3-9P01782 118 aa23.12■■□□□ 1.29
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CCNA2P20248 432 aa23.12■■□□□ 1.29
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HTR3AP46098 478 aa23.12■■□□□ 1.29
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TXNL4AP83876 142 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PPP2R2BQ00005 443 aa23.12■■□□□ 1.29
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CLEC12BQ2HXU8 276 aa23.12■■□□□ 1.29
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF621Q6ZSS3 439 aa23.12■■□□□ 1.29
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CROCCP2Q86T23 111 aa23.12■■□□□ 1.29
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CMIPQ8IY22 773 aa23.12■■□□□ 1.29
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ANKRD42Q8N9B4 389 aa23.12■■□□□ 1.29
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OR52E6Q96RD3 313 aa23.12■■□□□ 1.29
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 INPP5KQ9BT40 448 aa23.12■■□□□ 1.29
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SLC38A1Q9H2H9 487 aa23.12■■□□□ 1.29
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CADP27708 2225 aa23.11■■□□□ 1.29
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 AGAP5A6NIR3 686 aa23.11■■□□□ 1.29
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 AP3D1O14617 1153 aa23.11■■□□□ 1.29
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ADAM11O75078 769 aa23.11■■□□□ 1.29
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PGRP06401 933 aa23.11■■□□□ 1.29
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IL12AP29459 219 aa23.11■■□□□ 1.29
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IDUAP35475 653 aa23.11■■□□□ 1.29
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CDKN1AP38936 164 aa23.11■■□□□ 1.29
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CDKN2CP42773 168 aa23.11■■□□□ 1.29
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OR2B6P58173 313 aa23.11■■□□□ 1.29
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LRRC74AQ0VAA2 488 aa23.11■■□□□ 1.29
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FAPQ12884 760 aa23.11■■□□□ 1.29
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 VEZF1Q14119 521 aa23.11■■□□□ 1.29
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LRRC74BQ6ZQY2 392 aa23.11■■□□□ 1.29
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZBTB18Q99592 522 aa23.11■■□□□ 1.29
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CISD1Q9NZ45 108 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TMEM181Q9P2C4 612 aa23.11■■□□□ 1.29
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RAB21Q9UL25 225 aa23.11■■□□□ 1.29
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TRAPPC4Q9Y296 219 aa23.11■■□□□ 1.29
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 188 aa23.1■■□□□ 1.29
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 INAFM1C9JVW0 142 aa23.1■■□□□ 1.29
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RAMP1O60894 148 aa23.1■■□□□ 1.29
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GSNP06396 782 aa23.1■■□□□ 1.29
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CHRM4P08173 479 aa23.1■■□□□ 1.29
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SLC16A1P53985 500 aa23.1■■□□□ 1.29
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GNA13Q14344 377 aa23.1■■□□□ 1.29
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PGGHGQ32M88 737 aa23.1■■□□□ 1.29
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CCDC103Q8IW40 242 aa23.1■■□□□ 1.29
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 WDR60Q8WVS4 1066 aa23.1■■□□□ 1.29
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 WDR55Q9H6Y2 383 aaPredicted RBP23.1■■□□□ 1.29
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MTHFD2LQ9H903 347 aaPredicted RBP23.1■■□□□ 1.29
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NPAP1Q9NZP6 1156 aa23.1■■□□□ 1.29
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TMED7Q9Y3B3 224 aa23.1■■□□□ 1.29
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GPR45Q9Y5Y3 372 aa23.1■■□□□ 1.29
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GOLGA8QA0A0J9YX86 632 aa23.09■■□□□ 1.29
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CIB4A0PJX0 185 aa23.09■■□□□ 1.29
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GOLGA8OA6NCC3 632 aa23.09■■□□□ 1.29
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CCT8L1PA6NM43 557 aa23.09■■□□□ 1.29
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