RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293922.1

PTX4-201, Transcript of pentraxin 4, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTX4, Length 1,422 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX4-201ENST00000293922 P2RX1P51575 399 aa16.5■□□□□ 0.23
PTX4-201ENST00000293922 SUMO3P55854 103 aaPredicted RBP16.5■□□□□ 0.23
PTX4-201ENST00000293922 NUP107P57740 925 aa16.5■□□□□ 0.23
PTX4-201ENST00000293922 HOXC5Q00444 222 aa16.5■□□□□ 0.23
PTX4-201ENST00000293922 RCN1Q15293 331 aa16.5■□□□□ 0.23
PTX4-201ENST00000293922 DEF8Q6ZN54 512 aa16.5■□□□□ 0.23
PTX4-201ENST00000293922 WDSUB1Q8N9V3 476 aa16.5■□□□□ 0.23
PTX4-201ENST00000293922 OR5W2Q8NH69 310 aa16.5■□□□□ 0.23
PTX4-201ENST00000293922 RND1Q92730 232 aa16.5■□□□□ 0.23
PTX4-201ENST00000293922 ARSGQ96EG1 525 aa16.5■□□□□ 0.23
PTX4-201ENST00000293922 SH3YL1Q96HL8 342 aaPredicted RBP16.5■□□□□ 0.23
PTX4-201ENST00000293922 ZNF347Q96SE7 839 aa16.5■□□□□ 0.23
PTX4-201ENST00000293922 MCHR1Q99705 422 aa16.5■□□□□ 0.23
PTX4-201ENST00000293922 POLR2J2Q9GZM3 115 aaKnown RBP16.5■□□□□ 0.23
PTX4-201ENST00000293922 POLR2J3Q9H1A7 115 aaKnown RBP16.5■□□□□ 0.23
PTX4-201ENST00000293922 WDR1O75083 606 aa16.49■□□□□ 0.23
PTX4-201ENST00000293922 PRSS23O95084 383 aa16.49■□□□□ 0.23
PTX4-201ENST00000293922 HPNP05981 417 aa16.49■□□□□ 0.23
PTX4-201ENST00000293922 HTR2AP28223 471 aa16.49■□□□□ 0.23
PTX4-201ENST00000293922 WLSQ5T9L3 541 aa16.49■□□□□ 0.23
PTX4-201ENST00000293922 TIGD3Q6B0B8 471 aa16.49■□□□□ 0.23
PTX4-201ENST00000293922 B3GNT6Q6ZMB0 384 aa16.49■□□□□ 0.23
PTX4-201ENST00000293922 TSPYL5Q86VY4 417 aaPredicted RBP16.49■□□□□ 0.23
PTX4-201ENST00000293922 MCEMP1Q8IX19 187 aa16.49■□□□□ 0.23
PTX4-201ENST00000293922 TMCO5AQ8N6Q1 288 aa16.49■□□□□ 0.23
PTX4-201ENST00000293922 LSMEM1Q8N8F7 131 aa16.49■□□□□ 0.23
PTX4-201ENST00000293922 FADS6Q8N9I5 356 aa16.49■□□□□ 0.23
PTX4-201ENST00000293922 ASB5Q8WWX0 329 aa16.49■□□□□ 0.23
PTX4-201ENST00000293922 PRRC1Q96M27 445 aa16.49■□□□□ 0.23
PTX4-201ENST00000293922 ZNF559Q9BR84 538 aa16.49■□□□□ 0.23
PTX4-201ENST00000293922 TTYH2Q9BSA4 534 aa16.49■□□□□ 0.23
PTX4-201ENST00000293922 A4GNTQ9UNA3 340 aa16.49■□□□□ 0.23
PTX4-201ENST00000293922 FAM32AQ9Y421 112 aaKnown RBP16.49■□□□□ 0.23
PTX4-201ENST00000293922 H0Y3Z8 333 aa16.48■□□□□ 0.23
PTX4-201ENST00000293922 J3KTA2 159 aa16.48■□□□□ 0.23
PTX4-201ENST00000293922 GNB5O14775 395 aa16.48■□□□□ 0.23
PTX4-201ENST00000293922 FFAR1O14842 300 aa16.48■□□□□ 0.23
PTX4-201ENST00000293922 DIRAS1O95057 198 aa16.48■□□□□ 0.23
PTX4-201ENST00000293922 LINGO3P0C6S8 592 aa16.48■□□□□ 0.23
PTX4-201ENST00000293922 GLI4P10075 376 aa16.48■□□□□ 0.23
PTX4-201ENST00000293922 UQCRBP14927 111 aa16.48■□□□□ 0.23
PTX4-201ENST00000293922 FASP25445 335 aa16.48■□□□□ 0.23
PTX4-201ENST00000293922 ELAVL4P26378 380 aaKnown RBP16.48■□□□□ 0.23
PTX4-201ENST00000293922 CHRNB4P30926 498 aa16.48■□□□□ 0.23
PTX4-201ENST00000293922 YAP1P46937 504 aaKnown RBP16.48■□□□□ 0.23
PTX4-201ENST00000293922 CBFBQ13951 182 aa16.48■□□□□ 0.23
PTX4-201ENST00000293922 ATP6AP1Q15904 470 aa16.48■□□□□ 0.23
PTX4-201ENST00000293922 ENTPD8Q5MY95 495 aa16.48■□□□□ 0.23
PTX4-201ENST00000293922 OR5M10Q6IEU7 315 aa16.48■□□□□ 0.23
PTX4-201ENST00000293922 CYP4Z1Q86W10 505 aa16.48■□□□□ 0.23
PTX4-201ENST00000293922 PLCZ1Q86YW0 608 aa16.48■□□□□ 0.23
PTX4-201ENST00000293922 CCDC71Q8IV32 467 aaPredicted RBP16.48■□□□□ 0.23
PTX4-201ENST00000293922 LILRA2Q8N149 483 aa16.48■□□□□ 0.23
PTX4-201ENST00000293922 OR2M3Q8NG83 312 aa16.48■□□□□ 0.23
PTX4-201ENST00000293922 LRTOMTQ8WZ04 291 aa16.48■□□□□ 0.23
PTX4-201ENST00000293922 PIP5K1AQ99755 562 aa16.48■□□□□ 0.23
PTX4-201ENST00000293922 KLHDC3Q9BQ90 382 aa16.48■□□□□ 0.23
PTX4-201ENST00000293922 PRR14Q9BWN1 585 aa16.48■□□□□ 0.23
PTX4-201ENST00000293922 TRIM2Q9C040 744 aa16.48■□□□□ 0.23
PTX4-201ENST00000293922 STX18Q9P2W9 335 aaKnown RBP16.48■□□□□ 0.23
PTX4-201ENST00000293922 DNAJB9Q9UBS3 223 aa16.48■□□□□ 0.23
PTX4-201ENST00000293922 PDZD2O15018 2839 aa16.48■□□□□ 0.23
PTX4-201ENST00000293922 OTOGQ6ZRI0 2925 aa16.47■□□□□ 0.23
PTX4-201ENST00000293922 PHF3Q92576 2039 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
PTX4-201ENST00000293922 CLOCKO15516 846 aa16.47■□□□□ 0.23
PTX4-201ENST00000293922 DEAF1O75398 565 aaPredicted RBP16.47■□□□□ 0.23
PTX4-201ENST00000293922 TRAPPC6AO75865 159 aa16.47■□□□□ 0.23
PTX4-201ENST00000293922 OR5F1O95221 314 aa16.47■□□□□ 0.23
PTX4-201ENST00000293922 CST1P01037 141 aa16.47■□□□□ 0.23
PTX4-201ENST00000293922 COX6B1P14854 86 aa16.47■□□□□ 0.23
PTX4-201ENST00000293922 PGCP20142 388 aa16.47■□□□□ 0.23
PTX4-201ENST00000293922 RYKP34925 604 aa16.47■□□□□ 0.23
PTX4-201ENST00000293922 CCR4P51679 360 aa16.47■□□□□ 0.23
PTX4-201ENST00000293922 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP16.47■□□□□ 0.23
PTX4-201ENST00000293922 OR1Q1Q15612 314 aa16.47■□□□□ 0.23
PTX4-201ENST00000293922 OR2T5Q6IEZ7 315 aa16.47■□□□□ 0.23
PTX4-201ENST00000293922 OFCC1Q8IZS5 231 aa16.47■□□□□ 0.23
PTX4-201ENST00000293922 PQLC1Q8N2U9 271 aa16.47■□□□□ 0.23
PTX4-201ENST00000293922 ACBD4Q8NC06 268 aa16.47■□□□□ 0.23
PTX4-201ENST00000293922 OR1J4Q8NGS1 313 aa16.47■□□□□ 0.23
PTX4-201ENST00000293922 OR2T29Q8NH02 315 aa16.47■□□□□ 0.23
PTX4-201ENST00000293922 LILRB4Q8NHJ6 448 aa16.47■□□□□ 0.23
PTX4-201ENST00000293922 GPR119Q8TDV5 335 aa16.47■□□□□ 0.23
PTX4-201ENST00000293922 ADAMTS16Q8TE57 1224 aa16.47■□□□□ 0.23
PTX4-201ENST00000293922 DHRS1Q96LJ7 313 aa16.47■□□□□ 0.23
PTX4-201ENST00000293922 PKP2Q99959 881 aa16.47■□□□□ 0.23
PTX4-201ENST00000293922 DSN1Q9H410 356 aa16.47■□□□□ 0.23
PTX4-201ENST00000293922 RNPEPL1Q9HAU8 725 aa16.47■□□□□ 0.23
PTX4-201ENST00000293922 MED11Q9P086 117 aa16.47■□□□□ 0.23
PTX4-201ENST00000293922 CREBBPQ92793 2442 aa16.47■□□□□ 0.23
PTX4-201ENST00000293922 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP16.46■□□□□ 0.23
PTX4-201ENST00000293922 HOXD4P09016 255 aaPredicted RBP16.46■□□□□ 0.23
PTX4-201ENST00000293922 THRBP10828 461 aa16.46■□□□□ 0.23
PTX4-201ENST00000293922 GABRA1P14867 456 aa16.46■□□□□ 0.23
PTX4-201ENST00000293922 ANPEPP15144 967 aa16.46■□□□□ 0.23
PTX4-201ENST00000293922 PTGER4P35408 488 aa16.46■□□□□ 0.23
PTX4-201ENST00000293922 TAS2R41P59536 307 aa16.46■□□□□ 0.23
PTX4-201ENST00000293922 COPZ1P61923 177 aa16.46■□□□□ 0.23
PTX4-201ENST00000293922 TFF3Q07654 80 aa16.46■□□□□ 0.23
PTX4-201ENST00000293922 CRYZQ08257 329 aaKnown RBP16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 80.7 ms