RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602338.1

TTLL3-233, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

Gene TTLL3, Length 693 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-233	ENST00000602338	CD40	P25942	277 aa		10.5	□□□□□ -0.73
TTLL3-233	ENST00000602338	CASP9	P55211	416 aa		10.5	□□□□□ -0.73
TTLL3-233	ENST00000602338	SESN3	P58005	492 aa		10.5	□□□□□ -0.73
TTLL3-233	ENST00000602338	HBA1	P69905	142 aa		10.5	□□□□□ -0.73
TTLL3-233	ENST00000602338	SRSF2	Q01130	221 aa	Known RBP	10.5	□□□□□ -0.73
TTLL3-233	ENST00000602338	PLAUR	Q03405	335 aa		10.5	□□□□□ -0.73
TTLL3-233	ENST00000602338	CHRNE	Q04844	493 aa		10.5	□□□□□ -0.73
TTLL3-233	ENST00000602338	LOXL1	Q08397	574 aa	Predicted RBP	10.5	□□□□□ -0.73
TTLL3-233	ENST00000602338	MERTK	Q12866	999 aa		10.5	□□□□□ -0.73
TTLL3-233	ENST00000602338	ELOA3B	Q3SY89	546 aa		10.5	□□□□□ -0.73
TTLL3-233	ENST00000602338	SYT14P1	Q58G82	188 aa		10.5	□□□□□ -0.73
TTLL3-233	ENST00000602338	ARL13A	Q5H913	290 aa	Predicted RBP	10.5	□□□□□ -0.73
TTLL3-233	ENST00000602338	FBXW9	Q5XUX1	488 aa		10.5	□□□□□ -0.73
TTLL3-233	ENST00000602338	SLC22A25	Q6T423	547 aa		10.5	□□□□□ -0.73
TTLL3-233	ENST00000602338	CLEC2A	Q6UVW9	174 aa		10.5	□□□□□ -0.73
TTLL3-233	ENST00000602338	TMPPE	Q6ZT21	453 aa		10.5	□□□□□ -0.73
TTLL3-233	ENST00000602338	P2RY8	Q86VZ1	359 aa		10.5	□□□□□ -0.73
TTLL3-233	ENST00000602338	IFT20	Q8IY31	132 aa		10.5	□□□□□ -0.73
TTLL3-233	ENST00000602338	MUC15	Q8N387	334 aa		10.5	□□□□□ -0.73
TTLL3-233	ENST00000602338	ELOA3	Q8NG57	546 aa		10.5	□□□□□ -0.73
TTLL3-233	ENST00000602338	ST8SIA1	Q92185	356 aa		10.5	□□□□□ -0.73
TTLL3-233	ENST00000602338	ADAD1	Q96M93	576 aa	Known RBP	10.5	□□□□□ -0.73
TTLL3-233	ENST00000602338	DHRS9	Q9BPW9	319 aa		10.5	□□□□□ -0.73
TTLL3-233	ENST00000602338	TRMO	Q9BU70	441 aa		10.5	□□□□□ -0.73
TTLL3-233	ENST00000602338	MECR	Q9BV79	373 aa		10.5	□□□□□ -0.73
TTLL3-233	ENST00000602338	NMUR2	Q9GZQ4	415 aa		10.5	□□□□□ -0.73
TTLL3-233	ENST00000602338	CDC42EP3	Q9UKI2	254 aa		10.5	□□□□□ -0.73
TTLL3-233	ENST00000602338	TMEM114	B3SHH9	223 aa		10.49	□□□□□ -0.73
TTLL3-233	ENST00000602338		H7C417	338 aa		10.49	□□□□□ -0.73
TTLL3-233	ENST00000602338	SULT2B1	O00204	365 aa		10.49	□□□□□ -0.73
TTLL3-233	ENST00000602338	TRIM13	O60858	407 aa		10.49	□□□□□ -0.73
TTLL3-233	ENST00000602338	UGT2B17	O75795	530 aa		10.49	□□□□□ -0.73
TTLL3-233	ENST00000602338	CYP7B1	O75881	506 aa		10.49	□□□□□ -0.73
TTLL3-233	ENST00000602338	F12	P00748	615 aa	Predicted RBP	10.49	□□□□□ -0.73
TTLL3-233	ENST00000602338	FGF4	P08620	206 aa		10.49	□□□□□ -0.73
TTLL3-233	ENST00000602338	ITGA5	P08648	1049 aa		10.49	□□□□□ -0.73
TTLL3-233	ENST00000602338	KRT16	P08779	473 aa		10.49	□□□□□ -0.73
TTLL3-233	ENST00000602338	IGHV4-31	P0DP07	118 aa		10.49	□□□□□ -0.73
TTLL3-233	ENST00000602338	SOAT1	P35610	550 aa		10.49	□□□□□ -0.73
TTLL3-233	ENST00000602338	SLC25A3	Q00325	362 aa		10.49	□□□□□ -0.73
TTLL3-233	ENST00000602338	GPR68	Q15743	365 aa		10.49	□□□□□ -0.73
TTLL3-233	ENST00000602338	ZNF141	Q15928	474 aa		10.49	□□□□□ -0.73
TTLL3-233	ENST00000602338	MAPK14	Q16539	360 aa		10.49	□□□□□ -0.73
TTLL3-233	ENST00000602338	TMEM108	Q6UXF1	575 aa		10.49	□□□□□ -0.73
TTLL3-233	ENST00000602338	RIMKLA	Q8IXN7	391 aa		10.49	□□□□□ -0.73
TTLL3-233	ENST00000602338	UBE2J2	Q8N2K1	259 aa		10.49	□□□□□ -0.73
TTLL3-233	ENST00000602338	ARIH2OS	Q8N7S6	290 aa		10.49	□□□□□ -0.73
TTLL3-233	ENST00000602338	FAM71C	Q8NEG0	241 aa		10.49	□□□□□ -0.73
TTLL3-233	ENST00000602338	C10orf105	Q8TEF2	133 aa		10.49	□□□□□ -0.73
TTLL3-233	ENST00000602338	APH1A	Q96BI3	265 aa		10.49	□□□□□ -0.73
TTLL3-233	ENST00000602338	COQ8B	Q96D53	544 aa		10.49	□□□□□ -0.73
TTLL3-233	ENST00000602338	RADIL	Q96JH8	1075 aa		10.49	□□□□□ -0.73
TTLL3-233	ENST00000602338	ARL5B	Q96KC2	179 aa		10.49	□□□□□ -0.73
TTLL3-233	ENST00000602338	RHOXF2	Q9BQY4	288 aa		10.49	□□□□□ -0.73
TTLL3-233	ENST00000602338	OR11A1	Q9GZK7	315 aa		10.49	□□□□□ -0.73
TTLL3-233	ENST00000602338	ZNF350	Q9GZX5	532 aa		10.49	□□□□□ -0.73
TTLL3-233	ENST00000602338	LAT2	Q9GZY6	243 aa		10.49	□□□□□ -0.73
TTLL3-233	ENST00000602338	MALT1	Q9UDY8	824 aa		10.49	□□□□□ -0.73
TTLL3-233	ENST00000602338	POU2F3	Q9UKI9	436 aa		10.49	□□□□□ -0.73
TTLL3-233	ENST00000602338	MKLN1	Q9UL63	735 aa		10.49	□□□□□ -0.73
TTLL3-233	ENST00000602338	TRAF6	Q9Y4K3	522 aa		10.49	□□□□□ -0.73
TTLL3-233	ENST00000602338		M0R1B8	84 aa		10.48	□□□□□ -0.73
TTLL3-233	ENST00000602338	SKAP2	O75563	359 aa	Predicted RBP	10.48	□□□□□ -0.73
TTLL3-233	ENST00000602338	CSTA	P01040	98 aa		10.48	□□□□□ -0.73
TTLL3-233	ENST00000602338	DHRS4L1	P0CG22	281 aa		10.48	□□□□□ -0.73
TTLL3-233	ENST00000602338	SLC25A16	P16260	332 aa		10.48	□□□□□ -0.73
TTLL3-233	ENST00000602338	PTAFR	P25105	342 aa		10.48	□□□□□ -0.73
TTLL3-233	ENST00000602338	MAPK1	P28482	360 aa		10.48	□□□□□ -0.73
TTLL3-233	ENST00000602338	ALDH3A1	P30838	453 aa		10.48	□□□□□ -0.73
TTLL3-233	ENST00000602338	RPL3	P39023	403 aa	Known RBP	10.48	□□□□□ -0.73
TTLL3-233	ENST00000602338	FUT5	Q11128	374 aa		10.48	□□□□□ -0.73
TTLL3-233	ENST00000602338	GABRA6	Q16445	453 aa		10.48	□□□□□ -0.73
TTLL3-233	ENST00000602338	C6orf136	Q5SQH8	315 aa		10.48	□□□□□ -0.73
TTLL3-233	ENST00000602338	IL23R	Q5VWK5	629 aa		10.48	□□□□□ -0.73
TTLL3-233	ENST00000602338	ZCCHC23	Q6ZST2	131 aa		10.48	□□□□□ -0.73
TTLL3-233	ENST00000602338	SSX8	Q7RTT4	187 aa		10.48	□□□□□ -0.73
TTLL3-233	ENST00000602338	HMGN2P46	Q86SG4	172 aa		10.48	□□□□□ -0.73
TTLL3-233	ENST00000602338	MTDH	Q86UE4	582 aa	Known RBP	10.48	□□□□□ -0.73
TTLL3-233	ENST00000602338	CLECL1	Q8IZS7	167 aa		10.48	□□□□□ -0.73
TTLL3-233	ENST00000602338	FBXL14	Q8N1E6	418 aa		10.48	□□□□□ -0.73
TTLL3-233	ENST00000602338	WDR31	Q8NA23	367 aa		10.48	□□□□□ -0.73
TTLL3-233	ENST00000602338	OR52E4	Q8NGH9	312 aa		10.48	□□□□□ -0.73
TTLL3-233	ENST00000602338	MOAP1	Q96BY2	351 aa		10.48	□□□□□ -0.73
TTLL3-233	ENST00000602338	PPP3R2	Q96LZ3	170 aa		10.48	□□□□□ -0.73
TTLL3-233	ENST00000602338	KCNK17	Q96T54	332 aa		10.48	□□□□□ -0.73
TTLL3-233	ENST00000602338	DUSP26	Q9BV47	211 aa		10.48	□□□□□ -0.73
TTLL3-233	ENST00000602338	CCDC106	Q9BWC9	280 aa		10.48	□□□□□ -0.73
TTLL3-233	ENST00000602338	C1QTNF6	Q9BXI9	259 aa		10.48	□□□□□ -0.73
TTLL3-233	ENST00000602338	BHLHE41	Q9C0J9	482 aa	Predicted RBP	10.48	□□□□□ -0.73
TTLL3-233	ENST00000602338	CTPS2	Q9NRF8	586 aa		10.48	□□□□□ -0.73
TTLL3-233	ENST00000602338	ACER3	Q9NUN7	267 aa		10.48	□□□□□ -0.73
TTLL3-233	ENST00000602338	ATAD3A	Q9NVI7	634 aa		10.48	□□□□□ -0.73
TTLL3-233	ENST00000602338	TMEM160	Q9NX00	188 aa		10.48	□□□□□ -0.73
TTLL3-233	ENST00000602338	TAS2R16	Q9NYV7	291 aa		10.48	□□□□□ -0.73
TTLL3-233	ENST00000602338	EMC3	Q9P0I2	261 aa		10.48	□□□□□ -0.73
TTLL3-233	ENST00000602338	MGAT4B	Q9UQ53	548 aa		10.48	□□□□□ -0.73
TTLL3-233	ENST00000602338	NOSIP	Q9Y314	301 aa	Known RBP	10.48	□□□□□ -0.73
TTLL3-233	ENST00000602338	RNF103-CHMP3	A0A140T963	221 aa		10.47	□□□□□ -0.73
TTLL3-233	ENST00000602338	CIB4	A0PJX0	185 aa		10.47	□□□□□ -0.73
TTLL3-233	ENST00000602338	CCT8L1P	A6NM43	557 aa		10.47	□□□□□ -0.73

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