RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486978.5

CTDSPL-208, Transcript of CTD small phosphatase like, humanhuman

TSL 3

Gene CTDSPL, Length 609 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL-208ENST00000486978 NME5P56597 212 aa5.75□□□□□ -1.49
CTDSPL-208ENST00000486978 UFM1P61960 85 aa5.75□□□□□ -1.49
CTDSPL-208ENST00000486978 RAC1P63000 192 aa5.75□□□□□ -1.49
CTDSPL-208ENST00000486978 SIRPAP78324 504 aa5.75□□□□□ -1.49
CTDSPL-208ENST00000486978 LRRC74AQ0VAA2 488 aa5.75□□□□□ -1.49
CTDSPL-208ENST00000486978 FOXF1Q12946 379 aa5.75□□□□□ -1.49
CTDSPL-208ENST00000486978 FGFBP1Q14512 234 aa5.75□□□□□ -1.49
CTDSPL-208ENST00000486978 GPR68Q15743 365 aa5.75□□□□□ -1.49
CTDSPL-208ENST00000486978 ZNF141Q15928 474 aa5.75□□□□□ -1.49
CTDSPL-208ENST00000486978 SGCBQ16585 318 aa5.75□□□□□ -1.49
CTDSPL-208ENST00000486978 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
CTDSPL-208ENST00000486978 LINC01559Q495D7 138 aa5.75□□□□□ -1.49
CTDSPL-208ENST00000486978 PDSS1Q5T2R2 415 aa5.75□□□□□ -1.49
CTDSPL-208ENST00000486978 PDZK1Q5T2W1 519 aa5.75□□□□□ -1.49
CTDSPL-208ENST00000486978 ATAD3BQ5T9A4 648 aa5.75□□□□□ -1.49
CTDSPL-208ENST00000486978 NXNQ6DKJ4 435 aa5.75□□□□□ -1.49
CTDSPL-208ENST00000486978 TNFAIP8L2Q6P589 184 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
CTDSPL-208ENST00000486978 VWA1Q6PCB0 445 aa5.75□□□□□ -1.49
CTDSPL-208ENST00000486978 CBLN3Q6UW01 205 aa5.75□□□□□ -1.49
CTDSPL-208ENST00000486978 ESPNLQ6ZVH7 1005 aa5.75□□□□□ -1.49
CTDSPL-208ENST00000486978 C16orf62Q7Z3J2 963 aa5.75□□□□□ -1.49
CTDSPL-208ENST00000486978 TRIML2Q8N7C3 387 aa5.75□□□□□ -1.49
CTDSPL-208ENST00000486978 CNEP1R1Q8N9A8 125 aa5.75□□□□□ -1.49
CTDSPL-208ENST00000486978 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
CTDSPL-208ENST00000486978 OR10D3Q8NH80 312 aa5.75□□□□□ -1.49
CTDSPL-208ENST00000486978 FNDC9Q8TBE3 224 aa5.75□□□□□ -1.49
CTDSPL-208ENST00000486978 POC1BQ8TC44 478 aa5.75□□□□□ -1.49
CTDSPL-208ENST00000486978 PIWIL2Q8TC59 973 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
CTDSPL-208ENST00000486978 XAGE5Q8WWM1 108 aa5.75□□□□□ -1.49
CTDSPL-208ENST00000486978 OIT3Q8WWZ8 545 aa5.75□□□□□ -1.49
CTDSPL-208ENST00000486978 IGFBPL1Q8WX77 278 aa5.75□□□□□ -1.49
CTDSPL-208ENST00000486978 ROBO4Q8WZ75 1007 aa5.75□□□□□ -1.49
CTDSPL-208ENST00000486978 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
CTDSPL-208ENST00000486978 ARL8AQ96BM9 186 aa5.75□□□□□ -1.49
CTDSPL-208ENST00000486978 STARD4Q96DR4 205 aa5.75□□□□□ -1.49
CTDSPL-208ENST00000486978 NEURL3Q96EH8 262 aa5.75□□□□□ -1.49
CTDSPL-208ENST00000486978 ZNF845Q96IR2 970 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
CTDSPL-208ENST00000486978 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
CTDSPL-208ENST00000486978 ADGRG7Q96K78 797 aa5.75□□□□□ -1.49
CTDSPL-208ENST00000486978 CCDC115Q96NT0 180 aa5.75□□□□□ -1.49
CTDSPL-208ENST00000486978 OR52E6Q96RD3 313 aa5.75□□□□□ -1.49
CTDSPL-208ENST00000486978 ZBTB18Q99592 522 aa5.75□□□□□ -1.49
CTDSPL-208ENST00000486978 NPAS1Q99742 590 aa5.75□□□□□ -1.49
CTDSPL-208ENST00000486978 SLC35A5Q9BS91 424 aa5.75□□□□□ -1.49
CTDSPL-208ENST00000486978 ZNF350Q9GZX5 532 aa5.75□□□□□ -1.49
CTDSPL-208ENST00000486978 RNF122Q9H9V4 155 aa5.75□□□□□ -1.49
CTDSPL-208ENST00000486978 POLE3Q9NRF9 147 aa5.75□□□□□ -1.49
CTDSPL-208ENST00000486978 MCTS1Q9ULC4 181 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
CTDSPL-208ENST00000486978 ICAM5Q9UMF0 924 aa5.75□□□□□ -1.49
CTDSPL-208ENST00000486978 CARD8Q9Y2G2 431 aa5.75□□□□□ -1.49
CTDSPL-208ENST00000486978 GPR45Q9Y5Y3 372 aa5.75□□□□□ -1.49
CTDSPL-208ENST00000486978 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
CTDSPL-208ENST00000486978 MED12LQ86YW9 2145 aa5.75□□□□□ -1.49
CTDSPL-208ENST00000486978 A0A0J9YW62 118 aa5.74□□□□□ -1.49
CTDSPL-208ENST00000486978 CENPVL1A0A0U1RR11 272 aa5.74□□□□□ -1.49
CTDSPL-208ENST00000486978 SERINC4A6NH21 518 aa5.74□□□□□ -1.49
CTDSPL-208ENST00000486978 CCDC154A6NI56 674 aa5.74□□□□□ -1.49
CTDSPL-208ENST00000486978 C9JVG2 144 aa5.74□□□□□ -1.49
CTDSPL-208ENST00000486978 ZNF195O14628 629 aa5.74□□□□□ -1.49
CTDSPL-208ENST00000486978 TNFSF11O14788 317 aa5.74□□□□□ -1.49
CTDSPL-208ENST00000486978 ADAMDEC1O15204 470 aa5.74□□□□□ -1.49
CTDSPL-208ENST00000486978 ZNF264O43296 627 aa5.74□□□□□ -1.49
CTDSPL-208ENST00000486978 CD5LO43866 347 aa5.74□□□□□ -1.49
CTDSPL-208ENST00000486978 CXCL13O43927 109 aa5.74□□□□□ -1.49
CTDSPL-208ENST00000486978 KIAA0513O60268 411 aa5.74□□□□□ -1.49
CTDSPL-208ENST00000486978 GPRIN2O60269 458 aa5.74□□□□□ -1.49
CTDSPL-208ENST00000486978 EIF4E2O60573 245 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
CTDSPL-208ENST00000486978 FCMRO60667 390 aa5.74□□□□□ -1.49
CTDSPL-208ENST00000486978 UGT2B17O75795 530 aa5.74□□□□□ -1.49
CTDSPL-208ENST00000486978 AQP8O94778 261 aa5.74□□□□□ -1.49
CTDSPL-208ENST00000486978 SYNGR4O95473 234 aa5.74□□□□□ -1.49
CTDSPL-208ENST00000486978 NTN1O95631 604 aa5.74□□□□□ -1.49
CTDSPL-208ENST00000486978 CSTAP01040 98 aa5.74□□□□□ -1.49
CTDSPL-208ENST00000486978 CGAP01215 116 aa5.74□□□□□ -1.49
CTDSPL-208ENST00000486978 FAM157CP0CG43 387 aa5.74□□□□□ -1.49
CTDSPL-208ENST00000486978 CD8BP10966 210 aa5.74□□□□□ -1.49
CTDSPL-208ENST00000486978 PRKCAP17252 672 aa5.74□□□□□ -1.49
CTDSPL-208ENST00000486978 SFTPDP35247 375 aa5.74□□□□□ -1.49
CTDSPL-208ENST00000486978 CPOXP36551 454 aa5.74□□□□□ -1.49
CTDSPL-208ENST00000486978 PCYT1AP49585 367 aa5.74□□□□□ -1.49
CTDSPL-208ENST00000486978 ANXA11P50995 505 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
CTDSPL-208ENST00000486978 CCR4P51679 360 aa5.74□□□□□ -1.49
CTDSPL-208ENST00000486978 CASP9P55211 416 aa5.74□□□□□ -1.49
CTDSPL-208ENST00000486978 TXNL4AP83876 142 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
CTDSPL-208ENST00000486978 FUT5Q11128 374 aa5.74□□□□□ -1.49
CTDSPL-208ENST00000486978 SKP2Q13309 424 aa5.74□□□□□ -1.49
CTDSPL-208ENST00000486978 CBFBQ13951 182 aa5.74□□□□□ -1.49
CTDSPL-208ENST00000486978 GUSBP1Q15486 140 aa5.74□□□□□ -1.49
CTDSPL-208ENST00000486978 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP5.74□□□□□ -1.49
CTDSPL-208ENST00000486978 GSTA3Q16772 222 aa5.74□□□□□ -1.49
CTDSPL-208ENST00000486978 NDUFAF6Q330K2 333 aa5.74□□□□□ -1.49
CTDSPL-208ENST00000486978 CHRFAM7AQ494W8 412 aa5.74□□□□□ -1.49
CTDSPL-208ENST00000486978 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa5.74□□□□□ -1.49
CTDSPL-208ENST00000486978 PDCD4Q53EL6 469 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
CTDSPL-208ENST00000486978 AP1ARQ63HQ0 302 aa5.74□□□□□ -1.49
CTDSPL-208ENST00000486978 HBMQ6B0K9 141 aa5.74□□□□□ -1.49
CTDSPL-208ENST00000486978 PPP4R4Q6NUP7 873 aa5.74□□□□□ -1.49
CTDSPL-208ENST00000486978 FAM214BQ7L5A3 538 aa5.74□□□□□ -1.49
CTDSPL-208ENST00000486978 OLIG3Q7RTU3 272 aa5.74□□□□□ -1.49
CTDSPL-208ENST00000486978 MAVSQ7Z434 540 aa5.74□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41 ms