RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480525.5

HDAC6-223, Transcript of histone deacetylase 6, human

TSL 3

Gene HDAC6, Length 412 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDAC6-223	ENST00000480525	H3F3A	P84243	136 aa		4.59	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	SORD	Q00796	357 aa		4.59	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	PMP22	Q01453	160 aa		4.59	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	UBAP2L	Q14157	1087 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	RNPS1	Q15287	305 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	POU4F3	Q15319	338 aa		4.59	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	GPR68	Q15743	365 aa		4.59	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	MAPK14	Q16539	360 aa		4.59	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	SYPL1	Q16563	259 aa		4.59	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	CYP51A1	Q16850	503 aa		4.59	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	CTU2	Q2VPK5	515 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	GTDC1	Q4AE62	458 aa		4.59	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	ACSF3	Q4G176	576 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	ZNF311	Q5JNZ3	666 aa		4.59	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	COLEC12	Q5KU26	742 aa		4.59	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	SAMD4B	Q5PRF9	694 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	CCNJ	Q5T5M9	372 aa		4.59	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	MRPL2	Q5T653	305 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	C1orf185	Q5T7R7	199 aa		4.59	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	BICRAL	Q6AI39	1079 aa		4.59	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	ULK3	Q6PHR2	472 aa		4.59	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	CBLN3	Q6UW01	205 aa		4.59	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	LINC00114	Q6XXX2	140 aa		4.59	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	DNAJC14	Q6Y2X3	702 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	ZNF836	Q6ZNA1	936 aa		4.59	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	MARCH3	Q86UD3	253 aa		4.59	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	GGN	Q86UU5	652 aa		4.59	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	RANBP3L	Q86VV4	465 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	TREML1	Q86YW5	311 aa		4.59	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	ARMC8	Q8IUR7	673 aa		4.59	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	FITM2	Q8N6M3	262 aa		4.59	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	AMER2	Q8N7J2	671 aa		4.59	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	ANKFN1	Q8N957	763 aa		4.59	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	FAM156A	Q8NDB6	213 aa		4.59	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	ANKK1	Q8NFD2	765 aa		4.59	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	OR5M3	Q8NGP4	307 aa		4.59	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	OR52P1P	Q8NH57	321 aa		4.59	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	OR14L1P	Q8NHC6	308 aa		4.59	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	FBXO30	Q8TB52	745 aa		4.59	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	PHOSPHO1	Q8TCT1	267 aa		4.59	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	BCAS4	Q8TDM0	211 aa		4.59	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	STK35	Q8TDR2	534 aa		4.59	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	RNF128	Q8TEB7	428 aa		4.59	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	LIPH	Q8WWY8	451 aa		4.59	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	LZIC	Q8WZA0	190 aa		4.59	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	RAB8B	Q92930	207 aa		4.59	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	SLC38A4	Q969I6	547 aa		4.59	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	AURKB	Q96GD4	344 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	SFXN2	Q96NB2	322 aa		4.59	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	ARHGDIG	Q99819	225 aa		4.59	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	ZNF559	Q9BR84	538 aa		4.59	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	TTYH2	Q9BSA4	534 aa		4.59	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	YIPF4	Q9BSR8	244 aa		4.59	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	TMEM43	Q9BTV4	400 aa		4.59	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	SFXN3	Q9BWM7	321 aa		4.59	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	TRIM2	Q9C040	744 aa		4.59	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	PIGM	Q9H3S5	423 aa		4.59	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	DSN1	Q9H410	356 aa		4.59	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	LDAH	Q9H6V9	325 aa		4.59	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	CHST11	Q9NPF2	352 aa		4.59	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	FBXO34	Q9NWN3	711 aa		4.59	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	JKAMP	Q9P055	326 aa		4.59	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	SPRR3	Q9UBC9	169 aa		4.59	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	NIPSNAP3A	Q9UFN0	247 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	CHRNA9	Q9UGM1	479 aa		4.59	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	MAGEL2	Q9UJ55	1249 aa		4.59	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	ACAD8	Q9UKU7	415 aa		4.59	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	MKLN1	Q9UL63	735 aa		4.59	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	ZNF443	Q9Y2A4	671 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	SLC9A8	Q9Y2E8	581 aa		4.59	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	CHST2	Q9Y4C5	530 aa		4.59	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	FAM215A	Q9Y5M1	114 aa		4.59	□□□□□ -1.67
HDAC6-223	ENST00000480525	IGKV3D-15	A0A087WSY6	115 aa		4.58	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525		A0A0B4J2E0	115 aa		4.58	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	LOC100653049	A0A140TA62	436 aa		4.58	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525		A0A1B0GX12	115 aa		4.58	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	OR6C65	A6NJZ3	312 aa		4.58	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	FAM166B	A8MTA8	275 aa		4.58	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	ZNF724	A8MTY0	619 aa		4.58	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525		A8MVM7	634 aa		4.58	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525		C9JVG2	144 aa		4.58	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	NME4	O00746	187 aa		4.58	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	GNB5	O14775	395 aa		4.58	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	SEC14L5	O43304	696 aa		4.58	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	CHP2	O43745	196 aa		4.58	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	MGRN1	O60291	552 aa		4.58	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	GCM2	O75603	506 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	TRAPPC6A	O75865	159 aa		4.58	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	KRT34	O76011	436 aa		4.58	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	MT-ATP6	P00846	226 aa		4.58	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	IL2RA	P01589	272 aa		4.58	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	TPO	P07202	933 aa		4.58	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	CELA3A	P09093	270 aa		4.58	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	IGFBP2	P18065	325 aa		4.58	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	POU3F2	P20265	443 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	GNLY	P22749	145 aa		4.58	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	KDELR2	P33947	212 aa		4.58	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	OPRM1	P35372	400 aa		4.58	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	CPOX	P36551	454 aa		4.58	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	RBM34	P42696	430 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68

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