RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293922.1

PTX4-201, Transcript of pentraxin 4, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTX4, Length 1,422 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX4-201ENST00000293922 ANKRD33BA6NCL7 494 aa16.57■□□□□ 0.24
PTX4-201ENST00000293922 PRAMEF25A6NGN4 478 aa16.57■□□□□ 0.24
PTX4-201ENST00000293922 NPIPA2E9PIF3 369 aa16.57■□□□□ 0.24
PTX4-201ENST00000293922 NPIPA3F8WFD2 350 aa16.57■□□□□ 0.24
PTX4-201ENST00000293922 H3BNH8 94 aa16.57■□□□□ 0.24
PTX4-201ENST00000293922 SLC7A1P30825 629 aa16.57■□□□□ 0.24
PTX4-201ENST00000293922 CASP3P42574 277 aa16.57■□□□□ 0.24
PTX4-201ENST00000293922 GAS1P54826 345 aa16.57■□□□□ 0.24
PTX4-201ENST00000293922 SNTA1Q13424 505 aa16.57■□□□□ 0.24
PTX4-201ENST00000293922 SLC10A1Q14973 349 aa16.57■□□□□ 0.24
PTX4-201ENST00000293922 CD226Q15762 336 aa16.57■□□□□ 0.24
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PTX4-201ENST00000293922 BICRALQ6AI39 1079 aa16.57■□□□□ 0.24
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PTX4-201ENST00000293922 MARVELD2Q8N4S9 558 aa16.57■□□□□ 0.24
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PTX4-201ENST00000293922 NTNG2Q96CW9 530 aa16.57■□□□□ 0.24
PTX4-201ENST00000293922 SLC47A1Q96FL8 570 aa16.57■□□□□ 0.24
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PTX4-201ENST00000293922 ARHGDIGQ99819 225 aa16.57■□□□□ 0.24
PTX4-201ENST00000293922 RTN4RQ9BZR6 473 aa16.57■□□□□ 0.24
PTX4-201ENST00000293922 SLC13A4Q9UKG4 626 aa16.57■□□□□ 0.24
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PTX4-201ENST00000293922 SH3GLB1Q9Y371 365 aa16.57■□□□□ 0.24
PTX4-201ENST00000293922 FKBP6O75344 327 aa16.56■□□□□ 0.24
PTX4-201ENST00000293922 BCAS1O75363 584 aaPredicted RBP16.56■□□□□ 0.24
PTX4-201ENST00000293922 TRIM3O75382 744 aaPredicted RBP16.56■□□□□ 0.24
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PTX4-201ENST00000293922 PTGDSP41222 190 aa16.56■□□□□ 0.24
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PTX4-201ENST00000293922 PYDC1Q8WXC3 89 aa16.56■□□□□ 0.24
PTX4-201ENST00000293922 CNOT9Q92600 299 aaKnown RBP16.56■□□□□ 0.24
PTX4-201ENST00000293922 C7orf34Q96L11 122 aa16.56■□□□□ 0.24
PTX4-201ENST00000293922 TP63Q9H3D4 680 aaPredicted RBP16.56■□□□□ 0.24
PTX4-201ENST00000293922 IL1RAPQ9NPH3 570 aa16.56■□□□□ 0.24
PTX4-201ENST00000293922 ARMC1Q9NVT9 282 aa16.56■□□□□ 0.24
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PTX4-201ENST00000293922 SLC9A8Q9Y2E8 581 aa16.56■□□□□ 0.24
PTX4-201ENST00000293922 CACNA1DQ01668 2161 aa16.55■□□□□ 0.24
PTX4-201ENST00000293922 OR14I1A6ND48 311 aa16.55■□□□□ 0.24
PTX4-201ENST00000293922 NDUFB5O43674 189 aa16.55■□□□□ 0.24
PTX4-201ENST00000293922 SCO2O43819 266 aa16.55■□□□□ 0.24
PTX4-201ENST00000293922 SUSD5O60279 629 aa16.55■□□□□ 0.24
PTX4-201ENST00000293922 ANGPTL1O95841 491 aa16.55■□□□□ 0.24
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PTX4-201ENST00000293922 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP16.55■□□□□ 0.24
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PTX4-201ENST00000293922 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa16.55■□□□□ 0.24
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PTX4-201ENST00000293922 WFDC6Q9BQY6 131 aa16.55■□□□□ 0.24
PTX4-201ENST00000293922 ANGPTL4Q9BY76 406 aa16.55■□□□□ 0.24
PTX4-201ENST00000293922 METTL7AQ9H8H3 244 aa16.55■□□□□ 0.24
PTX4-201ENST00000293922 S100A14Q9HCY8 104 aa16.55■□□□□ 0.24
PTX4-201ENST00000293922 EXOSC3Q9NQT5 275 aaKnown RBP16.55■□□□□ 0.24
PTX4-201ENST00000293922 PNPLA3Q9NST1 481 aa16.55■□□□□ 0.24
PTX4-201ENST00000293922 KLRF1Q9NZS2 232 aa16.55■□□□□ 0.24
PTX4-201ENST00000293922 TNFRSF10DQ9UBN6 386 aa16.55■□□□□ 0.24
PTX4-201ENST00000293922 AP4S1Q9Y587 144 aa16.55■□□□□ 0.24
PTX4-201ENST00000293922 CSMD2Q7Z408 3487 aa16.55■□□□□ 0.24
PTX4-201ENST00000293922 H3BNX3 289 aa16.54■□□□□ 0.24
PTX4-201ENST00000293922 M0R3H8 397 aa16.54■□□□□ 0.24
PTX4-201ENST00000293922 AQP7O14520 342 aa16.54■□□□□ 0.24
PTX4-201ENST00000293922 ZNF264O43296 627 aa16.54■□□□□ 0.24
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PTX4-201ENST00000293922 SLC30A6Q6NXT4 461 aa16.54■□□□□ 0.24
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PTX4-201ENST00000293922 GATSQ8NAP1 163 aa16.54■□□□□ 0.24
PTX4-201ENST00000293922 OR6T1Q8NGN1 323 aa16.54■□□□□ 0.24
PTX4-201ENST00000293922 OR5M9Q8NGP3 310 aa16.54■□□□□ 0.24
PTX4-201ENST00000293922 MARVELD3Q96A59 401 aa16.54■□□□□ 0.24
PTX4-201ENST00000293922 ZNF597Q96LX8 424 aa16.54■□□□□ 0.24
PTX4-201ENST00000293922 JSRP1Q96MG2 331 aaPredicted RBP16.54■□□□□ 0.24
PTX4-201ENST00000293922 CHID1Q9BWS9 393 aa16.54■□□□□ 0.24
PTX4-201ENST00000293922 OSBPL11Q9BXB4 747 aa16.54■□□□□ 0.24
PTX4-201ENST00000293922 HHATLQ9HCP6 504 aa16.54■□□□□ 0.24
PTX4-201ENST00000293922 QPCTLQ9NXS2 382 aa16.54■□□□□ 0.24
PTX4-201ENST00000293922 WIF1Q9Y5W5 379 aa16.54■□□□□ 0.24
PTX4-201ENST00000293922 IGLV3-32A0A0A0MS00 114 aa16.53■□□□□ 0.24
PTX4-201ENST00000293922 TRGV5A0A0B4J1U4 118 aa16.53■□□□□ 0.24
PTX4-201ENST00000293922 BCKDKO14874 412 aa16.53■□□□□ 0.24
PTX4-201ENST00000293922 FRS3O43559 492 aa16.53■□□□□ 0.24
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