RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436289.6

NELFE-204, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 5

Gene NELFE, Length 906 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-204ENST00000436289 COQ10BQ9H8M1 238 aa13.13□□□□□ -0.31
NELFE-204ENST00000436289 MIEF1Q9NQG6 463 aa13.13□□□□□ -0.31
NELFE-204ENST00000436289 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa13.13□□□□□ -0.31
NELFE-204ENST00000436289 AMDHD2Q9Y303 409 aa13.13□□□□□ -0.31
NELFE-204ENST00000436289 IGKV3D-15A0A087WSY6 115 aa13.12□□□□□ -0.31
NELFE-204ENST00000436289 H3BNH8 94 aa13.12□□□□□ -0.31
NELFE-204ENST00000436289 GPR171O14626 319 aa13.12□□□□□ -0.31
NELFE-204ENST00000436289 LILRA1O75019 489 aa13.12□□□□□ -0.31
NELFE-204ENST00000436289 PDE5AO76074 875 aa13.12□□□□□ -0.31
NELFE-204ENST00000436289 NUDT14O95848 222 aa13.12□□□□□ -0.31
NELFE-204ENST00000436289 ANXA4P09525 319 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
NELFE-204ENST00000436289 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP13.12□□□□□ -0.31
NELFE-204ENST00000436289 KHKP50053 298 aa13.12□□□□□ -0.31
NELFE-204ENST00000436289 RAE1P78406 368 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
NELFE-204ENST00000436289 TGFBR3Q03167 851 aa13.12□□□□□ -0.31
NELFE-204ENST00000436289 C2orf80Q0P641 193 aa13.12□□□□□ -0.31
NELFE-204ENST00000436289 CALCOCO2Q13137 446 aa13.12□□□□□ -0.31
NELFE-204ENST00000436289 GABRA6Q16445 453 aa13.12□□□□□ -0.31
NELFE-204ENST00000436289 TECRLQ5HYJ1 363 aa13.12□□□□□ -0.31
NELFE-204ENST00000436289 LETMD1Q6P1Q0 360 aa13.12□□□□□ -0.31
NELFE-204ENST00000436289 ZCCHC12Q6PEW1 402 aa13.12□□□□□ -0.31
NELFE-204ENST00000436289 GLCCI1Q86VQ1 547 aa13.12□□□□□ -0.31
NELFE-204ENST00000436289 GATSQ8NAP1 163 aa13.12□□□□□ -0.31
NELFE-204ENST00000436289 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
NELFE-204ENST00000436289 PIK3R3Q92569 461 aa13.12□□□□□ -0.31
NELFE-204ENST00000436289 AMDHD1Q96NU7 426 aa13.12□□□□□ -0.31
NELFE-204ENST00000436289 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
NELFE-204ENST00000436289 TRIM31Q9BZY9 425 aa13.12□□□□□ -0.31
NELFE-204ENST00000436289 HOXD1Q9GZZ0 328 aa13.12□□□□□ -0.31
NELFE-204ENST00000436289 GLIPR2Q9H4G4 154 aa13.12□□□□□ -0.31
NELFE-204ENST00000436289 MALT1Q9UDY8 824 aa13.12□□□□□ -0.31
NELFE-204ENST00000436289 NOTCH1P46531 2555 aa13.11□□□□□ -0.31
NELFE-204ENST00000436289 IGHV3-15A0A0B4J1V0 119 aa13.11□□□□□ -0.31
NELFE-204ENST00000436289 CCDC151A5D8V7 595 aa13.11□□□□□ -0.31
NELFE-204ENST00000436289 VSTM5A8MXK1 200 aa13.11□□□□□ -0.31
NELFE-204ENST00000436289 C9JVG2 144 aa13.11□□□□□ -0.31
NELFE-204ENST00000436289 MANBAO00462 879 aa13.11□□□□□ -0.31
NELFE-204ENST00000436289 TMPRSS2O15393 492 aa13.11□□□□□ -0.31
NELFE-204ENST00000436289 DDX5P17844 614 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
NELFE-204ENST00000436289 TCP1P17987 556 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
NELFE-204ENST00000436289 PRIM2P49643 509 aa13.11□□□□□ -0.31
NELFE-204ENST00000436289 PPOXP50336 477 aa13.11□□□□□ -0.31
NELFE-204ENST00000436289 IDH3GP51553 393 aaPredicted RBP13.11□□□□□ -0.31
NELFE-204ENST00000436289 P2RX1P51575 399 aa13.11□□□□□ -0.31
NELFE-204ENST00000436289 ARFIP2P53365 341 aa13.11□□□□□ -0.31
NELFE-204ENST00000436289 CSNK2A1P68400 391 aaPredicted RBP13.11□□□□□ -0.31
NELFE-204ENST00000436289 ZNF763Q0D2J5 394 aa13.11□□□□□ -0.31
NELFE-204ENST00000436289 RASA2Q15283 850 aa13.11□□□□□ -0.31
NELFE-204ENST00000436289 TRADDQ15628 312 aa13.11□□□□□ -0.31
NELFE-204ENST00000436289 MROH9Q5TGP6 573 aa13.11□□□□□ -0.31
NELFE-204ENST00000436289 SHQ1Q6PI26 577 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
NELFE-204ENST00000436289 RINLQ6ZS11 566 aa13.11□□□□□ -0.31
NELFE-204ENST00000436289 ZNF527Q8NB42 609 aa13.11□□□□□ -0.31
NELFE-204ENST00000436289 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP13.11□□□□□ -0.31
NELFE-204ENST00000436289 ZNF300Q96RE9 604 aaPredicted RBP13.11□□□□□ -0.31
NELFE-204ENST00000436289 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa13.11□□□□□ -0.31
NELFE-204ENST00000436289 NOSIPQ9Y314 301 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
NELFE-204ENST00000436289 GRIP1Q9Y3R0 1128 aa13.11□□□□□ -0.31
NELFE-204ENST00000436289 CCDC188H7C350 402 aa13.1□□□□□ -0.31
NELFE-204ENST00000436289 KCNK2O95069 426 aa13.1□□□□□ -0.31
NELFE-204ENST00000436289 WNT11O96014 354 aa13.1□□□□□ -0.31
NELFE-204ENST00000436289 RPS17P08708 135 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
NELFE-204ENST00000436289 DAOP14920 347 aa13.1□□□□□ -0.31
NELFE-204ENST00000436289 PRKCAP17252 672 aa13.1□□□□□ -0.31
NELFE-204ENST00000436289 PRPS1P60891 318 aa13.1□□□□□ -0.31
NELFE-204ENST00000436289 EFNB3Q15768 340 aa13.1□□□□□ -0.31
NELFE-204ENST00000436289 AWAT1Q58HT5 328 aa13.1□□□□□ -0.31
NELFE-204ENST00000436289 SLC25A53Q5H9E4 307 aa13.1□□□□□ -0.31
NELFE-204ENST00000436289 ZNF786Q8N393 782 aa13.1□□□□□ -0.31
NELFE-204ENST00000436289 ATP6V1C2Q8NEY4 427 aa13.1□□□□□ -0.31
NELFE-204ENST00000436289 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa13.1□□□□□ -0.31
NELFE-204ENST00000436289 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
NELFE-204ENST00000436289 C1QTNF6Q9BXI9 259 aa13.1□□□□□ -0.31
NELFE-204ENST00000436289 PLK3Q9H4B4 646 aa13.1□□□□□ -0.31
NELFE-204ENST00000436289 DCTN4Q9UJW0 460 aa13.1□□□□□ -0.31
NELFE-204ENST00000436289 ICAM5Q9UMF0 924 aa13.1□□□□□ -0.31
NELFE-204ENST00000436289 SNX24Q9Y343 169 aa13.1□□□□□ -0.31
NELFE-204ENST00000436289 SPEF1Q9Y4P9 236 aa13.1□□□□□ -0.31
NELFE-204ENST00000436289 A0A1W2PR80 420 aa13.09□□□□□ -0.31
NELFE-204ENST00000436289 ATP6V1G2-DDX39BF2Z307 99 aa13.09□□□□□ -0.31
NELFE-204ENST00000436289 MRPL33O75394 65 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
NELFE-204ENST00000436289 EDNRAP25101 427 aa13.09□□□□□ -0.31
NELFE-204ENST00000436289 SERPINB8P50452 374 aa13.09□□□□□ -0.31
NELFE-204ENST00000436289 ZNF117Q03924 483 aa13.09□□□□□ -0.31
NELFE-204ENST00000436289 FOXL1Q12952 345 aa13.09□□□□□ -0.31
NELFE-204ENST00000436289 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa13.09□□□□□ -0.31
NELFE-204ENST00000436289 C3orf33Q6P1S2 294 aa13.09□□□□□ -0.31
NELFE-204ENST00000436289 IKBIPQ70UQ0 350 aa13.09□□□□□ -0.31
NELFE-204ENST00000436289 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
NELFE-204ENST00000436289 ANKS4BQ8N8V4 417 aa13.09□□□□□ -0.31
NELFE-204ENST00000436289 WDR31Q8NA23 367 aa13.09□□□□□ -0.31
NELFE-204ENST00000436289 METTL6Q8TCB7 284 aa13.09□□□□□ -0.31
NELFE-204ENST00000436289 GPR119Q8TDV5 335 aa13.09□□□□□ -0.31
NELFE-204ENST00000436289 FBF1Q8TES7 1133 aa13.09□□□□□ -0.31
NELFE-204ENST00000436289 ZHX1-C8orf76Q96EF9 292 aa13.09□□□□□ -0.31
NELFE-204ENST00000436289 APIPQ96GX9 242 aa13.09□□□□□ -0.31
NELFE-204ENST00000436289 SNX18Q96RF0 628 aa13.09□□□□□ -0.31
NELFE-204ENST00000436289 KCNS3Q9BQ31 491 aa13.09□□□□□ -0.31
NELFE-204ENST00000436289 ACPTQ9BZG2 426 aa13.09□□□□□ -0.31
NELFE-204ENST00000436289 OBP2BQ9NPH6 170 aa13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 83.7 ms