RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000416651.5

NIF3L1-206, Transcript of NGG1 interacting factor 3 like 1, human

TSL 2 BASIC

Gene NIF3L1, Length 967 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NIF3L1-206	ENST00000416651	SH3PXD2B	A1X283	911 aa		7.47	□□□□□ -1.21
NIF3L1-206	ENST00000416651	CCT8L1P	A6NM43	557 aa		7.47	□□□□□ -1.21
NIF3L1-206	ENST00000416651		B4DSR2	109 aa		7.47	□□□□□ -1.21
NIF3L1-206	ENST00000416651	KLF11	O14901	512 aa		7.47	□□□□□ -1.21
NIF3L1-206	ENST00000416651	KRT34	O76011	436 aa		7.47	□□□□□ -1.21
NIF3L1-206	ENST00000416651	MTHFD2	P13995	350 aa		7.47	□□□□□ -1.21
NIF3L1-206	ENST00000416651	IFNGR1	P15260	489 aa		7.47	□□□□□ -1.21
NIF3L1-206	ENST00000416651	COL8A2	P25067	703 aa		7.47	□□□□□ -1.21
NIF3L1-206	ENST00000416651	SERPINB1	P30740	379 aa		7.47	□□□□□ -1.21
NIF3L1-206	ENST00000416651	LIMS1	P48059	325 aa		7.47	□□□□□ -1.21
NIF3L1-206	ENST00000416651	PRIM2	P49643	509 aa		7.47	□□□□□ -1.21
NIF3L1-206	ENST00000416651	SLC18A2	Q05940	514 aa		7.47	□□□□□ -1.21
NIF3L1-206	ENST00000416651	GALNT1	Q10472	559 aa	Predicted RBP	7.47	□□□□□ -1.21
NIF3L1-206	ENST00000416651	TRADD	Q15628	312 aa		7.47	□□□□□ -1.21
NIF3L1-206	ENST00000416651	ADIPOQ	Q15848	244 aa		7.47	□□□□□ -1.21
NIF3L1-206	ENST00000416651	SGO1	Q5FBB7	561 aa		7.47	□□□□□ -1.21
NIF3L1-206	ENST00000416651	SHQ1	Q6PI26	577 aa	Known RBP	7.47	□□□□□ -1.21
NIF3L1-206	ENST00000416651	RPS27L	Q71UM5	84 aa	Known RBP	7.47	□□□□□ -1.21
NIF3L1-206	ENST00000416651	BCL6B	Q8N143	479 aa	Predicted RBP	7.47	□□□□□ -1.21
NIF3L1-206	ENST00000416651	OR52E4	Q8NGH9	312 aa		7.47	□□□□□ -1.21
NIF3L1-206	ENST00000416651	OR4C3	Q8NH37	302 aa		7.47	□□□□□ -1.21
NIF3L1-206	ENST00000416651	PIK3R3	Q92569	461 aa		7.47	□□□□□ -1.21
NIF3L1-206	ENST00000416651	EXOSC8	Q96B26	276 aa	Known RBP	7.47	□□□□□ -1.21
NIF3L1-206	ENST00000416651	LRRC58	Q96CX6	371 aa		7.47	□□□□□ -1.21
NIF3L1-206	ENST00000416651	TPK1	Q9H3S4	243 aa		7.47	□□□□□ -1.21
NIF3L1-206	ENST00000416651	BCO1	Q9HAY6	547 aa		7.47	□□□□□ -1.21
NIF3L1-206	ENST00000416651	G6PC2	Q9NQR9	355 aa		7.47	□□□□□ -1.21
NIF3L1-206	ENST00000416651	SDHAF3	Q9NRP4	125 aa		7.47	□□□□□ -1.21
NIF3L1-206	ENST00000416651	FAM120C	Q9NX05	1096 aa	Known RBP	7.47	□□□□□ -1.21
NIF3L1-206	ENST00000416651	OPTC	Q9UBM4	332 aa		7.47	□□□□□ -1.21
NIF3L1-206	ENST00000416651	TSC22D4	Q9Y3Q8	395 aa		7.47	□□□□□ -1.21
NIF3L1-206	ENST00000416651	CIB4	A0PJX0	185 aa		7.46	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	C1orf226	A1L170	272 aa		7.46	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	ZNF503-AS2	A6NEH8	195 aa		7.46	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	GOLGA6L10	A6NI86	522 aa		7.46	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	CXorf49	A8MYA2	514 aa	Predicted RBP	7.46	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	SUPT3H	B4E1H0	165 aa		7.46	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651		H0YIV9	168 aa		7.46	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	SUPT3H	O75486	399 aa		7.46	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	MSMB	P08118	114 aa		7.46	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	OR4A8	P0C604	315 aa		7.46	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	LINGO3	P0C6S8	592 aa		7.46	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	GSTT1	P30711	240 aa		7.46	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	SERPINF1	P36955	418 aa		7.46	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	IDH3G	P51553	393 aa	Predicted RBP	7.46	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	MAPK12	P53778	367 aa		7.46	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	SNRPD2	P62316	118 aa	Known RBP	7.46	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	RASGEF1B	Q0VAM2	473 aa		7.46	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	MORF4L2	Q15014	288 aa		7.46	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	RNPS1	Q15287	305 aa	Known RBP	7.46	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	CD226	Q15762	336 aa		7.46	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	NDUFAF6	Q330K2	333 aa		7.46	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	GTF2IRD2B	Q6EKJ0	949 aa		7.46	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	LEG1	Q6P5S2	330 aa		7.46	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	KLHL17	Q6TDP4	642 aa		7.46	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	COMMD6	Q7Z4G1	85 aa		7.46	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	ISCA2	Q86U28	154 aa		7.46	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	GTF2IRD2	Q86UP8	949 aa		7.46	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	TMEM139	Q8IV31	216 aa		7.46	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	ZNF786	Q8N393	782 aa		7.46	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	METTL4	Q8N3J2	472 aa		7.46	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	CDYL2	Q8N8U2	506 aa		7.46	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	FBXO27	Q8NI29	283 aa		7.46	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	ZNF675	Q8TD23	568 aa		7.46	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	UBTD2	Q8WUN7	234 aa		7.46	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	DTNBP1	Q96EV8	351 aa		7.46	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	MS4A14	Q96JA4	679 aa		7.46	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	ZNF48	Q96MX3	618 aa	Predicted RBP	7.46	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	ATOH8	Q96SQ7	321 aa		7.46	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	CENPK	Q9BS16	269 aa		7.46	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	PFDN4	Q9NQP4	134 aa		7.46	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	PAQR5	Q9NXK6	330 aa	Predicted RBP	7.46	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	UTS2R	Q9UKP6	389 aa		7.46	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	ABCG2	Q9UNQ0	655 aa		7.46	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	IGHV1-18	A0A0C4DH31	117 aa		7.45	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	DNAJC9-AS1	A6NH13	148 aa		7.45	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	PPP6C	O00743	305 aa		7.45	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	OR7A17	O14581	309 aa		7.45	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	ZNF195	O14628	629 aa		7.45	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	H6PD	O95479	791 aa		7.45	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	OXSR1	O95747	527 aa	Predicted RBP	7.45	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	TSPAN15	O95858	294 aa		7.45	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	GAA	P10253	952 aa		7.45	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	CHN1	P15882	459 aa		7.45	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	CALCR	P30988	508 aa		7.45	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	ARFIP1	P53367	373 aa		7.45	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	RAB10	P61026	200 aa		7.45	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	LMO4	P61968	165 aa		7.45	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	PRR5	P85299	388 aa		7.45	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	C17orf67	Q0P5P2	114 aa		7.45	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	HNRNPA0	Q13151	305 aa	Known RBP	7.45	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	FASTKD3	Q14CZ7	662 aa	Known RBP	7.45	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	ARL13A	Q5H913	290 aa	Predicted RBP	7.45	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	CDKL4	Q5MAI5	379 aa		7.45	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	ZBTB37	Q5TC79	503 aa		7.45	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	LIPJ	Q5W064	366 aa		7.45	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	STEAP4	Q687X5	459 aa		7.45	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	GOLGA7	Q7Z5G4	137 aa		7.45	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	TBC1D1	Q86TI0	1168 aa	Predicted RBP	7.45	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	TRABD2A	Q86V40	505 aa		7.45	□□□□□ -1.22

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