RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542443.5

TRDN-204, Transcript of triadin, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRDN, Length 1,294 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDN-204ENST00000542443 COL1A2P08123 1366 aa4.53□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 PHIPQ8WWQ0 1821 aa4.53□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 ANKRD36A6QL64 1941 aa4.53□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 MYLKQ15746 1914 aa4.53□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 OR6C76A6NM76 312 aa4.53□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 UBFD1O14562 309 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 HAT1O14929 419 aa4.53□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 DFNA5O60443 496 aa4.53□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 GMNNO75496 209 aa4.53□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 UGT2B17O75795 530 aa4.53□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 CLIC3O95833 236 aa4.53□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 PLGP00747 810 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 IGLV2-11P01706 119 aa4.53□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 IGHV2-70P01814 119 aa4.53□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 QDPRP09417 244 aa4.53□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 STMN1P16949 149 aa4.53□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 LBPP18428 481 aa4.53□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 GGT1P19440 569 aa4.53□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 CD9P21926 228 aa4.53□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 ELK4P28324 431 aa4.53□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 SERPINB1P30740 379 aa4.53□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 HOXC13P31276 330 aa4.53□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 RCVRNP35243 200 aa4.53□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 MATKP42679 507 aa4.53□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 UGT2B15P54855 530 aa4.53□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 TAS2R39P59534 338 aa4.53□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 CSNK2BP67870 215 aa4.53□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 MAT1AQ00266 395 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 ACVR1Q04771 509 aa4.53□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 RBPJQ06330 500 aa4.53□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 ZBTB6Q15916 424 aa4.53□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 PPP1R3AQ16821 1122 aa4.53□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 FAM83EQ2M2I3 478 aa4.53□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 HYAL4Q2M3T9 481 aa4.53□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 SLC25A52Q3SY17 297 aa4.53□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 UNC50Q53HI1 259 aa4.53□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 OTUD3Q5T2D3 398 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 ARHGEF16Q5VV41 709 aa4.53□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 TIGD3Q6B0B8 471 aa4.53□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 ZNF470Q6ECI4 717 aa4.53□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 SULT1C3Q6IMI6 304 aa4.53□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 CAPN13Q6MZZ7 669 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 ZNF544Q6NX49 715 aa4.53□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 CASC4Q6P4E1 433 aa4.53□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 XKRXQ6PP77 449 aa4.53□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 CORO6Q6QEF8 472 aa4.53□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 DLEU7Q6UYE1 221 aa4.53□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 PIWIL3Q7Z3Z3 882 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 SNX20Q7Z614 316 aa4.53□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 DEFB132Q7Z7B7 95 aa4.53□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 P2RY8Q86VZ1 359 aa4.53□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa4.53□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 UBQLNLQ8IYU4 475 aa4.53□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 CCDC185Q8N715 623 aa4.53□□□□□ -1.68
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TRDN-204ENST00000542443 OR8J3Q8NGG0 315 aa4.53□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 OR9I1Q8NGQ6 314 aa4.53□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 GRPEL2Q8TAA5 225 aa4.53□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 HEXDCQ8WVB3 486 aa4.53□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 SSMEM1Q8WWF3 244 aa4.53□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 CYGBQ8WWM9 190 aa4.53□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 FCGR1BQ92637 280 aa4.53□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 PEX13Q92968 403 aa4.53□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 TMEM143Q96AN5 459 aa4.53□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 C19orf60Q96EN9 201 aa4.53□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 FER1L6-AS2Q96M78 137 aa4.53□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 MYADMQ96S97 322 aa4.53□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 LGMNQ99538 433 aa4.53□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 IL12RB2Q99665 862 aa4.53□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 SH3GL1Q99961 368 aa4.53□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 DHRS9Q9BPW9 319 aa4.53□□□□□ -1.68
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TRDN-204ENST00000542443 RTP3Q9BQQ7 232 aa4.53□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 GON7Q9BXV9 100 aa4.53□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 NDEL1Q9GZM8 345 aa4.53□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 POMKQ9H5K3 350 aa4.53□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa4.53□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 ZFP14Q9HCL3 533 aa4.53□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 ZNF302Q9NR11 478 aa4.53□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 CHRAC1Q9NRG0 131 aa4.53□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 HEBP1Q9NRV9 189 aa4.53□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 NRBP2Q9NSY0 501 aa4.53□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 FKBP14Q9NWM8 211 aa4.53□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 FBXL12Q9NXK8 326 aa4.53□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 OPTCQ9UBM4 332 aa4.53□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 LEF1Q9UJU2 399 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 C3orf18Q9UK00 162 aa4.53□□□□□ -1.68
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