RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516122.1

RNU6-871P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 871, pseudogene, humanhuman

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Gene RNU6-871P, Length 100 nt, Biotype snRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-871P-201ENST00000516122 OPN1MWP04001 364 aa-2.03□□□□□ -2.73
RNU6-871P-201ENST00000516122 OPN1MW2P0DN77 364 aa-2.03□□□□□ -2.73
RNU6-871P-201ENST00000516122 OPN1MW3P0DN78 364 aa-2.03□□□□□ -2.73
RNU6-871P-201ENST00000516122 HSD17B3P37058 310 aa-2.03□□□□□ -2.73
RNU6-871P-201ENST00000516122 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP-2.03□□□□□ -2.73
RNU6-871P-201ENST00000516122 MFAP4P55083 255 aa-2.03□□□□□ -2.73
RNU6-871P-201ENST00000516122 CCL23P55773 120 aa-2.03□□□□□ -2.73
RNU6-871P-201ENST00000516122 CDKL1Q00532 357 aa-2.03□□□□□ -2.73
RNU6-871P-201ENST00000516122 HMGCS1Q01581 520 aa-2.03□□□□□ -2.73
RNU6-871P-201ENST00000516122 TGM3Q08188 693 aa-2.03□□□□□ -2.73
RNU6-871P-201ENST00000516122 SLC10A7Q0GE19 358 aa-2.03□□□□□ -2.73
RNU6-871P-201ENST00000516122 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP-2.03□□□□□ -2.73
RNU6-871P-201ENST00000516122 NFE2L1Q14494 772 aa-2.03□□□□□ -2.73
RNU6-871P-201ENST00000516122 UGCGQ16739 394 aa-2.03□□□□□ -2.73
RNU6-871P-201ENST00000516122 CYP51A1Q16850 503 aa-2.03□□□□□ -2.73
RNU6-871P-201ENST00000516122 CBWD6Q4V339 395 aa-2.03□□□□□ -2.73
RNU6-871P-201ENST00000516122 CBWD3Q5JTY5 395 aa-2.03□□□□□ -2.73
RNU6-871P-201ENST00000516122 C1orf146Q5VVC0 180 aa-2.03□□□□□ -2.73
RNU6-871P-201ENST00000516122 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP-2.03□□□□□ -2.73
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RNU6-871P-201ENST00000516122 SPATA5Q8NB90 893 aa-2.03□□□□□ -2.73
RNU6-871P-201ENST00000516122 CCDC191Q8NCU4 936 aa-2.03□□□□□ -2.73
RNU6-871P-201ENST00000516122 OR13G1Q8NGZ3 307 aa-2.03□□□□□ -2.73
RNU6-871P-201ENST00000516122 GOLGA5Q8TBA6 731 aa-2.03□□□□□ -2.73
RNU6-871P-201ENST00000516122 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP-2.03□□□□□ -2.73
RNU6-871P-201ENST00000516122 IL1F10Q8WWZ1 152 aa-2.03□□□□□ -2.73
RNU6-871P-201ENST00000516122 RAD54LQ92698 747 aa-2.03□□□□□ -2.73
RNU6-871P-201ENST00000516122 TMEM80Q96HE8 168 aa-2.03□□□□□ -2.73
RNU6-871P-201ENST00000516122 IP6K3Q96PC2 410 aa-2.03□□□□□ -2.73
RNU6-871P-201ENST00000516122 ZNF382Q96SR6 550 aa-2.03□□□□□ -2.73
RNU6-871P-201ENST00000516122 RAB33BQ9H082 229 aa-2.03□□□□□ -2.73
RNU6-871P-201ENST00000516122 SH2D4AQ9H788 454 aa-2.03□□□□□ -2.73
RNU6-871P-201ENST00000516122 CAB39LQ9H9S4 337 aa-2.03□□□□□ -2.73
RNU6-871P-201ENST00000516122 ZNF160Q9HCG1 818 aa-2.03□□□□□ -2.73
RNU6-871P-201ENST00000516122 PLCB1Q9NQ66 1216 aa-2.03□□□□□ -2.73
RNU6-871P-201ENST00000516122 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP-2.03□□□□□ -2.73
RNU6-871P-201ENST00000516122 NPIPA1Q9UND3 350 aa-2.03□□□□□ -2.73
RNU6-871P-201ENST00000516122 OR1A2Q9Y585 309 aa-2.03□□□□□ -2.73
RNU6-871P-201ENST00000516122 LPAP08519 4548 aa-2.04□□□□□ -2.74
RNU6-871P-201ENST00000516122 OR2A25A4D2G3 310 aa-2.04□□□□□ -2.74
RNU6-871P-201ENST00000516122 BTNL10A8MVZ5 291 aa-2.04□□□□□ -2.74
RNU6-871P-201ENST00000516122 LY6LH3BQJ8 138 aa-2.04□□□□□ -2.74
RNU6-871P-201ENST00000516122 CLDN4O14493 209 aa-2.04□□□□□ -2.74
RNU6-871P-201ENST00000516122 CNMDO75829 334 aa-2.04□□□□□ -2.74
RNU6-871P-201ENST00000516122 DYSFO75923 2080 aa-2.04□□□□□ -2.74
RNU6-871P-201ENST00000516122 LALBAP00709 142 aa-2.04□□□□□ -2.74
RNU6-871P-201ENST00000516122 ALPPP05187 535 aa-2.04□□□□□ -2.74
RNU6-871P-201ENST00000516122 ZNF735P0CB33 412 aa-2.04□□□□□ -2.74
RNU6-871P-201ENST00000516122 GZMAP12544 262 aa-2.04□□□□□ -2.74
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RNU6-871P-201ENST00000516122 PCGF2P35227 344 aa-2.04□□□□□ -2.74
RNU6-871P-201ENST00000516122 TPMTP51580 245 aa-2.04□□□□□ -2.74
RNU6-871P-201ENST00000516122 AFF2P51816 1311 aa-2.04□□□□□ -2.74
RNU6-871P-201ENST00000516122 TAS2R19P59542 299 aa-2.04□□□□□ -2.74
RNU6-871P-201ENST00000516122 ST3GAL3Q11203 375 aa-2.04□□□□□ -2.74
RNU6-871P-201ENST00000516122 ACSM5Q6NUN0 579 aa-2.04□□□□□ -2.74
RNU6-871P-201ENST00000516122 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP-2.04□□□□□ -2.74
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RNU6-871P-201ENST00000516122 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa-2.04□□□□□ -2.74
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RNU6-871P-201ENST00000516122 TSSK2Q96PF2 358 aa-2.04□□□□□ -2.74
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RNU6-871P-201ENST00000516122 SNX25Q9H3E2 840 aa-2.04□□□□□ -2.74
RNU6-871P-201ENST00000516122 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa-2.04□□□□□ -2.74
RNU6-871P-201ENST00000516122 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa-2.04□□□□□ -2.74
RNU6-871P-201ENST00000516122 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa-2.04□□□□□ -2.74
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RNU6-871P-201ENST00000516122 HMG20AQ9NP66 347 aa-2.04□□□□□ -2.74
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RNU6-871P-201ENST00000516122 HOXC10Q9NYD6 342 aa-2.04□□□□□ -2.74
RNU6-871P-201ENST00000516122 ASF1AQ9Y294 204 aa-2.04□□□□□ -2.74
RNU6-871P-201ENST00000516122 USP16Q9Y5T5 823 aa-2.04□□□□□ -2.74
RNU6-871P-201ENST00000516122 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa-2.04□□□□□ -2.74
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RNU6-871P-201ENST00000516122 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP-2.05□□□□□ -2.74
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RNU6-871P-201ENST00000516122 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa-2.05□□□□□ -2.74
RNU6-871P-201ENST00000516122 A0A1B0GUL7 405 aa-2.05□□□□□ -2.74
RNU6-871P-201ENST00000516122 CCDC162PA2VCL2 907 aa-2.05□□□□□ -2.74
RNU6-871P-201ENST00000516122 LEUTXA8MZ59 168 aa-2.05□□□□□ -2.74
RNU6-871P-201ENST00000516122 E9PBE3 544 aa-2.05□□□□□ -2.74
RNU6-871P-201ENST00000516122 H0YHG0 523 aa-2.05□□□□□ -2.74
RNU6-871P-201ENST00000516122 VEGFDO43915 354 aa-2.05□□□□□ -2.74
RNU6-871P-201ENST00000516122 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP-2.05□□□□□ -2.74
RNU6-871P-201ENST00000516122 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP-2.05□□□□□ -2.74
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RNU6-871P-201ENST00000516122 CLTBP09497 229 aa-2.05□□□□□ -2.74
RNU6-871P-201ENST00000516122 TUBP50607 506 aa-2.05□□□□□ -2.74
RNU6-871P-201ENST00000516122 PRAMEP78395 509 aa-2.05□□□□□ -2.74
RNU6-871P-201ENST00000516122 REG3AQ06141 175 aa-2.05□□□□□ -2.74
RNU6-871P-201ENST00000516122 PICALMQ13492 652 aa-2.05□□□□□ -2.74
RNU6-871P-201ENST00000516122 IRF3Q14653 427 aa-2.05□□□□□ -2.74
RNU6-871P-201ENST00000516122 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP-2.05□□□□□ -2.74
RNU6-871P-201ENST00000516122 C1orf189Q5VU69 101 aa-2.05□□□□□ -2.74
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