RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497210.5

CTPS1-211, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 3

Gene CTPS1, Length 463 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-211ENST00000497210 RTL4Q6ZR62 310 aa8.91□□□□□ -0.98
CTPS1-211ENST00000497210 FKBP9P1Q75LS8 142 aa8.91□□□□□ -0.98
CTPS1-211ENST00000497210 CBLL1Q75N03 491 aa8.91□□□□□ -0.98
CTPS1-211ENST00000497210 EIF3MQ7L2H7 374 aaKnown RBP8.91□□□□□ -0.98
CTPS1-211ENST00000497210 NUP54Q7Z3B4 507 aa8.91□□□□□ -0.98
CTPS1-211ENST00000497210 GALNT10Q86SR1 603 aa8.91□□□□□ -0.98
CTPS1-211ENST00000497210 SPPL2CQ8IUH8 684 aa8.91□□□□□ -0.98
CTPS1-211ENST00000497210 PRR22Q8IZ63 422 aa8.91□□□□□ -0.98
CTPS1-211ENST00000497210 CYP4Z2PQ8N1L4 340 aa8.91□□□□□ -0.98
CTPS1-211ENST00000497210 OR4N2Q8NGD1 307 aa8.91□□□□□ -0.98
CTPS1-211ENST00000497210 KISS1RQ969F8 398 aaPredicted RBP8.91□□□□□ -0.98
CTPS1-211ENST00000497210 SLC35B4Q969S0 331 aa8.91□□□□□ -0.98
CTPS1-211ENST00000497210 TAMM41Q96BW9 452 aa8.91□□□□□ -0.98
CTPS1-211ENST00000497210 SLC47A1Q96FL8 570 aa8.91□□□□□ -0.98
CTPS1-211ENST00000497210 TPD52L3Q96J77 140 aa8.91□□□□□ -0.98
CTPS1-211ENST00000497210 UTP23Q9BRU9 249 aaKnown RBP8.91□□□□□ -0.98
CTPS1-211ENST00000497210 RNF32Q9H0A6 362 aa8.91□□□□□ -0.98
CTPS1-211ENST00000497210 CDCP1Q9H5V8 836 aa8.91□□□□□ -0.98
CTPS1-211ENST00000497210 METTL7AQ9H8H3 244 aa8.91□□□□□ -0.98
CTPS1-211ENST00000497210 ST6GALNAC1Q9NSC7 600 aaPredicted RBP8.91□□□□□ -0.98
CTPS1-211ENST00000497210 DCAF13Q9NV06 445 aaKnown RBP8.91□□□□□ -0.98
CTPS1-211ENST00000497210 KLRF1Q9NZS2 232 aa8.91□□□□□ -0.98
CTPS1-211ENST00000497210 ANAPC2Q9UJX6 822 aa8.91□□□□□ -0.98
CTPS1-211ENST00000497210 USP22Q9UPT9 525 aa8.91□□□□□ -0.98
CTPS1-211ENST00000497210 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP8.91□□□□□ -0.98
CTPS1-211ENST00000497210 KCNE3Q9Y6H6 103 aa8.91□□□□□ -0.98
CTPS1-211ENST00000497210 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa8.91□□□□□ -0.98
CTPS1-211ENST00000497210 AKAP13Q12802 2813 aa8.9□□□□□ -0.98
CTPS1-211ENST00000497210 PCSK5Q92824 1860 aa8.9□□□□□ -0.98
CTPS1-211ENST00000497210 ANKRD65E5RJM6 399 aa8.9□□□□□ -0.98
CTPS1-211ENST00000497210 UGT2B11O75310 529 aa8.9□□□□□ -0.98
CTPS1-211ENST00000497210 FKBP6O75344 327 aa8.9□□□□□ -0.98
CTPS1-211ENST00000497210 SORBS2O94875 1100 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
CTPS1-211ENST00000497210 NADKO95544 446 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.98
CTPS1-211ENST00000497210 OXSR1O95747 527 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.98
CTPS1-211ENST00000497210 OPN1SWP03999 348 aa8.9□□□□□ -0.98
CTPS1-211ENST00000497210 IFNW1P05000 195 aa8.9□□□□□ -0.98
CTPS1-211ENST00000497210 SCG5P05408 212 aa8.9□□□□□ -0.98
CTPS1-211ENST00000497210 UBL4AP11441 157 aa8.9□□□□□ -0.98
CTPS1-211ENST00000497210 CYP4B1P13584 511 aa8.9□□□□□ -0.98
CTPS1-211ENST00000497210 ITGA2P17301 1181 aa8.9□□□□□ -0.98
CTPS1-211ENST00000497210 WT1P19544 449 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.98
CTPS1-211ENST00000497210 TBXA2RP21731 343 aa8.9□□□□□ -0.98
CTPS1-211ENST00000497210 IFNA8P32881 189 aa8.9□□□□□ -0.98
CTPS1-211ENST00000497210 SOX3P41225 446 aa8.9□□□□□ -0.98
CTPS1-211ENST00000497210 HLCSP50747 726 aa8.9□□□□□ -0.98
CTPS1-211ENST00000497210 SELENOWP63302 87 aa8.9□□□□□ -0.98
CTPS1-211ENST00000497210 RHDQ02161 417 aa8.9□□□□□ -0.98
CTPS1-211ENST00000497210 OC90Q02509 493 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.98
CTPS1-211ENST00000497210 CHRNB3Q05901 458 aa8.9□□□□□ -0.98
CTPS1-211ENST00000497210 Q0VFX4 171 aa8.9□□□□□ -0.98
CTPS1-211ENST00000497210 MFAP5Q13361 173 aa8.9□□□□□ -0.98
CTPS1-211ENST00000497210 SNTA1Q13424 505 aa8.9□□□□□ -0.98
CTPS1-211ENST00000497210 ZNF141Q15928 474 aa8.9□□□□□ -0.98
CTPS1-211ENST00000497210 GRAMD1BQ3KR37 738 aa8.9□□□□□ -0.98
CTPS1-211ENST00000497210 FAM209AQ5JX71 171 aa8.9□□□□□ -0.98
CTPS1-211ENST00000497210 PDZK1Q5T2W1 519 aa8.9□□□□□ -0.98
CTPS1-211ENST00000497210 TMEM81Q6P7N7 255 aa8.9□□□□□ -0.98
CTPS1-211ENST00000497210 BORAQ6PGQ7 559 aa8.9□□□□□ -0.98
CTPS1-211ENST00000497210 DHRS4L2Q6PKH6 230 aa8.9□□□□□ -0.98
CTPS1-211ENST00000497210 RANBP3LQ86VV4 465 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.98
CTPS1-211ENST00000497210 CYP4Z1Q86W10 505 aa8.9□□□□□ -0.98
CTPS1-211ENST00000497210 WFDC3Q8IUB2 231 aa8.9□□□□□ -0.98
CTPS1-211ENST00000497210 ZNF440Q8IYI8 595 aa8.9□□□□□ -0.98
CTPS1-211ENST00000497210 BEST3Q8N1M1 668 aa8.9□□□□□ -0.98
CTPS1-211ENST00000497210 APOBEC4Q8WW27 367 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
CTPS1-211ENST00000497210 C1orf159Q96HA4 380 aa8.9□□□□□ -0.98
CTPS1-211ENST00000497210 LMF1Q96S06 567 aa8.9□□□□□ -0.98
CTPS1-211ENST00000497210 DOHHQ9BU89 302 aa8.9□□□□□ -0.98
CTPS1-211ENST00000497210 OSBPL11Q9BXB4 747 aa8.9□□□□□ -0.98
CTPS1-211ENST00000497210 ZBTB20Q9HC78 741 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.98
CTPS1-211ENST00000497210 SDHAF3Q9NRP4 125 aa8.9□□□□□ -0.98
CTPS1-211ENST00000497210 CNIH4Q9P003 139 aa8.9□□□□□ -0.98
CTPS1-211ENST00000497210 AURKCQ9UQB9 309 aa8.9□□□□□ -0.98
CTPS1-211ENST00000497210 DTNAQ9Y4J8 743 aa8.9□□□□□ -0.98
CTPS1-211ENST00000497210 A0A087WV48 116 aa8.89□□□□□ -0.99
CTPS1-211ENST00000497210 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa8.89□□□□□ -0.99
CTPS1-211ENST00000497210 TCRBV3S1A0A5B6 114 aa8.89□□□□□ -0.99
CTPS1-211ENST00000497210 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP8.89□□□□□ -0.99
CTPS1-211ENST00000497210 SERINC4A6NH21 518 aa8.89□□□□□ -0.99
CTPS1-211ENST00000497210 TMEM200CA6NKL6 621 aa8.89□□□□□ -0.99
CTPS1-211ENST00000497210 ALG1L2C9J202 215 aa8.89□□□□□ -0.99
CTPS1-211ENST00000497210 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa8.89□□□□□ -0.99
CTPS1-211ENST00000497210 MKRN2OSH3BPM6 223 aa8.89□□□□□ -0.99
CTPS1-211ENST00000497210 K7ENP7 123 aa8.89□□□□□ -0.99
CTPS1-211ENST00000497210 M0QX08 132 aa8.89□□□□□ -0.99
CTPS1-211ENST00000497210 PRODHO43272 600 aa8.89□□□□□ -0.99
CTPS1-211ENST00000497210 FCMRO60667 390 aa8.89□□□□□ -0.99
CTPS1-211ENST00000497210 UGT2B17O75795 530 aa8.89□□□□□ -0.99
CTPS1-211ENST00000497210 MFN2O95140 757 aa8.89□□□□□ -0.99
CTPS1-211ENST00000497210 IGKV1D-16P01601 117 aa8.89□□□□□ -0.99
CTPS1-211ENST00000497210 P04436 131 aa8.89□□□□□ -0.99
CTPS1-211ENST00000497210 FABP3P05413 133 aa8.89□□□□□ -0.99
CTPS1-211ENST00000497210 RAP2AP10114 183 aa8.89□□□□□ -0.99
CTPS1-211ENST00000497210 IFNGR1P15260 489 aa8.89□□□□□ -0.99
CTPS1-211ENST00000497210 HOXC12P31275 282 aa8.89□□□□□ -0.99
CTPS1-211ENST00000497210 SLC6A8P48029 635 aa8.89□□□□□ -0.99
CTPS1-211ENST00000497210 SUMO3P55854 103 aaPredicted RBP8.89□□□□□ -0.99
CTPS1-211ENST00000497210 RGS8P57771 180 aaPredicted RBP8.89□□□□□ -0.99
CTPS1-211ENST00000497210 FBXW4P57775 412 aa8.89□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 73.8 ms