RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463419.1

NIN-208, Transcript of ninein, human

TSL 4

Gene NIN, Length 1,317 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NIN-208	ENST00000463419	CD79B	P40259	229 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NIN-208	ENST00000463419	PCYT1A	P49585	367 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NIN-208	ENST00000463419	P2RX1	P51575	399 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NIN-208	ENST00000463419	ATP12A	P54707	1039 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NIN-208	ENST00000463419	PHC1	P78364	1004 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NIN-208	ENST00000463419	BST1	Q10588	318 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NIN-208	ENST00000463419	FOXF1	Q12946	379 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NIN-208	ENST00000463419	NDUFAF6	Q330K2	333 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NIN-208	ENST00000463419	PAMR1	Q6UXH9	720 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NIN-208	ENST00000463419	ESPNL	Q6ZVH7	1005 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NIN-208	ENST00000463419	FAM214B	Q7L5A3	538 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NIN-208	ENST00000463419	LILRA2	Q8N149	483 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NIN-208	ENST00000463419	ANKRD42	Q8N9B4	389 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NIN-208	ENST00000463419	OR4A15	Q8NGL6	344 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NIN-208	ENST00000463419	OR2V1	Q8NHB1	315 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NIN-208	ENST00000463419	WFIKKN1	Q96NZ8	548 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NIN-208	ENST00000463419	SDF2	Q99470	211 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NIN-208	ENST00000463419	PAIP2	Q9BPZ3	127 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
NIN-208	ENST00000463419	PRRG4	Q9BZD6	226 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NIN-208	ENST00000463419	ICAM5	Q9UMF0	924 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NIN-208	ENST00000463419	CLEC4A	Q9UMR7	237 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NIN-208	ENST00000463419	PROCR	Q9UNN8	238 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NIN-208	ENST00000463419	DTNA	Q9Y4J8	743 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NIN-208	ENST00000463419	RNF103-CHMP3	A0A140T963	221 aa		11.61	□□□□□ -0.55
NIN-208	ENST00000463419		A0A1W2PPR1	153 aa		11.61	□□□□□ -0.55
NIN-208	ENST00000463419		H3BNH8	94 aa		11.61	□□□□□ -0.55
NIN-208	ENST00000463419	GTPBP1	O00178	669 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
NIN-208	ENST00000463419	CASK	O14936	926 aa		11.61	□□□□□ -0.55
NIN-208	ENST00000463419	EFNA2	O43921	213 aa		11.61	□□□□□ -0.55
NIN-208	ENST00000463419	ICMT	O60725	284 aa		11.61	□□□□□ -0.55
NIN-208	ENST00000463419	NUDT14	O95848	222 aa		11.61	□□□□□ -0.55
NIN-208	ENST00000463419	TUBB	P07437	444 aa		11.61	□□□□□ -0.55
NIN-208	ENST00000463419	POU2F1	P14859	743 aa		11.61	□□□□□ -0.55
NIN-208	ENST00000463419	ME2	P23368	584 aa		11.61	□□□□□ -0.55
NIN-208	ENST00000463419	SHC1	P29353	583 aa		11.61	□□□□□ -0.55
NIN-208	ENST00000463419	CCKAR	P32238	428 aa		11.61	□□□□□ -0.55
NIN-208	ENST00000463419	UGT2B10	P36537	528 aa		11.61	□□□□□ -0.55
NIN-208	ENST00000463419	EIF1	P41567	113 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
NIN-208	ENST00000463419	KCNJ5	P48544	419 aa		11.61	□□□□□ -0.55
NIN-208	ENST00000463419	CASP9	P55211	416 aa		11.61	□□□□□ -0.55
NIN-208	ENST00000463419	FGFBP1	Q14512	234 aa		11.61	□□□□□ -0.55
NIN-208	ENST00000463419	TOMM34	Q15785	309 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
NIN-208	ENST00000463419	HBM	Q6B0K9	141 aa		11.61	□□□□□ -0.55
NIN-208	ENST00000463419	OLIG3	Q7RTU3	272 aa		11.61	□□□□□ -0.55
NIN-208	ENST00000463419	CROCCP2	Q86T23	111 aa		11.61	□□□□□ -0.55
NIN-208	ENST00000463419	ANKRD46	Q86W74	232 aa		11.61	□□□□□ -0.55
NIN-208	ENST00000463419	KIRREL3	Q8IZU9	778 aa		11.61	□□□□□ -0.55
NIN-208	ENST00000463419	ZNF614	Q8N883	585 aa		11.61	□□□□□ -0.55
NIN-208	ENST00000463419	CCDC168	Q8NDH2	2452 aa		11.61	□□□□□ -0.55
NIN-208	ENST00000463419	CHDH	Q8NE62	594 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
NIN-208	ENST00000463419	FBXO27	Q8NI29	283 aa		11.61	□□□□□ -0.55
NIN-208	ENST00000463419	GPR119	Q8TDV5	335 aa		11.61	□□□□□ -0.55
NIN-208	ENST00000463419	TESC	Q96BS2	214 aa		11.61	□□□□□ -0.55
NIN-208	ENST00000463419	ZNF524	Q96C55	264 aa		11.61	□□□□□ -0.55
NIN-208	ENST00000463419	GMPPA	Q96IJ6	420 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
NIN-208	ENST00000463419	SLC35G5	Q96KT7	338 aa		11.61	□□□□□ -0.55
NIN-208	ENST00000463419	KLHL15	Q96M94	604 aa		11.61	□□□□□ -0.55
NIN-208	ENST00000463419	SLC39A3	Q9BRY0	314 aa		11.61	□□□□□ -0.55
NIN-208	ENST00000463419	MEAF6	Q9HAF1	191 aa		11.61	□□□□□ -0.55
NIN-208	ENST00000463419	PLSCR4	Q9NRQ2	329 aa		11.61	□□□□□ -0.55
NIN-208	ENST00000463419	PAQR5	Q9NXK6	330 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
NIN-208	ENST00000463419	KLHL28	Q9NXS3	571 aa		11.61	□□□□□ -0.55
NIN-208	ENST00000463419	ELOVL5	Q9NYP7	299 aa		11.61	□□□□□ -0.55
NIN-208	ENST00000463419	KCNE5	Q9UJ90	142 aa		11.61	□□□□□ -0.55
NIN-208	ENST00000463419	MCTS1	Q9ULC4	181 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
NIN-208	ENST00000463419	PCDHGB4	Q9UN71	923 aa		11.61	□□□□□ -0.55
NIN-208	ENST00000463419	EDAR	Q9UNE0	448 aa		11.61	□□□□□ -0.55
NIN-208	ENST00000463419	TEP1	Q99973	2627 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
NIN-208	ENST00000463419	PRSS51	A0A1B0GVH4	220 aa		11.6	□□□□□ -0.55
NIN-208	ENST00000463419	DUXA	A6NLW8	204 aa		11.6	□□□□□ -0.55
NIN-208	ENST00000463419	FCMR	O60667	390 aa		11.6	□□□□□ -0.55
NIN-208	ENST00000463419	SS18L1	O75177	396 aa	Predicted RBP	11.6	□□□□□ -0.55
NIN-208	ENST00000463419	ATE1	O95260	518 aa		11.6	□□□□□ -0.55
NIN-208	ENST00000463419	SYNGR4	O95473	234 aa		11.6	□□□□□ -0.55
NIN-208	ENST00000463419	PLG	P00747	810 aa	Predicted RBP	11.6	□□□□□ -0.55
NIN-208	ENST00000463419	RAF1	P04049	648 aa		11.6	□□□□□ -0.55
NIN-208	ENST00000463419	LBP	P18428	481 aa		11.6	□□□□□ -0.55
NIN-208	ENST00000463419	ELK4	P28324	431 aa		11.6	□□□□□ -0.55
NIN-208	ENST00000463419	ADH6	P28332	368 aa		11.6	□□□□□ -0.55
NIN-208	ENST00000463419	SFTPD	P35247	375 aa		11.6	□□□□□ -0.55
NIN-208	ENST00000463419	SUMO3	P55854	103 aa	Predicted RBP	11.6	□□□□□ -0.55
NIN-208	ENST00000463419	ARHGAP11B	Q3KRB8	267 aa		11.6	□□□□□ -0.55
NIN-208	ENST00000463419	SPANXN4	Q5MJ08	99 aa		11.6	□□□□□ -0.55
NIN-208	ENST00000463419	PDSS1	Q5T2R2	415 aa		11.6	□□□□□ -0.55
NIN-208	ENST00000463419	PDZK1	Q5T2W1	519 aa		11.6	□□□□□ -0.55
NIN-208	ENST00000463419	HHAT	Q5VTY9	493 aa		11.6	□□□□□ -0.55
NIN-208	ENST00000463419	ZNF550	Q7Z398	422 aa		11.6	□□□□□ -0.55
NIN-208	ENST00000463419	LRRC34	Q8IZ02	419 aa		11.6	□□□□□ -0.55
NIN-208	ENST00000463419	DEPDC4	Q8N2C3	294 aa		11.6	□□□□□ -0.55
NIN-208	ENST00000463419	OR6K3	Q8NGY3	331 aa		11.6	□□□□□ -0.55
NIN-208	ENST00000463419	RFWD2	Q8NHY2	731 aa		11.6	□□□□□ -0.55
NIN-208	ENST00000463419	OSTF1	Q92882	214 aa		11.6	□□□□□ -0.55
NIN-208	ENST00000463419	TEX37	Q96LM6	180 aa		11.6	□□□□□ -0.55
NIN-208	ENST00000463419	NMUR2	Q9GZQ4	415 aa		11.6	□□□□□ -0.55
NIN-208	ENST00000463419	OR51I1	Q9H343	314 aa		11.6	□□□□□ -0.55
NIN-208	ENST00000463419	C6orf203	Q9P0P8	240 aa	Predicted RBP	11.6	□□□□□ -0.55
NIN-208	ENST00000463419	MKLN1	Q9UL63	735 aa		11.6	□□□□□ -0.55
NIN-208	ENST00000463419	EMC9	Q9Y3B6	208 aa		11.6	□□□□□ -0.55
NIN-208	ENST00000463419	ANKHD1	Q8IWZ3	2542 aa	Known RBP	11.6	□□□□□ -0.55
NIN-208	ENST00000463419	CENPVL1	A0A0U1RR11	272 aa		11.6	□□□□□ -0.55

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