RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000416651.5

NIF3L1-206, Transcript of NGG1 interacting factor 3 like 1, human

TSL 2 BASIC

Gene NIF3L1, Length 967 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NIF3L1-206	ENST00000416651	FAM110B	Q8TC76	370 aa		7.5	□□□□□ -1.21
NIF3L1-206	ENST00000416651	KLHL29	Q96CT2	875 aa		7.5	□□□□□ -1.21
NIF3L1-206	ENST00000416651	KLHL15	Q96M94	604 aa		7.5	□□□□□ -1.21
NIF3L1-206	ENST00000416651	LRRC37B	Q96QE4	947 aa		7.5	□□□□□ -1.21
NIF3L1-206	ENST00000416651	PSD2	Q9BQI7	771 aa		7.5	□□□□□ -1.21
NIF3L1-206	ENST00000416651	LRRC1	Q9BTT6	524 aa		7.5	□□□□□ -1.21
NIF3L1-206	ENST00000416651	DERL2	Q9GZP9	239 aa		7.5	□□□□□ -1.21
NIF3L1-206	ENST00000416651	SSU72	Q9NP77	194 aa	Known RBP	7.5	□□□□□ -1.21
NIF3L1-206	ENST00000416651	TREM2	Q9NZC2	230 aa		7.5	□□□□□ -1.21
NIF3L1-206	ENST00000416651	CFL2	Q9Y281	166 aa		7.5	□□□□□ -1.21
NIF3L1-206	ENST00000416651	PTGDR2	Q9Y5Y4	395 aa		7.5	□□□□□ -1.21
NIF3L1-206	ENST00000416651	FKBP7	Q9Y680	259 aa		7.5	□□□□□ -1.21
NIF3L1-206	ENST00000416651	IGLV3-32	A0A0A0MS00	114 aa		7.49	□□□□□ -1.21
NIF3L1-206	ENST00000416651		A0A1W2PRB8	838 aa		7.49	□□□□□ -1.21
NIF3L1-206	ENST00000416651	CBFA2T2	O43439	604 aa		7.49	□□□□□ -1.21
NIF3L1-206	ENST00000416651	PDE5A	O76074	875 aa		7.49	□□□□□ -1.21
NIF3L1-206	ENST00000416651	DAO	P14920	347 aa		7.49	□□□□□ -1.21
NIF3L1-206	ENST00000416651	CSNK2A2	P19784	350 aa	Predicted RBP	7.49	□□□□□ -1.21
NIF3L1-206	ENST00000416651	MDK	P21741	143 aa	Predicted RBP	7.49	□□□□□ -1.21
NIF3L1-206	ENST00000416651	OMG	P23515	440 aa		7.49	□□□□□ -1.21
NIF3L1-206	ENST00000416651	PTAFR	P25105	342 aa		7.49	□□□□□ -1.21
NIF3L1-206	ENST00000416651	PTX3	P26022	381 aa	Predicted RBP	7.49	□□□□□ -1.21
NIF3L1-206	ENST00000416651	GIF	P27352	417 aa		7.49	□□□□□ -1.21
NIF3L1-206	ENST00000416651	CXCR5	P32302	372 aa		7.49	□□□□□ -1.21
NIF3L1-206	ENST00000416651	MANF	P55145	182 aa	Known RBP	7.49	□□□□□ -1.21
NIF3L1-206	ENST00000416651	KRTAP10-3	P60369	221 aa		7.49	□□□□□ -1.21
NIF3L1-206	ENST00000416651	PHC1	P78364	1004 aa		7.49	□□□□□ -1.21
NIF3L1-206	ENST00000416651	PLPPR5	Q32ZL2	321 aa		7.49	□□□□□ -1.21
NIF3L1-206	ENST00000416651	GRAMD1B	Q3KR37	738 aa		7.49	□□□□□ -1.21
NIF3L1-206	ENST00000416651	SPANXN3	Q5MJ09	141 aa		7.49	□□□□□ -1.21
NIF3L1-206	ENST00000416651	ARMC3	Q5W041	872 aa		7.49	□□□□□ -1.21
NIF3L1-206	ENST00000416651	FAHD2B	Q6P2I3	314 aa	Predicted RBP	7.49	□□□□□ -1.21
NIF3L1-206	ENST00000416651	LCNL1	Q6ZST4	164 aa		7.49	□□□□□ -1.21
NIF3L1-206	ENST00000416651	ESPNL	Q6ZVH7	1005 aa		7.49	□□□□□ -1.21
NIF3L1-206	ENST00000416651	LRRC70	Q7Z2Q7	622 aa		7.49	□□□□□ -1.21
NIF3L1-206	ENST00000416651	SLC46A3	Q7Z3Q1	461 aa		7.49	□□□□□ -1.21
NIF3L1-206	ENST00000416651	SPATA19	Q7Z5L4	167 aa		7.49	□□□□□ -1.21
NIF3L1-206	ENST00000416651	GALNT7	Q86SF2	657 aa		7.49	□□□□□ -1.21
NIF3L1-206	ENST00000416651	EXOC3L1	Q86VI1	746 aa		7.49	□□□□□ -1.21
NIF3L1-206	ENST00000416651	GLCCI1	Q86VQ1	547 aa		7.49	□□□□□ -1.21
NIF3L1-206	ENST00000416651	TDRP	Q86YL5	185 aa		7.49	□□□□□ -1.21
NIF3L1-206	ENST00000416651	LILRA2	Q8N149	483 aa		7.49	□□□□□ -1.21
NIF3L1-206	ENST00000416651	GTPBP8	Q8N3Z3	284 aa	Predicted RBP	7.49	□□□□□ -1.21
NIF3L1-206	ENST00000416651	CLDND2	Q8NHS1	167 aa		7.49	□□□□□ -1.21
NIF3L1-206	ENST00000416651	UBE2E3	Q969T4	207 aa		7.49	□□□□□ -1.21
NIF3L1-206	ENST00000416651	TMEM186	Q96B77	213 aa		7.49	□□□□□ -1.21
NIF3L1-206	ENST00000416651	DNAJA3	Q96EY1	480 aa		7.49	□□□□□ -1.21
NIF3L1-206	ENST00000416651	FAHD2A	Q96GK7	314 aa		7.49	□□□□□ -1.21
NIF3L1-206	ENST00000416651	SH3YL1	Q96HL8	342 aa	Predicted RBP	7.49	□□□□□ -1.21
NIF3L1-206	ENST00000416651	MCMBP	Q9BTE3	642 aa		7.49	□□□□□ -1.21
NIF3L1-206	ENST00000416651	PTGES2	Q9H7Z7	377 aa		7.49	□□□□□ -1.21
NIF3L1-206	ENST00000416651	SEC61A2	Q9H9S3	476 aa		7.49	□□□□□ -1.21
NIF3L1-206	ENST00000416651	MYNN	Q9NPC7	610 aa		7.49	□□□□□ -1.21
NIF3L1-206	ENST00000416651	MED17	Q9NVC6	651 aa		7.49	□□□□□ -1.21
NIF3L1-206	ENST00000416651	FAM53C	Q9NYF3	392 aa		7.49	□□□□□ -1.21
NIF3L1-206	ENST00000416651	OR10H1	Q9Y4A9	318 aa		7.49	□□□□□ -1.21
NIF3L1-206	ENST00000416651	SOX21	Q9Y651	276 aa	Predicted RBP	7.49	□□□□□ -1.21
NIF3L1-206	ENST00000416651		K7EPI3	171 aa		7.48	□□□□□ -1.21
NIF3L1-206	ENST00000416651	PRKD3	O94806	890 aa		7.48	□□□□□ -1.21
NIF3L1-206	ENST00000416651	UTS2	O95399	124 aa		7.48	□□□□□ -1.21
NIF3L1-206	ENST00000416651	IL33	O95760	270 aa		7.48	□□□□□ -1.21
NIF3L1-206	ENST00000416651	TPM3	P06753	285 aa		7.48	□□□□□ -1.21
NIF3L1-206	ENST00000416651	ITGA5	P08648	1049 aa		7.48	□□□□□ -1.21
NIF3L1-206	ENST00000416651	KRT20	P35900	424 aa		7.48	□□□□□ -1.21
NIF3L1-206	ENST00000416651	ELK3	P41970	407 aa		7.48	□□□□□ -1.21
NIF3L1-206	ENST00000416651	ALDH9A1	P49189	494 aa		7.48	□□□□□ -1.21
NIF3L1-206	ENST00000416651	ZNF155	Q12901	538 aa	Predicted RBP	7.48	□□□□□ -1.21
NIF3L1-206	ENST00000416651	FOXF1	Q12946	379 aa		7.48	□□□□□ -1.21
NIF3L1-206	ENST00000416651	FOXL1	Q12952	345 aa		7.48	□□□□□ -1.21
NIF3L1-206	ENST00000416651	CUL3	Q13618	768 aa		7.48	□□□□□ -1.21
NIF3L1-206	ENST00000416651	TOMM34	Q15785	309 aa	Predicted RBP	7.48	□□□□□ -1.21
NIF3L1-206	ENST00000416651	GABRA6	Q16445	453 aa		7.48	□□□□□ -1.21
NIF3L1-206	ENST00000416651	MLANA	Q16655	118 aa		7.48	□□□□□ -1.21
NIF3L1-206	ENST00000416651	TMEM176B	Q3YBM2	270 aa	Predicted RBP	7.48	□□□□□ -1.21
NIF3L1-206	ENST00000416651	CCNYL2	Q5T2Q4	361 aa		7.48	□□□□□ -1.21
NIF3L1-206	ENST00000416651	CPTP	Q5TA50	214 aa		7.48	□□□□□ -1.21
NIF3L1-206	ENST00000416651	RNASEH2B	Q5TBB1	312 aa	Known RBP	7.48	□□□□□ -1.21
NIF3L1-206	ENST00000416651	VHLL	Q6RSH7	139 aa		7.48	□□□□□ -1.21
NIF3L1-206	ENST00000416651		Q6ZPA2	131 aa		7.48	□□□□□ -1.21
NIF3L1-206	ENST00000416651	RHOU	Q7L0Q8	258 aa		7.48	□□□□□ -1.21
NIF3L1-206	ENST00000416651	SYCE1	Q8N0S2	351 aa		7.48	□□□□□ -1.21
NIF3L1-206	ENST00000416651	TXLNB	Q8N3L3	684 aa		7.48	□□□□□ -1.21
NIF3L1-206	ENST00000416651	TCAIM	Q8N3R3	496 aa		7.48	□□□□□ -1.21
NIF3L1-206	ENST00000416651	RNF10	Q8N5U6	811 aa	Known RBP	7.48	□□□□□ -1.21
NIF3L1-206	ENST00000416651	SIGLECL1	Q8N7X8	197 aa		7.48	□□□□□ -1.21
NIF3L1-206	ENST00000416651	SLC16A11	Q8NCK7	471 aa		7.48	□□□□□ -1.21
NIF3L1-206	ENST00000416651	MRGPRX4	Q96LA9	322 aa		7.48	□□□□□ -1.21
NIF3L1-206	ENST00000416651	TSPY26P	Q9H489	355 aa		7.48	□□□□□ -1.21
NIF3L1-206	ENST00000416651	ALG9	Q9H6U8	611 aa		7.48	□□□□□ -1.21
NIF3L1-206	ENST00000416651	CNOT10	Q9H9A5	744 aa	Known RBP	7.48	□□□□□ -1.21
NIF3L1-206	ENST00000416651	FARSB	Q9NSD9	589 aa	Known RBP	7.48	□□□□□ -1.21
NIF3L1-206	ENST00000416651	ACSS1	Q9NUB1	689 aa	Predicted RBP	7.48	□□□□□ -1.21
NIF3L1-206	ENST00000416651	MED29	Q9NX70	200 aa		7.48	□□□□□ -1.21
NIF3L1-206	ENST00000416651	NTM	Q9P121	344 aa		7.48	□□□□□ -1.21
NIF3L1-206	ENST00000416651	MCM8	Q9UJA3	840 aa		7.48	□□□□□ -1.21
NIF3L1-206	ENST00000416651	MGAT4B	Q9UQ53	548 aa		7.48	□□□□□ -1.21
NIF3L1-206	ENST00000416651	CHMP2B	Q9UQN3	213 aa		7.48	□□□□□ -1.21
NIF3L1-206	ENST00000416651	WNK2	Q9Y3S1	2297 aa		7.47	□□□□□ -1.21
NIF3L1-206	ENST00000416651	LOC100653049	A0A140TA62	436 aa		7.47	□□□□□ -1.21
NIF3L1-206	ENST00000416651	TMEM129	A0AVI4	362 aa		7.47	□□□□□ -1.21

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.4 ms