RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395145.3

CLDN3-201, Transcript of claudin 3, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene CLDN3, Length 1,274 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN3-201ENST00000395145 DLEU7Q6UYE1 221 aa18.51■□□□□ 0.55
CLDN3-201ENST00000395145 LRRC74BQ6ZQY2 392 aa18.51■□□□□ 0.55
CLDN3-201ENST00000395145 OLIG3Q7RTU3 272 aa18.51■□□□□ 0.55
CLDN3-201ENST00000395145 IFNEQ86WN2 208 aa18.51■□□□□ 0.55
CLDN3-201ENST00000395145 ZNF619Q8N2I2 560 aa18.51■□□□□ 0.55
CLDN3-201ENST00000395145 ANKFN1Q8N957 763 aa18.51■□□□□ 0.55
CLDN3-201ENST00000395145 PHF10Q8WUB8 498 aaKnown RBP18.51■□□□□ 0.55
CLDN3-201ENST00000395145 DMRTA2Q96SC8 542 aa18.51■□□□□ 0.55
CLDN3-201ENST00000395145 TIMP4Q99727 224 aa18.51■□□□□ 0.55
CLDN3-201ENST00000395145 VKORC1Q9BQB6 163 aa18.51■□□□□ 0.55
CLDN3-201ENST00000395145 UGT2B28Q9BY64 529 aa18.51■□□□□ 0.55
CLDN3-201ENST00000395145 SLC38A1Q9H2H9 487 aa18.51■□□□□ 0.55
CLDN3-201ENST00000395145 VAPAQ9P0L0 249 aa18.51■□□□□ 0.55
CLDN3-201ENST00000395145 P2RX2Q9UBL9 471 aa18.51■□□□□ 0.55
CLDN3-201ENST00000395145 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP18.51■□□□□ 0.55
CLDN3-201ENST00000395145 COL12A1Q99715 3063 aa18.5■□□□□ 0.55
CLDN3-201ENST00000395145 FIGNL2A6NMB9 653 aa18.5■□□□□ 0.55
CLDN3-201ENST00000395145 WDR1O75083 606 aa18.5■□□□□ 0.55
CLDN3-201ENST00000395145 H6PDO95479 791 aa18.5■□□□□ 0.55
CLDN3-201ENST00000395145 CHRM4P08173 479 aa18.5■□□□□ 0.55
CLDN3-201ENST00000395145 RNF224P0DH78 156 aa18.5■□□□□ 0.55
CLDN3-201ENST00000395145 BMP2P12643 396 aa18.5■□□□□ 0.55
CLDN3-201ENST00000395145 PPIBP23284 216 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
CLDN3-201ENST00000395145 CHMP24386 653 aa18.5■□□□□ 0.55
CLDN3-201ENST00000395145 GCKP35557 465 aa18.5■□□□□ 0.55
CLDN3-201ENST00000395145 ADH7P40394 386 aa18.5■□□□□ 0.55
CLDN3-201ENST00000395145 B3GALT5-AS1P59052 145 aa18.5■□□□□ 0.55
CLDN3-201ENST00000395145 DSTNP60981 165 aa18.5■□□□□ 0.55
CLDN3-201ENST00000395145 HPCAP84074 193 aa18.5■□□□□ 0.55
CLDN3-201ENST00000395145 KLF10Q13118 480 aa18.5■□□□□ 0.55
CLDN3-201ENST00000395145 SYPL1Q16563 259 aa18.5■□□□□ 0.55
CLDN3-201ENST00000395145 GLYR1Q49A26 553 aaPredicted RBP18.5■□□□□ 0.55
CLDN3-201ENST00000395145 PDZK1Q5T2W1 519 aa18.5■□□□□ 0.55
CLDN3-201ENST00000395145 SPATA21Q7Z572 469 aa18.5■□□□□ 0.55
CLDN3-201ENST00000395145 RETREG3Q86VR2 466 aa18.5■□□□□ 0.55
CLDN3-201ENST00000395145 OR5M9Q8NGP3 310 aa18.5■□□□□ 0.55
CLDN3-201ENST00000395145 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa18.5■□□□□ 0.55
CLDN3-201ENST00000395145 PMM1Q92871 262 aa18.5■□□□□ 0.55
CLDN3-201ENST00000395145 ABTB1Q969K4 478 aaPredicted RBP18.5■□□□□ 0.55
CLDN3-201ENST00000395145 CCDC120Q96HB5 630 aa18.5■□□□□ 0.55
CLDN3-201ENST00000395145 PRDM14Q9GZV8 571 aa18.5■□□□□ 0.55
CLDN3-201ENST00000395145 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
CLDN3-201ENST00000395145 A0A087WZY1 265 aa18.49■□□□□ 0.55
CLDN3-201ENST00000395145 CENPVL1A0A0U1RR11 272 aa18.49■□□□□ 0.55
CLDN3-201ENST00000395145 SERINC4A6NH21 518 aa18.49■□□□□ 0.55
CLDN3-201ENST00000395145 ANGPT2O15123 496 aa18.49■□□□□ 0.55
CLDN3-201ENST00000395145 SLC22A2O15244 555 aa18.49■□□□□ 0.55
CLDN3-201ENST00000395145 TNFRSF21O75509 655 aa18.49■□□□□ 0.55
CLDN3-201ENST00000395145 HOXD4P09016 255 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
CLDN3-201ENST00000395145 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
CLDN3-201ENST00000395145 GABRA1P14867 456 aa18.49■□□□□ 0.55
CLDN3-201ENST00000395145 HK1P19367 917 aa18.49■□□□□ 0.55
CLDN3-201ENST00000395145 DRD4P21917 467 aa18.49■□□□□ 0.55
CLDN3-201ENST00000395145 SUMO3P55854 103 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
CLDN3-201ENST00000395145 ZNF117Q03924 483 aa18.49■□□□□ 0.55
CLDN3-201ENST00000395145 CHRNEQ04844 493 aa18.49■□□□□ 0.55
CLDN3-201ENST00000395145 MAPK11Q15759 364 aa18.49■□□□□ 0.55
CLDN3-201ENST00000395145 DCST1Q5T197 706 aa18.49■□□□□ 0.55
CLDN3-201ENST00000395145 AAGABQ6PD74 315 aa18.49■□□□□ 0.55
CLDN3-201ENST00000395145 C3P1Q6ZMU1 363 aa18.49■□□□□ 0.55
CLDN3-201ENST00000395145 PM20D2Q8IYS1 436 aa18.49■□□□□ 0.55
CLDN3-201ENST00000395145 B4GALNT2Q8NHY0 566 aa18.49■□□□□ 0.55
CLDN3-201ENST00000395145 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
CLDN3-201ENST00000395145 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
CLDN3-201ENST00000395145 GMNCA6NCL1 334 aa18.48■□□□□ 0.55
CLDN3-201ENST00000395145 HCRTR2O43614 444 aa18.48■□□□□ 0.55
CLDN3-201ENST00000395145 EIF4E2O60573 245 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
CLDN3-201ENST00000395145 TFPTP0C1Z6 253 aa18.48■□□□□ 0.55
CLDN3-201ENST00000395145 NR2F1P10589 423 aa18.48■□□□□ 0.55
CLDN3-201ENST00000395145 CPN1P15169 458 aa18.48■□□□□ 0.55
CLDN3-201ENST00000395145 ACVR2AP27037 513 aa18.48■□□□□ 0.55
CLDN3-201ENST00000395145 GNGT1P63211 74 aa18.48■□□□□ 0.55
CLDN3-201ENST00000395145 FGFBP1Q14512 234 aa18.48■□□□□ 0.55
CLDN3-201ENST00000395145 MAPRE2Q15555 327 aa18.48■□□□□ 0.55
CLDN3-201ENST00000395145 MAPK14Q16539 360 aa18.48■□□□□ 0.55
CLDN3-201ENST00000395145 TMEM44Q2T9K0 475 aa18.48■□□□□ 0.55
CLDN3-201ENST00000395145 COQ5Q5HYK3 327 aa18.48■□□□□ 0.55
CLDN3-201ENST00000395145 ZNF585AQ6P3V2 769 aa18.48■□□□□ 0.55
CLDN3-201ENST00000395145 DHDDSQ86SQ9 333 aa18.48■□□□□ 0.55
CLDN3-201ENST00000395145 ZNF614Q8N883 585 aa18.48■□□□□ 0.55
CLDN3-201ENST00000395145 WDYHV1Q96HA8 205 aa18.48■□□□□ 0.55
CLDN3-201ENST00000395145 SH3YL1Q96HL8 342 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
CLDN3-201ENST00000395145 SFXN2Q96NB2 322 aa18.48■□□□□ 0.55
CLDN3-201ENST00000395145 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
CLDN3-201ENST00000395145 RUBCNLQ9H714 662 aa18.48■□□□□ 0.55
CLDN3-201ENST00000395145 FAM53CQ9NYF3 392 aa18.48■□□□□ 0.55
CLDN3-201ENST00000395145 CALML5Q9NZT1 146 aa18.48■□□□□ 0.55
CLDN3-201ENST00000395145 ICAM5Q9UMF0 924 aa18.48■□□□□ 0.55
CLDN3-201ENST00000395145 CORO2BQ9UQ03 480 aa18.48■□□□□ 0.55
CLDN3-201ENST00000395145 RPH3AQ9Y2J0 694 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
CLDN3-201ENST00000395145 L3MBTL1Q9Y468 752 aa18.48■□□□□ 0.55
CLDN3-201ENST00000395145 HEATR5AQ86XA9 2040 aa18.48■□□□□ 0.55
CLDN3-201ENST00000395145 DSPPQ9NZW4 1301 aa18.48■□□□□ 0.55
CLDN3-201ENST00000395145 C7orf72A4D263 438 aa18.47■□□□□ 0.55
CLDN3-201ENST00000395145 AHRRA9YTQ3 701 aa18.47■□□□□ 0.55
CLDN3-201ENST00000395145 LINC01387J3KSC0 135 aa18.47■□□□□ 0.55
CLDN3-201ENST00000395145 GTPBP1O00178 669 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
CLDN3-201ENST00000395145 FBP2O00757 339 aa18.47■□□□□ 0.55
CLDN3-201ENST00000395145 OIP5O43482 229 aa18.47■□□□□ 0.55
CLDN3-201ENST00000395145 ZG16O60844 167 aa18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 104.9 ms