RNA–Protein interactions for RNA: Q0110

BI2, Transcript of Mitochondrial mRNA maturase with a role in splicing, yeast

Gene BI2, Length 1,272 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
BI2	Q0110	POL32	P47110	350 aa		4.78	□□□□□ -1.64
BI2	Q0110	YJR107W	P47145	328 aa		4.78	□□□□□ -1.64
BI2	Q0110	CRR1	Q05790	422 aa		4.78	□□□□□ -1.64
BI2	Q0110	ADY2	P25613	283 aa		4.77	□□□□□ -1.65
BI2	Q0110	STE13	P33894	931 aa		4.77	□□□□□ -1.65
BI2	Q0110	YKR078W	P36158	585 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
BI2	Q0110	MUP1	P50276	574 aa		4.77	□□□□□ -1.65
BI2	Q0110	VPS30	Q02948	557 aa		4.77	□□□□□ -1.65
BI2	Q0110	FBP1	P09201	348 aa		4.76	□□□□□ -1.65
BI2	Q0110	CDC34	P14682	295 aa		4.76	□□□□□ -1.65
BI2	Q0110	FKH2	P41813	862 aa		4.76	□□□□□ -1.65
BI2	Q0110	RIA1	P53893	1110 aa		4.76	□□□□□ -1.65
BI2	Q0110	TUB3	P09734	445 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
BI2	Q0110	CDC48	P25694	835 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
BI2	Q0110	YJL163C	P46996	555 aa		4.75	□□□□□ -1.65
BI2	Q0110	DUS3	Q06053	668 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
BI2	Q0110	TSL1	P38427	1098 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
BI2	Q0110	RPP1	P38786	293 aa		4.74	□□□□□ -1.65
BI2	Q0110	MET10	P39692	1035 aa		4.74	□□□□□ -1.65
BI2	Q0110	RMD1	Q03441	430 aa		4.74	□□□□□ -1.65
BI2	Q0110	YIL108W	P40483	696 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
BI2	Q0110	SCS3	P53012	380 aa		4.73	□□□□□ -1.65
BI2	Q0110	ATE1	P16639	503 aa		4.72	□□□□□ -1.65
BI2	Q0110	CTF8	P38877	133 aa		4.72	□□□□□ -1.65
BI2	Q0110	ESC2	Q06340	456 aa		4.72	□□□□□ -1.65
BI2	Q0110	DMC1	P25453	334 aa		4.71	□□□□□ -1.66
BI2	Q0110	RPD3	P32561	433 aa		4.71	□□□□□ -1.66
BI2	Q0110	PET112	P33893	541 aa		4.71	□□□□□ -1.66
BI2	Q0110	YBR053C	P38235	358 aa		4.71	□□□□□ -1.66
BI2	Q0110	AMA1	P50082	593 aa		4.71	□□□□□ -1.66
BI2	Q0110	YKE2	P52553	114 aa		4.71	□□□□□ -1.66
BI2	Q0110	YGR053C	P53234	283 aa		4.71	□□□□□ -1.66
BI2	Q0110	YML020W	Q03722	664 aa		4.71	□□□□□ -1.66
BI2	Q0110	YBR238C	P38330	731 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
BI2	Q0110	MRPS35	P53292	345 aa		4.7	□□□□□ -1.66
BI2	Q0110	APM1	Q00776	475 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
BI2	Q0110	SPO11	P23179	398 aa		4.69	□□□□□ -1.66
BI2	Q0110	DAM1	P53267	343 aa		4.69	□□□□□ -1.66
BI2	Q0110	CBR1	P38626	284 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
BI2	Q0110	MBP1	P39678	833 aa		4.68	□□□□□ -1.66
BI2	Q0110	MRI1	Q06489	411 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
BI2	Q0110	ABD1	P32783	436 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
BI2	Q0110	ORC2	P32833	620 aa		4.67	□□□□□ -1.66
BI2	Q0110	TYE7	P33122	291 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
BI2	Q0110	GAT1	P43574	510 aa		4.66	□□□□□ -1.66
BI2	Q0110	PUS2	P53167	370 aa		4.66	□□□□□ -1.66
BI2	Q0110	SSL2	Q00578	843 aa		4.66	□□□□□ -1.66
BI2	Q0110	SGO1	Q08490	590 aa		4.66	□□□□□ -1.66
BI2	Q0110	NPP1	P25353	742 aa		4.65	□□□□□ -1.67
BI2	Q0110	HEM3	P28789	327 aa		4.65	□□□□□ -1.67
BI2	Q0110	PPH3	P32345	308 aa		4.65	□□□□□ -1.67
BI2	Q0110	YHR078W	P38799	552 aa		4.65	□□□□□ -1.67
BI2	Q0110	KRI1	P42846	591 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
BI2	Q0110	GUS1	P46655	708 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.65	□□□□□ -1.67	not detected
BI2	Q0110	NOP8	Q08287	484 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
BI2	Q0110	IRC13	Q08630	104 aa		4.65	□□□□□ -1.67
BI2	Q0110	RFA1	P22336	621 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
BI2	Q0110	YUR1	P26725	428 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BI2	Q0110	VHR1	P40522	640 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BI2	Q0110	YKR011C	Q02209	353 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BI2	Q0110	RRP15	Q06511	250 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
BI2	Q0110	PRP4	P20053	465 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
BI2	Q0110	YJL206C	P39529	758 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BI2	Q0110	YIR042C	P40586	236 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BI2	Q0110	CEP3	P40969	608 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BI2	Q0110	ADE8	P04161	214 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BI2	Q0110	HSV2	P50079	448 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
BI2	Q0110	PKH1	Q03407	766 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BI2	Q0110	YDR306C	Q06640	478 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BI2	Q0110	SBA1	P28707	216 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
BI2	Q0110	HIS7	P33734	552 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
BI2	Q0110	MNR2	P35724	969 aa		4.61	□□□□□ -1.67
BI2	Q0110	ASI2	P53895	289 aa		4.61	□□□□□ -1.67
BI2	Q0110	RIM13	Q03792	727 aa		4.61	□□□□□ -1.67
BI2	Q0110	RPN13	O13563	156 aa		4.6	□□□□□ -1.67
BI2	Q0110	ASF1	P32447	279 aa		4.6	□□□□□ -1.67
BI2	Q0110	NGG1	P32494	702 aa		4.6	□□□□□ -1.67
BI2	Q0110	GGA2	P38817	585 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
BI2	Q0110	FMP52	P40008	231 aa		4.6	□□□□□ -1.67
BI2	Q0110	TEL2	P53038	688 aa		4.6	□□□□□ -1.67
BI2	Q0110	SMX3	P54999	86 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
BI2	Q0110	TAF3	Q12297	353 aa		4.6	□□□□□ -1.67
BI2	Q0110	EMP70	P32802	667 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BI2	Q0110	AFR1	P33304	620 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BI2	Q0110	YEL020C	P39994	560 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BI2	Q0110	SEG1	Q04279	960 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BI2	Q0110	HOM2	P13663	365 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
BI2	Q0110	AGP1	P25376	633 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BI2	Q0110	YRO2	P38079	344 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BI2	Q0110	HDA1	P53973	706 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BI2	Q0110	NRG1	Q03125	231 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BI2	Q0110	VPS16	Q03308	798 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BI2	Q0110	OYE2	Q03558	400 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
BI2	Q0110	MPH2	P0CD99	609 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BI2	Q0110	LAT1	P12695	482 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
BI2	Q0110	CLN2	P20438	545 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BI2	Q0110	AAR2	P32357	355 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
BI2	Q0110	URA1	P28272	314 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
BI2	Q0110	BCD1	P38772	366 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BI2	Q0110	CCT7	P42943	550 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68

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