RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000619046.4

ATP6AP1-210, Transcript of ATPase H+ transporting accessory protein 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene ATP6AP1, Length 2,823 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1-210ENST00000619046 FAM227BQ96M60 508 aa14.96□□□□□ -0.01
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ATP6AP1-210ENST00000619046 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.02
ATP6AP1-210ENST00000619046 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP14.96□□□□□ -0.02
ATP6AP1-210ENST00000619046 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.02
ATP6AP1-210ENST00000619046 KSR2Q6VAB6 950 aa14.96□□□□□ -0.02
ATP6AP1-210ENST00000619046 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.02
ATP6AP1-210ENST00000619046 KCNF1Q9H3M0 494 aa14.96□□□□□ -0.02
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ATP6AP1-210ENST00000619046 PHF8Q9UPP1 1060 aa14.95□□□□□ -0.02
ATP6AP1-210ENST00000619046 RGPD5Q99666 1765 aa14.95□□□□□ -0.02
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ATP6AP1-210ENST00000619046 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
ATP6AP1-210ENST00000619046 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
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ATP6AP1-210ENST00000619046 ERC1Q8IUD2 1116 aa14.95□□□□□ -0.02
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ATP6AP1-210ENST00000619046 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
ATP6AP1-210ENST00000619046 SUCLG2Q96I99 432 aa14.95□□□□□ -0.02
ATP6AP1-210ENST00000619046 CHMP4AQ9BY43 222 aa14.95□□□□□ -0.02
ATP6AP1-210ENST00000619046 TAF6LQ9Y6J9 622 aa14.95□□□□□ -0.02
ATP6AP1-210ENST00000619046 SLC27A2O14975 620 aa14.94□□□□□ -0.02
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ATP6AP1-210ENST00000619046 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
ATP6AP1-210ENST00000619046 LAMA4Q16363 1823 aa14.94□□□□□ -0.02
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ATP6AP1-210ENST00000619046 ELP1O95163 1332 aa14.94□□□□□ -0.02
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ATP6AP1-210ENST00000619046 AACSQ86V21 672 aa14.94□□□□□ -0.02
ATP6AP1-210ENST00000619046 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
ATP6AP1-210ENST00000619046 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
ATP6AP1-210ENST00000619046 A0A0D9SFI3 127 aa14.93□□□□□ -0.02
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ATP6AP1-210ENST00000619046 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
ATP6AP1-210ENST00000619046 TEFQ10587 303 aa14.93□□□□□ -0.02
ATP6AP1-210ENST00000619046 ZNF710Q8N1W2 664 aa14.93□□□□□ -0.02
ATP6AP1-210ENST00000619046 PRIMPOLQ96LW4 560 aa14.93□□□□□ -0.02
ATP6AP1-210ENST00000619046 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
ATP6AP1-210ENST00000619046 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
ATP6AP1-210ENST00000619046 PDIA6Q15084 440 aa14.93□□□□□ -0.02
ATP6AP1-210ENST00000619046 TPRNQ4KMQ1 711 aa14.93□□□□□ -0.02
ATP6AP1-210ENST00000619046 GPATCH3Q96I76 525 aa14.93□□□□□ -0.02
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ATP6AP1-210ENST00000619046 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
ATP6AP1-210ENST00000619046 COL15A1P39059 1388 aa14.92□□□□□ -0.02
ATP6AP1-210ENST00000619046 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
ATP6AP1-210ENST00000619046 GRM8O00222 908 aa14.92□□□□□ -0.02
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ATP6AP1-210ENST00000619046 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
ATP6AP1-210ENST00000619046 RPS6KB1P23443 525 aa14.9□□□□□ -0.02
ATP6AP1-210ENST00000619046 AMOTQ4VCS5 1084 aa14.9□□□□□ -0.02
ATP6AP1-210ENST00000619046 C14orf37Q86TY3 774 aa14.9□□□□□ -0.02
ATP6AP1-210ENST00000619046 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
ATP6AP1-210ENST00000619046 PKNOX2Q96KN3 472 aa14.9□□□□□ -0.02
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ATP6AP1-210ENST00000619046 TSC1Q92574 1164 aa14.89□□□□□ -0.03
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ATP6AP1-210ENST00000619046 KRT85P78386 507 aa14.88□□□□□ -0.03
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ATP6AP1-210ENST00000619046 FAM200AQ8TCP9 573 aa14.88□□□□□ -0.03
ATP6AP1-210ENST00000619046 TCEANC2Q96MN5 208 aa14.88□□□□□ -0.03
ATP6AP1-210ENST00000619046 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa14.88□□□□□ -0.03
ATP6AP1-210ENST00000619046 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
ATP6AP1-210ENST00000619046 PSMA5P28066 241 aa14.88□□□□□ -0.03
ATP6AP1-210ENST00000619046 FERMT3Q86UX7 667 aa14.88□□□□□ -0.03
ATP6AP1-210ENST00000619046 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP14.88□□□□□ -0.03
ATP6AP1-210ENST00000619046 GLI3P10071 1580 aa14.88□□□□□ -0.03
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ATP6AP1-210ENST00000619046 TYRO3Q06418 890 aa14.87□□□□□ -0.03
ATP6AP1-210ENST00000619046 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
ATP6AP1-210ENST00000619046 BOLA2Q9H3K6 86 aa14.87□□□□□ -0.03
ATP6AP1-210ENST00000619046 HDAC5Q9UQL6 1122 aa14.87□□□□□ -0.03
ATP6AP1-210ENST00000619046 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
ATP6AP1-210ENST00000619046 TAF5LO75529 589 aa14.87□□□□□ -0.03
ATP6AP1-210ENST00000619046 EPHA10Q5JZY3 1008 aa14.87□□□□□ -0.03
ATP6AP1-210ENST00000619046 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa14.87□□□□□ -0.03
ATP6AP1-210ENST00000619046 NUP62CLQ9H1M0 184 aa14.87□□□□□ -0.03
ATP6AP1-210ENST00000619046 MAP3K11Q16584 847 aa14.86□□□□□ -0.03
ATP6AP1-210ENST00000619046 KLHDC4Q8TBB5 520 aa14.86□□□□□ -0.03
ATP6AP1-210ENST00000619046 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP14.86□□□□□ -0.03
ATP6AP1-210ENST00000619046 ANKRD1Q15327 319 aa14.86□□□□□ -0.03
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