RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591041.5

CAPNS1-212, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 812 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-212ENST00000591041 APBB1O00213 710 aa27.91■■■□□ 2.06
CAPNS1-212ENST00000591041 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP27.91■■■□□ 2.06
CAPNS1-212ENST00000591041 ITPK1Q13572 414 aa27.91■■■□□ 2.06
CAPNS1-212ENST00000591041 FAM182BQ5T319 152 aa27.91■■■□□ 2.06
CAPNS1-212ENST00000591041 SKAP1Q86WV1 359 aa27.91■■■□□ 2.06
CAPNS1-212ENST00000591041 PARP10Q53GL7 1025 aa27.9■■■□□ 2.06
CAPNS1-212ENST00000591041 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP27.89■■■□□ 2.06
CAPNS1-212ENST00000591041 GPATCH3Q96I76 525 aa27.89■■■□□ 2.06
CAPNS1-212ENST00000591041 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP27.88■■■□□ 2.05
CAPNS1-212ENST00000591041 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP27.88■■■□□ 2.05
CAPNS1-212ENST00000591041 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP27.88■■■□□ 2.05
CAPNS1-212ENST00000591041 AK7Q96M32 723 aa27.88■■■□□ 2.05
CAPNS1-212ENST00000591041 SLC27A3Q5K4L6 730 aa27.87■■■□□ 2.05
CAPNS1-212ENST00000591041 CASC1Q6TDU7 716 aa27.87■■■□□ 2.05
CAPNS1-212ENST00000591041 CLEC4GQ6UXB4 293 aa27.87■■■□□ 2.05
CAPNS1-212ENST00000591041 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP27.87■■■□□ 2.05
CAPNS1-212ENST00000591041 AOX1Q06278 1338 aa27.87■■■□□ 2.05
CAPNS1-212ENST00000591041 SBF2Q86WG5 1849 aa27.86■■■□□ 2.05
CAPNS1-212ENST00000591041 RHPN1Q8TCX5 695 aa27.86■■■□□ 2.05
CAPNS1-212ENST00000591041 CDHR2Q9BYE9 1310 aa27.86■■■□□ 2.05
CAPNS1-212ENST00000591041 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP27.85■■■□□ 2.05
CAPNS1-212ENST00000591041 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa27.85■■■□□ 2.05
CAPNS1-212ENST00000591041 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa27.85■■■□□ 2.05
CAPNS1-212ENST00000591041 CASP7P55210 303 aa27.84■■■□□ 2.05
CAPNS1-212ENST00000591041 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa27.84■■■□□ 2.05
CAPNS1-212ENST00000591041 OSBPL3Q9H4L5 887 aa27.84■■■□□ 2.05
CAPNS1-212ENST00000591041 RPS6KA4O75676 772 aa27.83■■■□□ 2.05
CAPNS1-212ENST00000591041 C8orf34Q49A92 452 aa27.83■■■□□ 2.05
CAPNS1-212ENST00000591041 NLRP10Q86W26 655 aa27.83■■■□□ 2.05
CAPNS1-212ENST00000591041 LINC00116Q8NCU8 138 aa27.83■■■□□ 2.05
CAPNS1-212ENST00000591041 PLA2G12BQ9BX93 195 aa27.83■■■□□ 2.05
CAPNS1-212ENST00000591041 COPRSQ9NQ92 184 aa27.83■■■□□ 2.05
CAPNS1-212ENST00000591041 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP27.83■■■□□ 2.05
CAPNS1-212ENST00000591041 KAZALD1Q96I82 304 aa27.82■■■□□ 2.04
CAPNS1-212ENST00000591041 CHMP3Q9Y3E7 222 aa27.82■■■□□ 2.04
CAPNS1-212ENST00000591041 LY75O60449 1722 aa27.81■■■□□ 2.04
CAPNS1-212ENST00000591041 MX1P20591 662 aa27.81■■■□□ 2.04
CAPNS1-212ENST00000591041 LMBR1LQ6UX01 489 aa27.81■■■□□ 2.04
CAPNS1-212ENST00000591041 ZNF34Q8IZ26 560 aa27.81■■■□□ 2.04
CAPNS1-212ENST00000591041 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP27.81■■■□□ 2.04
CAPNS1-212ENST00000591041 FBXO3Q9UK99 471 aa27.81■■■□□ 2.04
CAPNS1-212ENST00000591041 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP27.8■■■□□ 2.04
CAPNS1-212ENST00000591041 CCDC57Q2TAC2 916 aa27.8■■■□□ 2.04
CAPNS1-212ENST00000591041 TTC22Q5TAA0 569 aa27.8■■■□□ 2.04
CAPNS1-212ENST00000591041 ZPR1O75312 459 aa27.79■■■□□ 2.04
CAPNS1-212ENST00000591041 CAMTA2O94983 1202 aa27.79■■■□□ 2.04
CAPNS1-212ENST00000591041 ADRA2BP18089 450 aa27.79■■■□□ 2.04
CAPNS1-212ENST00000591041 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP27.79■■■□□ 2.04
CAPNS1-212ENST00000591041 HLFQ16534 295 aa27.79■■■□□ 2.04
CAPNS1-212ENST00000591041 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP27.79■■■□□ 2.04
CAPNS1-212ENST00000591041 ERC2O15083 957 aa27.78■■■□□ 2.04
CAPNS1-212ENST00000591041 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP27.78■■■□□ 2.04
CAPNS1-212ENST00000591041 GPTP24298 496 aa27.78■■■□□ 2.04
CAPNS1-212ENST00000591041 STAP2Q9UGK3 403 aa27.78■■■□□ 2.04
CAPNS1-212ENST00000591041 NUP98P52948 1817 aa27.78■■■□□ 2.04
CAPNS1-212ENST00000591041 PDE1AP54750 535 aa27.77■■■□□ 2.04
CAPNS1-212ENST00000591041 FOXO4P98177 505 aa27.77■■■□□ 2.04
CAPNS1-212ENST00000591041 TAF7LQ5H9L4 462 aa27.77■■■□□ 2.04
CAPNS1-212ENST00000591041 BCL11AQ9H165 835 aa27.77■■■□□ 2.04
CAPNS1-212ENST00000591041 TTC41PQ6P2S7 1318 aa27.76■■■□□ 2.03
CAPNS1-212ENST00000591041 SH3TC1Q8TE82 1336 aa27.76■■■□□ 2.03
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CAPNS1-212ENST00000591041 CDC45O75419 566 aa27.76■■■□□ 2.03
CAPNS1-212ENST00000591041 TRIM37O94972 964 aa27.76■■■□□ 2.03
CAPNS1-212ENST00000591041 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP27.75■■■□□ 2.03
CAPNS1-212ENST00000591041 PDE8AO60658 829 aa27.75■■■□□ 2.03
CAPNS1-212ENST00000591041 NARFQ9UHQ1 456 aa27.75■■■□□ 2.03
CAPNS1-212ENST00000591041 IL15P40933 162 aaPredicted RBP27.74■■■□□ 2.03
CAPNS1-212ENST00000591041 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP27.74■■■□□ 2.03
CAPNS1-212ENST00000591041 EPHA10Q5JZY3 1008 aa27.74■■■□□ 2.03
CAPNS1-212ENST00000591041 FAM89AQ96GI7 184 aa27.74■■■□□ 2.03
CAPNS1-212ENST00000591041 NYXQ9GZU5 481 aa27.74■■■□□ 2.03
CAPNS1-212ENST00000591041 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP27.74■■■□□ 2.03
CAPNS1-212ENST00000591041 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP27.73■■■□□ 2.03
CAPNS1-212ENST00000591041 CIAO1O76071 339 aa27.73■■■□□ 2.03
CAPNS1-212ENST00000591041 TRAPPC3LQ5T215 181 aa27.73■■■□□ 2.03
CAPNS1-212ENST00000591041 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP27.73■■■□□ 2.03
CAPNS1-212ENST00000591041 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa27.73■■■□□ 2.03
CAPNS1-212ENST00000591041 APBA3O96018 575 aa27.72■■■□□ 2.03
CAPNS1-212ENST00000591041 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP27.72■■■□□ 2.03
CAPNS1-212ENST00000591041 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP27.72■■■□□ 2.03
CAPNS1-212ENST00000591041 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP27.71■■■□□ 2.03
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CAPNS1-212ENST00000591041 RFC4P35249 363 aa27.71■■■□□ 2.03
CAPNS1-212ENST00000591041 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP27.71■■■□□ 2.03
CAPNS1-212ENST00000591041 DDRGK1Q96HY6 314 aa27.71■■■□□ 2.03
CAPNS1-212ENST00000591041 CAMKK2Q96RR4 588 aa27.71■■■□□ 2.03
CAPNS1-212ENST00000591041 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP27.71■■■□□ 2.03
CAPNS1-212ENST00000591041 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa27.7■■■□□ 2.02
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CAPNS1-212ENST00000591041 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP27.7■■■□□ 2.02
CAPNS1-212ENST00000591041 CTSWP56202 376 aa27.7■■■□□ 2.02
CAPNS1-212ENST00000591041 PTF1AQ7RTS3 328 aa27.7■■■□□ 2.02
CAPNS1-212ENST00000591041 SIL1Q9H173 461 aa27.7■■■□□ 2.02
CAPNS1-212ENST00000591041 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP27.69■■■□□ 2.02
CAPNS1-212ENST00000591041 GPR108Q9NPR9 543 aa27.69■■■□□ 2.02
CAPNS1-212ENST00000591041 C4BP0C0L5 1744 aa27.69■■■□□ 2.02
CAPNS1-212ENST00000591041 SALL3Q9BXA9 1300 aa27.68■■■□□ 2.02
CAPNS1-212ENST00000591041 PLSCR1O15162 318 aa27.68■■■□□ 2.02
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