RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588918.5

MFSD12-208, Transcript of major facilitator superfamily domain containing 12, human

TSL 5

Gene MFSD12, Length 2,040 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MFSD12-208	ENST00000588918	HDAC5	Q9UQL6	1122 aa		31.86	■■■□□ 2.69
MFSD12-208	ENST00000588918	TNS1	Q9HBL0	1735 aa	Known RBP	31.86	■■■□□ 2.69
MFSD12-208	ENST00000588918	HMMR	O75330	724 aa		31.85	■■■□□ 2.69
MFSD12-208	ENST00000588918	EPHA10	Q5JZY3	1008 aa		31.85	■■■□□ 2.69
MFSD12-208	ENST00000588918	ZNF34	Q8IZ26	560 aa		31.85	■■■□□ 2.69
MFSD12-208	ENST00000588918	PDZRN3	Q9UPQ7	1066 aa		31.85	■■■□□ 2.69
MFSD12-208	ENST00000588918	SRGAP3	O43295	1099 aa		31.84	■■■□□ 2.69
MFSD12-208	ENST00000588918	DCTPP1	Q9H773	170 aa		31.84	■■■□□ 2.69
MFSD12-208	ENST00000588918	UBN2	Q6ZU65	1347 aa		31.84	■■■□□ 2.69
MFSD12-208	ENST00000588918	TRAPPC3L	Q5T215	181 aa		31.83	■■■□□ 2.69
MFSD12-208	ENST00000588918	FAM89A	Q96GI7	184 aa		31.83	■■■□□ 2.69
MFSD12-208	ENST00000588918	ZBTB47	Q9UFB7	747 aa	Predicted RBP	31.83	■■■□□ 2.69
MFSD12-208	ENST00000588918	USPL1	Q5W0Q7	1092 aa		31.83	■■■□□ 2.69
MFSD12-208	ENST00000588918	GCC1	Q96CN9	775 aa		31.83	■■■□□ 2.69
MFSD12-208	ENST00000588918	NARF	Q9UHQ1	456 aa		31.82	■■■□□ 2.68
MFSD12-208	ENST00000588918	SYNE4	Q8N205	404 aa		31.82	■■■□□ 2.68
MFSD12-208	ENST00000588918	FAM177B	A6PVY3	158 aa		31.81	■■■□□ 2.68
MFSD12-208	ENST00000588918	ZPR1	O75312	459 aa		31.81	■■■□□ 2.68
MFSD12-208	ENST00000588918	EN1	Q05925	392 aa	Predicted RBP	31.81	■■■□□ 2.68
MFSD12-208	ENST00000588918	SSH3	Q8TE77	659 aa		31.81	■■■□□ 2.68
MFSD12-208	ENST00000588918	NIP7	Q9Y221	180 aa	Known RBP eCLIP	31.81	■■■□□ 2.68
MFSD12-208	ENST00000588918	ANKRD36C	Q5JPF3	1778 aa		31.8	■■■□□ 2.68
MFSD12-208	ENST00000588918	RPL17-C18orf32	A0A0A6YYL6	228 aa	Known RBP	31.8	■■■□□ 2.68
MFSD12-208	ENST00000588918	BCL2L12	Q9HB09	334 aa		31.8	■■■□□ 2.68
MFSD12-208	ENST00000588918	ZNF652	Q9Y2D9	606 aa		31.8	■■■□□ 2.68
MFSD12-208	ENST00000588918	APBB1	O00213	710 aa		31.8	■■■□□ 2.68
MFSD12-208	ENST00000588918	RFC4	P35249	363 aa		31.8	■■■□□ 2.68
MFSD12-208	ENST00000588918	RGS3	P49796	1198 aa		31.79	■■■□□ 2.68
MFSD12-208	ENST00000588918	POLA2	Q14181	598 aa		31.79	■■■□□ 2.68
MFSD12-208	ENST00000588918	ANKRD45	Q5TZF3	282 aa		31.79	■■■□□ 2.68
MFSD12-208	ENST00000588918	CLEC4G	Q6UXB4	293 aa		31.79	■■■□□ 2.68
MFSD12-208	ENST00000588918	ZBTB38	Q8NAP3	1195 aa	Predicted RBP	31.79	■■■□□ 2.68
MFSD12-208	ENST00000588918	TRMT112	Q9UI30	125 aa	Known RBP	31.79	■■■□□ 2.68
MFSD12-208	ENST00000588918	PCCA	P05165	728 aa	Predicted RBP	31.78	■■■□□ 2.68
MFSD12-208	ENST00000588918	MTX1	Q13505	466 aa		31.78	■■■□□ 2.68
MFSD12-208	ENST00000588918	EXOC6B	Q9Y2D4	811 aa		31.78	■■■□□ 2.68
MFSD12-208	ENST00000588918	EZH2	Q15910	746 aa	Known RBP	31.78	■■■□□ 2.68
MFSD12-208	ENST00000588918	SUSD4	Q5VX71	490 aa		31.78	■■■□□ 2.68
MFSD12-208	ENST00000588918	BCOR	Q6W2J9	1755 aa		31.77	■■■□□ 2.68
MFSD12-208	ENST00000588918	BICDL1	Q6ZP65	573 aa		31.77	■■■□□ 2.68
MFSD12-208	ENST00000588918	ZNF827	Q17R98	1081 aa		31.76	■■■□□ 2.68
MFSD12-208	ENST00000588918	UBR3	Q6ZT12	1888 aa		31.76	■■■□□ 2.67
MFSD12-208	ENST00000588918	FOXO4	P98177	505 aa		31.76	■■■□□ 2.67
MFSD12-208	ENST00000588918	NUCB1	Q02818	461 aa		31.76	■■■□□ 2.67
MFSD12-208	ENST00000588918	LNPK	Q9C0E8	428 aa		31.75	■■■□□ 2.67
MFSD12-208	ENST00000588918	TBC1D9B	Q66K14	1250 aa		31.75	■■■□□ 2.67
MFSD12-208	ENST00000588918	CAMKK2	Q96RR4	588 aa		31.75	■■■□□ 2.67
MFSD12-208	ENST00000588918	LMBR1L	Q6UX01	489 aa		31.74	■■■□□ 2.67
MFSD12-208	ENST00000588918	TFCP2L1	Q9NZI6	479 aa		31.74	■■■□□ 2.67
MFSD12-208	ENST00000588918	USP42	Q9H9J4	1324 aa	Known RBP	31.74	■■■□□ 2.67
MFSD12-208	ENST00000588918	ADRA2B	P18089	450 aa		31.73	■■■□□ 2.67
MFSD12-208	ENST00000588918	SSFA2	P28290	1259 aa		31.73	■■■□□ 2.67
MFSD12-208	ENST00000588918	SF3B2	Q13435	895 aa	Known RBP	31.73	■■■□□ 2.67
MFSD12-208	ENST00000588918	RABL6	Q3YEC7	729 aa	Predicted RBP	31.73	■■■□□ 2.67
MFSD12-208	ENST00000588918	PARP10	Q53GL7	1025 aa		31.73	■■■□□ 2.67
MFSD12-208	ENST00000588918	CHD1L	Q86WJ1	897 aa		31.73	■■■□□ 2.67
MFSD12-208	ENST00000588918	AKT1S1	Q96B36	256 aa		31.73	■■■□□ 2.67
MFSD12-208	ENST00000588918	SURF6	O75683	361 aa	Known RBP	31.72	■■■□□ 2.67
MFSD12-208	ENST00000588918	DEFB132	Q7Z7B7	95 aa		31.72	■■■□□ 2.67
MFSD12-208	ENST00000588918	PA2G4	Q9UQ80	394 aa	Known RBP	31.72	■■■□□ 2.67
MFSD12-208	ENST00000588918	C4A	P0C0L4	1744 aa		31.72	■■■□□ 2.67
MFSD12-208	ENST00000588918	HMGB2	P26583	209 aa	Known RBP	31.71	■■■□□ 2.67
MFSD12-208	ENST00000588918	UTP14A	Q9BVJ6	771 aa	Known RBP	31.71	■■■□□ 2.67
MFSD12-208	ENST00000588918	CHMP3	Q9Y3E7	222 aa		31.71	■■■□□ 2.67
MFSD12-208	ENST00000588918	SCN7A	Q01118	1682 aa		31.71	■■■□□ 2.67
MFSD12-208	ENST00000588918	SMARCA5	O60264	1052 aa	Predicted RBP	31.7	■■■□□ 2.67
MFSD12-208	ENST00000588918	KLHDC4	Q8TBB5	520 aa		31.7	■■■□□ 2.67
MFSD12-208	ENST00000588918	IRS4	O14654	1257 aa	Predicted RBP	31.7	■■■□□ 2.66
MFSD12-208	ENST00000588918	PDE4A	P27815	886 aa		31.7	■■■□□ 2.66
MFSD12-208	ENST00000588918	NBR1	Q14596	966 aa		31.7	■■■□□ 2.66
MFSD12-208	ENST00000588918	NUTM1	Q86Y26	1132 aa		31.68	■■■□□ 2.66
MFSD12-208	ENST00000588918	CDHR2	Q9BYE9	1310 aa		31.68	■■■□□ 2.66
MFSD12-208	ENST00000588918	RGL2	O15211	777 aa		31.68	■■■□□ 2.66
MFSD12-208	ENST00000588918	NTSR2	O95665	410 aa		31.68	■■■□□ 2.66
MFSD12-208	ENST00000588918	CCDC85A	Q96PX6	553 aa	Predicted RBP	31.68	■■■□□ 2.66
MFSD12-208	ENST00000588918	SH3TC1	Q8TE82	1336 aa		31.67	■■■□□ 2.66
MFSD12-208	ENST00000588918	BAG6	P46379	1132 aa		31.67	■■■□□ 2.66
MFSD12-208	ENST00000588918	SETDB2	Q96T68	719 aa		31.67	■■■□□ 2.66
MFSD12-208	ENST00000588918	RGPD3	A6NKT7	1758 aa	Predicted RBP	31.67	■■■□□ 2.66
MFSD12-208	ENST00000588918	RGPD4	Q7Z3J3	1758 aa		31.67	■■■□□ 2.66
MFSD12-208	ENST00000588918	PLA2G12B	Q9BX93	195 aa		31.66	■■■□□ 2.66
MFSD12-208	ENST00000588918	HCLS1	P14317	486 aa	Predicted RBP	31.66	■■■□□ 2.66
MFSD12-208	ENST00000588918	RFX5	P48382	616 aa	Predicted RBP	31.65	■■■□□ 2.66
MFSD12-208	ENST00000588918	SIL1	Q9H173	461 aa		31.65	■■■□□ 2.66
MFSD12-208	ENST00000588918	GYS1	P13807	737 aa		31.64	■■■□□ 2.66
MFSD12-208	ENST00000588918	C16orf71	Q8IYS4	520 aa	Predicted RBP	31.64	■■■□□ 2.66
MFSD12-208	ENST00000588918	COL23A1	Q86Y22	540 aa	Predicted RBP	31.63	■■■□□ 2.65
MFSD12-208	ENST00000588918	BACH2	Q9BYV9	841 aa		31.63	■■■□□ 2.65
MFSD12-208	ENST00000588918	ANO8	Q9HCE9	1232 aa	Predicted RBP	31.63	■■■□□ 2.65
MFSD12-208	ENST00000588918	LRRCC1	Q9C099	1032 aa		31.63	■■■□□ 2.65
MFSD12-208	ENST00000588918	PTPN12	Q05209	780 aa	Known RBP	31.62	■■■□□ 2.65
MFSD12-208	ENST00000588918	OS9	Q13438	667 aa	Predicted RBP	31.62	■■■□□ 2.65
MFSD12-208	ENST00000588918	PDE8A	O60658	829 aa		31.61	■■■□□ 2.65
MFSD12-208	ENST00000588918	NFIX	Q14938	502 aa		31.61	■■■□□ 2.65
MFSD12-208	ENST00000588918	CSF1R	P07333	972 aa		31.61	■■■□□ 2.65
MFSD12-208	ENST00000588918	ERFE	Q4G0M1	354 aa		31.61	■■■□□ 2.65
MFSD12-208	ENST00000588918	TTLL11	Q8NHH1	800 aa		31.61	■■■□□ 2.65
MFSD12-208	ENST00000588918	CTSW	P56202	376 aa		31.6	■■■□□ 2.65
MFSD12-208	ENST00000588918	FAM161A	Q3B820	660 aa		31.6	■■■□□ 2.65
MFSD12-208	ENST00000588918	IL1RAPL2	Q9NP60	686 aa		31.6	■■■□□ 2.65

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 86.6 ms