RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588374.1

EFTUD2-211, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD2, Length 524 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-211ENST00000588374 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa8.73□□□□□ -1.01
EFTUD2-211ENST00000588374 NYXQ9GZU5 481 aa8.73□□□□□ -1.01
EFTUD2-211ENST00000588374 CACNA1FO60840 1977 aa8.73□□□□□ -1.01
EFTUD2-211ENST00000588374 UBN2Q6ZU65 1347 aa8.73□□□□□ -1.01
EFTUD2-211ENST00000588374 CACNA1SQ13698 1873 aa8.72□□□□□ -1.01
EFTUD2-211ENST00000588374 PXDNLA1KZ92 1463 aa8.72□□□□□ -1.01
EFTUD2-211ENST00000588374 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa8.72□□□□□ -1.01
EFTUD2-211ENST00000588374 GRIN3BO60391 1043 aa8.72□□□□□ -1.01
EFTUD2-211ENST00000588374 DDX58O95786 925 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
EFTUD2-211ENST00000588374 PARP10Q53GL7 1025 aa8.72□□□□□ -1.01
EFTUD2-211ENST00000588374 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa8.72□□□□□ -1.01
EFTUD2-211ENST00000588374 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
EFTUD2-211ENST00000588374 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa8.72□□□□□ -1.01
EFTUD2-211ENST00000588374 NLRP10Q86W26 655 aa8.72□□□□□ -1.01
EFTUD2-211ENST00000588374 SYNE4Q8N205 404 aa8.72□□□□□ -1.01
EFTUD2-211ENST00000588374 PIP4P2Q8N4L2 257 aa8.72□□□□□ -1.01
EFTUD2-211ENST00000588374 MYD88Q99836 296 aa8.72□□□□□ -1.01
EFTUD2-211ENST00000588374 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
EFTUD2-211ENST00000588374 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
EFTUD2-211ENST00000588374 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa8.72□□□□□ -1.01
EFTUD2-211ENST00000588374 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.01
EFTUD2-211ENST00000588374 PI4KAP2A4QPH2 592 aa8.71□□□□□ -1.02
EFTUD2-211ENST00000588374 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
EFTUD2-211ENST00000588374 KSR2Q6VAB6 950 aa8.71□□□□□ -1.02
EFTUD2-211ENST00000588374 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
EFTUD2-211ENST00000588374 TTLL6Q8N841 843 aa8.71□□□□□ -1.02
EFTUD2-211ENST00000588374 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa8.71□□□□□ -1.02
EFTUD2-211ENST00000588374 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
EFTUD2-211ENST00000588374 ISCA1Q9BUE6 129 aa8.71□□□□□ -1.02
EFTUD2-211ENST00000588374 CHD4Q14839 1912 aa8.71□□□□□ -1.02
EFTUD2-211ENST00000588374 ATP10DQ9P241 1426 aa8.71□□□□□ -1.02
EFTUD2-211ENST00000588374 NTSR2O95665 410 aa8.7□□□□□ -1.02
EFTUD2-211ENST00000588374 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
EFTUD2-211ENST00000588374 FLIIQ13045 1269 aa8.7□□□□□ -1.02
EFTUD2-211ENST00000588374 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
EFTUD2-211ENST00000588374 FAM89AQ96GI7 184 aa8.7□□□□□ -1.02
EFTUD2-211ENST00000588374 MASTLQ96GX5 879 aa8.7□□□□□ -1.02
EFTUD2-211ENST00000588374 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
EFTUD2-211ENST00000588374 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa8.7□□□□□ -1.02
EFTUD2-211ENST00000588374 DLEC1Q9Y238 1755 aa8.69□□□□□ -1.02
EFTUD2-211ENST00000588374 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa8.69□□□□□ -1.02
EFTUD2-211ENST00000588374 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa8.69□□□□□ -1.02
EFTUD2-211ENST00000588374 SRGNP10124 158 aa8.69□□□□□ -1.02
EFTUD2-211ENST00000588374 KCNA4P22459 653 aa8.69□□□□□ -1.02
EFTUD2-211ENST00000588374 YY1P25490 414 aa8.69□□□□□ -1.02
EFTUD2-211ENST00000588374 NEXNQ0ZGT2 675 aa8.69□□□□□ -1.02
EFTUD2-211ENST00000588374 SLC10A5Q5PT55 438 aa8.69□□□□□ -1.02
EFTUD2-211ENST00000588374 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
EFTUD2-211ENST00000588374 NLRP3Q96P20 1036 aa8.69□□□□□ -1.02
EFTUD2-211ENST00000588374 SLX4Q8IY92 1834 aa8.68□□□□□ -1.02
EFTUD2-211ENST00000588374 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
EFTUD2-211ENST00000588374 F6X3S4 739 aa8.68□□□□□ -1.02
EFTUD2-211ENST00000588374 C21orf2O43822 256 aa8.68□□□□□ -1.02
EFTUD2-211ENST00000588374 NPR1P16066 1061 aa8.68□□□□□ -1.02
EFTUD2-211ENST00000588374 ALDH1B1P30837 517 aa8.68□□□□□ -1.02
EFTUD2-211ENST00000588374 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
EFTUD2-211ENST00000588374 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
EFTUD2-211ENST00000588374 STYK1Q6J9G0 422 aa8.68□□□□□ -1.02
EFTUD2-211ENST00000588374 C3orf67Q6ZVT6 689 aa8.68□□□□□ -1.02
EFTUD2-211ENST00000588374 SSH1Q8WYL5 1049 aa8.68□□□□□ -1.02
EFTUD2-211ENST00000588374 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
EFTUD2-211ENST00000588374 CNKSR1Q969H4 720 aa8.68□□□□□ -1.02
EFTUD2-211ENST00000588374 BCL2L13Q9BXK5 485 aa8.68□□□□□ -1.02
EFTUD2-211ENST00000588374 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
EFTUD2-211ENST00000588374 ADCY9O60503 1353 aa8.68□□□□□ -1.02
EFTUD2-211ENST00000588374 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
EFTUD2-211ENST00000588374 LAMB2P55268 1798 aa8.68□□□□□ -1.02
EFTUD2-211ENST00000588374 TAF1P21675 1872 aa8.68□□□□□ -1.02
EFTUD2-211ENST00000588374 IGKV5-2P06315 115 aa8.67□□□□□ -1.02
EFTUD2-211ENST00000588374 SLC4A10Q6U841 1118 aa8.67□□□□□ -1.02
EFTUD2-211ENST00000588374 CCDC191Q8NCU4 936 aa8.67□□□□□ -1.02
EFTUD2-211ENST00000588374 SH3TC1Q8TE82 1336 aa8.67□□□□□ -1.02
EFTUD2-211ENST00000588374 DNAAF4Q8WXU2 420 aa8.67□□□□□ -1.02
EFTUD2-211ENST00000588374 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
EFTUD2-211ENST00000588374 ABCC12Q96J65 1359 aa8.67□□□□□ -1.02
EFTUD2-211ENST00000588374 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
EFTUD2-211ENST00000588374 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
EFTUD2-211ENST00000588374 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
EFTUD2-211ENST00000588374 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
EFTUD2-211ENST00000588374 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
EFTUD2-211ENST00000588374 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
EFTUD2-211ENST00000588374 SBF1O95248 1867 aa8.66□□□□□ -1.02
EFTUD2-211ENST00000588374 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
EFTUD2-211ENST00000588374 RNF123Q5XPI4 1314 aa8.65□□□□□ -1.02
EFTUD2-211ENST00000588374 NEURL1BA8MQ27 555 aa8.65□□□□□ -1.02
EFTUD2-211ENST00000588374 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
EFTUD2-211ENST00000588374 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
EFTUD2-211ENST00000588374 ALDH1L2Q3SY69 923 aa8.65□□□□□ -1.02
EFTUD2-211ENST00000588374 CRY2Q49AN0 593 aa8.65□□□□□ -1.02
EFTUD2-211ENST00000588374 OLFM4Q6UX06 510 aa8.65□□□□□ -1.02
EFTUD2-211ENST00000588374 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
EFTUD2-211ENST00000588374 CRAMP1Q96RY5 1269 aa8.65□□□□□ -1.02
EFTUD2-211ENST00000588374 SMC4Q9NTJ3 1288 aa8.65□□□□□ -1.02
EFTUD2-211ENST00000588374 H7C1W4 665 aa8.64□□□□□ -1.03
EFTUD2-211ENST00000588374 PDE8AO60658 829 aa8.64□□□□□ -1.03
EFTUD2-211ENST00000588374 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
EFTUD2-211ENST00000588374 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
EFTUD2-211ENST00000588374 RARSP54136 660 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
EFTUD2-211ENST00000588374 RASSF7Q02833 373 aa8.64□□□□□ -1.03
EFTUD2-211ENST00000588374 GCKRQ14397 625 aa8.64□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.6 ms